logo

Genes within 1Mb (chr1:30745004:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 3.20e-01 0.102 0.103 0.158 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00112 0.0824 0.158 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 4.87e-01 0.0481 0.0691 0.158 B L1
ENSG00000162510 MATN1 21419 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0226 0.0727 0.158 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0688 0.0567 0.158 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 1.15e-01 -0.135 0.0854 0.158 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0122 0.0667 0.158 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 1.45e-01 -0.115 0.0786 0.158 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0518 0.0892 0.158 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 1.43e-01 -0.102 0.0694 0.158 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 3.32e-01 0.0603 0.062 0.158 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 1.98e-02 0.16 0.068 0.158 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 1.73e-01 0.0981 0.0717 0.158 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 4.18e-01 0.0499 0.0615 0.158 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0935 0.0735 0.158 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 2.66e-02 -0.26 0.116 0.158 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 1.92e-01 0.102 0.0781 0.158 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 2.58e-01 0.0781 0.0688 0.158 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 5.44e-02 0.129 0.0664 0.158 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 4.20e-01 0.0665 0.0824 0.158 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0135 0.0785 0.158 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0436 0.0987 0.158 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0364 0.105 0.16 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 2.44e-01 -0.144 0.123 0.16 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 3.33e-01 0.094 0.0968 0.16 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 1.82e-01 0.0924 0.0689 0.16 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 2.04e-01 -0.143 0.112 0.16 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -664561 sc-eQTL 8.60e-01 0.0202 0.114 0.16 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -761222 sc-eQTL 2.36e-01 0.0896 0.0754 0.16 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0652 0.109 0.16 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 3.82e-01 0.07 0.08 0.158 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 7.63e-01 -0.03 0.0994 0.158 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 1.08e-01 0.102 0.0633 0.158 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 5.06e-01 -0.039 0.0585 0.158 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -163754 sc-eQTL 6.35e-01 0.0535 0.113 0.158 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 1.97e-01 -0.102 0.0787 0.158 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -664561 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0359 0.121 0.158 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -761222 sc-eQTL 7.78e-02 0.187 0.106 0.158 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 9.40e-01 0.00707 0.093 0.158 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0209 0.115 0.159 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00204 0.0785 0.159 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0162 0.0823 0.159 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 6.75e-01 0.0397 0.0947 0.159 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0239 0.0691 0.159 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 6.26e-01 0.052 0.106 0.159 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0192 0.0983 0.159 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 8.16e-02 -0.15 0.0857 0.158 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 7.70e-01 -0.027 0.0922 0.158 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0302 0.0829 0.158 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 1.75e-01 0.0922 0.0677 0.158 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 6.25e-01 0.0444 0.0907 0.158 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 2.99e-01 0.116 0.111 0.158 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 1.60e-02 -0.278 0.114 0.158 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 1.25e-01 0.21 0.136 0.158 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 9.29e-01 0.0123 0.139 0.158 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0887 0.129 0.158 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 21419 sc-eQTL 3.18e-01 -0.112 0.112 0.158 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 8.88e-01 0.0111 0.0784 0.158 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 4.64e-02 -0.265 0.132 0.158 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 2.56e-01 0.144 0.126 0.158 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 1.97e-02 -0.26 0.11 0.158 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 1.50e-01 0.188 0.13 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 6.51e-01 0.0493 0.109 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 7.27e-01 0.0358 0.103 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 21419 sc-eQTL 1.45e-01 0.156 0.106 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0166 0.0656 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 7.18e-02 -0.219 0.121 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 6.98e-01 0.0358 0.092 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 3.73e-02 -0.214 0.102 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 5.49e-01 0.0743 0.124 0.157 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 5.47e-02 -0.218 0.113 0.157 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 7.51e-01 0.0315 0.0993 0.157 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 21419 sc-eQTL 1.93e-01 0.124 0.0946 0.157 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 5.46e-01 0.0509 0.0841 0.157 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 8.18e-01 0.0259 0.112 0.157 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 7.70e-01 0.0282 0.0963 0.157 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0501 0.113 0.157 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 7.37e-03 0.301 0.111 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 3.68e-01 0.088 0.0976 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0734 0.0861 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 21419 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0331 0.0875 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0323 0.0584 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 2.37e-01 -0.122 0.103 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 9.15e-01 0.00824 0.0768 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0915 0.0946 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 2.27e-01 -0.144 0.119 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0224 0.0987 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 6.08e-02 0.181 0.0958 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 21419 sc-eQTL 8.17e-02 -0.161 0.0921 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 8.95e-01 0.0083 0.063 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 3.94e-02 -0.235 0.113 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0762 0.0916 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 1.21e-01 -0.153 0.0985 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 3.20e-01 0.122 0.122 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 7.00e-01 0.0464 0.12 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 2.61e-01 -0.132 0.118 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00897 0.105 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0243 0.108 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00934 0.115 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0533 0.101 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 5.84e-02 -0.178 0.0936 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 1.38e-01 -0.124 0.0833 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 6.72e-01 0.0283 0.0668 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 1.64e-02 0.171 0.0707 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 4.39e-01 0.0608 0.0784 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 8.30e-01 0.0156 0.0727 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 8.98e-01 0.0108 0.0835 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 8.00e-01 0.03 0.118 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 3.58e-01 0.0878 0.0953 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 1.71e-01 0.116 0.0842 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 2.51e-02 0.156 0.0693 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 8.07e-01 0.023 0.094 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 7.14e-01 0.0327 0.089 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 7.36e-02 -0.177 0.0984 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 3.36e-01 -0.114 0.118 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 8.46e-01 0.0219 0.113 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 6.23e-01 0.0462 0.0938 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 7.60e-01 -0.029 0.0949 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 9.89e-01 0.00141 0.106 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 7.55e-01 0.0348 0.111 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 5.88e-01 0.0593 0.109 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 1.18e-01 -0.199 0.127 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0994 0.0979 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 3.85e-02 0.197 0.0943 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0548 0.105 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00598 0.0919 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0798 0.111 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0831 0.104 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 3.02e-01 -0.123 0.119 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 7.56e-02 0.182 0.102 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 3.16e-01 0.0827 0.0823 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 3.72e-04 0.277 0.0767 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 3.57e-01 0.101 0.11 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 4.05e-01 0.0821 0.0985 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 3.70e-01 0.0963 0.107 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 4.93e-01 0.0931 0.135 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0159 0.124 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 1.43e-01 0.171 0.116 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 5.56e-01 0.072 0.122 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0059 0.125 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0799 0.113 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 9.23e-01 0.0111 0.114 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 1.62e-01 -0.174 0.124 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 3.05e-01 -0.123 0.119 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 6.47e-01 -0.056 0.122 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 4.30e-02 -0.232 0.114 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0716 0.108 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 8.30e-02 -0.206 0.118 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 3.53e-01 -0.1 0.108 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 4.26e-01 -0.102 0.127 0.16 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 1.57e-01 0.16 0.112 0.16 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 3.40e-01 -0.103 0.108 0.16 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 2.01e-01 0.13 0.102 0.16 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 5.26e-01 0.0712 0.112 0.16 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 1.16e-01 0.178 0.113 0.16 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 6.84e-02 -0.213 0.116 0.16 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 7.64e-02 0.229 0.128 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 1.36e-01 -0.163 0.109 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0908 0.115 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 9.32e-01 0.00968 0.113 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0118 0.11 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 6.24e-03 -0.308 0.112 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 9.13e-01 0.0122 0.112 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 1.28e-01 -0.183 0.12 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0401 0.0892 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0216 0.0915 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 6.82e-01 0.0401 0.0976 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 7.82e-01 0.024 0.0868 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 6.25e-01 0.0598 0.122 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 6.83e-01 0.0412 0.101 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0535 0.129 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 3.36e-01 -0.111 0.115 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 3.41e-01 0.107 0.112 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 9.71e-01 0.00394 0.107 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 4.73e-01 0.0869 0.121 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 4.92e-01 0.0786 0.114 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0397 0.11 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 2.40e-01 0.137 0.116 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0236 0.091 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 9.88e-01 0.00143 0.0984 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0808 0.108 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 8.74e-01 0.0147 0.0924 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 4.37e-01 0.0893 0.115 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0713 0.107 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0821 0.126 0.174 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 6.38e-01 0.0691 0.147 0.174 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0923 0.127 0.174 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 21419 sc-eQTL 8.07e-02 0.207 0.117 0.174 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 1.20e-01 0.132 0.084 0.174 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 5.54e-01 0.0775 0.131 0.174 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 2.25e-01 0.141 0.115 0.174 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 8.29e-01 0.0268 0.124 0.174 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 4.84e-02 -0.181 0.0913 0.159 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 8.26e-02 -0.203 0.116 0.159 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0913 0.109 0.159 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00383 0.0783 0.159 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 1.90e-01 -0.151 0.114 0.159 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 9.59e-01 0.00558 0.109 0.159 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 3.35e-01 -0.097 0.1 0.159 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 3.87e-01 0.105 0.121 0.158 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 7.26e-02 -0.211 0.117 0.158 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 5.18e-01 0.0609 0.094 0.158 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 2.18e-01 0.133 0.107 0.158 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 1.38e-01 0.173 0.116 0.158 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0142 0.11 0.158 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0297 0.11 0.158 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 5.74e-02 -0.234 0.122 0.159 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 9.40e-01 0.01 0.134 0.159 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 2.33e-01 0.137 0.114 0.159 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00219 0.0805 0.159 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0876 0.116 0.159 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -664561 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0627 0.103 0.159 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -761222 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00849 0.102 0.159 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 6.48e-02 -0.201 0.108 0.159 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 7.30e-01 0.0336 0.0971 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00346 0.108 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 3.50e-01 0.0686 0.0732 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0496 0.0642 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -163754 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0116 0.121 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0494 0.099 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -664561 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0179 0.123 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -761222 sc-eQTL 4.79e-01 0.0768 0.108 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0447 0.101 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 1.30e-01 0.154 0.102 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 6.50e-01 0.0548 0.121 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 5.90e-01 0.0471 0.0872 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0642 0.067 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -163754 sc-eQTL 4.69e-01 0.0839 0.116 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0764 0.105 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -664561 sc-eQTL 8.72e-01 0.0199 0.123 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -761222 sc-eQTL 5.71e-01 0.0565 0.0996 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0447 0.1 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 9.79e-01 0.0043 0.162 0.148 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 9.41e-01 0.0103 0.139 0.148 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0551 0.143 0.148 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 7.39e-01 0.052 0.156 0.148 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 3.67e-01 0.129 0.142 0.148 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 2.24e-01 0.175 0.143 0.148 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 2.50e-01 -0.16 0.139 0.148 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0582 0.113 0.16 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 1.64e-02 -0.29 0.12 0.16 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0107 0.103 0.16 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0203 0.0809 0.16 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -163754 sc-eQTL 9.53e-01 0.00658 0.111 0.16 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 5.29e-04 -0.398 0.113 0.16 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -664561 sc-eQTL 9.06e-01 0.0137 0.116 0.16 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -761222 sc-eQTL 4.23e-01 0.0882 0.11 0.16 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 6.96e-01 -0.043 0.11 0.16 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 9.40e-02 0.175 0.104 0.163 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0339 0.112 0.163 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 8.32e-01 0.0193 0.0913 0.163 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 8.18e-01 0.0191 0.0829 0.163 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -163754 sc-eQTL 6.50e-01 0.0422 0.0929 0.163 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 4.82e-01 -0.075 0.106 0.163 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -664561 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0848 0.101 0.163 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -761222 sc-eQTL 6.07e-01 0.0522 0.101 0.163 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 1.95e-01 -0.136 0.105 0.163 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 2.97e-02 0.263 0.12 0.164 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 1.41e-01 -0.196 0.132 0.164 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0447 0.111 0.164 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 3.57e-01 0.0947 0.103 0.164 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0489 0.133 0.164 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -664561 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0201 0.125 0.164 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -761222 sc-eQTL 2.83e-01 0.104 0.0965 0.164 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00917 0.114 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 3.57e-02 0.257 0.122 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 2.05e-01 -0.13 0.102 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 1.29e-01 0.138 0.0903 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 21419 sc-eQTL 2.75e-01 0.113 0.103 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 5.00e-01 0.0439 0.0649 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 9.80e-02 -0.178 0.107 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 2.89e-01 0.0911 0.0858 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 1.61e-01 -0.131 0.0933 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 1.60e-01 0.154 0.109 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 6.48e-01 0.0397 0.0869 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 4.50e-01 0.0622 0.0822 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 21419 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0741 0.0791 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 8.72e-01 0.00902 0.0558 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 4.18e-02 -0.207 0.101 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0309 0.072 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0561 0.0855 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 4.23e-01 0.0739 0.092 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 7.36e-01 0.0352 0.104 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 2.18e-01 0.0819 0.0663 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0704 0.0583 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -163754 sc-eQTL 8.69e-01 0.0197 0.119 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0546 0.0838 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -664561 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0175 0.123 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -761222 sc-eQTL 2.36e-01 0.119 0.1 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0284 0.0942 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 1.50e-01 0.145 0.1 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 9.54e-02 -0.183 0.109 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 8.09e-01 0.0219 0.0901 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0369 0.072 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -163754 sc-eQTL 7.95e-01 0.0274 0.105 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 3.94e-02 -0.196 0.0947 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -664561 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0282 0.109 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -761222 sc-eQTL 4.59e-01 0.0768 0.103 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0198 0.104 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -551784 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0812 0.115 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -551978 sc-eQTL 6.39e-01 0.037 0.0787 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -320987 sc-eQTL 9.39e-01 0.00666 0.0863 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -12770 sc-eQTL 6.05e-01 0.0499 0.0963 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -899892 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0122 0.0732 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 sc-eQTL 4.61e-01 0.082 0.111 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 13311 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0504 0.0959 0.159 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000186056 MATN1-AS1 26500 eQTL 1.87e-02 -0.0407 0.0173 0.0 0.0 0.162

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162510 \N 21419 8.53e-05 1.92e-05 6.07e-06 9.4e-06 3.53e-06 1.59e-05 2.99e-05 2.51e-06 1.59e-05 8.7e-06 1.94e-05 7.98e-06 3.3e-05 5.77e-06 6.25e-06 1.15e-05 1.1e-05 1.87e-05 6.61e-06 4.12e-06 9.31e-06 2.18e-05 2.96e-05 6.56e-06 3.01e-05 5.4e-06 8.26e-06 5.65e-06 2.21e-05 1.73e-05 9.73e-06 9.85e-07 1.65e-06 4.01e-06 6.94e-06 3.78e-06 1.78e-06 2.02e-06 2.22e-06 2.38e-06 1.12e-06 3.92e-05 5.69e-06 1.49e-07 2.71e-06 3.1e-06 2.62e-06 1.12e-06 1.46e-06