logo

Genes within 1Mb (chr1:30740727:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0853 0.0983 0.177 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 7.12e-01 0.0291 0.0789 0.177 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 7.68e-01 0.0195 0.0662 0.177 B L1
ENSG00000162510 MATN1 17142 sc-eQTL 6.39e-02 0.129 0.069 0.177 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 7.86e-01 0.0148 0.0545 0.177 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 8.33e-01 0.0174 0.0823 0.177 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 6.84e-01 -0.026 0.0638 0.177 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 1.51e-01 -0.108 0.0752 0.177 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 1.73e-01 -0.118 0.086 0.177 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 6.54e-02 -0.124 0.0669 0.177 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 2.09e-02 -0.138 0.0593 0.177 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0728 0.0664 0.177 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0765 0.0694 0.177 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0564 0.0594 0.177 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0178 0.0713 0.177 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0592 0.113 0.177 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 3.20e-01 -0.075 0.0752 0.177 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 5.94e-02 -0.125 0.0658 0.177 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0592 0.0643 0.177 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0676 0.0793 0.177 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 1.66e-01 0.104 0.0752 0.177 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 1.75e-01 -0.129 0.0945 0.177 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 3.71e-01 0.0905 0.101 0.176 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 1.64e-01 0.167 0.119 0.176 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00626 0.0937 0.176 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 1.55e-01 0.0949 0.0666 0.176 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0722 0.108 0.176 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -668838 sc-eQTL 8.74e-01 0.0176 0.11 0.176 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -765499 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0721 0.0729 0.176 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 3.70e-02 0.22 0.105 0.176 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 5.10e-01 0.0508 0.077 0.177 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 7.79e-02 -0.168 0.0949 0.177 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 3.70e-01 -0.055 0.0612 0.177 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0306 0.0563 0.177 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -168031 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0164 0.108 0.177 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0668 0.0759 0.177 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -668838 sc-eQTL 3.95e-01 -0.099 0.116 0.177 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -765499 sc-eQTL 1.46e-01 -0.149 0.102 0.177 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 7.15e-01 0.0327 0.0895 0.177 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 5.31e-02 -0.21 0.108 0.178 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0573 0.0743 0.178 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 3.60e-01 0.0715 0.0779 0.178 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0883 0.0896 0.178 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0466 0.0655 0.178 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 7.26e-01 0.0354 0.101 0.178 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0901 0.093 0.178 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0552 0.0811 0.177 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0617 0.0867 0.177 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 3.41e-01 0.0743 0.0779 0.177 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0749 0.0637 0.177 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 5.86e-02 -0.161 0.0847 0.177 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 3.39e-01 -0.1 0.104 0.177 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 4.28e-01 0.0866 0.109 0.177 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 2.60e-01 0.142 0.126 0.176 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0587 0.127 0.176 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 6.16e-01 0.0594 0.118 0.176 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 17142 sc-eQTL 1.70e-01 -0.141 0.103 0.176 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 4.65e-01 0.0527 0.0719 0.176 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00197 0.123 0.176 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 3.22e-01 -0.115 0.116 0.176 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 7.28e-01 0.0359 0.103 0.176 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 3.07e-01 -0.124 0.121 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0404 0.101 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00562 0.0952 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 17142 sc-eQTL 5.45e-01 0.06 0.099 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0491 0.0607 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 2.64e-01 -0.126 0.113 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 8.59e-02 -0.146 0.0848 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 5.15e-01 0.0622 0.0954 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 1.43e-01 0.172 0.117 0.177 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 5.05e-01 0.0725 0.109 0.177 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 6.43e-01 0.0439 0.0945 0.177 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 17142 sc-eQTL 1.89e-01 -0.119 0.0901 0.177 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0172 0.0802 0.177 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 7.85e-01 0.0292 0.107 0.177 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 4.17e-01 0.0745 0.0916 0.177 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 6.40e-02 -0.198 0.107 0.177 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 3.80e-02 -0.221 0.106 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 6.75e-01 0.0389 0.0925 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0221 0.0816 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 17142 sc-eQTL 5.72e-02 0.157 0.0821 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 6.41e-01 0.0258 0.0553 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0832 0.0973 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0425 0.0726 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 1.18e-02 -0.224 0.0884 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 4.58e-01 0.0839 0.113 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 1.24e-01 0.143 0.0928 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 2.58e-01 0.103 0.0911 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 17142 sc-eQTL 2.79e-01 0.095 0.0874 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0255 0.0595 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 2.63e-01 0.121 0.108 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 3.84e-01 0.0756 0.0865 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0847 0.0935 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 5.49e-01 -0.069 0.115 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00369 0.113 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 8.30e-02 -0.192 0.11 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 1.84e-02 -0.232 0.0977 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 2.02e-01 -0.129 0.101 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0651 0.108 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 4.61e-02 -0.19 0.0946 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 7.34e-01 0.0303 0.0893 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0724 0.079 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 2.66e-02 -0.14 0.0625 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 1.07e-01 -0.109 0.0673 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0873 0.074 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 8.21e-01 0.0156 0.0687 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00969 0.079 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 1.20e-02 -0.283 0.112 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 1.67e-01 -0.126 0.0911 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 1.38e-01 -0.12 0.0806 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0595 0.0671 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 9.44e-01 0.00633 0.0901 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0355 0.0852 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 2.17e-01 0.117 0.0946 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 5.47e-01 -0.068 0.113 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 6.12e-02 -0.201 0.107 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0981 0.0893 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 1.66e-01 -0.126 0.0902 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 1.66e-01 -0.14 0.101 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 7.00e-02 -0.192 0.105 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 9.89e-02 -0.172 0.104 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 5.61e-01 0.0714 0.123 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 1.63e-01 -0.131 0.0938 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0522 0.0915 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000324 0.101 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 6.26e-01 -0.043 0.0882 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 2.21e-01 0.13 0.106 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0413 0.1 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 7.58e-01 0.0345 0.112 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 7.61e-01 0.0294 0.0963 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0816 0.0773 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 4.10e-04 -0.259 0.0721 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00686 0.103 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 7.33e-01 0.0316 0.0927 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0502 0.101 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0466 0.124 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 7.87e-01 0.0308 0.114 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0828 0.107 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 1.80e-01 -0.15 0.111 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 5.41e-01 0.0699 0.114 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 9.08e-01 -0.012 0.103 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0588 0.105 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 2.37e-01 -0.137 0.116 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 8.08e-01 0.0271 0.111 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 9.09e-01 0.013 0.114 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 8.45e-01 0.021 0.107 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 8.57e-01 0.0181 0.101 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 1.65e-01 0.154 0.11 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 6.54e-01 0.0451 0.1 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0924 0.118 0.18 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 4.35e-01 -0.082 0.105 0.18 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 8.74e-01 0.016 0.101 0.18 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 1.67e-01 -0.131 0.0945 0.18 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0755 0.104 0.18 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0646 0.106 0.18 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 2.31e-01 0.13 0.109 0.18 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 3.98e-02 -0.246 0.119 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0911 0.101 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 9.11e-01 -0.012 0.107 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 1.13e-03 -0.339 0.103 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0579 0.102 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0256 0.106 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 7.67e-01 0.031 0.104 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0842 0.115 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0708 0.0849 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 3.81e-01 0.0765 0.0871 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 7.56e-01 0.029 0.093 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 1.59e-01 -0.116 0.0824 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 5.30e-01 0.0732 0.116 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 2.56e-01 -0.109 0.0959 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 6.76e-01 0.0501 0.119 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 5.71e-03 -0.292 0.105 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 5.46e-02 0.199 0.103 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 5.49e-02 -0.19 0.0983 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 9.95e-01 0.000753 0.112 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 1.15e-01 0.166 0.105 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0633 0.102 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 2.90e-01 -0.117 0.11 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 8.63e-01 0.0149 0.0861 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 2.61e-01 -0.105 0.0928 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0996 0.102 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 8.74e-01 0.0138 0.0873 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00921 0.109 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00365 0.101 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 4.31e-01 0.101 0.128 0.17 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 4.00e-01 -0.125 0.148 0.17 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 1.95e-01 -0.167 0.128 0.17 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 17142 sc-eQTL 2.64e-01 -0.135 0.12 0.17 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 5.34e-01 0.0537 0.086 0.17 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 1.71e-01 -0.181 0.132 0.17 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 2.30e-01 -0.141 0.117 0.17 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 4.21e-01 -0.101 0.125 0.17 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 2.33e-01 0.106 0.0883 0.178 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 6.22e-01 0.0556 0.112 0.178 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00219 0.105 0.178 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0614 0.0752 0.178 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0566 0.11 0.178 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 9.93e-01 0.000966 0.105 0.178 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 3.73e-01 0.0862 0.0966 0.178 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 6.84e-01 0.0478 0.117 0.177 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 3.04e-01 -0.117 0.113 0.177 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0423 0.0908 0.177 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0232 0.104 0.177 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 2.59e-01 0.127 0.112 0.177 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0186 0.106 0.177 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0372 0.106 0.177 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 9.41e-02 0.193 0.115 0.173 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 9.17e-01 0.013 0.125 0.173 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0647 0.107 0.173 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 9.22e-01 0.00741 0.0754 0.173 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0736 0.109 0.173 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -668838 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0681 0.0967 0.173 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -765499 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0668 0.095 0.173 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 1.41e-01 0.15 0.102 0.173 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0116 0.0934 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 3.38e-02 -0.22 0.103 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 9.60e-01 0.00356 0.0705 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00361 0.0619 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -168031 sc-eQTL 2.78e-01 -0.126 0.116 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 4.26e-02 -0.192 0.0943 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -668838 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0963 0.118 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -765499 sc-eQTL 4.37e-01 -0.081 0.104 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 4.40e-01 0.0752 0.0971 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 5.10e-01 0.0642 0.0973 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0827 0.115 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0978 0.0829 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0165 0.0639 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -168031 sc-eQTL 8.43e-01 0.0218 0.11 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 1.82e-01 0.133 0.0993 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -668838 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0685 0.117 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -765499 sc-eQTL 6.74e-01 -0.04 0.095 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 9.93e-01 0.000846 0.0954 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0726 0.143 0.188 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 1.69e-02 -0.291 0.12 0.188 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0329 0.126 0.188 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 1.65e-01 -0.191 0.137 0.188 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 1.97e-01 -0.162 0.125 0.188 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 4.37e-01 0.0987 0.127 0.188 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 1.43e-01 0.18 0.122 0.188 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00436 0.11 0.178 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 8.89e-01 0.0166 0.118 0.178 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 3.88e-01 0.0866 0.1 0.178 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 1.19e-01 -0.122 0.0782 0.178 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -168031 sc-eQTL 7.76e-01 0.0307 0.108 0.178 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0316 0.113 0.178 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -668838 sc-eQTL 2.78e-02 -0.247 0.111 0.178 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -765499 sc-eQTL 2.88e-02 -0.233 0.106 0.178 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 7.37e-01 0.036 0.107 0.178 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 5.53e-01 0.0608 0.102 0.176 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 1.25e-01 -0.167 0.108 0.176 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 5.90e-01 -0.048 0.0891 0.176 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 4.70e-01 0.0586 0.0808 0.176 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -168031 sc-eQTL 1.23e-01 0.14 0.0902 0.176 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0657 0.104 0.176 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -668838 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0987 0.0988 0.176 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -765499 sc-eQTL 5.95e-01 0.0527 0.0989 0.176 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00781 0.103 0.176 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0445 0.115 0.175 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 9.31e-01 0.0109 0.126 0.175 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 2.82e-01 0.112 0.104 0.175 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 3.22e-01 0.0963 0.0968 0.175 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0979 0.126 0.175 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -668838 sc-eQTL 6.53e-01 0.0531 0.118 0.175 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -765499 sc-eQTL 5.42e-01 0.0559 0.0913 0.175 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 8.26e-01 0.0237 0.108 0.175 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 8.81e-01 0.0173 0.115 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0678 0.0959 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 9.75e-01 0.00267 0.0851 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 17142 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0128 0.097 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0603 0.0608 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0299 0.101 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 2.12e-01 -0.1 0.0803 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0308 0.0878 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 3.06e-01 -0.106 0.104 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 2.25e-01 0.0995 0.0818 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 3.36e-01 0.0747 0.0775 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 17142 sc-eQTL 3.85e-02 0.154 0.074 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 8.76e-01 0.00823 0.0526 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 9.90e-01 0.00116 0.0961 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00424 0.068 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 9.41e-03 -0.208 0.0795 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 4.47e-01 0.0671 0.0882 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 6.51e-02 -0.184 0.0992 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0483 0.0637 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 8.95e-01 -0.00743 0.0561 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -168031 sc-eQTL 2.76e-01 -0.125 0.114 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0423 0.0803 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -668838 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0758 0.118 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -765499 sc-eQTL 4.37e-01 -0.075 0.0963 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 6.05e-01 0.0468 0.0902 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0474 0.0974 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 4.20e-01 -0.086 0.107 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00834 0.0874 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0328 0.0699 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -168031 sc-eQTL 2.98e-01 0.106 0.102 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0653 0.0927 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -668838 sc-eQTL 4.72e-02 -0.209 0.105 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -765499 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0968 0.1 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 6.88e-01 0.0404 0.101 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -556061 sc-eQTL 1.26e-01 -0.167 0.108 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -556255 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0858 0.0742 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -325264 sc-eQTL 7.99e-01 0.0208 0.0815 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -17047 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0509 0.0911 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -904169 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0237 0.0692 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 22223 sc-eQTL 4.29e-01 0.0833 0.105 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 9034 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0798 0.0906 0.179 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162510 MATN1 17142 eQTL 0.00468 0.0793 0.028 0.00119 0.00155 0.154

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina