logo

Genes within 1Mb (chr1:30773035:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 3.73e-01 0.076 0.0851 0.282 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0245 0.0682 0.282 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 9.94e-01 0.000449 0.0573 0.282 B L1
ENSG00000162510 MATN1 49450 sc-eQTL 1.57e-03 -0.188 0.0588 0.282 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 3.52e-02 -0.0989 0.0467 0.282 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 7.47e-01 -0.023 0.0712 0.282 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 4.09e-04 -0.193 0.0536 0.282 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00789 0.0654 0.282 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 6.61e-01 0.0321 0.0731 0.282 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 6.71e-01 0.0243 0.0571 0.282 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 3.17e-01 0.0509 0.0507 0.282 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 6.77e-02 -0.103 0.0559 0.282 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 4.03e-01 0.0493 0.0588 0.282 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 5.96e-01 0.0268 0.0504 0.282 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 1.97e-01 0.0778 0.0601 0.282 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 5.71e-01 0.0548 0.0965 0.282 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0392 0.0642 0.282 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 2.40e-01 0.0665 0.0564 0.282 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 8.59e-01 0.00977 0.055 0.282 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 2.66e-01 0.0753 0.0675 0.282 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0378 0.0644 0.282 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 8.61e-01 0.0142 0.081 0.282 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 3.09e-01 -0.087 0.0853 0.282 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000399 0.101 0.282 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 2.96e-01 0.0829 0.0791 0.282 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 3.70e-02 0.118 0.056 0.282 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 6.59e-01 0.0406 0.0918 0.282 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -636530 sc-eQTL 9.66e-01 0.00399 0.0934 0.282 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -733191 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00205 0.0619 0.282 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 9.99e-02 -0.147 0.089 0.282 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 1.44e-01 0.0979 0.0667 0.282 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 5.22e-01 0.0532 0.0831 0.282 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 1.75e-01 -0.0722 0.0531 0.282 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0128 0.049 0.282 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -135723 sc-eQTL 1.14e-01 -0.149 0.0937 0.282 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0329 0.0661 0.282 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -636530 sc-eQTL 6.50e-01 0.046 0.101 0.282 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -733191 sc-eQTL 1.29e-01 0.135 0.0886 0.282 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 1.90e-01 0.102 0.0775 0.282 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0328 0.0927 0.281 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -991858 sc-eQTL 4.58e-01 0.0593 0.0797 0.281 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 4.59e-01 -0.047 0.0634 0.281 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000391 0.0665 0.281 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 3.52e-04 0.27 0.0743 0.281 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 2.09e-01 0.0702 0.0557 0.281 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0595 0.086 0.281 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 1.25e-01 0.122 0.079 0.281 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 9.71e-01 0.00253 0.0695 0.282 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0737 0.0741 0.282 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0416 0.0667 0.282 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0184 0.0547 0.282 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 1.11e-01 0.116 0.0726 0.282 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0474 0.0895 0.282 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0259 0.0933 0.282 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 8.02e-01 0.0278 0.111 0.27 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0184 0.111 0.27 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 3.56e-02 -0.217 0.102 0.27 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 49450 sc-eQTL 8.72e-02 -0.154 0.0898 0.27 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 1.68e-02 -0.15 0.0621 0.27 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 7.90e-01 0.0287 0.107 0.27 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0475 0.102 0.27 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 9.19e-01 0.0092 0.0902 0.27 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 1.92e-01 0.136 0.104 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 3.32e-01 0.0843 0.0867 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 7.70e-01 -0.024 0.082 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 49450 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0549 0.0852 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0583 0.0522 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0361 0.0972 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 6.92e-01 0.0291 0.0735 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0944 0.082 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 3.50e-01 0.0935 0.0999 0.284 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0884 0.092 0.284 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0832 0.08 0.284 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 49450 sc-eQTL 8.96e-01 0.0101 0.0768 0.284 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 2.16e-04 -0.248 0.0658 0.284 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 8.39e-01 0.0185 0.0908 0.284 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0631 0.0777 0.284 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 7.50e-02 -0.162 0.0905 0.284 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 4.77e-02 0.184 0.0922 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0287 0.0803 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00276 0.0709 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 49450 sc-eQTL 4.99e-02 -0.141 0.0713 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 9.62e-02 -0.0797 0.0477 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 1.55e-01 0.12 0.0843 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 2.64e-03 -0.188 0.0618 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 9.16e-01 0.00822 0.0779 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0679 0.0986 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0449 0.0814 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00542 0.0798 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 49450 sc-eQTL 8.08e-02 -0.133 0.076 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 8.63e-02 -0.089 0.0516 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 1.62e-01 -0.132 0.0942 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 1.29e-02 -0.187 0.0746 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0217 0.0818 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 7.87e-01 0.0265 0.0978 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 1.45e-01 0.14 0.0957 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 8.82e-01 0.014 0.0943 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 8.06e-01 0.0207 0.0841 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0444 0.0861 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0363 0.0919 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 3.16e-01 0.0815 0.081 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0931 0.0762 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 7.39e-01 0.0226 0.0678 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 3.28e-01 0.053 0.054 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 4.74e-02 -0.115 0.0575 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 9.10e-01 0.0072 0.0636 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 3.33e-01 0.057 0.0587 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 2.92e-01 0.0712 0.0674 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 7.99e-02 0.168 0.0957 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 5.87e-01 0.0423 0.0777 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 7.67e-01 0.0204 0.0688 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 1.43e-01 -0.0835 0.0568 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 3.75e-02 0.158 0.0757 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0577 0.0723 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00943 0.0807 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 2.38e-01 0.113 0.0954 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 4.24e-01 -0.073 0.0911 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 3.92e-02 0.156 0.0752 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 1.70e-02 -0.182 0.0758 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 5.80e-01 0.0477 0.086 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0518 0.0899 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 2.47e-01 0.103 0.0883 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 4.25e-01 0.0847 0.106 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 7.67e-01 0.0241 0.0813 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 9.99e-01 0.000106 0.079 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 2.92e-02 0.19 0.0865 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 2.01e-01 0.0973 0.0759 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 1.82e-01 -0.123 0.0916 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 5.95e-02 0.163 0.0858 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 5.39e-01 -0.059 0.0959 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0822 0.0826 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 4.75e-01 0.0476 0.0665 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0834 0.0636 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0468 0.0887 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0268 0.0796 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 4.81e-01 0.0611 0.0866 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 9.24e-01 0.00996 0.105 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0889 0.0959 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 2.66e-01 -0.101 0.0901 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0371 0.0945 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0362 0.0966 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 5.17e-01 0.0567 0.0874 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0523 0.0884 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0313 0.1 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 1.01e-01 0.157 0.0954 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 9.16e-01 0.0104 0.0982 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 3.27e-01 0.0905 0.0921 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 4.73e-01 0.0624 0.0868 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 7.64e-01 0.0288 0.0958 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0699 0.0866 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0475 0.101 0.284 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 8.73e-01 0.0144 0.09 0.284 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0176 0.0862 0.284 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0658 0.0812 0.284 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 4.15e-02 0.182 0.0885 0.284 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0633 0.0905 0.284 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0358 0.0933 0.284 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 8.39e-01 0.021 0.103 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -991858 sc-eQTL 3.08e-02 0.173 0.0797 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 4.13e-02 -0.177 0.0861 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 1.72e-01 0.125 0.091 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 5.44e-04 0.308 0.0875 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 9.61e-01 -0.0043 0.0876 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 5.74e-01 -0.051 0.0905 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 6.48e-01 0.0408 0.0892 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 8.64e-01 0.0168 0.0977 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -991858 sc-eQTL 6.41e-01 0.0401 0.0859 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 4.12e-01 0.0593 0.0722 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 5.37e-01 0.0458 0.0741 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 7.14e-03 0.211 0.0777 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 5.34e-01 0.0437 0.0703 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 2.45e-01 -0.115 0.0988 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 2.49e-01 0.0942 0.0815 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0267 0.105 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -991858 sc-eQTL 9.31e-01 0.00721 0.0835 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0764 0.0937 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0189 0.0915 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 1.09e-03 0.282 0.085 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 9.01e-01 0.0123 0.0984 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 8.34e-01 0.0195 0.0929 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 4.60e-01 0.0665 0.0897 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0304 0.095 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -991858 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00668 0.0859 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0988 0.0739 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0884 0.08 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 1.09e-04 0.336 0.0852 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 4.77e-02 0.149 0.0746 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 3.34e-01 0.0904 0.0934 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 4.75e-01 0.0623 0.087 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 3.52e-01 -0.113 0.12 0.256 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0662 0.14 0.256 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 6.74e-02 0.222 0.12 0.256 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 49450 sc-eQTL 9.59e-01 0.00579 0.114 0.256 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 9.96e-02 0.133 0.0801 0.256 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0132 0.125 0.256 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0887 0.111 0.256 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00855 0.118 0.256 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 3.91e-01 0.0648 0.0754 0.283 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 6.78e-02 -0.175 0.0951 0.283 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 3.00e-01 0.0927 0.0892 0.283 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 1.60e-01 0.0899 0.0639 0.283 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 9.42e-01 0.0069 0.0941 0.283 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 5.00e-01 0.0605 0.0896 0.283 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 9.64e-01 0.00374 0.0825 0.283 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 1.94e-01 0.129 0.0987 0.282 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0112 0.0959 0.282 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0412 0.0767 0.282 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 9.74e-01 0.00284 0.0879 0.282 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 7.07e-01 0.0357 0.0949 0.282 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 4.98e-01 0.0607 0.0895 0.282 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 1.32e-01 0.135 0.089 0.282 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0558 0.0995 0.288 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 2.64e-01 -0.12 0.107 0.288 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 7.18e-01 0.0334 0.0925 0.288 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 2.62e-01 0.0728 0.0647 0.288 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 6.91e-01 0.0374 0.0939 0.288 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -636530 sc-eQTL 4.19e-01 0.0674 0.0832 0.288 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -733191 sc-eQTL 3.94e-01 0.0698 0.0817 0.288 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 2.34e-02 -0.199 0.0869 0.288 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 3.30e-01 0.078 0.0798 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 4.27e-01 0.0709 0.0891 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 7.78e-02 -0.106 0.06 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 8.82e-01 0.00785 0.053 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -135723 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0608 0.0998 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 9.63e-01 0.00375 0.0816 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -636530 sc-eQTL 6.54e-01 0.0454 0.101 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -733191 sc-eQTL 7.77e-02 0.157 0.0887 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 9.96e-02 0.137 0.0828 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 4.91e-01 0.0579 0.0838 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0468 0.0991 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 8.56e-01 0.013 0.0717 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 1.15e-01 -0.0866 0.0548 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -135723 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0636 0.0951 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0721 0.0858 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -636530 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0222 0.101 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -733191 sc-eQTL 4.97e-01 0.0556 0.0818 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 4.94e-01 0.0563 0.0821 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 3.30e-01 0.118 0.121 0.297 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 6.87e-01 0.0421 0.104 0.297 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 2.29e-01 -0.129 0.107 0.297 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 1.67e-01 0.161 0.116 0.297 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0288 0.107 0.297 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0816 0.108 0.297 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 1.46e-01 0.152 0.104 0.297 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 3.34e-01 0.0892 0.0922 0.287 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 4.80e-01 0.0703 0.0992 0.287 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00464 0.0843 0.287 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 5.43e-01 0.0403 0.0661 0.287 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -135723 sc-eQTL 1.03e-01 -0.147 0.09 0.287 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 4.62e-01 -0.07 0.095 0.287 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -636530 sc-eQTL 9.68e-01 0.00383 0.0948 0.287 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -733191 sc-eQTL 3.38e-01 0.086 0.0896 0.287 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 7.51e-01 0.0285 0.0898 0.287 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 7.95e-02 0.153 0.0866 0.278 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 6.98e-01 0.0362 0.0931 0.278 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 7.80e-02 -0.134 0.0755 0.278 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0162 0.0691 0.278 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -135723 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0555 0.0774 0.278 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0424 0.0888 0.278 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -636530 sc-eQTL 3.01e-01 0.0874 0.0843 0.278 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -733191 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0404 0.0844 0.278 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 2.29e-01 -0.105 0.0873 0.278 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0961 0.0958 0.305 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 7.97e-02 0.184 0.104 0.305 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 2.82e-01 0.0941 0.0871 0.305 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 1.49e-01 0.117 0.0807 0.305 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 9.38e-01 0.00824 0.105 0.305 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -636530 sc-eQTL 7.88e-01 0.0265 0.0985 0.305 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -733191 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0624 0.0764 0.305 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 8.94e-01 -0.012 0.09 0.305 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 1.38e-01 0.146 0.0981 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 7.68e-01 0.0243 0.0821 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0693 0.0726 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 49450 sc-eQTL 1.80e-01 -0.111 0.0826 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 1.48e-03 -0.164 0.0509 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0123 0.0863 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0568 0.0688 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 1.65e-01 -0.104 0.0748 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 3.88e-01 0.0784 0.0906 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0416 0.0717 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 5.55e-01 0.0401 0.0678 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 49450 sc-eQTL 6.07e-03 -0.178 0.0642 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 1.18e-01 -0.0719 0.0457 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 8.37e-01 0.0173 0.084 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 1.14e-05 -0.255 0.0567 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 8.42e-01 0.0141 0.0706 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 3.60e-01 0.0697 0.0761 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 7.52e-01 0.0273 0.0863 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0712 0.0548 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0223 0.0484 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -135723 sc-eQTL 3.16e-01 -0.099 0.0985 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0491 0.0693 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -636530 sc-eQTL 8.12e-01 0.0242 0.102 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -733191 sc-eQTL 4.61e-02 0.166 0.0825 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 9.86e-02 0.129 0.0775 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 9.54e-02 0.138 0.0825 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 7.13e-01 0.0335 0.0909 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0554 0.0744 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00214 0.0596 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -135723 sc-eQTL 2.08e-01 -0.11 0.0867 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0538 0.079 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -636530 sc-eQTL 9.27e-01 0.00833 0.0903 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -733191 sc-eQTL 2.09e-01 0.108 0.0853 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 8.07e-01 -0.021 0.0858 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0435 0.093 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -991858 sc-eQTL 6.69e-01 0.0339 0.0792 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0252 0.0635 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -292956 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0433 0.0696 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 sc-eQTL 8.05e-04 0.258 0.0758 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -871861 sc-eQTL 9.48e-02 0.0986 0.0587 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0605 0.0897 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 41342 sc-eQTL 1.78e-01 0.104 0.0771 0.28 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000060688 SNRNP40 -523753 eQTL 0.0535 -0.0354 0.0183 0.00113 0.0 0.282
ENSG00000121766 ZCCHC17 -523947 eQTL 3.93e-02 -0.0397 0.0192 0.0 0.0 0.282
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 eQTL 6.62e-27 0.113 0.0102 0.0 0.0 0.282
ENSG00000162512 SDC3 -135723 eQTL 0.0341 -0.0566 0.0267 0.0 0.0 0.282
ENSG00000186056 MATN1-AS1 54531 eQTL 1.81e-04 -0.051 0.0136 0.00357 0.0 0.282

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000134644 \N -292956 1.2e-06 2.17e-07 6.42e-08 2.87e-07 1.03e-07 2.67e-07 2.74e-07 5.53e-08 1.85e-07 1.05e-07 1.61e-07 1.23e-07 2.94e-07 8.42e-08 9.12e-08 7.98e-08 4.45e-08 2.43e-07 8.68e-08 8.69e-08 1.33e-07 1.9e-07 1.75e-07 3.58e-08 2.28e-07 1.26e-07 1.23e-07 1.36e-07 1.34e-07 1.36e-07 1.35e-07 5.46e-08 5.2e-08 1.03e-07 1.33e-07 3.05e-08 5.96e-08 8.57e-08 5.27e-08 7.77e-08 8.68e-08 1.55e-07 3.25e-08 7.3e-09 5.84e-08 1.71e-08 7.12e-08 2.8e-09 5.16e-08
ENSG00000162511 LAPTM5 15261 0.000103 1.48e-05 2.64e-06 7.6e-06 2.58e-06 1.34e-05 1.81e-05 1.85e-06 1.42e-05 6.01e-06 1.39e-05 5.88e-06 2.26e-05 4.48e-06 4.05e-06 8.95e-06 6.49e-06 1.52e-05 3.37e-06 2.79e-06 6.51e-06 1.7e-05 1.11e-05 3.7e-06 1.67e-05 4.33e-06 6.94e-06 5e-06 1.45e-05 1.03e-05 8.88e-06 9.89e-07 1.34e-06 3.78e-06 4.54e-06 2.21e-06 1.73e-06 1.89e-06 2.35e-06 1.26e-06 1.02e-06 1.45e-05 2.66e-06 1.96e-07 8.86e-07 1.49e-06 1.76e-06 7.04e-07 4.32e-07