logo

Genes within 1Mb (chr1:30755931:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0783 0.0938 0.216 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 2.00e-01 0.0964 0.075 0.216 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 1.76e-01 -0.0854 0.0629 0.216 B L1
ENSG00000162510 MATN1 32346 sc-eQTL 8.15e-05 0.257 0.064 0.216 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0282 0.0519 0.216 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0188 0.0785 0.216 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 3.82e-01 0.0532 0.0608 0.216 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 2.89e-02 -0.157 0.0713 0.216 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0889 0.0806 0.216 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0433 0.0631 0.216 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0593 0.0561 0.216 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 6.69e-03 0.168 0.0613 0.216 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 5.50e-01 -0.039 0.0651 0.216 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0504 0.0557 0.216 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0628 0.0667 0.216 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 1.80e-01 -0.142 0.105 0.216 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 5.20e-02 0.136 0.0698 0.216 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 1.04e-01 -0.101 0.0616 0.216 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 4.44e-01 0.0461 0.0601 0.216 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 3.07e-02 -0.16 0.0734 0.216 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0611 0.0704 0.216 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0477 0.0886 0.216 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 9.19e-01 0.00963 0.0945 0.216 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 4.62e-01 0.0823 0.112 0.216 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0512 0.0876 0.216 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0526 0.0625 0.216 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 3.23e-01 -0.1 0.101 0.216 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -653634 sc-eQTL 5.02e-01 0.0693 0.103 0.216 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -750295 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0269 0.0684 0.216 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 2.38e-01 -0.117 0.0987 0.216 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 3.36e-01 0.07 0.0727 0.216 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 5.13e-01 0.0592 0.0902 0.216 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0548 0.0577 0.216 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0708 0.053 0.216 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -152827 sc-eQTL 9.85e-01 0.00198 0.102 0.216 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 7.28e-01 -0.025 0.0718 0.216 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -653634 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0438 0.11 0.216 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -750295 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0294 0.0967 0.216 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 9.93e-03 -0.216 0.0832 0.216 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0377 0.103 0.217 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0234 0.0703 0.217 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 1.70e-01 -0.101 0.0734 0.217 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 6.68e-02 -0.155 0.0842 0.217 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 7.34e-01 0.0211 0.062 0.217 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 3.78e-01 0.0841 0.0952 0.217 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 4.84e-03 -0.246 0.0864 0.217 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 3.77e-01 -0.068 0.0768 0.216 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 1.38e-01 0.122 0.0818 0.216 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00474 0.0739 0.216 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00174 0.0606 0.216 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0223 0.0809 0.216 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 4.77e-01 0.0706 0.0991 0.216 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 3.04e-01 0.106 0.103 0.216 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 5.85e-01 0.0655 0.12 0.222 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 5.31e-01 0.0758 0.121 0.222 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 4.68e-01 0.0816 0.112 0.222 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 32346 sc-eQTL 2.18e-01 0.121 0.0978 0.222 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 8.91e-01 -0.00944 0.0685 0.222 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00432 0.117 0.222 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 3.12e-01 0.112 0.11 0.222 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 2.41e-01 -0.115 0.0974 0.222 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 4.55e-01 0.0861 0.115 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 8.96e-01 0.0125 0.0959 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 1.86e-01 -0.12 0.0901 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 32346 sc-eQTL 2.70e-01 0.104 0.0939 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0505 0.0577 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 2.50e-01 -0.124 0.107 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0745 0.081 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0102 0.0908 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 7.54e-01 0.0349 0.111 0.211 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 4.41e-01 0.0791 0.102 0.211 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 1.57e-01 0.126 0.0888 0.211 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 32346 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0788 0.0852 0.211 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 4.12e-01 0.0622 0.0756 0.211 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 1.52e-01 -0.145 0.101 0.211 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 9.76e-01 0.00264 0.0866 0.211 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 4.57e-01 0.0754 0.101 0.211 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 2.25e-01 -0.125 0.103 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 4.26e-01 0.0708 0.0887 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0628 0.0783 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 32346 sc-eQTL 1.36e-03 0.252 0.0776 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0288 0.0531 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 6.69e-01 0.0401 0.0936 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 3.18e-01 0.0696 0.0696 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 7.61e-03 -0.228 0.0847 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0648 0.111 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00787 0.0918 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 9.72e-01 0.00313 0.0898 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 32346 sc-eQTL 5.76e-01 0.0483 0.0862 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 8.78e-01 -0.00902 0.0586 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 8.14e-01 0.0251 0.107 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 1.56e-01 0.121 0.0849 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 6.70e-02 -0.168 0.0914 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 8.31e-01 0.0232 0.109 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0106 0.107 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 1.60e-01 -0.147 0.104 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 6.82e-01 0.0383 0.0933 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0413 0.0956 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 1.47e-01 0.148 0.102 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0413 0.09 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0487 0.0843 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00665 0.0748 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 1.38e-01 -0.0885 0.0594 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 8.47e-03 0.167 0.0629 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0131 0.0702 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0345 0.0649 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0861 0.0743 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0837 0.106 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 4.97e-01 -0.058 0.0853 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 4.60e-01 0.056 0.0755 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 1.28e-02 0.155 0.0618 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0714 0.084 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 9.73e-01 -0.0027 0.0796 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 2.50e-01 -0.102 0.0884 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 7.87e-01 0.0285 0.105 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 9.45e-01 0.00694 0.101 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0198 0.0837 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 5.24e-01 0.0539 0.0846 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0543 0.0948 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 2.21e-01 -0.121 0.0987 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0475 0.0976 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 5.00e-02 -0.227 0.115 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 2.14e-01 0.111 0.0886 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 5.50e-01 0.0516 0.0863 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00354 0.0957 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0831 0.0831 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 8.04e-01 -0.025 0.101 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0942 0.0944 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 7.63e-01 0.0317 0.105 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 1.47e-01 0.131 0.0901 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 8.00e-02 -0.127 0.0724 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 3.13e-01 0.0704 0.0697 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00586 0.0971 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 7.75e-01 0.025 0.0872 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 2.91e-01 -0.1 0.0947 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 2.42e-01 0.139 0.118 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00783 0.109 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 4.78e-01 0.0726 0.102 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 8.75e-01 0.0169 0.107 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 4.43e-01 -0.084 0.109 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0244 0.0991 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0465 0.1 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0575 0.11 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 9.16e-01 0.0111 0.105 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0447 0.107 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000405 0.101 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 2.26e-01 -0.115 0.0948 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0911 0.105 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 1.38e-02 -0.232 0.0934 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 5.32e-01 0.07 0.112 0.214 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 3.28e-01 0.097 0.099 0.214 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0517 0.095 0.214 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 6.43e-01 0.0416 0.0896 0.214 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 9.05e-01 0.0118 0.0985 0.214 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 4.62e-01 0.0735 0.0998 0.214 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 3.61e-01 0.0941 0.103 0.214 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 4.49e-01 0.0875 0.115 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 4.52e-01 0.0735 0.0976 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 3.86e-01 -0.089 0.102 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 3.31e-02 -0.215 0.1 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 2.65e-01 0.11 0.098 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 3.23e-01 -0.101 0.101 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 1.06e-01 -0.161 0.0996 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 8.62e-01 0.0189 0.109 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0932 0.0804 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0337 0.0827 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 1.50e-01 -0.127 0.0878 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00638 0.0785 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 1.80e-01 0.148 0.11 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 3.85e-02 -0.188 0.0903 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 7.91e-01 0.0308 0.116 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0268 0.104 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 3.79e-01 -0.089 0.101 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 6.80e-02 -0.175 0.0956 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 9.66e-01 0.00458 0.109 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 8.97e-01 0.0133 0.103 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 5.39e-01 -0.061 0.099 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0626 0.106 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0198 0.0826 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0097 0.0893 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 1.26e-03 -0.314 0.0959 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 9.95e-01 0.000482 0.0838 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0297 0.104 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 8.73e-02 -0.165 0.0963 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 7.39e-01 0.0407 0.122 0.244 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 3.83e-01 0.124 0.141 0.244 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 3.52e-01 -0.114 0.122 0.244 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 32346 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0337 0.115 0.244 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0704 0.0816 0.244 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 3.74e-01 0.112 0.126 0.244 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 1.97e-01 0.144 0.111 0.244 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00878 0.119 0.244 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 4.91e-01 -0.058 0.0841 0.209 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 3.25e-01 -0.105 0.107 0.209 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0875 0.0995 0.209 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0179 0.0715 0.209 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0855 0.105 0.209 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 4.80e-01 0.0707 0.0998 0.209 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 1.08e-01 -0.148 0.0913 0.209 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 2.85e-01 -0.118 0.11 0.216 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 5.21e-01 0.0683 0.106 0.216 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0555 0.0851 0.216 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 2.71e-01 0.107 0.0973 0.216 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 4.61e-01 0.0778 0.105 0.216 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0573 0.0993 0.216 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0821 0.0991 0.216 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 3.22e-01 -0.108 0.109 0.217 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 8.05e-01 0.0293 0.118 0.217 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 2.29e-01 -0.122 0.101 0.217 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 4.20e-02 -0.144 0.0705 0.217 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0546 0.103 0.217 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -653634 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00962 0.0916 0.217 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -750295 sc-eQTL 3.50e-02 -0.189 0.0889 0.217 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0146 0.0969 0.217 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00384 0.0878 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 9.49e-01 0.00626 0.0979 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 8.83e-01 -0.00976 0.0663 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0623 0.058 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -152827 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0998 0.109 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 7.73e-02 -0.158 0.0888 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -653634 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0456 0.111 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -750295 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0587 0.0979 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 2.59e-02 -0.203 0.0903 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 2.39e-01 0.109 0.0924 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 6.67e-01 0.0471 0.109 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 3.19e-02 -0.169 0.0783 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0752 0.0606 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -152827 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0136 0.105 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 3.97e-01 0.0805 0.0947 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -653634 sc-eQTL 8.57e-01 0.02 0.111 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -750295 sc-eQTL 8.05e-01 0.0224 0.0904 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 8.40e-02 -0.156 0.0901 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 9.46e-01 0.00937 0.138 0.206 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 4.04e-01 0.0991 0.118 0.206 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 2.92e-01 0.129 0.122 0.206 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 7.64e-01 -0.04 0.133 0.206 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 1.69e-02 -0.288 0.119 0.206 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 6.57e-01 0.0545 0.123 0.206 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 2.16e-01 0.147 0.118 0.206 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 5.93e-01 0.055 0.103 0.211 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0635 0.111 0.211 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0948 0.0936 0.211 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 1.29e-01 -0.111 0.0732 0.211 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -152827 sc-eQTL 4.22e-01 0.0809 0.101 0.211 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0217 0.106 0.211 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -653634 sc-eQTL 7.60e-01 0.0323 0.105 0.211 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -750295 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0529 0.0999 0.211 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0746 0.0999 0.211 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0664 0.0968 0.215 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 4.83e-01 0.0726 0.103 0.215 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 5.52e-01 0.0502 0.0844 0.215 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 2.79e-01 0.0829 0.0765 0.215 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -152827 sc-eQTL 6.58e-01 0.0381 0.0859 0.215 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 8.22e-01 0.0222 0.0986 0.215 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -653634 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0957 0.0936 0.215 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -750295 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0527 0.0937 0.215 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 1.58e-01 -0.137 0.0967 0.215 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 1.26e-01 0.171 0.111 0.195 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 7.39e-01 0.041 0.123 0.195 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0437 0.102 0.195 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 5.90e-01 0.051 0.0945 0.195 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0297 0.123 0.195 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -653634 sc-eQTL 2.53e-01 0.131 0.114 0.195 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -750295 sc-eQTL 5.42e-01 0.0544 0.089 0.195 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0953 0.105 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 5.50e-01 0.0653 0.109 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 8.95e-01 0.012 0.091 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 8.99e-01 0.0103 0.0806 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 32346 sc-eQTL 7.46e-02 0.163 0.0912 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 6.46e-01 0.0266 0.0577 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 1.77e-01 -0.129 0.0952 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 9.90e-01 -0.000994 0.0764 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 5.57e-01 0.0489 0.0832 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 2.63e-01 -0.112 0.1 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 5.12e-01 0.0521 0.0793 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0542 0.075 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 32346 sc-eQTL 1.15e-03 0.233 0.0705 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0265 0.0509 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 5.13e-01 0.0608 0.0929 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 9.14e-02 0.111 0.0653 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 8.88e-03 -0.203 0.0768 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 3.90e-01 0.0714 0.0829 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 5.04e-01 0.0628 0.094 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0718 0.0598 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0667 0.0526 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -152827 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0794 0.107 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 5.97e-01 -0.04 0.0756 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -653634 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0269 0.111 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -750295 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0259 0.0908 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 7.97e-03 -0.224 0.0836 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 8.02e-01 0.0229 0.0915 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 8.62e-01 0.0174 0.1 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0182 0.082 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0162 0.0656 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -152827 sc-eQTL 3.98e-01 0.081 0.0957 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0455 0.087 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -653634 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00365 0.0994 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -750295 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0282 0.0943 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0896 0.0942 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -540857 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0248 0.103 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -541051 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0331 0.0705 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -310060 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0703 0.0771 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 sc-eQTL 9.13e-02 -0.145 0.0857 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -888965 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0133 0.0656 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 37427 sc-eQTL 2.52e-01 0.114 0.0993 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 24238 sc-eQTL 5.39e-03 -0.237 0.0844 0.218 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162511 LAPTM5 -1843 eQTL 0.00158 -0.0387 0.0122 0.0 0.0 0.215
ENSG00000168528 SERINC2 -653634 eQTL 0.000219 0.175 0.0471 0.0 0.0 0.215

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina