logo

Genes within 1Mb (chr1:30783739:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0156 0.111 0.143 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 4.24e-01 0.0709 0.0886 0.143 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0211 0.0744 0.143 B L1
ENSG00000162510 MATN1 60154 sc-eQTL 9.60e-02 0.13 0.0778 0.143 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 2.06e-01 0.0774 0.0611 0.143 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 9.79e-01 0.00239 0.0925 0.143 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 1.27e-01 0.109 0.0714 0.143 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 5.65e-01 0.0489 0.085 0.143 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0836 0.0943 0.143 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 4.87e-01 0.0513 0.0737 0.143 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 5.02e-01 0.0441 0.0657 0.143 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 5.06e-01 0.0485 0.0728 0.143 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 1.14e-01 -0.12 0.0757 0.143 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 9.05e-02 -0.11 0.0647 0.143 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 5.20e-01 0.0502 0.078 0.143 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 8.15e-01 0.029 0.123 0.143 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 6.04e-01 0.0425 0.082 0.143 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0518 0.0722 0.143 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 6.78e-01 0.0292 0.0701 0.143 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0146 0.0864 0.143 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 9.42e-01 0.00597 0.0822 0.143 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 8.88e-01 0.0146 0.103 0.143 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 6.19e-02 0.202 0.108 0.146 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0306 0.129 0.146 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 2.35e-01 -0.119 0.1 0.146 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 8.76e-01 0.0113 0.0719 0.146 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 2.19e-01 -0.143 0.116 0.146 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -625826 sc-eQTL 5.55e-01 0.07 0.118 0.146 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -722487 sc-eQTL 8.18e-02 -0.136 0.0779 0.146 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 3.64e-01 0.103 0.113 0.146 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 4.94e-01 0.0573 0.0837 0.143 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0389 0.104 0.143 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 6.98e-01 0.0258 0.0665 0.143 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 1.24e-01 -0.094 0.0609 0.143 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -125019 sc-eQTL 3.94e-01 -0.1 0.117 0.143 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 4.61e-01 0.0609 0.0824 0.143 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -625826 sc-eQTL 1.85e-01 0.167 0.126 0.143 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -722487 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0713 0.111 0.143 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0567 0.0971 0.143 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 5.20e-01 0.0778 0.121 0.144 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -981154 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0057 0.104 0.144 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 2.43e-01 0.0965 0.0824 0.144 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0189 0.0867 0.144 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 9.49e-01 0.00645 0.0998 0.144 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0208 0.0728 0.144 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 1.11e-02 0.283 0.11 0.144 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 3.40e-01 0.0988 0.103 0.144 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 7.97e-01 -0.023 0.0893 0.143 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0106 0.0955 0.143 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 4.37e-01 0.0668 0.0858 0.143 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000786 0.0704 0.143 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 9.07e-01 0.011 0.094 0.143 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 4.86e-01 0.0803 0.115 0.143 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 2.87e-01 0.128 0.12 0.143 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 1.22e-01 0.206 0.133 0.153 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 1.00e-01 0.221 0.134 0.153 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0402 0.125 0.153 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 60154 sc-eQTL 6.00e-01 0.0576 0.109 0.153 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 1.65e-01 0.106 0.076 0.153 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0513 0.13 0.153 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 2.13e-01 -0.154 0.123 0.153 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0592 0.109 0.153 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 8.54e-01 0.025 0.136 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000564 0.113 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0711 0.106 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 60154 sc-eQTL 1.51e-01 -0.159 0.11 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 3.48e-01 0.0639 0.0679 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 4.57e-01 0.0941 0.126 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 3.01e-02 0.206 0.0945 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 1.37e-02 0.262 0.105 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0881 0.128 0.142 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 5.12e-01 0.0774 0.118 0.142 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 1.56e-01 0.146 0.102 0.142 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 60154 sc-eQTL 4.11e-01 0.0808 0.0981 0.142 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 1.94e-01 0.113 0.0868 0.142 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0479 0.116 0.142 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0109 0.0997 0.142 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 5.09e-02 0.227 0.116 0.142 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0573 0.119 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 4.17e-01 0.0836 0.103 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0625 0.0908 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 60154 sc-eQTL 4.90e-02 0.181 0.0913 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 4.53e-01 0.0462 0.0615 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 1.49e-01 -0.156 0.108 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 4.94e-02 0.158 0.0802 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 1.59e-01 -0.14 0.0994 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0541 0.127 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0566 0.105 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 1.79e-01 -0.138 0.102 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 60154 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000415 0.0983 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 5.65e-01 0.0385 0.0667 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0248 0.121 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 5.47e-01 0.0586 0.0972 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 8.84e-01 0.0154 0.105 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 4.81e-01 0.0872 0.123 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 7.37e-01 0.0409 0.121 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 8.96e-01 0.0156 0.119 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 3.46e-01 -0.1 0.106 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0108 0.109 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 2.63e-01 -0.13 0.116 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 1.54e-01 0.146 0.102 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00138 0.0987 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 6.70e-01 0.0373 0.0874 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 8.28e-01 0.0152 0.0698 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 5.99e-01 0.0394 0.0748 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 6.92e-02 -0.149 0.0814 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0572 0.0758 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 7.38e-01 0.0292 0.0872 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 9.08e-02 -0.211 0.124 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 9.55e-01 0.00568 0.101 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 1.67e-01 0.123 0.0886 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 6.83e-01 0.0302 0.0738 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 8.43e-01 0.0196 0.099 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 1.19e-01 -0.146 0.0932 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 5.43e-01 0.0635 0.104 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 7.08e-01 0.0459 0.122 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 9.03e-01 0.0143 0.117 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0796 0.097 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 2.80e-01 0.106 0.098 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0604 0.11 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0481 0.115 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 9.16e-01 -0.012 0.113 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 7.66e-01 0.0395 0.132 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 4.86e-01 0.0708 0.101 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 9.49e-01 0.00626 0.0987 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 2.05e-01 -0.138 0.109 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0973 0.0949 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 3.91e-01 0.0985 0.115 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 5.11e-01 -0.071 0.108 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 8.29e-01 0.0262 0.121 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 8.19e-01 0.024 0.105 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 6.87e-01 -0.034 0.0842 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 2.58e-01 0.0912 0.0805 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0499 0.112 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 8.15e-01 0.0236 0.101 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00495 0.11 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 7.56e-01 0.0423 0.136 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 2.64e-01 0.139 0.124 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 1.12e-01 0.186 0.116 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 5.49e-01 0.0734 0.122 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 5.18e-01 0.081 0.125 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 2.18e-01 -0.14 0.113 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 9.64e-01 0.00524 0.115 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00943 0.127 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 8.58e-01 0.0217 0.121 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0384 0.124 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 4.27e-01 0.0927 0.117 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 8.69e-01 0.0181 0.11 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 8.22e-01 0.0272 0.121 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 9.27e-01 0.0101 0.11 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 1.99e-01 0.165 0.128 0.145 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 1.86e-01 -0.151 0.114 0.145 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 6.85e-01 0.0443 0.109 0.145 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0107 0.103 0.145 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 5.44e-01 0.0688 0.113 0.145 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00678 0.115 0.145 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 8.54e-01 0.0219 0.118 0.145 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 5.10e-01 0.0864 0.131 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -981154 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0259 0.103 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0343 0.111 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00918 0.116 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 3.53e-01 -0.107 0.115 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0835 0.111 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 5.76e-02 0.218 0.114 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 5.16e-01 0.0739 0.114 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 1.60e-01 0.176 0.124 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -981154 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0435 0.11 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 5.88e-01 0.0502 0.0924 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00298 0.0949 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0348 0.101 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 3.07e-01 0.092 0.0898 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 9.84e-03 0.325 0.125 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 3.07e-01 0.107 0.104 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 4.62e-01 0.0983 0.133 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -981154 sc-eQTL 8.51e-01 0.02 0.106 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 1.05e-01 0.193 0.119 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0892 0.116 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00984 0.111 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 2.36e-01 -0.148 0.125 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 1.99e-01 0.151 0.118 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 2.81e-01 0.123 0.114 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0117 0.124 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -981154 sc-eQTL 4.07e-01 0.0926 0.112 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 8.39e-01 0.0197 0.0965 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 8.80e-01 0.0158 0.104 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 2.43e-01 -0.134 0.115 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 3.75e-01 0.0868 0.0977 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 8.97e-01 0.0157 0.122 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 2.34e-01 0.135 0.113 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0688 0.139 0.141 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 8.43e-01 -0.032 0.161 0.141 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0668 0.14 0.141 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 60154 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0972 0.13 0.141 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00707 0.0934 0.141 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 3.74e-01 -0.128 0.143 0.141 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0871 0.128 0.141 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0192 0.136 0.141 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0586 0.0946 0.143 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0607 0.12 0.143 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 5.65e-01 0.0646 0.112 0.143 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 2.00e-01 -0.103 0.0801 0.143 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 2.52e-01 -0.135 0.118 0.143 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 5.86e-01 0.0612 0.112 0.143 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00729 0.103 0.143 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0684 0.125 0.143 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 6.31e-01 0.0582 0.121 0.143 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 6.40e-01 0.0454 0.0969 0.143 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 1.38e-01 0.164 0.11 0.143 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 9.25e-01 0.0113 0.12 0.143 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 8.71e-02 -0.193 0.112 0.143 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 8.36e-01 0.0235 0.113 0.143 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 1.66e-01 0.171 0.123 0.144 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0247 0.134 0.144 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 1.30e-01 -0.174 0.114 0.144 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 8.47e-01 0.0156 0.0807 0.144 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 3.37e-01 -0.112 0.117 0.144 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -625826 sc-eQTL 9.46e-01 -0.007 0.104 0.144 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -722487 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0951 0.102 0.144 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 2.36e-01 0.13 0.109 0.144 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 7.01e-01 0.0384 0.1 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 7.26e-01 0.0391 0.112 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0227 0.0755 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0334 0.0662 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -125019 sc-eQTL 1.43e-01 -0.183 0.124 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 9.85e-01 0.00198 0.102 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -625826 sc-eQTL 8.63e-02 0.216 0.125 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -722487 sc-eQTL 9.46e-01 0.0076 0.112 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0486 0.104 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 5.94e-01 0.0565 0.106 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 9.61e-01 0.00605 0.125 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 3.56e-01 0.0835 0.0902 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0388 0.0695 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -125019 sc-eQTL 8.01e-01 0.0304 0.12 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 1.06e-01 0.175 0.108 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -625826 sc-eQTL 2.47e-01 0.147 0.127 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -722487 sc-eQTL 6.46e-02 -0.19 0.102 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 1.00e+00 3.22e-05 0.104 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 2.90e-01 -0.169 0.159 0.142 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 2.12e-01 0.172 0.137 0.142 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 5.10e-01 0.0935 0.141 0.142 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 8.49e-01 0.0294 0.154 0.142 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0388 0.141 0.142 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 4.64e-02 0.282 0.14 0.142 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 7.62e-02 0.243 0.136 0.142 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 3.65e-01 0.107 0.118 0.144 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 8.88e-01 0.0179 0.127 0.144 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 7.58e-01 0.0333 0.108 0.144 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 5.00e-02 -0.165 0.0838 0.144 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -125019 sc-eQTL 8.57e-01 0.0209 0.116 0.144 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0267 0.122 0.144 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -625826 sc-eQTL 4.13e-01 0.0994 0.121 0.144 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -722487 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0251 0.115 0.144 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0132 0.115 0.144 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0158 0.11 0.147 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 9.21e-01 0.0117 0.118 0.147 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 3.26e-01 0.0945 0.096 0.147 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 2.48e-01 -0.101 0.0871 0.147 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -125019 sc-eQTL 5.42e-01 0.0598 0.0979 0.147 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 2.07e-01 0.142 0.112 0.147 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -625826 sc-eQTL 5.26e-01 0.0679 0.107 0.147 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -722487 sc-eQTL 1.38e-01 0.158 0.106 0.147 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 2.88e-01 0.118 0.11 0.147 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 2.03e-01 0.161 0.126 0.141 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 1.39e-01 -0.205 0.138 0.141 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 1.65e-01 -0.159 0.114 0.141 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 7.87e-01 -0.029 0.107 0.141 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 3.07e-01 -0.142 0.138 0.141 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -625826 sc-eQTL 3.05e-01 0.133 0.129 0.141 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -722487 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0855 0.1 0.141 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 3.79e-01 0.104 0.118 0.141 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0499 0.129 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 5.40e-01 0.0657 0.107 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 8.32e-01 0.0201 0.095 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 60154 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0525 0.108 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 7.35e-02 0.122 0.0675 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 7.62e-01 0.0342 0.113 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 1.73e-01 0.123 0.0896 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 7.68e-03 0.26 0.0965 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0441 0.116 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 8.01e-01 0.0232 0.0919 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 2.15e-01 -0.108 0.0867 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 60154 sc-eQTL 8.15e-02 0.146 0.0831 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 5.97e-01 0.0312 0.0589 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 1.78e-01 -0.145 0.107 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 6.67e-02 0.139 0.0755 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 2.22e-01 -0.11 0.0901 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 5.73e-01 0.0539 0.0956 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 7.20e-01 0.0389 0.108 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 7.44e-01 0.0226 0.0691 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0676 0.0606 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -125019 sc-eQTL 3.14e-01 -0.125 0.124 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 3.39e-01 0.0833 0.0869 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -625826 sc-eQTL 1.65e-01 0.177 0.127 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -722487 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0835 0.104 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0623 0.0977 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 6.71e-01 0.0448 0.106 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0782 0.115 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 4.53e-01 0.071 0.0945 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 7.42e-02 -0.135 0.0751 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -125019 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0715 0.11 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 8.01e-01 0.0254 0.1 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -625826 sc-eQTL 3.07e-01 0.117 0.114 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -722487 sc-eQTL 6.84e-01 0.0443 0.109 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 8.82e-01 0.0162 0.109 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -513049 sc-eQTL 4.01e-01 0.101 0.12 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -981154 sc-eQTL 9.13e-01 0.0113 0.103 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -513243 sc-eQTL 2.63e-01 0.0921 0.0821 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -282252 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0358 0.0902 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00383 0.101 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -861157 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0413 0.0766 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 65235 sc-eQTL 2.86e-02 0.253 0.115 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 52046 sc-eQTL 2.63e-01 0.112 0.1 0.144 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 eQTL 0.00229 -0.044 0.0144 0.0 0.0 0.143
ENSG00000162512 SDC3 -125019 eQTL 0.00168 -0.112 0.0355 0.023 0.00686 0.143
ENSG00000168528 SERINC2 -625826 eQTL 0.000159 0.21 0.0555 0.0 0.0 0.143
ENSG00000284543 LINC01226 -722542 eQTL 0.042 0.0932 0.0458 0.0 0.0 0.143

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162511 LAPTM5 25965 0.000397 1.19e-05 2.47e-06 4.57e-06 1.5e-06 2.46e-05 1.59e-05 8.83e-07 8.41e-06 5.08e-06 8.9e-06 2.86e-06 1.39e-05 3.66e-06 2.92e-06 7.03e-06 4.62e-06 1.87e-05 2.64e-06 1.15e-06 5.1e-06 1.37e-05 1.39e-05 2.6e-06 1.03e-05 2.43e-06 4.46e-06 1.76e-06 1.29e-05 8.58e-06 4.82e-06 3.27e-07 7.68e-07 2.89e-06 2.03e-06 9.79e-07 8.71e-07 3.79e-07 9.08e-07 3.71e-07 2.79e-07 1.68e-05 2.66e-06 1.22e-08 6.99e-07 7.61e-07 8.75e-07 2.4e-07 2.4e-07
ENSG00000162512 SDC3 -125019 0.00036 5.93e-06 8.44e-07 3.09e-06 4.65e-07 7.21e-06 8.03e-06 4.01e-07 4.8e-06 1.7e-06 4.13e-06 1.27e-06 7.69e-06 1.64e-06 1.41e-06 3.84e-06 1.84e-06 7.7e-06 1.44e-06 8.39e-07 2.89e-06 6.89e-06 5.5e-06 9.95e-07 4.72e-06 1.19e-06 1.84e-06 1.44e-06 4.48e-06 3.32e-06 2.02e-06 3.7e-08 7.53e-07 1.57e-06 1.47e-06 5.42e-07 7.3e-07 1.66e-07 1.12e-06 3.99e-07 2.59e-07 1.23e-05 1.43e-06 2.04e-08 3.71e-07 2.97e-07 3.7e-07 3.13e-08 6.27e-08
ENSG00000168528 SERINC2 -625826 1.1e-05 8.81e-07 7.76e-08 4.36e-07 9.24e-08 6.02e-07 6.19e-07 5.33e-08 2.35e-07 8.53e-08 3.21e-07 1.19e-07 9.57e-07 8.55e-08 7.79e-08 1.1e-07 1.38e-07 4.72e-07 1.55e-07 5.46e-08 1.33e-07 3.92e-07 3.7e-07 3.22e-08 2.74e-07 1.43e-07 1.19e-07 1.06e-07 1.48e-07 1.58e-07 1.27e-07 3.84e-08 5.2e-08 2.19e-07 1.67e-07 3.94e-08 6.39e-08 9.3e-08 3.82e-08 7.78e-08 4.58e-08 1.19e-06 5.84e-08 3.33e-08 6.38e-08 1.71e-08 1.19e-07 4.6e-09 4.74e-08