logo

Genes within 1Mb (chr1:30735195:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00111 0.13 0.092 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0289 0.104 0.092 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 6.91e-02 0.159 0.0868 0.092 B L1
ENSG00000162510 MATN1 11610 sc-eQTL 1.35e-01 0.137 0.0915 0.092 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 6.50e-01 0.0327 0.072 0.092 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00119 0.109 0.092 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0941 0.0841 0.092 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 6.50e-01 0.0453 0.0998 0.092 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0453 0.11 0.092 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 6.00e-02 0.162 0.0856 0.092 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 6.48e-01 0.0351 0.0768 0.092 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 7.24e-01 -0.03 0.0851 0.092 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 3.23e-01 0.088 0.0888 0.092 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 1.51e-01 -0.109 0.0758 0.092 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 9.12e-01 0.0101 0.0912 0.092 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 6.83e-01 0.0599 0.147 0.092 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 1.58e-01 0.138 0.0973 0.092 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 8.33e-01 0.0182 0.086 0.092 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 5.11e-01 0.0549 0.0835 0.092 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 7.00e-01 0.0398 0.103 0.092 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 4.39e-02 -0.197 0.097 0.092 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 8.75e-01 0.0194 0.123 0.092 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 3.42e-01 0.136 0.143 0.083 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 2.55e-03 0.506 0.166 0.083 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0158 0.133 0.083 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 1.95e-02 -0.22 0.0934 0.083 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0815 0.153 0.083 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -674370 sc-eQTL 3.74e-01 -0.139 0.156 0.083 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -771031 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0701 0.103 0.083 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 4.96e-01 -0.102 0.15 0.083 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 9.57e-01 0.00549 0.103 0.092 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 2.29e-01 0.153 0.127 0.092 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0478 0.0816 0.092 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 3.00e-01 0.0779 0.0749 0.092 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -173563 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0876 0.144 0.092 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 4.87e-02 0.199 0.1 0.092 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -674370 sc-eQTL 7.07e-01 0.0584 0.155 0.092 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -771031 sc-eQTL 2.28e-01 -0.164 0.136 0.092 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 6.27e-01 -0.058 0.119 0.092 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 8.45e-03 -0.366 0.138 0.092 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 3.90e-01 0.0823 0.0956 0.092 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 7.20e-01 0.036 0.1 0.092 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 2.63e-01 -0.129 0.115 0.092 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0881 0.0842 0.092 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 8.21e-02 -0.225 0.129 0.092 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 2.65e-01 -0.134 0.12 0.092 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0428 0.109 0.092 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 2.35e-01 0.138 0.116 0.092 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0265 0.104 0.092 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 2.16e-01 -0.106 0.0853 0.092 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0132 0.114 0.092 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0873 0.14 0.092 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 3.13e-01 0.147 0.146 0.092 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 1.49e-01 -0.248 0.171 0.089 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 2.00e-01 -0.223 0.173 0.089 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 2.93e-01 0.17 0.161 0.089 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 11610 sc-eQTL 5.96e-01 0.075 0.141 0.089 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 8.83e-01 0.0145 0.0985 0.089 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 4.70e-01 0.121 0.167 0.089 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 4.93e-01 0.109 0.159 0.089 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 7.83e-02 0.247 0.139 0.089 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 1.77e-01 0.224 0.166 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 8.57e-01 0.0251 0.139 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 8.31e-01 0.0279 0.131 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 11610 sc-eQTL 8.99e-02 0.231 0.135 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 3.33e-01 0.081 0.0835 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 8.52e-01 -0.029 0.155 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 2.86e-01 -0.125 0.117 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 6.95e-02 -0.238 0.13 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00777 0.163 0.093 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 8.75e-01 0.0236 0.15 0.093 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0563 0.131 0.093 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 11610 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0164 0.125 0.093 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 3.17e-01 0.111 0.111 0.093 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 2.08e-01 -0.186 0.147 0.093 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0736 0.127 0.093 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0221 0.149 0.093 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 4.50e-01 -0.108 0.143 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 1.40e-01 -0.182 0.123 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 3.38e-01 0.104 0.108 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 11610 sc-eQTL 5.06e-01 0.0734 0.11 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 7.25e-01 0.0259 0.0737 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 7.67e-02 0.229 0.129 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 2.02e-01 -0.123 0.0964 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 6.24e-01 0.0586 0.119 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 6.67e-01 0.0659 0.153 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 1.44e-01 0.184 0.125 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 4.66e-02 0.245 0.122 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 11610 sc-eQTL 5.66e-01 0.0681 0.118 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 1.17e-01 0.126 0.08 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0691 0.146 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 2.62e-02 -0.259 0.116 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 8.44e-01 0.0249 0.127 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 3.61e-01 -0.137 0.15 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 4.05e-01 0.123 0.147 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0444 0.145 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0893 0.129 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 8.90e-01 0.0184 0.132 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0647 0.141 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 8.35e-01 0.026 0.125 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 4.85e-01 0.0822 0.118 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 4.55e-01 0.0779 0.104 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 9.88e-02 0.137 0.0828 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0322 0.0893 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 1.66e-01 0.136 0.0975 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0675 0.0905 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0311 0.104 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0455 0.145 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 3.47e-01 0.11 0.117 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 2.78e-01 -0.112 0.103 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0139 0.0859 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 6.95e-01 0.0453 0.115 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 5.62e-02 -0.208 0.108 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 1.12e-01 -0.193 0.121 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 8.23e-01 -0.033 0.147 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 5.61e-01 0.0816 0.14 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 3.08e-01 -0.119 0.117 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0383 0.118 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 1.70e-01 0.181 0.132 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 2.98e-01 -0.144 0.138 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 2.18e-01 0.168 0.136 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 1.78e-01 0.216 0.16 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 1.02e-01 0.201 0.122 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0927 0.119 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0479 0.132 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 6.19e-01 0.0574 0.115 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 1.02e-01 -0.227 0.138 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 9.17e-01 0.0137 0.131 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 1.81e-01 -0.195 0.145 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 4.05e-01 0.105 0.126 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0226 0.101 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 7.73e-01 0.028 0.097 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 3.43e-01 -0.128 0.135 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 1.12e-01 -0.192 0.12 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 7.33e-01 -0.045 0.132 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 7.76e-01 0.0509 0.179 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 2.96e-01 -0.171 0.163 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0518 0.154 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 8.43e-01 0.032 0.161 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 9.69e-01 0.00643 0.165 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 7.77e-01 0.0422 0.149 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 4.27e-01 -0.12 0.15 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0322 0.156 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 5.67e-01 0.0858 0.15 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 4.13e-01 -0.126 0.153 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 4.38e-01 0.112 0.144 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 1.17e-01 0.212 0.135 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 3.35e-01 -0.144 0.149 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 3.96e-01 -0.115 0.135 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0571 0.159 0.091 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0476 0.141 0.091 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 9.00e-01 -0.017 0.135 0.091 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 7.48e-02 -0.226 0.126 0.091 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0221 0.14 0.091 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0395 0.142 0.091 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 1.42e-01 0.214 0.145 0.091 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 1.79e-01 -0.214 0.159 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 1.31e-01 0.203 0.134 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0862 0.142 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0543 0.14 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0623 0.136 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 4.07e-02 0.286 0.139 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 3.49e-01 0.13 0.138 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 1.04e-01 -0.246 0.15 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 2.36e-01 0.132 0.111 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 8.61e-01 0.02 0.115 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0742 0.122 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0638 0.109 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 4.83e-02 -0.302 0.152 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 1.12e-01 -0.201 0.126 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 9.96e-02 -0.254 0.153 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 7.09e-01 0.0514 0.138 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 5.81e-01 0.0742 0.134 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 5.31e-02 -0.247 0.127 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0579 0.144 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 8.82e-01 0.0203 0.136 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 9.05e-02 -0.223 0.131 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0926 0.145 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 5.94e-01 0.0602 0.113 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 7.73e-01 0.0353 0.122 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 6.29e-01 -0.065 0.134 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0327 0.115 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 1.99e-01 -0.183 0.142 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00889 0.133 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0491 0.159 0.107 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 5.92e-01 0.0988 0.184 0.107 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 3.51e-01 0.149 0.159 0.107 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 11610 sc-eQTL 5.87e-01 0.0811 0.149 0.107 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 3.25e-01 -0.105 0.106 0.107 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 2.70e-01 0.181 0.163 0.107 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 3.72e-01 -0.13 0.145 0.107 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0343 0.155 0.107 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 7.09e-01 0.0439 0.118 0.091 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 2.54e-01 0.17 0.149 0.091 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 3.58e-01 0.128 0.139 0.091 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 1.35e-01 0.149 0.0995 0.091 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 2.09e-02 0.337 0.145 0.091 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0528 0.14 0.091 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 3.85e-01 0.112 0.128 0.091 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 7.60e-01 0.0462 0.151 0.092 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 3.34e-01 0.141 0.146 0.092 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0797 0.117 0.092 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 2.41e-01 -0.157 0.134 0.092 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 3.57e-02 -0.303 0.143 0.092 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 4.53e-01 -0.103 0.136 0.092 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0706 0.136 0.092 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 8.63e-01 0.0295 0.171 0.08 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0884 0.185 0.08 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 9.05e-01 0.019 0.159 0.08 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 7.40e-01 -0.037 0.111 0.08 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 4.06e-01 -0.134 0.161 0.08 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -674370 sc-eQTL 6.33e-01 0.0683 0.143 0.08 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -771031 sc-eQTL 6.27e-01 0.0684 0.14 0.08 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 7.76e-01 0.043 0.151 0.08 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 1.64e-01 -0.173 0.124 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 1.75e-01 0.188 0.138 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 1.02e-01 -0.153 0.0933 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 2.25e-01 0.1 0.0821 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -173563 sc-eQTL 5.40e-01 0.0953 0.155 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 8.93e-01 -0.017 0.127 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -674370 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0218 0.157 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -771031 sc-eQTL 2.34e-01 -0.165 0.138 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 4.89e-01 0.0897 0.129 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 2.85e-01 -0.142 0.132 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 7.94e-01 -0.041 0.157 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 3.58e-01 0.104 0.113 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 8.28e-01 0.0189 0.0871 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -173563 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0595 0.15 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 5.41e-02 0.261 0.135 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -674370 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0274 0.159 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -771031 sc-eQTL 7.87e-01 -0.035 0.129 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 6.67e-01 -0.056 0.13 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 4.95e-01 -0.138 0.201 0.082 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00364 0.173 0.082 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 9.52e-01 0.0108 0.178 0.082 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0141 0.194 0.082 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 6.73e-01 0.075 0.177 0.082 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 3.39e-01 -0.171 0.178 0.082 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 9.00e-01 0.0218 0.173 0.082 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 2.23e-01 -0.184 0.15 0.084 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 4.00e-01 0.137 0.162 0.084 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 7.67e-01 0.0408 0.138 0.084 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 4.95e-01 0.0738 0.108 0.084 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -173563 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0429 0.148 0.084 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0021 0.155 0.084 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -674370 sc-eQTL 3.24e-01 0.153 0.154 0.084 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -771031 sc-eQTL 9.84e-01 0.00294 0.147 0.084 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 6.92e-02 -0.266 0.146 0.084 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 3.04e-01 0.15 0.146 0.084 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 5.81e-01 -0.086 0.156 0.084 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 6.45e-01 0.0586 0.127 0.084 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0755 0.115 0.084 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -173563 sc-eQTL 6.38e-01 0.0611 0.129 0.084 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0426 0.148 0.084 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -674370 sc-eQTL 6.80e-01 0.0583 0.141 0.084 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -771031 sc-eQTL 1.13e-01 -0.224 0.14 0.084 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 3.48e-01 -0.138 0.146 0.084 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 9.26e-01 0.0153 0.164 0.076 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 6.21e-03 0.487 0.176 0.076 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 9.26e-02 -0.25 0.148 0.076 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0921 0.139 0.076 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0343 0.18 0.076 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -674370 sc-eQTL 6.27e-02 -0.312 0.166 0.076 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -771031 sc-eQTL 6.14e-01 -0.066 0.13 0.076 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 5.40e-01 0.0942 0.153 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 9.60e-01 0.00795 0.16 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 6.34e-01 0.0633 0.133 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 7.41e-01 0.0389 0.118 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 11610 sc-eQTL 6.39e-02 0.248 0.133 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 6.91e-01 0.0336 0.0843 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0422 0.14 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 2.67e-01 -0.124 0.111 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 3.15e-01 -0.122 0.121 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0608 0.138 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0231 0.11 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 2.62e-01 0.116 0.103 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 11610 sc-eQTL 4.50e-01 0.0754 0.0996 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 5.65e-01 0.0405 0.0702 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 1.34e-01 0.192 0.128 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 1.16e-01 -0.142 0.0902 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 3.88e-01 0.0931 0.108 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0943 0.117 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 3.47e-01 0.124 0.132 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0636 0.0843 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 3.03e-01 0.0764 0.074 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -173563 sc-eQTL 9.38e-01 0.0118 0.151 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 1.31e-01 0.16 0.106 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -674370 sc-eQTL 8.06e-01 0.0382 0.156 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -771031 sc-eQTL 1.57e-01 -0.18 0.127 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 9.33e-01 0.01 0.12 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 9.88e-01 0.00197 0.132 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 2.54e-01 0.164 0.144 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 7.01e-01 0.0454 0.118 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 4.00e-01 0.0796 0.0944 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -173563 sc-eQTL 6.91e-01 0.0549 0.138 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 7.25e-01 0.0442 0.125 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -674370 sc-eQTL 3.21e-01 0.142 0.143 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -771031 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0958 0.136 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 6.26e-02 -0.253 0.135 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -561593 sc-eQTL 1.71e-02 -0.335 0.139 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -561787 sc-eQTL 5.70e-01 0.0549 0.0965 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -330796 sc-eQTL 7.30e-01 0.0365 0.106 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 sc-eQTL 2.22e-01 -0.144 0.118 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -909701 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0609 0.0897 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 sc-eQTL 1.46e-02 -0.331 0.134 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 3502 sc-eQTL 1.02e-01 -0.192 0.117 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162510 MATN1 11610 eQTL 0.00276 -0.0969 0.0323 0.00179 0.00156 0.0952
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 eQTL 2.68e-12 0.114 0.0161 0.0 0.00339 0.0952
ENSG00000186056 MATN1-AS1 16691 eQTL 3.65e-05 -0.0855 0.0206 0.00113 0.00111 0.0952
ENSG00000284543 LINC01226 -771086 eQTL 0.002 -0.161 0.0521 0.00292 0.0014 0.0952

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162511 LAPTM5 -22579 0.000181 1.62e-05 1.79e-06 1.01e-05 2.42e-06 2.24e-05 2.56e-05 2.41e-06 1.54e-05 6.12e-06 2.22e-05 7.55e-06 3.39e-05 4.33e-06 3.71e-06 1.3e-05 1.02e-05 2.59e-05 2.95e-06 3.12e-06 7.08e-06 2.18e-05 2.21e-05 4.9e-06 3.39e-05 4.5e-06 8.02e-06 5e-06 1.58e-05 1.36e-05 7.65e-06 1.07e-06 1.28e-06 3.54e-06 8.57e-06 2.36e-06 1.41e-06 1.45e-06 2.03e-06 2.37e-06 1.3e-06 4.41e-05 6.6e-06 1.99e-07 1.84e-06 1.61e-06 3.11e-06 7.8e-07 5.98e-07