logo

Genes within 1Mb (chr1:30749782:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0867 0.175 0.053 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0552 0.14 0.053 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 7.31e-01 0.0406 0.118 0.053 B L1
ENSG00000162510 MATN1 26197 sc-eQTL 5.79e-01 0.0689 0.124 0.053 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 5.27e-01 0.0615 0.0969 0.053 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 9.92e-02 -0.241 0.146 0.053 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 4.76e-01 0.0811 0.114 0.053 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 8.26e-01 0.0296 0.135 0.053 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 3.55e-01 -0.14 0.151 0.053 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 2.86e-01 -0.126 0.118 0.053 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 7.06e-01 0.0398 0.105 0.053 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0601 0.117 0.053 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00167 0.122 0.053 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 9.75e-01 0.00324 0.104 0.053 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0487 0.125 0.053 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0739 0.204 0.053 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 4.08e-01 0.112 0.135 0.053 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0311 0.119 0.053 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 4.76e-01 0.0826 0.116 0.053 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0256 0.143 0.053 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 2.40e-01 0.159 0.135 0.053 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 1.39e-01 -0.252 0.17 0.053 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 3.43e-01 0.129 0.136 0.053 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 5.39e-01 -0.104 0.169 0.053 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 2.14e-01 0.135 0.108 0.053 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0792 0.0994 0.053 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -158976 sc-eQTL 4.14e-01 0.157 0.191 0.053 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 4.16e-01 -0.109 0.134 0.053 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -659783 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0537 0.205 0.053 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -756444 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0407 0.181 0.053 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 2.81e-01 0.171 0.158 0.053 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 5.07e-01 -0.126 0.19 0.054 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0838 0.13 0.054 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 3.77e-02 0.282 0.135 0.054 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0107 0.157 0.054 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0281 0.115 0.054 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 7.77e-01 -0.05 0.176 0.054 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 5.52e-01 0.097 0.163 0.054 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 2.59e-01 0.163 0.144 0.053 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 5.12e-01 -0.101 0.154 0.053 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 9.43e-01 0.00997 0.139 0.053 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 2.63e-02 0.252 0.112 0.053 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 2.72e-01 0.167 0.151 0.053 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 9.02e-01 0.0229 0.186 0.053 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0734 0.194 0.053 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0159 0.231 0.054 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 4.38e-01 -0.18 0.232 0.054 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 4.26e-01 0.172 0.216 0.054 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 26197 sc-eQTL 2.31e-01 -0.226 0.188 0.054 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 2.95e-01 -0.138 0.131 0.054 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 2.72e-01 0.247 0.224 0.054 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 1.77e-02 -0.502 0.209 0.054 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0673 0.188 0.054 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 8.83e-01 0.0319 0.216 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 8.37e-01 0.0371 0.18 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0684 0.17 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 26197 sc-eQTL 9.30e-01 0.0156 0.177 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 8.42e-01 0.0216 0.108 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 3.46e-01 -0.19 0.201 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00126 0.152 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 8.17e-01 0.0394 0.17 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 4.22e-01 0.165 0.205 0.054 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 5.08e-01 0.125 0.189 0.054 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 5.12e-01 0.108 0.164 0.054 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 26197 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0979 0.157 0.054 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0409 0.14 0.054 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 5.24e-01 -0.119 0.186 0.054 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 8.61e-01 0.028 0.16 0.054 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0551 0.187 0.054 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 7.56e-01 0.0591 0.19 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 8.26e-01 0.036 0.164 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0901 0.144 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 26197 sc-eQTL 1.21e-01 0.227 0.146 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 6.92e-01 0.0389 0.098 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 2.71e-02 -0.38 0.171 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 5.01e-01 0.0867 0.129 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 6.70e-01 0.0679 0.159 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 5.85e-01 0.11 0.201 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 2.79e-01 -0.18 0.166 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 2.26e-01 0.197 0.162 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 26197 sc-eQTL 5.14e-01 -0.102 0.156 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 3.85e-01 0.092 0.106 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 3.66e-01 -0.174 0.192 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 9.52e-01 0.00931 0.154 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0107 0.167 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 4.72e-01 -0.114 0.158 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 7.46e-02 -0.249 0.139 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 2.71e-01 0.123 0.111 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0172 0.12 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 6.92e-01 0.052 0.131 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 7.65e-01 0.0363 0.121 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0876 0.139 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 9.72e-01 0.007 0.2 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 3.90e-01 0.139 0.161 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0566 0.143 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0878 0.118 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 2.25e-01 -0.192 0.158 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 6.18e-01 0.0749 0.15 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 9.00e-01 0.0211 0.167 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 5.23e-01 0.128 0.199 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 8.38e-02 -0.328 0.189 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 7.19e-01 0.057 0.158 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 5.53e-01 0.095 0.16 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 3.85e-01 -0.156 0.179 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 4.07e-01 -0.156 0.187 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0671 0.185 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 5.88e-01 0.122 0.226 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 7.36e-01 0.0584 0.173 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0239 0.168 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 5.37e-01 0.115 0.186 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0615 0.162 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 8.63e-01 0.0339 0.196 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 1.52e-01 -0.264 0.183 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 2.28e-01 -0.246 0.203 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 3.37e-01 0.169 0.175 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0513 0.141 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 5.68e-02 0.257 0.134 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 6.06e-01 0.0971 0.188 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 3.14e-01 0.17 0.169 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0522 0.184 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 3.11e-01 0.212 0.208 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 2.00e-01 0.257 0.2 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 2.18e-01 0.252 0.204 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0364 0.193 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 1.40e-01 -0.267 0.18 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 9.46e-01 0.0136 0.2 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 2.90e-01 -0.191 0.18 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 7.17e-02 0.383 0.211 0.052 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0763 0.189 0.052 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 2.63e-01 0.202 0.18 0.052 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 7.37e-02 0.304 0.169 0.052 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0503 0.188 0.052 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00986 0.19 0.052 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 8.38e-01 0.0401 0.196 0.052 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 3.68e-01 -0.196 0.217 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 2.54e-01 -0.21 0.183 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 2.14e-01 0.24 0.192 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 3.80e-01 -0.167 0.19 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 9.52e-01 0.0111 0.185 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 2.97e-02 -0.414 0.189 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 7.27e-01 -0.066 0.189 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 4.69e-01 -0.146 0.201 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 2.79e-01 -0.161 0.149 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 3.09e-02 0.328 0.151 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 5.24e-01 0.104 0.163 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 1.88e-01 -0.191 0.144 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0177 0.204 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 1.87e-01 0.222 0.168 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 2.96e-01 0.222 0.212 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 3.72e-01 -0.17 0.19 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 6.26e-01 0.0902 0.185 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 2.95e-01 0.185 0.176 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0264 0.199 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 3.84e-01 -0.164 0.188 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 3.44e-01 -0.172 0.181 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0115 0.196 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 3.99e-01 0.129 0.153 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 3.20e-01 0.165 0.165 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 8.73e-01 0.0292 0.182 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 5.47e-01 0.0938 0.155 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 7.17e-02 0.347 0.192 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 7.35e-01 0.0609 0.18 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 6.71e-01 0.0912 0.214 0.067 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 1.59e-01 0.349 0.246 0.067 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0514 0.216 0.067 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 26197 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0916 0.201 0.067 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0272 0.144 0.067 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 1.86e-01 0.292 0.22 0.067 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 1.61e-01 -0.275 0.195 0.067 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 8.84e-01 0.0305 0.209 0.067 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 7.19e-01 0.0567 0.157 0.052 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0335 0.199 0.052 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0896 0.186 0.052 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 2.94e-01 0.14 0.133 0.052 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 7.05e-02 0.353 0.194 0.052 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 5.40e-01 -0.114 0.186 0.052 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 1.15e-01 0.27 0.171 0.052 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 2.17e-01 0.26 0.21 0.053 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 2.87e-01 0.217 0.204 0.053 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 7.89e-01 0.0438 0.163 0.053 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 8.60e-01 0.0329 0.187 0.053 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 2.86e-01 0.215 0.201 0.053 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 7.97e-02 -0.333 0.189 0.053 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 4.71e-02 0.376 0.189 0.053 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 7.77e-02 0.289 0.163 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 2.17e-02 -0.418 0.181 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 5.55e-02 0.236 0.123 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 2.38e-01 -0.128 0.108 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -158976 sc-eQTL 9.25e-01 0.0193 0.205 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0159 0.167 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -659783 sc-eQTL 7.72e-01 -0.06 0.207 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -756444 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00121 0.183 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 3.34e-01 0.165 0.171 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 3.13e-01 -0.174 0.172 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 4.62e-01 0.15 0.203 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 4.13e-01 0.121 0.147 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0585 0.113 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -158976 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0272 0.195 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0873 0.176 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -659783 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0343 0.207 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -756444 sc-eQTL 5.43e-01 -0.102 0.168 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 8.17e-01 0.0391 0.169 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 5.86e-01 0.139 0.255 0.055 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 3.29e-01 -0.214 0.218 0.055 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 1.00e+00 4.36e-05 0.226 0.055 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 7.47e-01 0.0791 0.245 0.055 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 6.09e-01 0.115 0.224 0.055 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 3.15e-01 0.228 0.225 0.055 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 2.66e-01 -0.244 0.218 0.055 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 2.68e-01 -0.208 0.187 0.056 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 4.09e-01 0.166 0.201 0.056 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 2.37e-01 0.202 0.17 0.056 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0282 0.134 0.056 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -158976 sc-eQTL 7.47e-01 0.0592 0.184 0.056 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 3.23e-02 -0.411 0.191 0.056 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -659783 sc-eQTL 8.76e-01 0.03 0.192 0.056 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -756444 sc-eQTL 6.01e-01 0.0952 0.182 0.056 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 1.12e-01 0.289 0.181 0.056 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 3.31e-01 -0.21 0.215 0.051 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 4.04e-01 -0.198 0.236 0.051 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 1.57e-01 -0.277 0.195 0.051 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 2.65e-01 -0.203 0.182 0.051 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 1.00e-01 0.388 0.235 0.051 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -659783 sc-eQTL 4.46e-01 -0.169 0.221 0.051 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -756444 sc-eQTL 3.32e-01 -0.167 0.171 0.051 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 3.96e-01 0.172 0.202 0.051 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 6.18e-01 0.101 0.202 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0577 0.169 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 2.03e-01 0.19 0.149 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 26197 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0154 0.17 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0184 0.107 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0174 0.177 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 8.32e-01 0.0301 0.142 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0199 0.154 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0159 0.186 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0142 0.147 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0225 0.139 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 26197 sc-eQTL 3.05e-01 0.137 0.133 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 3.36e-01 0.0907 0.094 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 2.32e-02 -0.388 0.17 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 7.24e-01 0.0431 0.122 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 7.41e-01 0.0478 0.144 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 3.97e-01 0.132 0.156 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 3.07e-01 -0.18 0.176 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 2.80e-02 0.246 0.111 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 3.11e-01 -0.1 0.0988 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -158976 sc-eQTL 8.94e-01 0.027 0.202 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0669 0.142 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -659783 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0343 0.208 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -756444 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0354 0.17 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 4.83e-01 0.112 0.159 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 3.52e-01 -0.159 0.171 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 5.42e-01 0.114 0.187 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0664 0.154 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 3.81e-01 -0.108 0.123 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -158976 sc-eQTL 2.08e-01 0.226 0.179 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 4.21e-02 -0.33 0.162 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -659783 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0296 0.186 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -756444 sc-eQTL 8.61e-01 -0.031 0.177 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 2.07e-01 0.223 0.176 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -547006 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0967 0.192 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547200 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0303 0.131 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -316209 sc-eQTL 1.22e-01 0.221 0.143 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -7992 sc-eQTL 8.52e-01 0.0299 0.16 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -895114 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0136 0.122 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31278 sc-eQTL 9.98e-01 0.000376 0.185 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 18089 sc-eQTL 4.01e-01 0.134 0.159 0.054 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000237329 AL356320.2 -286952 eQTL 0.0521 -0.134 0.0687 0.0011 0.0 0.0677

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina