logo

Genes within 1Mb (chr1:30780982:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 3.17e-01 -0.109 0.109 0.135 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 7.13e-02 0.157 0.0864 0.135 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 1.63e-01 -0.102 0.0727 0.135 B L1
ENSG00000162510 MATN1 57397 sc-eQTL 2.85e-03 0.227 0.0752 0.135 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0439 0.0601 0.135 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 5.52e-01 -0.054 0.0907 0.135 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 1.29e-01 0.107 0.0701 0.135 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 6.75e-01 -0.035 0.0834 0.135 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0317 0.0929 0.135 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 5.72e-01 -0.041 0.0725 0.135 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0259 0.0646 0.135 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 2.37e-04 0.259 0.0693 0.135 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 6.60e-01 -0.033 0.0748 0.135 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0159 0.064 0.135 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 9.41e-01 0.00569 0.0767 0.135 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0669 0.122 0.135 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 4.17e-02 0.165 0.0806 0.135 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0772 0.0714 0.135 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 5.36e-02 0.134 0.069 0.135 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 5.65e-02 -0.163 0.0849 0.135 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 8.46e-01 0.0158 0.0815 0.135 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0716 0.102 0.135 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 3.88e-01 0.0928 0.107 0.137 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0443 0.127 0.137 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0982 0.0995 0.137 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 1.05e-02 -0.181 0.0701 0.137 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 8.37e-01 0.0239 0.116 0.137 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -628583 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0682 0.117 0.137 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -725244 sc-eQTL 3.79e-01 0.0685 0.0777 0.137 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0934 0.112 0.137 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 5.00e-01 0.0566 0.0838 0.135 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 1.65e-01 0.144 0.104 0.135 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0316 0.0666 0.135 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 4.01e-02 -0.125 0.0607 0.135 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -127776 sc-eQTL 2.24e-01 0.143 0.117 0.135 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0774 0.0825 0.135 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -628583 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0467 0.126 0.135 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -725244 sc-eQTL 6.27e-01 0.0542 0.111 0.135 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0947 0.0971 0.135 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 6.32e-01 0.0569 0.119 0.135 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -983911 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0467 0.102 0.135 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0429 0.0813 0.135 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 1.18e-01 -0.133 0.0848 0.135 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 1.92e-01 -0.128 0.0978 0.135 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 6.25e-01 0.035 0.0716 0.135 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 1.40e-01 0.163 0.11 0.135 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 3.90e-02 -0.209 0.101 0.135 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0149 0.0886 0.135 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 2.27e-01 0.114 0.0944 0.135 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0268 0.0851 0.135 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 2.39e-01 0.0822 0.0696 0.135 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 2.30e-01 0.112 0.0929 0.135 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 1.63e-01 0.159 0.114 0.135 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 9.05e-01 0.0143 0.119 0.135 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00975 0.136 0.14 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 3.30e-01 0.134 0.137 0.14 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 7.33e-01 0.0437 0.128 0.14 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 57397 sc-eQTL 4.96e-02 -0.218 0.11 0.14 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0224 0.0778 0.14 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 4.09e-01 -0.109 0.132 0.14 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 1.86e-01 0.166 0.125 0.14 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 2.23e-01 -0.135 0.111 0.14 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0541 0.135 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 9.57e-01 0.00604 0.113 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0922 0.106 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 57397 sc-eQTL 4.21e-01 0.0893 0.111 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 8.25e-01 0.015 0.068 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 9.31e-01 0.011 0.126 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0281 0.0955 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 3.32e-01 0.104 0.107 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0365 0.129 0.131 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 9.98e-01 0.000248 0.119 0.131 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 6.78e-01 -0.043 0.104 0.131 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 57397 sc-eQTL 8.24e-01 0.0221 0.0991 0.131 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 6.14e-01 0.0444 0.0878 0.131 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0819 0.117 0.131 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0319 0.101 0.131 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 2.63e-01 0.132 0.117 0.131 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0631 0.119 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 1.43e-01 0.15 0.102 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0678 0.0904 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 57397 sc-eQTL 2.28e-03 0.278 0.0899 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 9.21e-01 0.00612 0.0614 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0173 0.108 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 8.63e-02 0.138 0.08 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 5.01e-01 -0.067 0.0994 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 3.95e-01 -0.108 0.126 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0164 0.104 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 9.38e-01 0.00797 0.102 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 57397 sc-eQTL 4.94e-01 0.0671 0.0979 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 4.26e-01 0.053 0.0665 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0211 0.121 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 6.00e-01 0.0509 0.0969 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 8.77e-01 0.0162 0.105 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 9.62e-01 0.00594 0.124 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0881 0.122 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 2.22e-01 -0.146 0.119 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 1.31e-01 0.161 0.106 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0173 0.109 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 7.09e-01 0.0437 0.117 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 1.90e-01 0.135 0.103 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0563 0.0964 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 7.72e-01 0.0247 0.0855 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0336 0.0682 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 1.79e-04 0.27 0.0707 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 8.62e-01 0.0139 0.0802 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0463 0.0742 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 3.68e-01 0.0768 0.0851 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 9.49e-01 -0.008 0.125 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0652 0.1 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 1.91e-01 0.116 0.0886 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 7.49e-02 0.131 0.0732 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 2.61e-01 -0.111 0.0986 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 4.29e-01 0.0741 0.0935 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 1.42e-01 -0.153 0.104 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 8.34e-01 0.0263 0.125 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 7.05e-01 0.0452 0.119 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 3.05e-01 0.102 0.099 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 8.44e-02 0.173 0.0997 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 1.51e-01 -0.161 0.112 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00401 0.117 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 5.75e-01 0.0649 0.116 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0668 0.133 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 3.20e-01 0.101 0.101 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 5.87e-01 0.0536 0.0987 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 1.50e-01 0.157 0.109 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 7.37e-02 -0.17 0.0945 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 5.89e-01 0.0622 0.115 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0564 0.108 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 8.73e-01 0.0197 0.123 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 2.97e-01 0.111 0.106 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0699 0.0852 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 4.41e-03 0.231 0.0802 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 6.61e-01 0.0498 0.114 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 9.82e-01 0.00229 0.102 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 3.60e-01 -0.102 0.111 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 1.88e-01 0.178 0.135 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0593 0.124 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 9.28e-01 0.0106 0.117 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 1.62e-01 0.171 0.122 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 1.77e-01 -0.168 0.124 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00934 0.113 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 5.93e-01 0.0612 0.114 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 9.27e-01 0.0121 0.131 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 6.66e-01 0.0543 0.126 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0261 0.128 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 6.08e-01 -0.062 0.121 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 1.90e-01 -0.149 0.113 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 1.55e-01 -0.178 0.125 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 3.10e-02 -0.244 0.112 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0152 0.131 0.132 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 6.18e-02 0.216 0.115 0.132 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0835 0.111 0.132 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 4.02e-02 0.214 0.104 0.132 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 3.30e-01 0.112 0.115 0.132 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 1.01e-01 0.191 0.116 0.132 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 9.13e-01 0.0132 0.12 0.132 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 9.92e-01 0.00124 0.13 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -983911 sc-eQTL 9.54e-02 -0.17 0.101 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 3.99e-01 0.093 0.11 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0525 0.116 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0776 0.114 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 1.52e-01 0.158 0.11 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 3.79e-01 -0.101 0.114 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 3.11e-01 -0.114 0.113 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0112 0.124 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -983911 sc-eQTL 3.10e-01 -0.111 0.109 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 2.23e-01 -0.112 0.0916 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0673 0.0942 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 2.09e-01 -0.126 0.1 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 5.40e-01 0.0549 0.0894 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 1.32e-01 0.189 0.125 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 2.49e-01 -0.12 0.104 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 9.67e-01 -0.0056 0.134 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -983911 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0862 0.106 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 2.77e-01 0.13 0.119 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00458 0.117 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 9.17e-02 -0.187 0.111 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 6.35e-01 0.0597 0.125 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0924 0.118 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0182 0.115 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 8.34e-01 0.0253 0.121 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -983911 sc-eQTL 5.28e-01 0.0687 0.109 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0496 0.094 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 2.52e-01 -0.116 0.101 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 7.90e-02 -0.196 0.111 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0444 0.0954 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 7.79e-01 0.0333 0.119 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0734 0.11 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 7.90e-01 0.036 0.135 0.163 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0873 0.156 0.163 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0215 0.136 0.163 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 57397 sc-eQTL 7.25e-01 0.0446 0.126 0.163 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0348 0.0902 0.163 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 6.20e-02 0.258 0.137 0.163 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 3.92e-01 0.106 0.123 0.163 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0868 0.131 0.163 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0726 0.0965 0.133 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 9.87e-01 0.00195 0.123 0.133 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0842 0.114 0.133 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0439 0.082 0.133 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 9.29e-01 0.0108 0.12 0.133 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 1.37e-01 -0.17 0.114 0.133 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 1.30e-01 -0.159 0.105 0.133 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 3.35e-01 -0.123 0.128 0.135 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0571 0.124 0.135 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0565 0.0991 0.135 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 6.52e-02 0.209 0.113 0.135 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0269 0.123 0.135 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0326 0.116 0.135 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 3.58e-01 -0.106 0.115 0.135 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0811 0.124 0.139 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 1.40e-01 0.199 0.134 0.139 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 9.84e-02 -0.191 0.115 0.139 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 2.48e-03 -0.243 0.0792 0.139 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 8.35e-01 0.0246 0.118 0.139 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -628583 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0187 0.104 0.139 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -725244 sc-eQTL 8.96e-02 -0.173 0.102 0.139 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0513 0.11 0.139 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0167 0.101 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 3.86e-01 0.0974 0.112 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0305 0.076 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0867 0.0665 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -127776 sc-eQTL 2.98e-01 -0.131 0.125 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 3.71e-01 -0.092 0.103 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -628583 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0298 0.127 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -725244 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0481 0.112 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0576 0.105 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 1.00e-01 0.173 0.105 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 3.06e-01 0.127 0.124 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 2.09e-01 -0.113 0.0897 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 1.15e-01 -0.109 0.0688 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -127776 sc-eQTL 2.85e-01 0.128 0.119 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0513 0.108 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -628583 sc-eQTL 8.75e-01 0.0199 0.126 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -725244 sc-eQTL 6.51e-01 0.0465 0.103 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 1.61e-01 -0.145 0.103 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 3.47e-01 0.143 0.151 0.139 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 7.25e-01 0.0459 0.13 0.139 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 6.85e-01 0.0545 0.134 0.139 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00618 0.146 0.139 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0683 0.133 0.139 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 1.07e-01 0.216 0.133 0.139 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 7.16e-01 0.0474 0.13 0.139 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 6.62e-01 0.0532 0.122 0.138 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 3.13e-01 -0.132 0.131 0.138 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 1.17e-01 -0.174 0.11 0.138 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 3.08e-02 -0.187 0.0861 0.138 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -127776 sc-eQTL 2.27e-01 0.144 0.119 0.138 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0965 0.125 0.138 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -628583 sc-eQTL 5.86e-01 0.0681 0.125 0.138 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -725244 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0239 0.118 0.138 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 2.93e-01 -0.125 0.118 0.138 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 8.31e-01 0.0239 0.112 0.136 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 4.41e-01 0.0917 0.119 0.136 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 5.57e-01 0.0572 0.0972 0.136 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 1.71e-01 0.121 0.0879 0.136 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -127776 sc-eQTL 6.68e-01 0.0425 0.099 0.136 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 5.79e-01 -0.063 0.113 0.136 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -628583 sc-eQTL 2.39e-01 -0.127 0.108 0.136 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -725244 sc-eQTL 5.42e-01 0.0659 0.108 0.136 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0346 0.112 0.136 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 3.82e-03 0.37 0.126 0.127 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0436 0.142 0.127 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0144 0.118 0.127 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 3.31e-01 -0.106 0.109 0.127 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 9.92e-01 0.00143 0.142 0.127 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -628583 sc-eQTL 9.89e-01 0.00186 0.133 0.127 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -725244 sc-eQTL 7.79e-01 0.029 0.103 0.127 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0247 0.121 0.127 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 9.82e-01 0.00291 0.126 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 9.85e-01 0.00195 0.105 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0772 0.0929 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 57397 sc-eQTL 7.16e-01 0.0386 0.106 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 1.82e-01 0.0888 0.0664 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 1.68e-01 -0.152 0.11 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 8.16e-01 0.0206 0.0881 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 1.16e-01 0.151 0.0955 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 2.94e-01 -0.121 0.115 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 1.95e-01 0.119 0.0912 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0389 0.0866 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 57397 sc-eQTL 6.03e-03 0.227 0.0819 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 9.56e-01 0.00323 0.0587 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 8.85e-01 0.0156 0.107 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 8.50e-02 0.13 0.0753 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0266 0.09 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 5.21e-01 0.0614 0.0955 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 1.23e-01 0.167 0.108 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 4.51e-01 -0.052 0.069 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 7.98e-02 -0.106 0.0602 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -127776 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0441 0.124 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 3.58e-01 -0.08 0.0869 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -628583 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0182 0.127 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -725244 sc-eQTL 8.61e-01 0.0183 0.104 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 2.72e-01 -0.107 0.0975 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 4.12e-01 0.0858 0.104 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00432 0.114 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0196 0.0938 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0589 0.0749 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -127776 sc-eQTL 7.29e-02 0.196 0.109 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 2.58e-01 -0.113 0.0993 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -628583 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0211 0.114 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -725244 sc-eQTL 4.02e-01 0.0905 0.108 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 3.52e-01 -0.1 0.108 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -515806 sc-eQTL 6.64e-01 0.0518 0.119 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -983911 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0277 0.101 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -516000 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0497 0.0813 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -285009 sc-eQTL 2.27e-01 -0.108 0.0889 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 sc-eQTL 1.28e-01 -0.151 0.0991 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -863914 sc-eQTL 9.24e-01 0.00726 0.0757 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 62478 sc-eQTL 7.23e-02 0.206 0.114 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 49289 sc-eQTL 5.26e-02 -0.192 0.0983 0.136 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162511 LAPTM5 23208 eQTL 2.44e-05 -0.0586 0.0138 0.0 0.0 0.141

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000186056 \N 62478 2.2e-05 1.04e-05 1.76e-06 6.84e-06 2.35e-06 6.86e-06 1.5e-05 2.11e-06 1.05e-05 5.8e-06 1.23e-05 5.48e-06 1.62e-05 3.72e-06 3.54e-06 7.21e-06 4.9e-06 1.17e-05 3.07e-06 2.85e-06 6.27e-06 1.1e-05 1.02e-05 3.36e-06 1.72e-05 4.39e-06 6.57e-06 4.73e-06 1.15e-05 9.87e-06 5.45e-06 1.05e-06 1.11e-06 3.61e-06 5.01e-06 2.53e-06 1.73e-06 1.43e-06 2.15e-06 1.01e-06 9.75e-07 1.35e-05 2.52e-06 1.64e-07 1.36e-06 1.78e-06 1.8e-06 7.02e-07 4.73e-07