logo

Genes within 1Mb (chr1:30770747:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 3.78e-01 0.0744 0.0841 0.284 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0279 0.0675 0.284 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00237 0.0566 0.284 B L1
ENSG00000162510 MATN1 47162 sc-eQTL 2.12e-03 -0.181 0.0582 0.284 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 3.34e-02 -0.0988 0.0461 0.284 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0171 0.0704 0.284 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 4.83e-04 -0.188 0.0531 0.284 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00516 0.0647 0.284 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 6.41e-01 0.0338 0.0724 0.284 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 6.61e-01 0.0249 0.0566 0.284 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 3.15e-01 0.0506 0.0503 0.284 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 4.55e-02 -0.111 0.0553 0.284 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 4.77e-01 0.0415 0.0583 0.284 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 5.47e-01 0.0301 0.0499 0.284 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 1.84e-01 0.0795 0.0596 0.284 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 4.56e-01 0.0714 0.0956 0.284 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0317 0.0636 0.284 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 3.62e-01 0.0512 0.056 0.284 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 9.41e-01 0.00401 0.0545 0.284 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 2.50e-01 0.0771 0.0669 0.284 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0413 0.0638 0.284 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 8.90e-01 0.0111 0.0802 0.284 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 3.09e-01 -0.087 0.0853 0.282 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000399 0.101 0.282 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 2.96e-01 0.0829 0.0791 0.282 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 3.70e-02 0.118 0.056 0.282 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 6.59e-01 0.0406 0.0918 0.282 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -638818 sc-eQTL 9.66e-01 0.00399 0.0934 0.282 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -735479 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00205 0.0619 0.282 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 9.99e-02 -0.147 0.089 0.282 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 1.70e-01 0.0911 0.0661 0.284 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 4.01e-01 0.0691 0.0822 0.284 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 1.38e-01 -0.0781 0.0525 0.284 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0095 0.0485 0.284 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -138011 sc-eQTL 1.13e-01 -0.147 0.0927 0.284 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0399 0.0654 0.284 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -638818 sc-eQTL 6.43e-01 0.0464 0.1 0.284 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -735479 sc-eQTL 1.22e-01 0.136 0.0877 0.284 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 2.18e-01 0.0948 0.0768 0.284 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0315 0.0916 0.283 NK L1
ENSG00000121753 ADGRB2 -994146 sc-eQTL 3.34e-01 0.0762 0.0787 0.283 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0406 0.0627 0.283 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0048 0.0658 0.283 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 4.71e-04 0.261 0.0736 0.283 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 2.29e-01 0.0665 0.0551 0.283 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0557 0.085 0.283 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 1.25e-01 0.12 0.0781 0.283 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00425 0.0688 0.284 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 2.77e-01 -0.08 0.0733 0.284 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0318 0.0661 0.284 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0303 0.0542 0.284 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 1.00e-01 0.119 0.0719 0.284 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0366 0.0887 0.284 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0255 0.0924 0.284 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 8.98e-01 0.0141 0.109 0.273 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0281 0.11 0.273 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 5.48e-02 -0.196 0.102 0.273 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 47162 sc-eQTL 7.42e-02 -0.16 0.0888 0.273 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 1.33e-02 -0.154 0.0614 0.273 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 7.45e-01 0.0346 0.106 0.273 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 7.22e-01 -0.036 0.101 0.273 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 9.37e-01 0.00709 0.0893 0.273 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 1.91e-01 0.135 0.103 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 3.10e-01 0.0874 0.0859 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0332 0.0812 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 47162 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0569 0.0844 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0599 0.0517 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0411 0.0963 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 6.68e-01 0.0313 0.0728 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0839 0.0812 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 3.72e-01 0.0886 0.099 0.287 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 2.93e-01 -0.096 0.0911 0.287 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0854 0.0793 0.287 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 47162 sc-eQTL 9.32e-01 0.00647 0.0761 0.287 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 3.05e-04 -0.24 0.0653 0.287 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 7.77e-01 0.0255 0.09 0.287 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0664 0.077 0.287 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 8.74e-02 -0.154 0.0897 0.287 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 4.80e-02 0.182 0.0913 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0297 0.0796 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00296 0.0702 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 47162 sc-eQTL 5.92e-02 -0.134 0.0707 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 8.44e-02 -0.0819 0.0473 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 1.28e-01 0.127 0.0835 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 2.83e-03 -0.185 0.0612 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 8.79e-01 0.0118 0.0772 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0715 0.0977 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0433 0.0807 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00777 0.0791 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 47162 sc-eQTL 7.62e-02 -0.134 0.0753 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 8.88e-02 -0.0875 0.0512 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 1.47e-01 -0.136 0.0933 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 1.72e-02 -0.178 0.074 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0208 0.0811 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 8.44e-01 0.0191 0.0968 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 1.95e-01 0.123 0.0948 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 9.39e-01 0.00713 0.0934 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 7.83e-01 0.023 0.0833 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0486 0.0853 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 6.53e-01 -0.041 0.091 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 2.48e-01 0.0929 0.0801 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0898 0.0756 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 7.25e-01 0.0236 0.0672 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 3.61e-01 0.049 0.0536 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 3.27e-02 -0.122 0.0569 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 9.57e-01 0.00341 0.0631 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 2.97e-01 0.0608 0.0582 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 2.72e-01 0.0736 0.0668 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 7.72e-02 0.168 0.0949 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 5.61e-01 0.0449 0.077 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 6.65e-01 0.0296 0.0682 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 1.01e-01 -0.0926 0.0562 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 5.53e-02 0.145 0.0752 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0562 0.0717 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0179 0.08 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 2.21e-01 0.116 0.0945 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0682 0.0903 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 2.74e-02 0.165 0.0745 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 1.16e-02 -0.191 0.075 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 5.88e-01 0.0463 0.0853 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0451 0.0891 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 2.19e-01 0.108 0.0875 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 4.44e-01 0.0804 0.105 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 5.98e-01 0.0424 0.0804 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0129 0.0781 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 4.10e-02 0.176 0.0857 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 2.03e-01 0.0958 0.0751 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 2.06e-01 -0.115 0.0906 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 8.08e-02 0.149 0.085 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0384 0.095 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0839 0.0817 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 6.17e-01 0.033 0.0659 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 1.30e-01 -0.0955 0.0629 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0531 0.0878 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0357 0.0789 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 4.40e-01 0.0664 0.0858 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 8.50e-01 0.0196 0.104 0.294 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0668 0.0951 0.294 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 2.40e-01 -0.105 0.0892 0.294 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0287 0.0936 0.294 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 8.10e-01 -0.023 0.0957 0.294 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 4.23e-01 0.0695 0.0866 0.294 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0608 0.0875 0.294 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0251 0.0993 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 1.42e-01 0.14 0.0947 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 8.07e-01 0.0238 0.0973 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 3.35e-01 0.0882 0.0913 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 3.53e-01 0.0801 0.086 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 6.98e-01 0.0369 0.095 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0718 0.0858 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0494 0.1 0.286 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 9.12e-01 0.00988 0.0891 0.286 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00985 0.0854 0.286 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0801 0.0803 0.286 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 3.47e-02 0.186 0.0875 0.286 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0471 0.0896 0.286 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0429 0.0924 0.286 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 8.64e-01 0.0175 0.102 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -994146 sc-eQTL 2.30e-02 0.181 0.0789 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 4.22e-02 -0.175 0.0854 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 1.91e-01 0.118 0.0902 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 1.07e-03 0.289 0.087 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00538 0.0868 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0497 0.0897 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 7.20e-01 0.0318 0.0884 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 8.85e-01 0.014 0.0967 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -994146 sc-eQTL 5.66e-01 0.0489 0.085 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 3.55e-01 0.0662 0.0714 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 5.65e-01 0.0423 0.0733 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 8.53e-03 0.204 0.077 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 5.07e-01 0.0462 0.0695 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 2.44e-01 -0.114 0.0977 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 2.42e-01 0.0947 0.0806 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0133 0.104 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -994146 sc-eQTL 7.90e-01 0.022 0.0826 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0752 0.0927 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0219 0.0905 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 1.59e-03 0.27 0.0842 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 9.95e-01 0.00059 0.0973 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 7.58e-01 0.0284 0.0919 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 3.60e-01 0.0814 0.0887 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 7.58e-01 -0.029 0.0941 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000121753 ADGRB2 -994146 sc-eQTL 9.66e-01 0.00362 0.085 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0957 0.0732 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0919 0.0792 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 1.34e-04 0.329 0.0844 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 6.43e-02 0.137 0.0739 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 3.11e-01 0.0938 0.0925 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 4.90e-01 0.0595 0.0861 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0832 0.119 0.259 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 6.96e-01 -0.054 0.138 0.259 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 4.27e-02 0.241 0.118 0.259 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 47162 sc-eQTL 7.42e-01 0.0368 0.112 0.259 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 1.42e-01 0.117 0.079 0.259 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 9.39e-01 0.00945 0.123 0.259 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0843 0.109 0.259 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0286 0.116 0.259 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 4.62e-01 0.0552 0.0748 0.285 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 9.59e-02 -0.158 0.0944 0.285 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 2.59e-01 0.1 0.0884 0.285 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 2.08e-01 0.08 0.0634 0.285 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 8.95e-01 0.0124 0.0933 0.285 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 5.49e-01 0.0533 0.0888 0.285 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00337 0.0818 0.285 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 2.19e-01 0.121 0.0979 0.284 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0111 0.0951 0.284 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0384 0.076 0.284 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 8.55e-01 -0.016 0.0871 0.284 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 8.05e-01 0.0233 0.0941 0.284 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 5.58e-01 0.052 0.0887 0.284 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 1.03e-01 0.144 0.0881 0.284 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0558 0.0995 0.288 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 2.64e-01 -0.12 0.107 0.288 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 7.18e-01 0.0334 0.0925 0.288 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 2.62e-01 0.0728 0.0647 0.288 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 6.91e-01 0.0374 0.0939 0.288 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -638818 sc-eQTL 4.19e-01 0.0674 0.0832 0.288 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -735479 sc-eQTL 3.94e-01 0.0698 0.0817 0.288 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 2.34e-02 -0.199 0.0869 0.288 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 3.52e-01 0.0737 0.0791 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 3.66e-01 0.0799 0.0882 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 6.19e-02 -0.111 0.0593 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 7.40e-01 0.0175 0.0525 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -138011 sc-eQTL 5.99e-01 -0.052 0.0989 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00889 0.0808 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -638818 sc-eQTL 6.15e-01 0.0503 0.1 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -735479 sc-eQTL 6.45e-02 0.163 0.0878 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 8.01e-02 0.144 0.082 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 6.00e-01 0.0437 0.0831 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0369 0.0982 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 9.97e-01 0.000269 0.071 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 1.40e-01 -0.0805 0.0543 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -138011 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0691 0.0942 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0704 0.085 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -638818 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0215 0.0998 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -735479 sc-eQTL 5.53e-01 0.0482 0.081 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 6.04e-01 0.0423 0.0814 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 3.93e-01 0.102 0.119 0.3 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 7.88e-01 0.0278 0.103 0.3 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 2.72e-01 -0.116 0.106 0.3 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 2.60e-01 0.13 0.115 0.3 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0363 0.105 0.3 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0827 0.106 0.3 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 1.16e-01 0.162 0.102 0.3 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 3.28e-01 0.0897 0.0915 0.289 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 3.67e-01 0.0889 0.0984 0.289 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00821 0.0836 0.289 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 4.43e-01 0.0503 0.0655 0.289 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -138011 sc-eQTL 8.52e-02 -0.154 0.0892 0.289 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0618 0.0943 0.289 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -638818 sc-eQTL 9.49e-01 0.00608 0.094 0.289 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -735479 sc-eQTL 3.58e-01 0.0819 0.0889 0.289 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 7.41e-01 0.0295 0.0891 0.289 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 8.24e-02 0.15 0.0858 0.281 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 5.57e-01 0.0541 0.0921 0.281 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 7.35e-02 -0.134 0.0747 0.281 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0192 0.0684 0.281 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -138011 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0602 0.0765 0.281 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0462 0.0879 0.281 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -638818 sc-eQTL 3.34e-01 0.0809 0.0835 0.281 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -735479 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0405 0.0835 0.281 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 1.95e-01 -0.112 0.0863 0.281 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0961 0.0958 0.305 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 7.97e-02 0.184 0.104 0.305 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 2.82e-01 0.0941 0.0871 0.305 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 1.49e-01 0.117 0.0807 0.305 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 9.38e-01 0.00824 0.105 0.305 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -638818 sc-eQTL 7.88e-01 0.0265 0.0985 0.305 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -735479 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0624 0.0764 0.305 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 8.94e-01 -0.012 0.09 0.305 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 1.53e-01 0.139 0.0972 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 8.20e-01 0.0185 0.0813 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0757 0.0719 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 47162 sc-eQTL 1.72e-01 -0.112 0.0818 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 1.63e-03 -0.161 0.0504 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00889 0.0855 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0544 0.0682 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0963 0.0741 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 3.82e-01 0.0786 0.0897 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0433 0.071 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 5.73e-01 0.0379 0.0671 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 47162 sc-eQTL 7.16e-03 -0.173 0.0636 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 1.08e-01 -0.073 0.0453 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 7.97e-01 0.0215 0.0832 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 1.48e-05 -0.25 0.0563 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 8.37e-01 0.0144 0.0699 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 4.16e-01 0.0615 0.0754 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 6.73e-01 0.0361 0.0855 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 1.51e-01 -0.0783 0.0543 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0156 0.0479 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -138011 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0962 0.0976 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0557 0.0687 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -638818 sc-eQTL 7.75e-01 0.0289 0.101 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -735479 sc-eQTL 3.93e-02 0.169 0.0817 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 9.42e-02 0.129 0.0767 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 9.07e-02 0.139 0.0817 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 5.48e-01 0.0541 0.0899 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0581 0.0736 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00358 0.059 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -138011 sc-eQTL 1.91e-01 -0.113 0.0858 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0535 0.0782 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -638818 sc-eQTL 9.96e-01 0.000409 0.0893 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -735479 sc-eQTL 2.12e-01 0.106 0.0845 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0322 0.0849 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0417 0.092 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121753 ADGRB2 -994146 sc-eQTL 5.56e-01 0.0462 0.0783 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -526235 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0192 0.0629 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -295244 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0459 0.0688 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 sc-eQTL 9.80e-04 0.251 0.075 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -874149 sc-eQTL 1.08e-01 0.0937 0.0581 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0555 0.0887 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 39054 sc-eQTL 1.77e-01 0.103 0.0763 0.282 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000060688 SNRNP40 -526041 eQTL 0.0484 -0.036 0.0182 0.00121 0.0 0.285
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 eQTL 7.040000000000001e-27 0.113 0.0102 0.0 0.0 0.285
ENSG00000162512 SDC3 -138011 eQTL 0.0471 -0.0528 0.0265 0.0 0.0 0.285
ENSG00000186056 MATN1-AS1 52243 eQTL 2.30e-04 -0.0499 0.0135 0.00292 0.0 0.285

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000134644 \N -295244 1.26e-06 3.12e-07 1.14e-07 4.39e-07 1.06e-07 1.64e-07 5.13e-07 7.12e-08 3.17e-07 2.12e-07 6.56e-07 3.08e-07 6.47e-07 8.55e-08 1.68e-07 1.49e-07 9.3e-08 3.44e-07 2.6e-07 2.68e-07 1.68e-07 3.15e-07 2.48e-07 1.78e-07 4.67e-07 1.94e-07 2.43e-07 2.7e-07 2.57e-07 3.93e-07 3.32e-07 5.25e-08 9.26e-08 1.17e-07 3.34e-07 7.57e-08 1.07e-07 1.03e-07 4.9e-08 5.96e-08 1.91e-07 2.74e-07 5.58e-08 1.31e-07 1.8e-07 1.91e-08 1.03e-07 3.84e-08 1.93e-07
ENSG00000162511 LAPTM5 12973 3.63e-05 3.01e-05 5.89e-06 1.45e-05 5.6e-06 1.34e-05 4.22e-05 4.28e-06 2.88e-05 1.42e-05 3.59e-05 1.59e-05 4.4e-05 1.23e-05 6.78e-06 1.72e-05 1.55e-05 2.37e-05 7.41e-06 6.54e-06 1.4e-05 2.99e-05 2.89e-05 8.47e-06 3.87e-05 7.81e-06 1.38e-05 1.19e-05 3.04e-05 2.28e-05 1.87e-05 1.58e-06 2.56e-06 6.6e-06 1.11e-05 5.34e-06 2.85e-06 3.17e-06 4.35e-06 3.2e-06 1.7e-06 3.42e-05 3.64e-06 3.73e-07 2.49e-06 3.47e-06 4.09e-06 1.6e-06 1.5e-06