logo

Genes within 1Mb (chr1:30757685:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 4.26e-01 0.104 0.13 0.1 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0486 0.104 0.1 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 6.62e-01 0.0384 0.0876 0.1 B L1
ENSG00000162510 MATN1 34100 sc-eQTL 3.41e-02 0.195 0.0912 0.1 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 8.67e-01 0.0121 0.0722 0.1 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0219 0.109 0.1 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0714 0.0844 0.1 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 1.16e-02 -0.251 0.0986 0.1 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 4.42e-01 -0.087 0.113 0.1 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 7.91e-01 0.0234 0.0884 0.1 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00944 0.0787 0.1 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00716 0.0872 0.1 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0631 0.0911 0.1 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 1.29e-01 -0.118 0.0776 0.1 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0646 0.0933 0.1 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 4.52e-01 -0.112 0.148 0.1 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 7.85e-01 0.027 0.0987 0.1 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0734 0.0868 0.1 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0872 0.0842 0.1 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0597 0.104 0.1 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 1.08e-01 -0.159 0.0983 0.1 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0506 0.124 0.1 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 9.28e-01 -0.012 0.133 0.099 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 3.05e-01 0.161 0.156 0.099 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 8.05e-01 0.0304 0.123 0.099 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 2.47e-01 0.102 0.0875 0.099 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 1.14e-01 -0.225 0.141 0.099 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -651880 sc-eQTL 2.54e-02 0.322 0.143 0.099 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -748541 sc-eQTL 2.85e-01 -0.103 0.0956 0.099 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0225 0.139 0.099 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 2.78e-01 0.11 0.101 0.1 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0845 0.125 0.1 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00269 0.0804 0.1 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 7.97e-01 0.019 0.074 0.1 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -151073 sc-eQTL 2.64e-01 -0.159 0.142 0.1 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 1.92e-01 0.13 0.0993 0.1 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -651880 sc-eQTL 4.51e-01 0.115 0.152 0.1 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -748541 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0699 0.134 0.1 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 3.47e-02 -0.247 0.116 0.1 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0626 0.142 0.101 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 6.48e-01 0.0444 0.0972 0.101 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 9.20e-01 0.0103 0.102 0.101 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 3.03e-01 -0.121 0.117 0.101 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0609 0.0856 0.101 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 6.72e-01 0.0559 0.132 0.101 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 1.99e-01 -0.156 0.121 0.101 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 2.06e-01 -0.137 0.108 0.1 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000961 0.116 0.1 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 4.91e-01 0.072 0.104 0.1 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 1.97e-01 -0.11 0.0853 0.1 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 6.71e-02 -0.209 0.114 0.1 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0859 0.14 0.1 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 2.62e-01 0.164 0.146 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 5.22e-01 0.107 0.166 0.102 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0366 0.168 0.102 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 6.22e-01 0.0771 0.156 0.102 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 34100 sc-eQTL 1.39e-03 0.431 0.133 0.102 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 8.62e-01 0.0166 0.0952 0.102 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0855 0.162 0.102 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 4.24e-01 -0.123 0.153 0.102 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0562 0.136 0.102 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 2.33e-01 0.188 0.158 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0372 0.132 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0674 0.124 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 34100 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0175 0.129 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 1.72e-01 -0.108 0.079 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 2.60e-01 -0.166 0.147 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0788 0.111 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 2.35e-01 -0.148 0.124 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 5.11e-01 0.101 0.153 0.099 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 3.83e-01 0.124 0.141 0.099 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 2.33e-02 0.278 0.122 0.099 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 34100 sc-eQTL 9.94e-01 0.00089 0.118 0.099 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 8.11e-01 0.025 0.104 0.099 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 2.50e-01 -0.16 0.139 0.099 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0609 0.119 0.099 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0231 0.14 0.099 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0624 0.141 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0699 0.122 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0125 0.107 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 34100 sc-eQTL 1.79e-01 0.146 0.109 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0322 0.0728 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 9.20e-01 0.0128 0.128 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0516 0.0956 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 7.11e-03 -0.316 0.116 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 5.08e-01 0.0997 0.15 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 8.10e-01 0.03 0.124 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 9.22e-01 -0.012 0.122 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 34100 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00865 0.117 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0887 0.0791 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 8.59e-01 0.0256 0.144 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 5.23e-01 0.0738 0.115 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 4.20e-02 -0.253 0.124 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 7.78e-01 0.0415 0.147 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 2.35e-01 0.172 0.144 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0728 0.142 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 2.32e-01 -0.151 0.126 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0249 0.13 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 5.80e-01 0.0767 0.138 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 1.14e-01 -0.193 0.121 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 4.89e-01 0.0809 0.117 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 9.97e-01 0.000401 0.104 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0701 0.0826 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0354 0.0887 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0827 0.0971 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0475 0.0899 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 8.11e-02 -0.18 0.103 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 1.49e-01 -0.215 0.148 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 7.56e-01 0.0373 0.12 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 6.28e-01 0.0516 0.106 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 2.20e-01 0.108 0.0879 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00817 0.118 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 1.80e-01 -0.15 0.111 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 7.38e-01 0.0418 0.125 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0372 0.145 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 4.37e-01 -0.108 0.138 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 3.55e-01 -0.107 0.115 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0992 0.116 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 5.43e-01 0.0796 0.131 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 4.47e-01 -0.104 0.136 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0753 0.134 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 1.65e-01 -0.219 0.157 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 5.72e-01 0.0685 0.121 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00616 0.118 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 6.34e-02 -0.241 0.129 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0298 0.113 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0613 0.137 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 3.20e-01 -0.128 0.129 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 6.48e-01 0.0667 0.146 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 4.11e-01 0.104 0.126 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0737 0.101 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 2.92e-01 -0.102 0.0968 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 4.72e-01 -0.097 0.135 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 9.67e-01 0.00507 0.121 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0662 0.132 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 7.59e-01 0.0504 0.164 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0237 0.15 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 2.52e-01 0.162 0.141 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0965 0.148 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 6.65e-01 0.0656 0.151 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0571 0.137 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 2.73e-01 -0.152 0.138 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 3.24e-01 -0.146 0.148 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0683 0.142 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0173 0.145 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 6.19e-01 0.068 0.137 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 7.66e-01 0.0383 0.129 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 8.21e-01 0.0322 0.142 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 3.23e-01 -0.127 0.128 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 6.16e-01 0.0772 0.154 0.102 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 2.90e-01 -0.144 0.136 0.102 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0214 0.131 0.102 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 2.36e-01 -0.146 0.123 0.102 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0948 0.135 0.102 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 2.71e-01 -0.151 0.137 0.102 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 3.59e-01 0.13 0.141 0.102 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 3.26e-01 0.152 0.154 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00388 0.131 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 6.66e-01 0.0594 0.137 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 7.82e-02 -0.238 0.134 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 8.54e-01 0.0242 0.132 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 6.35e-01 0.0647 0.136 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0341 0.134 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 2.86e-01 0.16 0.15 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0556 0.111 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 8.13e-01 0.027 0.114 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0761 0.121 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0879 0.108 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 4.89e-01 0.105 0.152 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 1.63e-01 -0.175 0.125 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0226 0.156 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0331 0.139 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 2.51e-01 -0.156 0.135 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0615 0.13 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0624 0.146 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 4.13e-01 0.113 0.138 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00995 0.133 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 3.84e-01 -0.126 0.144 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 7.03e-01 0.0432 0.113 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 4.51e-01 0.0922 0.122 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 2.26e-02 -0.305 0.133 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 5.52e-01 0.0681 0.114 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0478 0.142 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 2.85e-01 -0.142 0.132 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0423 0.189 0.1 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 2.55e-01 0.249 0.217 0.1 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 3.99e-01 -0.16 0.189 0.1 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 34100 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0577 0.177 0.1 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0296 0.127 0.1 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 1.90e-01 -0.255 0.193 0.1 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0404 0.173 0.1 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0388 0.184 0.1 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0425 0.115 0.098 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 4.38e-01 -0.113 0.146 0.098 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 8.41e-01 0.0273 0.136 0.098 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 7.83e-01 0.027 0.0977 0.098 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 3.19e-01 -0.143 0.143 0.098 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 2.53e-02 0.304 0.135 0.098 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 4.15e-01 -0.102 0.125 0.098 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 3.67e-01 -0.135 0.149 0.1 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 1.17e-01 0.227 0.144 0.1 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 6.45e-01 0.0535 0.116 0.1 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 7.86e-01 0.036 0.133 0.1 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 5.97e-01 0.0759 0.143 0.1 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 1.80e-01 -0.181 0.135 0.1 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0818 0.135 0.1 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0433 0.157 0.1 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 4.37e-01 -0.132 0.169 0.1 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 5.93e-01 0.078 0.145 0.1 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 8.20e-01 0.0233 0.102 0.1 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 4.99e-01 -0.1 0.148 0.1 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -651880 sc-eQTL 1.98e-01 0.169 0.13 0.1 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -748541 sc-eQTL 2.60e-01 -0.145 0.128 0.1 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 6.94e-01 0.0545 0.139 0.1 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 3.51e-01 0.115 0.123 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0997 0.137 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 5.91e-01 0.0498 0.0927 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 8.44e-01 0.016 0.0814 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -151073 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0804 0.153 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0743 0.125 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -651880 sc-eQTL 5.44e-01 0.0942 0.155 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -748541 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000735 0.137 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 5.48e-02 -0.245 0.127 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00264 0.131 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0653 0.155 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0414 0.112 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 6.06e-01 0.0444 0.0858 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -151073 sc-eQTL 4.05e-01 -0.123 0.148 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 8.91e-02 0.227 0.133 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -651880 sc-eQTL 2.48e-01 0.181 0.157 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -748541 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00693 0.128 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0448 0.128 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 3.60e-01 -0.179 0.195 0.091 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 4.93e-01 0.115 0.168 0.091 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 1.55e-01 0.246 0.172 0.091 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 8.96e-01 0.0246 0.188 0.091 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 1.88e-02 -0.402 0.169 0.091 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 5.17e-01 -0.113 0.174 0.091 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 4.94e-01 0.115 0.168 0.091 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 5.84e-01 0.0808 0.147 0.093 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 9.53e-01 0.00937 0.159 0.093 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 9.03e-01 0.0165 0.134 0.093 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 3.99e-01 -0.089 0.105 0.093 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -151073 sc-eQTL 9.19e-01 0.0147 0.144 0.093 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 3.90e-01 0.131 0.152 0.093 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -651880 sc-eQTL 5.92e-01 0.0811 0.151 0.093 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -748541 sc-eQTL 4.80e-01 -0.101 0.143 0.093 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0494 0.143 0.093 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 1.48e-01 -0.192 0.132 0.1 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0124 0.142 0.1 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 3.42e-01 0.11 0.115 0.1 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0706 0.105 0.1 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -151073 sc-eQTL 8.99e-01 0.015 0.118 0.1 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 2.24e-01 0.164 0.135 0.1 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -651880 sc-eQTL 9.61e-01 0.00626 0.129 0.1 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -748541 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0884 0.128 0.1 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 1.55e-01 -0.189 0.132 0.1 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0355 0.157 0.093 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 1.00e+00 -5.54e-05 0.172 0.093 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 2.69e-01 -0.158 0.142 0.093 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 1.60e-01 0.186 0.132 0.093 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 5.29e-01 -0.108 0.172 0.093 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -651880 sc-eQTL 1.37e-01 0.238 0.16 0.093 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -748541 sc-eQTL 4.26e-01 0.0995 0.125 0.093 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0245 0.147 0.093 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 5.56e-01 0.0887 0.15 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0287 0.125 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 1.43e-01 0.163 0.11 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 34100 sc-eQTL 1.23e-01 0.195 0.126 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 4.66e-01 -0.058 0.0795 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0616 0.132 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0634 0.105 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0938 0.114 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 6.12e-01 0.07 0.138 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0415 0.109 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0112 0.103 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 34100 sc-eQTL 9.07e-02 0.167 0.0986 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0393 0.0698 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00189 0.128 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 8.54e-01 0.0166 0.0902 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 1.67e-03 -0.333 0.105 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 2.31e-01 0.139 0.116 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0779 0.132 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 9.99e-01 0.000134 0.0841 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 7.03e-01 0.0283 0.0739 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -151073 sc-eQTL 5.00e-01 -0.102 0.151 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 3.52e-01 0.0987 0.106 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -651880 sc-eQTL 4.26e-01 0.124 0.155 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -748541 sc-eQTL 7.59e-01 -0.039 0.127 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 5.25e-02 -0.23 0.118 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0848 0.128 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 9.28e-01 0.0126 0.14 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 9.27e-01 0.0106 0.114 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0214 0.0915 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -151073 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0773 0.134 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 2.57e-01 0.138 0.121 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -651880 sc-eQTL 5.30e-01 0.0872 0.139 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -748541 sc-eQTL 4.23e-01 -0.106 0.131 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0819 0.132 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -539103 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0265 0.143 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539297 sc-eQTL 7.14e-01 0.0358 0.0975 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -308306 sc-eQTL 9.08e-01 0.0123 0.107 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -89 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0967 0.119 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -887211 sc-eQTL 2.59e-01 -0.102 0.0904 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 39181 sc-eQTL 8.16e-01 0.0321 0.138 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 25992 sc-eQTL 1.76e-01 -0.161 0.118 0.101 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162512 SDC3 -151073 eQTL 0.0205 -0.1 0.0431 0.0 0.0 0.0844
ENSG00000168528 SERINC2 -651880 eQTL 0.00056 0.233 0.0673 0.0 0.0 0.0844

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000168528 SERINC2 -651880 2.61e-07 1.11e-07 3.35e-08 1.78e-07 9.65e-08 9.87e-08 1.42e-07 5.21e-08 1.37e-07 4.24e-08 1.63e-07 8.02e-08 1.26e-07 6.21e-08 5.44e-08 8.01e-08 5.1e-08 1.07e-07 5.2e-08 3.88e-08 1.06e-07 1.33e-07 1.29e-07 4.82e-08 1.31e-07 1.15e-07 1.13e-07 8.71e-08 9.88e-08 1.09e-07 9.58e-08 3.95e-08 2.74e-08 8.49e-08 8.96e-08 3.9e-08 5.02e-08 9.13e-08 8.42e-08 3.09e-08 4.68e-08 1.36e-07 5.2e-08 3.16e-08 8.16e-08 1.69e-08 1.37e-07 4.26e-09 4.85e-08