logo

Genes within 1Mb (chr1:30774386:TG:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 2.42e-01 0.13 0.111 0.13 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 6.81e-01 0.0366 0.0889 0.13 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0519 0.0745 0.13 B L1
ENSG00000162510 MATN1 50801 sc-eQTL 1.63e-01 0.109 0.0781 0.13 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 4.18e-03 0.174 0.0602 0.13 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0197 0.0927 0.13 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 1.31e-01 0.109 0.0716 0.13 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 4.30e-01 0.0672 0.0851 0.13 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 2.99e-01 0.099 0.0951 0.13 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 8.75e-01 0.0117 0.0745 0.13 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0489 0.0662 0.13 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0622 0.0733 0.13 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 1.69e-01 -0.106 0.0765 0.13 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 6.60e-03 0.177 0.0646 0.13 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 8.11e-01 0.0188 0.0787 0.13 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0609 0.126 0.13 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 8.47e-01 0.0161 0.0837 0.13 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0457 0.0737 0.13 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00516 0.0716 0.13 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 6.30e-01 0.0425 0.0881 0.13 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 4.90e-02 0.165 0.0831 0.13 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 7.98e-01 0.0271 0.105 0.13 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0712 0.121 0.124 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 2.36e-01 0.17 0.143 0.124 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0445 0.112 0.124 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 8.87e-01 0.0114 0.0802 0.124 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 5.01e-01 0.0876 0.13 0.124 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -635179 sc-eQTL 2.96e-01 0.138 0.132 0.124 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -731840 sc-eQTL 8.18e-01 0.0202 0.0876 0.124 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 1.37e-01 0.188 0.126 0.124 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0525 0.0876 0.13 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0709 0.109 0.13 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0121 0.0697 0.13 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 1.40e-01 0.0944 0.0638 0.13 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -134372 sc-eQTL 3.73e-01 0.11 0.123 0.13 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0728 0.0863 0.13 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -635179 sc-eQTL 8.65e-02 0.226 0.131 0.13 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -731840 sc-eQTL 1.41e-01 -0.171 0.116 0.13 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 4.09e-01 0.0842 0.102 0.13 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 2.87e-01 -0.128 0.12 0.131 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -990507 sc-eQTL 3.06e-01 0.106 0.103 0.131 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0197 0.0821 0.131 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 1.09e-01 -0.138 0.0856 0.131 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 3.41e-01 0.0943 0.0989 0.131 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00076 0.0724 0.131 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0273 0.111 0.131 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 6.22e-01 0.0507 0.103 0.131 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 3.19e-01 0.092 0.0921 0.13 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 3.75e-01 0.0876 0.0985 0.13 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 2.21e-01 0.109 0.0884 0.13 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00899 0.0727 0.13 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 2.72e-01 -0.107 0.0969 0.13 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00658 0.119 0.13 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 9.29e-01 -0.011 0.124 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 2.13e-01 -0.178 0.142 0.128 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 1.75e-01 -0.195 0.143 0.128 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 1.63e-01 0.187 0.133 0.128 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 50801 sc-eQTL 8.39e-01 0.0238 0.117 0.128 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 1.36e-01 0.122 0.0811 0.128 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 8.69e-01 -0.023 0.139 0.128 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 2.06e-01 -0.166 0.131 0.128 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0338 0.117 0.128 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 4.26e-01 -0.109 0.137 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 9.95e-01 0.0007 0.114 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0937 0.108 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 50801 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0748 0.112 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 9.80e-01 0.00174 0.069 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0371 0.128 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0948 0.0966 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0407 0.108 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 8.99e-01 -0.017 0.133 0.131 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0655 0.123 0.131 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 3.11e-01 -0.108 0.107 0.131 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 50801 sc-eQTL 9.09e-01 0.0118 0.102 0.131 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 5.02e-01 0.0609 0.0906 0.131 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 6.82e-01 0.0497 0.121 0.131 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 4.59e-01 0.0769 0.104 0.131 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00449 0.122 0.131 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 6.25e-01 -0.06 0.123 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 3.30e-01 -0.103 0.106 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0518 0.0934 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 50801 sc-eQTL 3.02e-01 0.0978 0.0946 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 1.05e-01 0.102 0.0629 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0737 0.112 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 3.17e-01 0.0833 0.083 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 7.69e-02 0.181 0.102 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 8.68e-04 0.433 0.128 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 1.52e-02 0.262 0.107 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 5.41e-01 0.065 0.106 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 50801 sc-eQTL 2.52e-02 0.227 0.101 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 3.54e-01 0.0642 0.0691 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 4.09e-01 0.104 0.126 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 3.80e-01 0.0886 0.101 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 5.69e-01 0.0621 0.109 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 2.04e-01 -0.165 0.129 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0913 0.128 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 9.44e-01 0.00883 0.125 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 2.05e-01 -0.141 0.111 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 7.40e-01 0.038 0.115 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 2.60e-01 0.138 0.122 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0682 0.108 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 5.13e-01 0.065 0.0991 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0399 0.0879 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00846 0.0702 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 3.80e-01 -0.066 0.0751 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0995 0.0823 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 3.29e-02 0.162 0.0756 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 8.05e-01 0.0217 0.0877 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 6.54e-01 0.0563 0.125 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 1.43e-01 0.148 0.101 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 4.65e-02 -0.177 0.0886 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0142 0.0742 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 2.30e-01 -0.119 0.0991 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 2.27e-02 0.214 0.093 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 5.67e-01 0.0602 0.105 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 1.79e-01 0.174 0.129 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 7.22e-01 0.0439 0.123 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 8.42e-02 -0.177 0.102 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 6.22e-02 0.193 0.103 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 4.88e-01 0.0806 0.116 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 1.87e-01 0.16 0.121 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 3.04e-01 0.123 0.119 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 5.07e-01 0.0913 0.137 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0852 0.105 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0471 0.102 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 9.10e-01 0.0128 0.113 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 7.91e-01 0.0262 0.0988 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 2.65e-01 0.133 0.119 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0769 0.112 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00777 0.125 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0266 0.108 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0215 0.0868 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 3.48e-02 -0.175 0.0823 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 3.13e-01 0.117 0.115 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 3.22e-01 0.103 0.104 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 4.87e-01 0.0787 0.113 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 2.78e-01 -0.16 0.148 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00626 0.136 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00579 0.128 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 1.10e-01 -0.213 0.133 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 1.67e-02 0.325 0.134 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0613 0.123 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 8.04e-01 0.031 0.125 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 1.18e-01 -0.209 0.133 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 4.00e-01 -0.108 0.128 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0343 0.131 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 1.42e-01 -0.181 0.123 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0877 0.116 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0437 0.128 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 1.13e-01 0.183 0.115 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0369 0.14 0.128 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 4.28e-01 0.0982 0.124 0.128 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 1.52e-01 0.17 0.118 0.128 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0898 0.112 0.128 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 7.66e-02 -0.217 0.122 0.128 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 5.84e-01 0.0683 0.125 0.128 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 4.92e-01 0.0883 0.128 0.128 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 5.02e-02 -0.263 0.133 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -990507 sc-eQTL 9.21e-01 0.0104 0.105 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 4.17e-01 0.0924 0.114 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 8.67e-01 -0.02 0.119 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 6.84e-02 -0.214 0.117 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0606 0.114 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 3.93e-01 -0.101 0.118 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 8.29e-01 0.0252 0.117 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 2.55e-01 -0.145 0.127 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -990507 sc-eQTL 1.07e-01 0.181 0.112 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 7.35e-01 -0.032 0.0945 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 1.33e-01 -0.146 0.0965 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 1.73e-01 0.141 0.103 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0392 0.092 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 2.76e-01 -0.141 0.129 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 8.68e-01 0.0178 0.107 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 7.02e-01 0.0509 0.133 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -990507 sc-eQTL 5.76e-01 0.0592 0.106 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 1.89e-01 -0.156 0.118 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 2.20e-01 -0.142 0.115 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 1.39e-01 0.163 0.11 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 6.82e-01 0.0511 0.125 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 2.10e-01 0.147 0.117 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0802 0.114 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0329 0.124 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -990507 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0501 0.112 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 4.29e-01 0.0765 0.0966 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 6.95e-01 -0.041 0.105 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 3.23e-01 0.114 0.115 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0727 0.098 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0449 0.122 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 7.07e-01 0.0428 0.114 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 8.52e-01 0.0263 0.14 0.13 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 4.46e-01 0.124 0.162 0.13 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 9.09e-01 0.0162 0.141 0.13 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 50801 sc-eQTL 4.88e-01 0.0915 0.132 0.13 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0705 0.094 0.13 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0998 0.145 0.13 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0691 0.129 0.13 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 9.20e-01 0.0138 0.137 0.13 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 4.48e-01 0.0744 0.0979 0.13 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 1.77e-01 0.168 0.124 0.13 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 6.26e-01 0.0566 0.116 0.13 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 4.93e-01 0.0571 0.0831 0.13 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 9.89e-01 0.0017 0.122 0.13 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 9.97e-01 0.000394 0.116 0.13 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0256 0.107 0.13 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 6.77e-01 0.0564 0.135 0.13 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0487 0.131 0.13 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0197 0.105 0.13 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 1.84e-02 -0.281 0.118 0.13 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0387 0.129 0.13 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 1.83e-01 0.163 0.122 0.13 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0501 0.122 0.13 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00732 0.145 0.112 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 1.41e-01 0.23 0.156 0.112 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 8.60e-01 0.0237 0.134 0.112 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 2.39e-01 0.111 0.0939 0.112 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 6.13e-01 0.0691 0.136 0.112 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -635179 sc-eQTL 1.71e-02 0.287 0.119 0.112 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -731840 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0332 0.119 0.112 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 9.47e-02 0.213 0.127 0.112 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 9.04e-01 0.0128 0.106 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0862 0.118 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 6.30e-01 0.0386 0.08 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 3.88e-01 0.0606 0.0701 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -134372 sc-eQTL 3.65e-02 0.276 0.131 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 6.70e-01 0.0462 0.108 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -635179 sc-eQTL 2.99e-01 0.139 0.134 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -731840 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0927 0.118 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 7.09e-01 0.0413 0.11 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0732 0.111 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0676 0.132 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0534 0.0952 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 4.86e-01 0.051 0.0732 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -134372 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0589 0.126 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0863 0.114 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -635179 sc-eQTL 6.94e-02 0.243 0.133 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -731840 sc-eQTL 1.65e-01 -0.151 0.108 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 7.51e-01 0.0347 0.109 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 4.62e-01 0.132 0.178 0.124 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 5.10e-02 -0.298 0.151 0.124 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 9.86e-01 0.0027 0.158 0.124 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 5.91e-02 -0.323 0.17 0.124 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 3.59e-01 -0.144 0.157 0.124 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 4.40e-01 0.123 0.158 0.124 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 1.33e-01 0.23 0.152 0.124 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 2.12e-01 -0.158 0.126 0.127 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 9.70e-01 0.00506 0.136 0.127 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 5.32e-01 -0.072 0.115 0.127 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 1.52e-02 0.218 0.089 0.127 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -134372 sc-eQTL 9.08e-01 0.0143 0.124 0.127 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0749 0.13 0.127 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -635179 sc-eQTL 5.55e-02 0.247 0.128 0.127 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -731840 sc-eQTL 3.15e-01 -0.123 0.122 0.127 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 9.79e-02 0.203 0.122 0.127 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 9.17e-01 0.0128 0.123 0.127 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 2.23e-01 -0.159 0.131 0.127 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0661 0.107 0.127 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 1.46e-01 0.141 0.0967 0.127 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -134372 sc-eQTL 4.72e-01 0.0784 0.109 0.127 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 3.90e-01 -0.107 0.125 0.127 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -635179 sc-eQTL 2.63e-03 0.354 0.116 0.127 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -731840 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0111 0.119 0.127 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 2.36e-02 0.278 0.122 0.127 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0194 0.147 0.116 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0763 0.161 0.116 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 2.80e-01 -0.144 0.133 0.116 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 8.55e-01 0.0227 0.124 0.116 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 4.64e-01 -0.118 0.161 0.116 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -635179 sc-eQTL 2.00e-01 -0.193 0.15 0.116 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -731840 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0644 0.117 0.116 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0995 0.137 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 2.50e-01 -0.15 0.13 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00815 0.109 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 2.16e-01 -0.119 0.0958 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 50801 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0149 0.11 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 9.12e-01 0.00767 0.0689 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 9.03e-01 0.014 0.114 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00652 0.0911 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0887 0.0991 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 7.58e-02 0.21 0.118 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 4.78e-01 0.0667 0.0938 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 9.92e-01 0.000933 0.0888 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 50801 sc-eQTL 7.54e-02 0.152 0.0849 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 2.21e-01 0.0737 0.06 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0377 0.11 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 1.41e-01 0.114 0.0774 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 1.28e-01 0.14 0.0919 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0396 0.101 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 3.69e-01 -0.103 0.114 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 7.62e-01 0.022 0.0727 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 2.15e-01 0.0792 0.0637 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -134372 sc-eQTL 1.44e-01 0.191 0.13 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0323 0.0917 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -635179 sc-eQTL 1.62e-01 0.188 0.134 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -731840 sc-eQTL 1.36e-01 -0.164 0.109 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 5.77e-01 0.0575 0.103 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 3.22e-01 -0.115 0.116 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 9.36e-01 0.0102 0.127 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0619 0.104 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 2.51e-02 0.186 0.0824 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -134372 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00445 0.122 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0597 0.111 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -635179 sc-eQTL 9.19e-03 0.327 0.124 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -731840 sc-eQTL 1.23e-01 -0.185 0.119 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 1.82e-02 0.282 0.119 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0982 0.121 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -990507 sc-eQTL 4.67e-01 0.0748 0.103 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0336 0.0824 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -291605 sc-eQTL 1.62e-01 -0.126 0.0899 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 16612 sc-eQTL 2.18e-01 0.124 0.101 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -870510 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00542 0.0767 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 55882 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0126 0.116 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 42693 sc-eQTL 6.47e-01 0.0461 0.1 0.129 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000060688 SNRNP40 -522402 eQTL 0.024 0.0629 0.0278 0.00112 0.0 0.111
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 eQTL 6.45e-04 0.0998 0.0291 0.0 0.0 0.111

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000121766 ZCCHC17 -522596 8.21e-07 3.11e-07 6.26e-08 2.49e-07 1.07e-07 1.77e-07 5.13e-07 5.53e-08 2.56e-07 1.39e-07 4.13e-07 2.55e-07 9.23e-07 1.54e-07 2.44e-07 2.1e-07 4.17e-08 3.67e-07 2.12e-07 4.8e-08 1.6e-07 5.36e-07 2.67e-07 2.68e-08 3.7e-07 1.31e-07 2.43e-07 1.1e-07 1.36e-07 1.33e-07 1.52e-07 3.39e-08 3.51e-08 1.38e-07 1.27e-07 3.22e-08 4.07e-08 6.78e-08 5.69e-08 1.61e-08 4.53e-08 7.53e-07 6.04e-08 1.5e-07 5.59e-08 6.12e-08 7.26e-08 2.8e-09 4.79e-08