logo

Genes within 1Mb (chr1:30758538:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 5.49e-01 0.0787 0.131 0.098 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0451 0.105 0.098 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 7.22e-01 0.0314 0.0881 0.098 B L1
ENSG00000162510 MATN1 34953 sc-eQTL 3.16e-02 0.198 0.0916 0.098 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 7.91e-01 0.0192 0.0725 0.098 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0331 0.109 0.098 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0728 0.0848 0.098 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 1.07e-02 -0.255 0.099 0.098 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0788 0.114 0.098 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 6.44e-01 0.0412 0.089 0.098 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0152 0.0793 0.098 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0118 0.0878 0.098 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0691 0.0917 0.098 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 1.10e-01 -0.125 0.0781 0.098 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 4.38e-01 -0.073 0.094 0.098 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 4.33e-01 -0.117 0.149 0.098 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 8.47e-01 0.0192 0.0995 0.098 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0683 0.0875 0.098 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0891 0.0849 0.098 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0752 0.105 0.098 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 9.91e-02 -0.164 0.0991 0.098 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0471 0.125 0.098 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000369 0.133 0.097 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 2.77e-01 0.171 0.157 0.097 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 8.75e-01 0.0194 0.124 0.097 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 2.48e-01 0.102 0.088 0.097 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 1.21e-01 -0.221 0.142 0.097 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -651027 sc-eQTL 3.30e-02 0.309 0.144 0.097 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -747688 sc-eQTL 2.94e-01 -0.101 0.0961 0.097 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 8.64e-01 -0.024 0.14 0.097 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 2.47e-01 0.118 0.101 0.098 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 3.57e-01 -0.116 0.126 0.098 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0136 0.0808 0.098 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 8.38e-01 0.0152 0.0743 0.098 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -150220 sc-eQTL 1.90e-01 -0.187 0.142 0.098 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 1.95e-01 0.13 0.0999 0.098 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -651027 sc-eQTL 5.73e-01 0.0866 0.153 0.098 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -747688 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0625 0.135 0.098 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 4.72e-02 -0.234 0.117 0.098 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0576 0.143 0.099 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 7.67e-01 0.0291 0.098 0.099 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 8.91e-01 0.0141 0.103 0.099 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 3.07e-01 -0.121 0.118 0.099 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0831 0.0862 0.099 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 6.81e-01 0.0548 0.133 0.099 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 2.56e-01 -0.139 0.122 0.099 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 1.43e-01 -0.161 0.109 0.098 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 9.00e-01 0.0147 0.117 0.098 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 4.44e-01 0.0809 0.105 0.098 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 1.88e-01 -0.114 0.0862 0.098 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 8.04e-02 -0.202 0.115 0.098 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 3.64e-01 -0.129 0.141 0.098 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 2.05e-01 0.187 0.147 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 4.39e-01 0.13 0.168 0.099 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 9.06e-01 0.0201 0.169 0.099 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 7.14e-01 0.0578 0.157 0.099 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 34953 sc-eQTL 3.61e-03 0.396 0.134 0.099 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 8.91e-01 0.0132 0.096 0.099 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0799 0.163 0.099 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0924 0.155 0.099 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0489 0.137 0.099 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 3.30e-01 0.155 0.159 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0328 0.132 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0772 0.125 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 34953 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00312 0.13 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 1.56e-01 -0.113 0.0795 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 2.08e-01 -0.186 0.148 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0682 0.112 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 2.47e-01 -0.145 0.125 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 6.22e-01 0.0762 0.154 0.097 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 2.52e-01 0.163 0.142 0.097 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 2.56e-02 0.275 0.122 0.097 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 34953 sc-eQTL 8.51e-01 0.0223 0.118 0.097 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 7.22e-01 0.0374 0.105 0.097 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 3.00e-01 -0.145 0.14 0.097 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0563 0.12 0.097 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0204 0.141 0.097 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0813 0.142 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0617 0.123 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 8.53e-01 -0.02 0.108 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 34953 sc-eQTL 1.87e-01 0.145 0.109 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0301 0.0733 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 9.44e-01 0.00916 0.129 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0557 0.0963 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 7.23e-03 -0.317 0.117 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 5.71e-01 0.0861 0.152 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 9.92e-01 0.00119 0.125 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0237 0.123 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 34953 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0161 0.118 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0885 0.0797 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00722 0.145 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 5.82e-01 0.0641 0.116 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 4.47e-02 -0.251 0.124 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 6.88e-01 0.0596 0.148 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 1.88e-01 0.192 0.145 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0548 0.143 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 1.85e-01 -0.169 0.127 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0223 0.131 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 6.91e-01 0.0555 0.139 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 1.70e-01 -0.169 0.122 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 4.66e-01 0.0858 0.117 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00157 0.104 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0698 0.0831 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0501 0.0891 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0909 0.0976 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0479 0.0905 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 7.90e-02 -0.182 0.103 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 1.55e-01 -0.214 0.15 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 6.09e-01 0.0621 0.121 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 6.89e-01 0.043 0.107 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 1.96e-01 0.115 0.0886 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00945 0.119 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 1.28e-01 -0.172 0.112 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 7.89e-01 0.0337 0.126 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0263 0.146 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0793 0.139 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 2.73e-01 -0.127 0.116 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0961 0.117 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 5.83e-01 0.0723 0.131 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 4.53e-01 -0.103 0.137 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0883 0.135 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 1.96e-01 -0.206 0.159 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 5.87e-01 0.0665 0.122 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0182 0.119 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 6.31e-02 -0.243 0.13 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0401 0.114 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0302 0.138 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 3.68e-01 -0.117 0.13 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 7.82e-01 0.0407 0.147 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 4.92e-01 0.0871 0.127 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0705 0.102 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 2.53e-01 -0.112 0.0974 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 4.10e-01 -0.112 0.136 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00375 0.122 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 5.62e-01 -0.077 0.133 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 7.43e-01 0.0542 0.165 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0169 0.151 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 2.35e-01 0.169 0.142 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 4.00e-01 -0.126 0.149 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 7.07e-01 0.0573 0.152 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0616 0.138 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 2.78e-01 -0.151 0.139 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 3.00e-01 -0.155 0.149 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 6.65e-01 -0.062 0.143 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00355 0.146 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 6.41e-01 0.0642 0.138 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 7.91e-01 0.0343 0.13 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 8.89e-01 0.02 0.143 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 2.86e-01 -0.138 0.129 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 6.99e-01 0.0599 0.155 0.1 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 3.31e-01 -0.134 0.137 0.1 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0213 0.132 0.1 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 2.25e-01 -0.151 0.124 0.1 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 5.73e-01 -0.077 0.136 0.1 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 1.73e-01 -0.188 0.138 0.1 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 2.99e-01 0.148 0.142 0.1 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 3.73e-01 0.139 0.156 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0348 0.132 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 7.31e-01 0.0476 0.138 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 1.19e-01 -0.212 0.136 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000813 0.133 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 7.14e-01 0.0502 0.137 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0431 0.135 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 2.79e-01 0.164 0.151 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 5.81e-01 -0.062 0.112 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 8.17e-01 0.0267 0.115 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 5.31e-01 -0.077 0.123 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 3.25e-01 -0.108 0.109 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 4.53e-01 0.115 0.154 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 2.05e-01 -0.161 0.126 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0638 0.157 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0292 0.14 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 2.94e-01 -0.144 0.136 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0534 0.131 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0598 0.147 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 3.33e-01 0.135 0.139 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0386 0.134 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 4.76e-01 -0.104 0.146 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 8.07e-01 0.0279 0.114 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 4.48e-01 0.0934 0.123 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 1.93e-02 -0.315 0.134 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 5.82e-01 0.0636 0.115 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0623 0.144 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 3.68e-01 -0.12 0.133 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 9.32e-01 -0.016 0.187 0.096 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 3.14e-01 0.219 0.216 0.096 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 2.98e-01 -0.196 0.188 0.096 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 34953 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0509 0.176 0.096 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0214 0.126 0.096 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 2.17e-01 -0.239 0.192 0.096 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0373 0.172 0.096 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0655 0.183 0.096 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0454 0.116 0.096 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0957 0.147 0.096 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 7.82e-01 0.0379 0.137 0.096 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 5.69e-01 0.0561 0.0983 0.096 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 2.65e-01 -0.161 0.144 0.096 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 4.06e-02 0.28 0.136 0.096 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0971 0.126 0.096 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 4.06e-01 -0.125 0.15 0.098 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 1.61e-01 0.204 0.145 0.098 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 6.61e-01 0.0512 0.117 0.098 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 7.70e-01 0.039 0.133 0.098 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 5.30e-01 0.0907 0.144 0.098 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 1.74e-01 -0.184 0.135 0.098 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0896 0.136 0.098 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0441 0.157 0.098 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 3.50e-01 -0.159 0.17 0.098 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 7.48e-01 0.0471 0.146 0.098 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 6.73e-01 0.0433 0.102 0.098 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 4.55e-01 -0.111 0.148 0.098 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -651027 sc-eQTL 1.79e-01 0.176 0.131 0.098 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -747688 sc-eQTL 2.85e-01 -0.138 0.129 0.098 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 6.76e-01 0.058 0.139 0.098 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 2.92e-01 0.13 0.123 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 3.62e-01 -0.126 0.138 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 6.64e-01 0.0405 0.0933 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 8.95e-01 0.0108 0.0819 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -150220 sc-eQTL 4.09e-01 -0.127 0.154 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0655 0.126 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -651027 sc-eQTL 6.38e-01 0.0735 0.156 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -747688 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00708 0.138 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 7.51e-02 -0.229 0.128 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 9.93e-01 0.00108 0.132 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0789 0.156 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0711 0.112 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 8.08e-01 0.0211 0.0865 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -150220 sc-eQTL 4.12e-01 -0.123 0.149 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 9.36e-02 0.226 0.134 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -651027 sc-eQTL 3.33e-01 0.153 0.158 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -747688 sc-eQTL 8.89e-01 0.0179 0.128 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0543 0.129 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 3.17e-01 -0.197 0.197 0.088 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 6.41e-01 0.079 0.169 0.088 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 1.19e-01 0.272 0.173 0.088 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0342 0.19 0.088 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 2.08e-02 -0.398 0.17 0.088 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0827 0.175 0.088 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 5.04e-01 0.114 0.169 0.088 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 7.62e-01 0.045 0.149 0.091 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0164 0.16 0.091 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 8.75e-01 0.0213 0.136 0.091 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0788 0.106 0.091 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -150220 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00071 0.146 0.091 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 4.37e-01 0.119 0.153 0.091 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -651027 sc-eQTL 8.67e-01 0.0255 0.152 0.091 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -747688 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0848 0.144 0.091 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0247 0.144 0.091 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 2.03e-01 -0.17 0.133 0.097 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0381 0.143 0.097 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 3.21e-01 0.116 0.116 0.097 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0445 0.106 0.097 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -150220 sc-eQTL 7.77e-01 0.0336 0.119 0.097 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 1.57e-01 0.192 0.135 0.097 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -651027 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0169 0.129 0.097 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -747688 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0745 0.129 0.097 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 2.53e-01 -0.153 0.134 0.097 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00519 0.158 0.09 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 8.80e-01 0.0263 0.173 0.09 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 2.50e-01 -0.165 0.143 0.09 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 1.99e-01 0.171 0.133 0.09 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0986 0.173 0.09 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -651027 sc-eQTL 1.71e-01 0.222 0.161 0.09 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -747688 sc-eQTL 3.95e-01 0.107 0.126 0.09 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0366 0.148 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 7.22e-01 0.054 0.151 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 9.57e-01 0.00683 0.126 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 1.74e-01 0.152 0.111 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 34953 sc-eQTL 9.25e-02 0.214 0.127 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0588 0.0799 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0572 0.133 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0442 0.106 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0897 0.115 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 7.18e-01 0.0501 0.139 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0551 0.11 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0233 0.104 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 34953 sc-eQTL 9.82e-02 0.165 0.0993 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0377 0.0703 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0226 0.129 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 8.94e-01 0.0121 0.0909 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 1.70e-03 -0.335 0.105 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 1.92e-01 0.153 0.117 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 4.45e-01 -0.101 0.132 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0175 0.0845 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 7.51e-01 0.0236 0.0743 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -150220 sc-eQTL 3.69e-01 -0.136 0.151 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 3.60e-01 0.0975 0.106 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -651027 sc-eQTL 5.28e-01 0.0985 0.156 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -747688 sc-eQTL 7.72e-01 -0.037 0.128 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 6.34e-02 -0.221 0.119 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0931 0.128 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0219 0.141 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 8.78e-01 0.0177 0.115 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00444 0.0921 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -150220 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0885 0.134 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 2.28e-01 0.147 0.122 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -651027 sc-eQTL 7.08e-01 0.0524 0.139 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -747688 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0837 0.132 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0436 0.133 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -538250 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0196 0.144 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -538444 sc-eQTL 8.12e-01 0.0234 0.0983 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -307453 sc-eQTL 8.76e-01 0.0168 0.108 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 764 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0995 0.12 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -886358 sc-eQTL 1.84e-01 -0.121 0.091 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 40034 sc-eQTL 8.07e-01 0.034 0.139 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 26845 sc-eQTL 2.40e-01 -0.141 0.119 0.099 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162512 SDC3 -150220 eQTL 0.0206 -0.1 0.0432 0.0 0.0 0.0839
ENSG00000168528 SERINC2 -651027 eQTL 0.000502 0.236 0.0676 0.0 0.0 0.0839

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000168528 SERINC2 -651027 2.6e-07 1.16e-07 3.41e-08 1.67e-07 1.03e-07 9.14e-08 1.36e-07 5.29e-08 1.32e-07 3.99e-08 1.59e-07 7.49e-08 1.2e-07 6.1e-08 4.48e-08 7.76e-08 5.2e-08 1.02e-07 4.91e-08 2.93e-08 1.04e-07 1.31e-07 1.31e-07 5.19e-08 1.33e-07 1.03e-07 1.12e-07 8.27e-08 1.05e-07 1.09e-07 9.43e-08 3.29e-08 2.6e-08 8.09e-08 9.51e-08 4.23e-08 4.7e-08 8.75e-08 8.44e-08 3.87e-08 3.18e-08 1.42e-07 4.01e-08 1.1e-08 1.15e-07 1.83e-08 1.5e-07 4.82e-09 4.72e-08