logo

Genes within 1Mb (chr1:30757252:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 9.57e-01 0.0052 0.0965 0.205 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0522 0.0772 0.205 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 5.58e-01 -0.038 0.0648 0.205 B L1
ENSG00000162510 MATN1 33667 sc-eQTL 8.70e-04 -0.224 0.0664 0.205 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 7.21e-03 -0.142 0.0525 0.205 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0264 0.0805 0.205 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 8.51e-04 -0.206 0.0609 0.205 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0166 0.074 0.205 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0226 0.082 0.205 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 1.13e-01 -0.102 0.0637 0.205 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 2.34e-02 0.129 0.0564 0.205 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 2.37e-03 -0.19 0.0619 0.205 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 2.05e-01 0.0837 0.0659 0.205 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0513 0.0565 0.205 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 3.25e-01 0.0667 0.0676 0.205 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 4.56e-01 0.0807 0.108 0.205 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 1.66e-01 -0.0997 0.0716 0.205 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 5.43e-02 0.122 0.0628 0.205 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 8.73e-01 0.00988 0.0615 0.205 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 8.21e-01 0.0171 0.0758 0.205 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0163 0.0721 0.205 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 1.03e-01 0.148 0.0901 0.205 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0797 0.0979 0.2 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 9.18e-01 0.012 0.116 0.2 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 8.19e-01 0.0208 0.0909 0.2 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 4.72e-02 0.128 0.0643 0.2 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0436 0.105 0.2 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -652313 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0426 0.107 0.2 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -748974 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0679 0.0708 0.2 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 1.87e-01 -0.135 0.102 0.2 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 3.79e-02 0.154 0.0736 0.205 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 9.08e-01 0.0107 0.0922 0.205 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0777 0.0589 0.205 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0628 0.0542 0.205 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -151506 sc-eQTL 5.21e-02 -0.202 0.104 0.205 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00632 0.0733 0.205 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -652313 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0866 0.112 0.205 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -748974 sc-eQTL 6.99e-02 0.179 0.098 0.205 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0237 0.0863 0.205 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0751 0.106 0.204 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0454 0.0727 0.204 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 3.32e-01 0.0741 0.0761 0.204 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 3.03e-04 0.313 0.0851 0.204 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0175 0.0641 0.204 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 1.18e-01 -0.154 0.0981 0.204 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 2.91e-02 0.198 0.0901 0.204 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 3.25e-02 0.17 0.0791 0.205 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0907 0.0852 0.205 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 5.47e-01 0.0463 0.0768 0.205 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0068 0.063 0.205 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 3.40e-02 0.178 0.0832 0.205 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 6.44e-01 0.0476 0.103 0.205 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 7.75e-01 0.0307 0.107 0.205 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0023 0.124 0.202 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 1.84e-01 -0.166 0.124 0.202 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 7.75e-02 -0.204 0.115 0.202 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 33667 sc-eQTL 1.93e-01 -0.132 0.101 0.202 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 1.21e-02 -0.176 0.0695 0.202 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 7.89e-01 0.0323 0.12 0.202 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0853 0.114 0.202 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0726 0.101 0.202 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 3.02e-01 0.123 0.119 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 7.73e-01 0.0287 0.0991 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 1.06e-01 -0.151 0.0929 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 33667 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0371 0.0973 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0125 0.0597 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 1.80e-01 -0.149 0.11 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 6.67e-01 0.0361 0.0838 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 1.06e-01 -0.151 0.0932 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 3.21e-01 0.113 0.113 0.207 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 1.42e-01 -0.153 0.104 0.207 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0502 0.0908 0.207 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 33667 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0481 0.0869 0.207 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 1.36e-04 -0.289 0.0744 0.207 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 5.00e-01 0.0695 0.103 0.207 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 1.18e-01 -0.138 0.0877 0.207 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 5.96e-02 -0.194 0.102 0.207 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 1.24e-01 0.163 0.105 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0102 0.0913 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 9.30e-01 0.00705 0.0806 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 33667 sc-eQTL 1.02e-02 -0.209 0.0805 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 1.02e-02 -0.139 0.0537 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 3.17e-01 0.0964 0.096 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 7.79e-04 -0.238 0.0698 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 9.15e-01 0.00949 0.0886 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0947 0.113 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 6.62e-01 0.0409 0.0935 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0501 0.0915 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 33667 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00396 0.0879 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 4.91e-03 -0.167 0.0586 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0802 0.108 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 2.17e-01 -0.107 0.0866 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0321 0.0939 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 4.01e-01 0.0933 0.111 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 1.90e-01 -0.143 0.109 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 2.45e-01 0.125 0.107 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0264 0.0954 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 9.93e-01 0.000863 0.0979 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 8.72e-02 -0.178 0.104 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 2.35e-01 0.109 0.0918 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0448 0.0857 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 2.09e-01 -0.0954 0.0757 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 2.98e-02 0.131 0.06 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 2.67e-03 -0.193 0.0636 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 9.36e-01 0.00574 0.0713 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 9.16e-01 0.007 0.066 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 9.90e-01 -0.000926 0.0758 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0157 0.108 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 2.12e-01 -0.109 0.0866 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 2.63e-01 0.0862 0.0767 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 2.97e-02 -0.138 0.0632 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 4.90e-03 0.239 0.084 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0978 0.0808 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 7.97e-01 0.0233 0.0902 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 3.53e-01 0.0998 0.107 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 1.08e-01 -0.165 0.102 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 2.45e-02 0.191 0.0843 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 4.98e-03 -0.241 0.0847 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0414 0.0967 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0814 0.101 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 9.89e-01 0.00143 0.0995 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 4.23e-01 0.0952 0.119 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0822 0.091 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 6.07e-01 0.0456 0.0885 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 1.89e-02 0.229 0.0968 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 2.54e-01 0.0973 0.0851 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 2.59e-01 -0.116 0.103 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 9.36e-03 0.25 0.0954 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 3.06e-01 -0.11 0.107 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0982 0.0925 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 2.40e-01 0.0877 0.0744 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 7.39e-02 -0.127 0.071 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 1.35e-01 -0.149 0.0989 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 6.26e-01 0.0435 0.0892 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 4.54e-01 0.0728 0.0971 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 5.12e-01 0.079 0.12 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0951 0.11 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0481 0.104 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 7.54e-01 -0.034 0.109 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 3.12e-01 -0.112 0.111 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00348 0.101 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0532 0.102 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0706 0.115 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 1.95e-01 0.143 0.11 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 3.96e-01 0.0958 0.113 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 1.16e-01 0.167 0.105 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0284 0.0998 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 6.28e-01 0.0534 0.11 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0894 0.0994 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 2.14e-01 0.144 0.116 0.208 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0415 0.103 0.208 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 3.74e-01 0.0876 0.0984 0.208 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0469 0.093 0.208 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 4.65e-02 0.203 0.101 0.208 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0107 0.104 0.208 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 9.04e-01 0.0129 0.107 0.208 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0228 0.117 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 1.40e-01 -0.146 0.0985 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 2.75e-01 0.114 0.104 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 2.83e-05 0.421 0.0982 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 3.09e-01 -0.101 0.0994 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0461 0.103 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 4.05e-01 0.0846 0.101 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0434 0.111 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 8.45e-01 0.0161 0.0825 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 4.67e-01 0.0617 0.0845 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 8.15e-04 0.298 0.0879 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00816 0.0803 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 2.06e-01 -0.143 0.113 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 2.38e-01 0.11 0.093 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 9.16e-01 0.0125 0.119 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 2.16e-01 -0.131 0.106 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 8.46e-01 0.0202 0.103 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 7.70e-04 0.328 0.096 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00179 0.111 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0322 0.105 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 4.52e-01 0.0765 0.101 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 8.61e-01 0.0191 0.108 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0482 0.0846 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 6.09e-01 0.0468 0.0915 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 2.92e-03 0.297 0.0987 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 3.27e-01 0.0841 0.0857 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 6.53e-01 0.048 0.107 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 6.09e-01 0.0509 0.0993 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 1.11e-01 -0.213 0.133 0.189 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 3.31e-01 -0.151 0.155 0.189 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 1.66e-01 0.187 0.134 0.189 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 33667 sc-eQTL 6.75e-01 0.0529 0.126 0.189 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 5.03e-02 0.175 0.0885 0.189 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 7.20e-01 0.0498 0.139 0.189 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 6.43e-01 0.0571 0.123 0.189 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 1.64e-01 0.182 0.13 0.189 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 7.53e-02 0.151 0.0843 0.204 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 1.46e-02 -0.262 0.106 0.204 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 7.66e-02 0.178 0.0998 0.204 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 3.73e-01 0.0644 0.072 0.204 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0883 0.106 0.204 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0138 0.101 0.204 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 7.98e-01 0.0237 0.0927 0.204 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00824 0.112 0.205 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0462 0.108 0.205 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0498 0.0865 0.205 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00667 0.0991 0.205 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0774 0.107 0.205 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 4.46e-01 -0.077 0.101 0.205 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 1.15e-01 0.159 0.1 0.205 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0195 0.114 0.207 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0998 0.123 0.207 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 9.67e-01 0.00439 0.106 0.207 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 8.45e-01 0.0145 0.074 0.207 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0249 0.107 0.207 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -652313 sc-eQTL 8.03e-01 0.0237 0.0951 0.207 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -748974 sc-eQTL 5.33e-01 0.0583 0.0933 0.207 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 3.41e-02 -0.212 0.0993 0.207 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 2.24e-01 0.109 0.0895 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 9.69e-01 0.00395 0.1 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 1.11e-01 -0.108 0.0674 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0472 0.0594 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -151506 sc-eQTL 2.77e-01 -0.122 0.112 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 8.09e-01 0.0221 0.0916 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -652313 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0884 0.113 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -748974 sc-eQTL 8.04e-02 0.175 0.0996 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 2.35e-01 0.111 0.0932 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 2.06e-01 0.119 0.0938 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0307 0.111 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00134 0.0804 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 6.44e-02 -0.114 0.0613 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -151506 sc-eQTL 9.33e-02 -0.179 0.106 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0166 0.0964 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -652313 sc-eQTL 2.03e-01 -0.144 0.113 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -748974 sc-eQTL 1.19e-01 0.143 0.0913 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 6.19e-01 0.0459 0.0922 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 3.35e-01 0.134 0.139 0.218 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 3.49e-01 0.112 0.119 0.218 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 8.84e-01 -0.018 0.123 0.218 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 4.85e-01 0.0936 0.134 0.218 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 5.19e-01 -0.079 0.122 0.218 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000902 0.123 0.218 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 3.80e-01 0.105 0.119 0.218 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 4.74e-01 0.0748 0.104 0.209 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 2.56e-01 0.127 0.112 0.209 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 1.86e-01 0.126 0.0948 0.209 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0667 0.0745 0.209 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -151506 sc-eQTL 1.09e-01 -0.163 0.102 0.209 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0661 0.107 0.209 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -652313 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0484 0.107 0.209 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -748974 sc-eQTL 1.56e-01 0.144 0.101 0.209 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 3.20e-01 -0.101 0.101 0.209 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 4.91e-01 0.0676 0.0981 0.204 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 6.13e-01 -0.053 0.105 0.204 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 3.12e-02 -0.183 0.0846 0.204 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 3.34e-01 -0.075 0.0775 0.204 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -151506 sc-eQTL 2.22e-01 -0.106 0.0868 0.204 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 2.52e-01 -0.114 0.0996 0.204 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -652313 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00697 0.0951 0.204 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -748974 sc-eQTL 2.86e-01 -0.101 0.0947 0.204 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 1.18e-01 -0.154 0.0979 0.204 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 3.18e-01 -0.11 0.11 0.212 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 5.63e-01 0.0701 0.121 0.212 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 5.74e-01 0.0566 0.1 0.212 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 2.48e-02 0.208 0.0919 0.212 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0395 0.121 0.212 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -652313 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0429 0.113 0.212 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -748974 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0779 0.0878 0.212 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 8.30e-01 0.0223 0.103 0.212 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 1.73e-01 0.153 0.112 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0674 0.0935 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 1.61e-01 -0.116 0.0826 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 33667 sc-eQTL 1.39e-01 -0.14 0.0941 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 3.79e-03 -0.171 0.0583 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0443 0.0984 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 2.11e-01 -0.0982 0.0783 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 4.72e-02 -0.169 0.0849 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 7.46e-01 0.0332 0.102 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 8.03e-01 0.0202 0.0809 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 7.90e-01 0.0204 0.0765 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 33667 sc-eQTL 7.78e-03 -0.195 0.0724 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 9.15e-03 -0.134 0.051 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 8.54e-01 0.0175 0.0947 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 1.09e-04 -0.255 0.0646 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 8.97e-01 0.0103 0.0795 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 4.70e-02 0.168 0.0842 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 9.30e-01 0.00851 0.0963 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 1.77e-01 -0.0829 0.0612 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0511 0.0539 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -151506 sc-eQTL 1.37e-01 -0.164 0.11 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0151 0.0774 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -652313 sc-eQTL 3.35e-01 -0.109 0.113 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -748974 sc-eQTL 3.86e-02 0.191 0.092 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 3.28e-01 0.085 0.0868 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 5.19e-01 0.0604 0.0935 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 9.10e-01 0.0116 0.102 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0775 0.0837 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0877 0.0668 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -151506 sc-eQTL 2.59e-01 -0.111 0.0977 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0959 0.0888 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -652313 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0538 0.102 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -748974 sc-eQTL 3.72e-01 0.0862 0.0963 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 1.84e-01 -0.128 0.0962 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -539536 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0615 0.107 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0283 0.0729 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -308739 sc-eQTL 6.52e-01 0.0361 0.0799 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 sc-eQTL 6.51e-04 0.301 0.0869 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -887644 sc-eQTL 5.30e-01 0.0426 0.0678 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 sc-eQTL 9.78e-02 -0.17 0.102 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 25559 sc-eQTL 5.29e-02 0.172 0.0881 0.203 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121766 ZCCHC17 -539730 eQTL 3.12e-02 -0.049 0.0227 0.0 0.0 0.192
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 eQTL 1.1099999999999999e-42 0.167 0.0116 0.189 0.185 0.192
ENSG00000162512 SDC3 -151506 eQTL 0.0497 -0.062 0.0315 0.0 0.0 0.192
ENSG00000168528 SERINC2 -652313 eQTL 0.00526 -0.138 0.0493 0.0 0.0 0.192
ENSG00000186056 MATN1-AS1 38748 eQTL 2.89e-04 -0.0584 0.016 0.00453 0.0 0.192

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000060688 \N -539536 2.95e-07 1.08e-07 3.44e-08 1.76e-07 1.02e-07 9.61e-08 1.39e-07 5.24e-08 1.36e-07 4.23e-08 1.63e-07 7.6e-08 1.23e-07 6.21e-08 5.14e-08 7.87e-08 5.1e-08 1.07e-07 5.12e-08 3.15e-08 1.06e-07 1.33e-07 1.29e-07 5.01e-08 1.33e-07 1.09e-07 1.11e-07 8.49e-08 1.03e-07 1.1e-07 9.5e-08 3.59e-08 2.74e-08 8.82e-08 9.41e-08 4.19e-08 4.91e-08 9.25e-08 8.3e-08 3.69e-08 3.66e-08 1.39e-07 2.94e-08 4.4e-08 1.09e-07 1.75e-08 1.44e-07 4.7e-09 4.72e-08
ENSG00000162511 LAPTM5 -522 0.000333 0.000366 4.11e-05 8.22e-05 4.33e-05 0.000106 0.000297 3.7e-05 0.000264 0.000108 0.000324 0.000141 0.000408 0.000119 4.99e-05 0.000204 0.000124 0.000184 6.26e-05 4.93e-05 0.000123 0.000304 0.000266 6.62e-05 0.000321 7.97e-05 0.000137 9.44e-05 0.000259 0.000105 0.000172 1.01e-05 1.32e-05 4.97e-05 4.97e-05 3.25e-05 1.15e-05 1.43e-05 2.5e-05 1.2e-05 6.44e-06 0.000387 3.49e-05 1.1e-06 2.27e-05 3.56e-05 2.95e-05 1.33e-05 8.67e-06