logo

Genes within 1Mb (chr1:30785481:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 4.01e-02 -0.285 0.138 0.09 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 9.10e-01 0.0126 0.112 0.09 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 5.36e-01 0.058 0.0935 0.09 B L1
ENSG00000162510 MATN1 61896 sc-eQTL 5.80e-02 0.186 0.0976 0.09 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 4.02e-01 0.0646 0.0769 0.09 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0287 0.116 0.09 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 4.60e-02 0.18 0.0895 0.09 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0835 0.107 0.09 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 2.07e-01 -0.153 0.121 0.09 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 3.00e-01 -0.098 0.0943 0.09 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 2.87e-01 0.0896 0.0839 0.09 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 2.48e-03 0.28 0.0913 0.09 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 9.38e-01 0.00764 0.0975 0.09 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 3.22e-01 0.0826 0.0832 0.09 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 2.60e-01 -0.113 0.0996 0.09 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 7.21e-01 0.0572 0.16 0.09 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 9.71e-03 0.274 0.105 0.09 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 3.22e-01 0.093 0.0936 0.09 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 1.60e-01 0.128 0.0907 0.09 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 8.53e-01 0.0208 0.112 0.09 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00379 0.107 0.09 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0298 0.134 0.09 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 2.29e-01 0.168 0.139 0.092 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 7.11e-01 0.0616 0.166 0.092 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0337 0.13 0.092 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 7.42e-02 -0.165 0.092 0.092 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 9.73e-01 0.00517 0.15 0.092 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -624084 sc-eQTL 3.26e-02 -0.325 0.151 0.092 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -720745 sc-eQTL 9.52e-01 0.00611 0.101 0.092 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0161 0.147 0.092 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0471 0.109 0.09 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 6.84e-01 0.0552 0.135 0.09 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 2.06e-01 -0.11 0.0865 0.09 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 5.33e-02 -0.154 0.0792 0.09 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -123277 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00456 0.154 0.09 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 9.47e-01 0.00713 0.108 0.09 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -624084 sc-eQTL 3.18e-01 -0.165 0.164 0.09 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -720745 sc-eQTL 5.20e-01 0.0934 0.145 0.09 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 3.82e-02 -0.262 0.126 0.09 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 3.54e-01 0.141 0.152 0.09 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -979412 sc-eQTL 4.33e-02 -0.264 0.13 0.09 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 1.43e-01 0.152 0.104 0.09 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 3.32e-01 -0.106 0.109 0.09 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 3.50e-01 0.118 0.126 0.09 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 1.15e-01 0.145 0.0914 0.09 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 2.06e-01 0.179 0.141 0.09 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0846 0.131 0.09 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 5.35e-01 0.0701 0.113 0.09 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 6.30e-01 0.0583 0.121 0.09 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 5.68e-01 0.062 0.108 0.09 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 1.64e-01 0.124 0.0886 0.09 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0142 0.119 0.09 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 8.19e-01 0.0335 0.146 0.09 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0207 0.152 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000457 0.175 0.094 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 5.29e-02 0.34 0.175 0.094 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 6.25e-01 0.0803 0.164 0.094 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 61896 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0817 0.143 0.094 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0892 0.0998 0.094 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 6.27e-01 0.0829 0.17 0.094 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 5.35e-01 0.1 0.161 0.094 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 1.69e-01 -0.196 0.142 0.094 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 2.74e-01 -0.187 0.17 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 2.87e-01 0.152 0.142 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 6.99e-01 -0.052 0.134 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 61896 sc-eQTL 5.58e-01 0.082 0.14 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 3.21e-01 0.0851 0.0856 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 6.61e-01 0.07 0.159 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 3.20e-02 0.257 0.119 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0435 0.135 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 4.76e-01 -0.119 0.166 0.091 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 2.77e-01 -0.167 0.153 0.091 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 6.31e-01 0.0643 0.134 0.091 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 61896 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0562 0.128 0.091 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 6.28e-01 -0.055 0.113 0.091 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 3.81e-01 -0.133 0.151 0.091 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0175 0.13 0.091 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 3.28e-01 -0.148 0.152 0.091 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 2.18e-01 -0.186 0.151 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 4.30e-01 0.103 0.131 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 3.05e-01 0.118 0.115 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 61896 sc-eQTL 2.01e-02 0.271 0.116 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 4.56e-01 0.0584 0.0781 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 9.35e-01 0.0113 0.138 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 7.99e-02 0.18 0.102 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 1.24e-01 -0.195 0.126 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 2.76e-01 -0.177 0.162 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 1.62e-02 -0.321 0.133 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 2.01e-01 0.168 0.131 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 61896 sc-eQTL 4.92e-01 0.0868 0.126 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 1.50e-01 0.123 0.0853 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 2.08e-01 -0.196 0.155 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 1.72e-01 0.17 0.124 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 3.78e-01 0.119 0.135 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00638 0.164 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 7.87e-01 0.0436 0.161 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 5.52e-01 0.0939 0.158 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00533 0.141 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0666 0.144 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 7.49e-01 0.0492 0.154 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 1.22e-01 0.21 0.135 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 5.50e-02 -0.242 0.126 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0209 0.112 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 5.58e-01 0.0525 0.0896 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 1.24e-02 0.239 0.0946 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0189 0.105 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 6.52e-01 0.044 0.0974 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0947 0.112 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0363 0.158 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 5.54e-02 -0.244 0.127 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 4.14e-01 0.0924 0.113 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 1.43e-02 0.228 0.0925 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00364 0.126 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 2.22e-01 0.145 0.119 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 1.91e-01 -0.173 0.132 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 2.96e-01 0.165 0.158 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 4.44e-01 -0.115 0.15 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 5.13e-03 0.348 0.123 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 5.46e-03 0.35 0.125 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 6.12e-01 0.0723 0.142 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 4.44e-01 0.114 0.148 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 3.44e-01 0.138 0.146 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 6.04e-01 0.0891 0.171 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 8.87e-02 0.223 0.131 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 2.86e-02 0.278 0.126 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 3.22e-01 0.14 0.141 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 2.82e-01 0.133 0.123 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 1.85e-01 -0.197 0.148 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 4.34e-01 0.109 0.14 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 8.47e-01 0.0304 0.158 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 4.81e-01 0.0958 0.136 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 8.29e-01 0.0236 0.109 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 2.18e-01 0.129 0.104 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 8.65e-01 0.0247 0.146 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 6.46e-01 0.0602 0.131 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 8.41e-01 0.0286 0.142 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0801 0.175 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00456 0.161 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 4.34e-01 -0.118 0.151 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 8.42e-01 0.0316 0.158 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 2.68e-01 -0.179 0.161 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0689 0.146 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0944 0.148 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 7.28e-02 0.301 0.167 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 1.03e-02 0.412 0.159 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 1.35e-01 -0.247 0.164 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 3.24e-01 0.153 0.155 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 9.84e-02 -0.241 0.145 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 3.28e-01 -0.158 0.161 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0964 0.146 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 3.22e-01 0.172 0.173 0.084 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 2.70e-03 0.456 0.15 0.084 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 2.83e-01 0.158 0.147 0.084 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 2.63e-01 0.155 0.138 0.084 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 9.41e-01 0.0114 0.153 0.084 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 6.58e-01 0.0685 0.155 0.084 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0983 0.159 0.084 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 4.01e-01 0.145 0.172 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -979412 sc-eQTL 3.13e-01 -0.136 0.135 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00458 0.146 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 5.10e-01 -0.101 0.153 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 9.69e-01 -0.0058 0.151 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 7.19e-01 0.0527 0.146 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 2.02e-01 -0.193 0.151 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 8.22e-01 0.0337 0.149 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 4.46e-01 0.124 0.163 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -979412 sc-eQTL 2.38e-01 -0.169 0.143 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 5.96e-01 0.064 0.12 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 8.24e-01 0.0275 0.124 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 2.76e-01 0.144 0.131 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 1.36e-01 0.175 0.117 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 4.68e-02 0.327 0.164 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 7.43e-01 0.0447 0.136 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 9.90e-01 0.00218 0.169 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -979412 sc-eQTL 4.52e-01 -0.101 0.134 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 5.06e-01 0.1 0.151 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 1.85e-01 0.194 0.146 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 3.99e-01 0.118 0.14 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 2.27e-01 -0.191 0.157 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 4.14e-01 0.122 0.149 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 7.83e-01 0.0399 0.144 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 2.11e-01 0.194 0.155 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -979412 sc-eQTL 9.55e-02 -0.233 0.139 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 1.46e-01 0.176 0.12 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 8.28e-02 -0.227 0.13 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0513 0.144 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0483 0.123 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0229 0.153 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 3.29e-01 -0.139 0.142 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0281 0.184 0.089 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 4.28e-01 -0.17 0.213 0.089 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 4.85e-01 0.13 0.185 0.089 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 61896 sc-eQTL 3.94e-01 0.148 0.173 0.089 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 1.58e-01 -0.174 0.123 0.089 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 8.61e-01 0.0333 0.191 0.089 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 1.42e-02 0.411 0.165 0.089 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 1.91e-01 -0.235 0.179 0.089 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 6.77e-01 0.0499 0.12 0.091 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 5.31e-03 -0.42 0.149 0.091 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 4.76e-01 -0.101 0.142 0.091 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 4.40e-01 0.0787 0.102 0.091 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0316 0.149 0.091 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 3.89e-01 0.122 0.142 0.091 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 1.28e-01 -0.199 0.13 0.091 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 9.59e-01 0.00838 0.162 0.09 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 5.81e-01 0.0864 0.156 0.09 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 6.15e-01 0.0632 0.125 0.09 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 4.67e-02 0.284 0.142 0.09 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 4.39e-01 -0.12 0.155 0.09 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 7.14e-01 0.0536 0.146 0.09 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 3.88e-01 -0.126 0.146 0.09 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 3.11e-01 0.165 0.162 0.088 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 8.66e-01 0.0297 0.176 0.088 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0399 0.151 0.088 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 2.65e-02 -0.234 0.105 0.088 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 9.41e-01 0.0114 0.154 0.088 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -624084 sc-eQTL 8.08e-02 -0.237 0.135 0.088 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -720745 sc-eQTL 3.93e-01 -0.114 0.134 0.088 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00601 0.144 0.088 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 9.24e-01 0.0127 0.133 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0807 0.148 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0739 0.1 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 1.25e-01 -0.135 0.0875 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -123277 sc-eQTL 3.74e-01 -0.147 0.165 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 9.15e-01 0.0144 0.135 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -624084 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0965 0.168 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -720745 sc-eQTL 3.66e-01 0.134 0.148 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 2.84e-03 -0.409 0.135 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0179 0.137 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 7.43e-01 0.0532 0.162 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 7.46e-02 -0.208 0.116 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 7.39e-02 -0.16 0.0892 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -123277 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0132 0.155 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 8.02e-01 0.0353 0.14 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -624084 sc-eQTL 3.66e-01 -0.149 0.164 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -720745 sc-eQTL 9.04e-01 0.0162 0.133 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 4.30e-01 -0.106 0.134 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 2.95e-01 -0.212 0.202 0.088 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0474 0.174 0.088 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 5.39e-01 -0.111 0.179 0.088 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 6.92e-01 0.0774 0.195 0.088 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 3.94e-01 -0.152 0.178 0.088 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 4.05e-01 0.15 0.18 0.088 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 2.42e-01 0.204 0.174 0.088 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 6.88e-01 0.0611 0.152 0.091 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 7.00e-01 0.063 0.164 0.091 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 7.03e-01 -0.053 0.139 0.091 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0236 0.109 0.091 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -123277 sc-eQTL 8.92e-01 0.0203 0.149 0.091 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0296 0.157 0.091 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -624084 sc-eQTL 2.06e-01 -0.197 0.155 0.091 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -720745 sc-eQTL 4.55e-01 -0.11 0.148 0.091 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0442 0.148 0.091 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 6.92e-01 0.0567 0.143 0.093 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 7.46e-01 0.0495 0.153 0.093 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 8.76e-01 0.0195 0.125 0.093 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 4.78e-01 0.0803 0.113 0.093 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -123277 sc-eQTL 2.92e-01 0.134 0.127 0.093 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 2.96e-01 -0.152 0.145 0.093 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -624084 sc-eQTL 4.10e-01 -0.114 0.138 0.093 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -720745 sc-eQTL 2.00e-01 -0.177 0.138 0.093 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 3.94e-01 -0.122 0.143 0.093 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 5.51e-01 0.0958 0.16 0.093 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 6.52e-01 0.0796 0.176 0.093 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 9.40e-01 0.011 0.146 0.093 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 1.08e-01 -0.218 0.135 0.093 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 9.93e-01 0.00148 0.176 0.093 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -624084 sc-eQTL 4.28e-01 -0.131 0.164 0.093 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -720745 sc-eQTL 7.48e-01 -0.041 0.128 0.093 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0856 0.15 0.093 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 1.73e-01 -0.221 0.162 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 7.57e-01 0.042 0.135 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0148 0.12 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 61896 sc-eQTL 6.38e-01 0.0645 0.137 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 3.53e-01 0.0798 0.0858 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0133 0.142 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 1.04e-01 0.185 0.113 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 2.35e-01 -0.147 0.124 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 3.72e-02 -0.307 0.146 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0545 0.117 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 1.36e-01 0.165 0.11 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 61896 sc-eQTL 2.93e-02 0.231 0.105 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 4.51e-01 0.0565 0.0749 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0874 0.137 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 1.69e-01 0.133 0.0964 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0495 0.115 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 9.24e-01 -0.012 0.125 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0216 0.142 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 9.81e-02 -0.15 0.0901 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 5.34e-02 -0.153 0.079 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -123277 sc-eQTL 4.58e-01 -0.121 0.162 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0256 0.114 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -624084 sc-eQTL 3.72e-01 -0.149 0.167 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -720745 sc-eQTL 3.67e-01 0.124 0.137 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 7.58e-03 -0.34 0.126 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 3.79e-01 0.12 0.136 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 7.56e-01 0.0463 0.149 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0459 0.122 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 6.15e-01 -0.049 0.0973 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -123277 sc-eQTL 3.91e-01 0.122 0.142 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 4.39e-01 -0.1 0.129 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -624084 sc-eQTL 3.44e-01 -0.14 0.147 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -720745 sc-eQTL 4.07e-01 -0.116 0.14 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0778 0.14 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -511307 sc-eQTL 4.21e-01 0.125 0.154 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -979412 sc-eQTL 6.35e-02 -0.244 0.131 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -511501 sc-eQTL 6.07e-02 0.198 0.105 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -280510 sc-eQTL 4.63e-01 -0.085 0.116 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 27707 sc-eQTL 4.04e-01 0.108 0.129 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -859415 sc-eQTL 2.35e-01 0.117 0.098 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 sc-eQTL 7.45e-02 0.265 0.148 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 53788 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0736 0.129 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000134644 PUM1 -280510 eQTL 0.0183 0.0618 0.0261 0.0 0.0 0.078
ENSG00000162517 PEF1 -859415 eQTL 0.0312 0.0592 0.0274 0.0 0.0 0.078
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 eQTL 2.39e-02 -0.0525 0.0232 0.0 0.0 0.078

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000186056 MATN1-AS1 66977 7.88e-06 9.39e-06 1.35e-06 4.2e-06 1.82e-06 4.01e-06 9.62e-06 1.55e-06 6.53e-06 4.62e-06 1.04e-05 4.64e-06 1.13e-05 3.9e-06 1.57e-06 5.79e-06 3.74e-06 4.69e-06 2.23e-06 2.62e-06 4.61e-06 8.06e-06 6.76e-06 2.36e-06 1.15e-05 2.55e-06 4.35e-06 3.24e-06 7.21e-06 7.79e-06 4.33e-06 5.57e-07 6.67e-07 2.6e-06 3.58e-06 1.91e-06 1.23e-06 1.14e-06 1.29e-06 8.05e-07 7.59e-07 1.06e-05 1.3e-06 1.79e-07 7.64e-07 1.02e-06 1.08e-06 6.09e-07 5.98e-07