logo

Genes within 1Mb (chr1:30749682:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 7.89e-01 0.0344 0.128 0.111 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 1.01e-01 0.168 0.102 0.111 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0304 0.0861 0.111 B L1
ENSG00000162510 MATN1 26097 sc-eQTL 5.10e-03 0.251 0.0888 0.111 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 6.33e-01 0.0339 0.0708 0.111 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0185 0.107 0.111 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 1.13e-01 0.132 0.0826 0.111 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 8.93e-02 0.167 0.0976 0.111 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 3.23e-01 -0.109 0.11 0.111 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 3.61e-01 0.0786 0.0859 0.111 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0194 0.0766 0.111 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00275 0.0849 0.111 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 4.38e-01 -0.069 0.0887 0.111 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00703 0.076 0.111 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0408 0.091 0.111 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 3.19e-01 0.144 0.144 0.111 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 3.55e-01 0.089 0.096 0.111 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0843 0.0845 0.111 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 8.74e-01 0.0131 0.0823 0.111 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0541 0.101 0.111 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0441 0.0964 0.111 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 7.82e-01 0.0335 0.121 0.111 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 3.64e-01 -0.119 0.131 0.108 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 1.17e-01 -0.243 0.155 0.108 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 9.27e-01 0.0112 0.122 0.108 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 1.63e-01 -0.121 0.0866 0.108 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 1.90e-01 -0.185 0.141 0.108 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -659883 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0304 0.144 0.108 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -756544 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0346 0.095 0.108 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 2.38e-01 -0.162 0.137 0.108 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 3.01e-01 -0.104 0.1 0.111 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 4.17e-01 0.101 0.124 0.111 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0132 0.0797 0.111 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0336 0.0733 0.111 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -159076 sc-eQTL 7.68e-01 0.0417 0.141 0.111 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 8.37e-01 0.0203 0.0989 0.111 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -659883 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00204 0.151 0.111 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -756544 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0921 0.133 0.111 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 5.88e-02 0.219 0.115 0.111 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 4.15e-01 -0.112 0.138 0.112 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 1.77e-01 0.127 0.0939 0.112 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 3.97e-01 0.0838 0.0988 0.112 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00219 0.114 0.112 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 5.80e-01 -0.046 0.0831 0.112 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 1.47e-01 -0.185 0.127 0.112 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 2.97e-01 -0.123 0.118 0.112 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 9.36e-01 0.00857 0.107 0.111 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 2.93e-01 -0.12 0.114 0.111 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 3.36e-01 0.099 0.103 0.111 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 5.02e-01 0.0567 0.0843 0.111 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00709 0.113 0.111 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 3.72e-01 0.123 0.138 0.111 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 9.53e-01 0.00857 0.144 0.111 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 4.81e-01 0.114 0.161 0.115 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0462 0.162 0.115 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 6.39e-01 0.0709 0.151 0.115 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 26097 sc-eQTL 6.28e-02 -0.244 0.131 0.115 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 1.65e-01 0.128 0.0914 0.115 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 5.32e-01 0.0978 0.156 0.115 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 1.32e-01 -0.223 0.147 0.115 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 1.26e-01 0.2 0.13 0.115 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 4.73e-01 0.111 0.155 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 5.84e-01 0.0708 0.129 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 3.50e-01 0.114 0.122 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 26097 sc-eQTL 3.50e-01 0.118 0.127 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 2.09e-01 0.0978 0.0775 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0519 0.144 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0207 0.109 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 5.30e-01 0.0768 0.122 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 4.06e-01 0.125 0.151 0.112 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0692 0.139 0.112 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 2.68e-01 -0.134 0.121 0.112 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 26097 sc-eQTL 2.72e-01 0.127 0.115 0.112 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 7.99e-02 0.179 0.102 0.112 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 1.22e-01 -0.211 0.136 0.112 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 1.69e-02 0.279 0.116 0.112 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0541 0.137 0.112 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0873 0.138 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 1.05e-01 0.193 0.119 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0242 0.105 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 26097 sc-eQTL 3.15e-03 0.312 0.105 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 1.21e-01 0.11 0.0709 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0219 0.126 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 2.25e-02 0.213 0.0925 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 8.51e-01 0.0217 0.116 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 7.39e-01 0.0488 0.146 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0829 0.121 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0246 0.118 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 26097 sc-eQTL 9.28e-01 0.0102 0.113 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 4.21e-02 0.156 0.0762 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 1.18e-01 0.218 0.139 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 8.55e-01 0.0205 0.112 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 4.15e-03 0.344 0.119 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 1.13e-02 -0.376 0.147 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0414 0.147 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 2.92e-01 -0.152 0.144 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 2.68e-01 -0.142 0.128 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 1.71e-02 -0.312 0.13 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00923 0.141 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 4.33e-02 -0.25 0.123 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0819 0.114 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 3.94e-01 0.0862 0.101 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 7.68e-01 0.0238 0.0808 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 5.61e-01 0.0503 0.0865 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 3.46e-01 0.0895 0.0947 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0214 0.0878 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 6.26e-01 0.0493 0.101 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0328 0.143 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 4.82e-01 0.0809 0.115 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 1.94e-01 -0.132 0.102 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 1.54e-01 -0.12 0.0842 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 1.10e-01 -0.181 0.113 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00194 0.107 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 7.05e-01 0.0453 0.119 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 7.98e-02 0.251 0.142 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 2.41e-01 -0.16 0.136 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 6.38e-01 0.0537 0.114 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 5.46e-01 0.0695 0.115 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 3.84e-04 -0.452 0.125 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0431 0.135 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0229 0.133 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 5.47e-01 0.0968 0.16 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 2.64e-01 0.137 0.123 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0182 0.119 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 2.79e-01 -0.143 0.132 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0275 0.115 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0452 0.139 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0159 0.131 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 1.58e-01 0.203 0.143 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00342 0.124 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 2.06e-01 -0.126 0.0996 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 7.78e-01 0.027 0.0957 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 3.56e-01 -0.123 0.133 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0345 0.12 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 9.38e-01 0.0102 0.13 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 7.43e-01 0.0517 0.157 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 7.86e-01 0.0391 0.144 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 1.80e-01 0.181 0.135 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 5.42e-01 0.0866 0.142 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 4.61e-01 -0.107 0.145 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 4.19e-01 0.106 0.131 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0148 0.133 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 5.88e-01 0.0818 0.151 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 7.98e-01 0.0372 0.145 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 4.08e-01 0.123 0.148 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 4.18e-01 0.113 0.139 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0817 0.131 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0245 0.144 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 5.97e-01 0.0691 0.131 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 3.75e-01 0.137 0.154 0.11 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 3.39e-01 -0.131 0.136 0.11 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 8.26e-02 0.227 0.13 0.11 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0432 0.124 0.11 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 6.79e-01 0.0563 0.136 0.11 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 3.09e-01 0.14 0.137 0.11 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 1.74e-01 0.193 0.141 0.11 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 9.10e-01 0.0175 0.155 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 3.33e-01 0.126 0.13 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 1.90e-01 -0.179 0.137 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 3.53e-01 -0.126 0.135 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 9.97e-01 0.000549 0.131 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 3.70e-01 0.122 0.136 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 1.63e-01 -0.187 0.133 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 2.59e-01 -0.165 0.146 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 6.50e-01 0.0491 0.108 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 3.74e-01 0.0988 0.111 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 7.03e-01 0.0451 0.118 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 2.93e-01 -0.111 0.105 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 9.48e-02 -0.247 0.147 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0465 0.122 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 2.91e-01 0.166 0.157 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 2.26e-01 0.17 0.14 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0382 0.137 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0124 0.131 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 4.91e-01 -0.102 0.147 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0386 0.139 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0686 0.134 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0749 0.142 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 4.63e-02 0.22 0.11 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 1.71e-01 0.164 0.119 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 7.67e-01 0.0391 0.132 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 3.78e-01 -0.099 0.112 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 8.88e-01 0.0197 0.14 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 9.80e-01 0.00319 0.13 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 6.52e-01 0.0747 0.165 0.111 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 5.07e-03 0.53 0.185 0.111 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000395 0.167 0.111 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 26097 sc-eQTL 4.60e-01 -0.115 0.155 0.111 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 4.38e-02 -0.222 0.109 0.111 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 6.11e-01 0.0869 0.171 0.111 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 7.38e-02 -0.27 0.15 0.111 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0519 0.162 0.111 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 2.00e-01 -0.145 0.113 0.109 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 7.39e-01 0.048 0.144 0.109 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 1.79e-01 0.18 0.134 0.109 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0814 0.0962 0.109 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 8.31e-01 0.0303 0.141 0.109 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0424 0.135 0.109 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 4.59e-01 0.0918 0.124 0.109 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 4.26e-01 0.118 0.148 0.111 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 6.73e-01 0.0605 0.143 0.111 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0305 0.115 0.111 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 2.46e-01 0.152 0.131 0.111 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0774 0.142 0.111 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 4.32e-01 -0.105 0.134 0.111 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 9.46e-01 0.00914 0.134 0.111 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 1.03e-01 -0.244 0.149 0.112 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 2.28e-01 -0.195 0.161 0.112 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 4.29e-01 0.11 0.139 0.112 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0232 0.0976 0.112 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 1.34e-01 -0.211 0.14 0.112 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -659883 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0393 0.125 0.112 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -756544 sc-eQTL 9.20e-01 0.0125 0.123 0.112 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 1.52e-01 -0.19 0.132 0.112 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0537 0.12 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0796 0.134 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 7.03e-01 0.0347 0.0909 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 5.99e-01 -0.042 0.0797 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -159076 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0574 0.15 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 9.78e-01 0.00332 0.123 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -659883 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00956 0.152 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -756544 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0666 0.134 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 4.13e-02 0.255 0.124 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 5.24e-01 -0.081 0.127 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 1.97e-01 0.193 0.149 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 5.01e-01 0.0728 0.108 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0894 0.083 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -159076 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0867 0.144 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 6.50e-01 0.059 0.13 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -659883 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0127 0.152 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -756544 sc-eQTL 6.50e-01 0.0562 0.124 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0811 0.124 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0185 0.185 0.112 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 4.41e-01 -0.122 0.158 0.112 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 5.02e-01 -0.11 0.163 0.112 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 9.38e-01 0.0138 0.178 0.112 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0894 0.162 0.112 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 3.94e-01 0.14 0.164 0.112 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0911 0.159 0.112 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 2.24e-02 -0.314 0.136 0.116 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 3.88e-01 0.128 0.148 0.116 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 6.46e-01 0.0578 0.126 0.116 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 9.81e-01 0.00237 0.0988 0.116 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -159076 sc-eQTL 4.01e-01 0.114 0.135 0.116 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 8.20e-01 0.0324 0.142 0.116 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -659883 sc-eQTL 3.41e-01 0.135 0.141 0.116 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -756544 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0478 0.134 0.116 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 8.52e-01 -0.025 0.134 0.116 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 3.03e-01 -0.136 0.132 0.113 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 6.91e-01 0.0561 0.141 0.113 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 2.76e-01 -0.125 0.115 0.113 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0762 0.105 0.113 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -159076 sc-eQTL 3.50e-02 0.246 0.116 0.113 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0304 0.135 0.113 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -659883 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0952 0.128 0.113 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -756544 sc-eQTL 2.52e-02 -0.285 0.126 0.113 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 1.50e-02 0.321 0.131 0.113 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00624 0.154 0.119 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 4.75e-01 -0.121 0.169 0.119 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 2.89e-01 -0.149 0.14 0.119 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0527 0.131 0.119 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 4.85e-01 0.119 0.169 0.119 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -659883 sc-eQTL 7.70e-02 -0.279 0.157 0.119 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -756544 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0614 0.123 0.119 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 1.52e-01 -0.207 0.144 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 1.88e-01 0.195 0.148 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 9.10e-01 -0.014 0.123 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 8.96e-01 0.0143 0.109 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 26097 sc-eQTL 5.78e-01 0.0694 0.125 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 1.52e-01 0.112 0.0779 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0977 0.13 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 7.38e-01 0.0348 0.104 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 5.73e-01 0.0637 0.113 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 4.26e-01 -0.107 0.134 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 2.43e-01 0.124 0.105 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0734 0.1 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 26097 sc-eQTL 6.27e-03 0.261 0.0947 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 1.14e-01 0.107 0.0675 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 5.30e-01 0.0778 0.124 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 6.25e-02 0.163 0.0869 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 5.75e-02 0.197 0.103 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0635 0.114 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 6.11e-01 0.066 0.13 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 8.59e-01 0.0148 0.0827 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0456 0.0727 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -159076 sc-eQTL 6.62e-01 -0.065 0.148 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000143 0.104 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -659883 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0104 0.153 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -756544 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0233 0.125 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 8.37e-02 0.202 0.116 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 1.34e-02 -0.307 0.123 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 5.97e-01 0.0724 0.137 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0723 0.112 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0605 0.0895 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -159076 sc-eQTL 3.08e-01 0.134 0.131 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0353 0.119 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -659883 sc-eQTL 9.41e-01 0.01 0.136 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -756544 sc-eQTL 1.44e-01 -0.188 0.128 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 2.38e-01 0.152 0.129 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -547106 sc-eQTL 3.94e-01 -0.119 0.139 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -547300 sc-eQTL 1.87e-01 0.125 0.0946 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -316309 sc-eQTL 3.36e-01 0.1 0.104 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -8092 sc-eQTL 9.86e-01 0.00202 0.116 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -895214 sc-eQTL 6.84e-01 -0.036 0.0883 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 31178 sc-eQTL 5.83e-02 -0.253 0.133 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 17989 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0242 0.116 0.112 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000168528 SERINC2 -659883 eQTL 0.00372 -0.159 0.0547 0.0 0.0 0.129
ENSG00000237329 AL356320.2 -287052 eQTL 0.0387 -0.103 0.0496 0.00122 0.0 0.129

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina