logo

Genes within 1Mb (chr1:30727589:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 9.23e-01 0.0101 0.104 0.162 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 1.18e-01 -0.13 0.0829 0.162 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 5.59e-01 0.0409 0.0699 0.162 B L1
ENSG00000162510 MATN1 4004 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00278 0.0735 0.162 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 4.18e-01 0.0467 0.0575 0.162 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 1.98e-01 -0.112 0.0866 0.162 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 1.11e-01 -0.107 0.0671 0.162 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 1.89e-01 -0.105 0.0795 0.162 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0546 0.0896 0.162 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0378 0.0701 0.162 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 6.50e-01 0.0283 0.0624 0.162 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 1.31e-02 0.171 0.0682 0.162 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 4.13e-01 0.0592 0.0722 0.162 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 7.35e-01 -0.021 0.0618 0.162 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 2.07e-02 -0.171 0.0732 0.162 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 3.11e-01 -0.121 0.119 0.162 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 3.47e-01 0.0743 0.0789 0.162 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 3.29e-01 0.068 0.0695 0.162 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 5.37e-03 0.187 0.0664 0.162 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00649 0.0833 0.162 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0479 0.0792 0.162 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 2.18e-01 -0.123 0.0993 0.162 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0486 0.104 0.167 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0301 0.123 0.167 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 7.74e-02 0.17 0.0959 0.167 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 3.01e-01 0.0714 0.0689 0.167 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 6.16e-01 0.0563 0.112 0.167 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -681976 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0471 0.114 0.167 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -778637 sc-eQTL 3.37e-01 0.0724 0.0752 0.167 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0582 0.109 0.167 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 6.94e-01 0.0321 0.0815 0.162 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0352 0.101 0.162 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 8.14e-01 0.0152 0.0648 0.162 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0485 0.0595 0.162 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -181169 sc-eQTL 2.68e-01 -0.127 0.114 0.162 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0661 0.0803 0.162 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -681976 sc-eQTL 2.19e-01 -0.151 0.123 0.162 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -778637 sc-eQTL 4.69e-01 0.0785 0.108 0.162 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 7.35e-01 0.0321 0.0946 0.162 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 6.00e-01 0.0602 0.115 0.163 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 1.48e-01 -0.113 0.0781 0.163 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 5.68e-01 0.0471 0.0822 0.163 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 2.75e-01 0.103 0.0945 0.163 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000675 0.0691 0.163 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0115 0.106 0.163 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0137 0.0983 0.163 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 3.32e-01 0.0835 0.0858 0.162 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0604 0.0918 0.162 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 1.46e-01 -0.12 0.0823 0.162 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 1.88e-02 0.158 0.0669 0.162 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 3.04e-01 0.093 0.0903 0.162 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 7.68e-01 0.0327 0.111 0.162 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 4.93e-02 -0.226 0.115 0.162 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 3.48e-01 0.126 0.133 0.166 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 4.98e-01 0.0915 0.135 0.166 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0431 0.125 0.166 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 4004 sc-eQTL 1.32e-01 -0.165 0.109 0.166 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0188 0.0763 0.166 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 2.45e-01 -0.151 0.129 0.166 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 5.94e-01 0.0657 0.123 0.166 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 6.11e-02 -0.204 0.108 0.166 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 6.17e-01 0.0643 0.128 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0358 0.107 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0241 0.101 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 4004 sc-eQTL 2.88e-01 0.112 0.105 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 4.64e-01 0.0473 0.0644 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 2.83e-01 -0.129 0.119 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0133 0.0906 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0771 0.101 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 7.22e-01 0.0443 0.125 0.162 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 2.66e-01 -0.128 0.114 0.162 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 7.16e-01 0.0364 0.0998 0.162 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 4004 sc-eQTL 4.05e-01 0.0797 0.0954 0.162 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0181 0.0847 0.162 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0473 0.113 0.162 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0867 0.0967 0.162 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 9.31e-01 0.00991 0.114 0.162 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 5.49e-01 0.0687 0.114 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000879 0.0987 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 8.25e-01 0.0193 0.0871 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 4004 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00447 0.0884 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 4.22e-01 0.0475 0.0589 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0224 0.104 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0981 0.0772 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 8.19e-01 -0.022 0.0958 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 7.66e-02 -0.212 0.119 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 1.45e-02 -0.24 0.0975 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 1.58e-01 0.137 0.0963 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 4004 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0685 0.0928 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 8.65e-01 0.0108 0.0631 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 4.97e-02 -0.225 0.114 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0534 0.0918 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 2.59e-01 -0.112 0.099 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0421 0.121 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 4.29e-01 0.0944 0.119 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0474 0.117 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 9.62e-01 0.00495 0.104 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 8.55e-01 0.0195 0.107 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 7.51e-01 0.0363 0.114 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0456 0.101 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 1.22e-01 -0.146 0.094 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0399 0.0838 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 7.60e-01 0.0205 0.0669 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 4.99e-02 0.14 0.0711 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0187 0.0786 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 2.06e-01 -0.092 0.0725 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0536 0.0835 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0121 0.119 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 5.04e-01 0.0639 0.0955 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 5.70e-01 0.0481 0.0846 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 6.57e-04 0.236 0.0683 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 6.55e-01 0.0421 0.0941 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 9.02e-01 0.0109 0.0891 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 2.59e-01 -0.112 0.0989 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 6.41e-01 0.055 0.118 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0571 0.112 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 5.67e-01 0.0535 0.0934 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 3.70e-01 0.0847 0.0944 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 2.65e-01 0.118 0.106 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 8.60e-01 0.0196 0.111 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00706 0.109 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0998 0.129 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 2.34e-01 -0.117 0.0984 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 4.23e-03 0.272 0.094 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 7.03e-01 0.0405 0.106 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0438 0.0924 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 2.66e-01 -0.124 0.111 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 8.49e-01 -0.02 0.105 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0529 0.118 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 1.74e-02 0.24 0.1 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0408 0.0816 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 6.22e-03 0.212 0.0769 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0317 0.109 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0606 0.0976 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0218 0.106 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 9.59e-01 0.00673 0.132 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 9.54e-01 0.00701 0.121 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 5.02e-01 0.0762 0.113 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 3.74e-01 0.106 0.119 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0285 0.121 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 3.40e-01 0.105 0.11 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 2.53e-01 0.127 0.111 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 9.99e-01 0.000219 0.131 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 9.31e-01 0.0109 0.126 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0401 0.129 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0664 0.121 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 8.09e-01 0.0276 0.114 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 2.43e-03 -0.377 0.123 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 7.58e-01 -0.035 0.114 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 4.98e-01 0.0861 0.127 0.162 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 2.94e-01 0.118 0.112 0.162 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 2.67e-01 -0.12 0.108 0.162 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 1.67e-01 0.14 0.101 0.162 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 3.15e-01 0.112 0.112 0.162 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 3.31e-01 0.11 0.113 0.162 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 1.79e-01 -0.157 0.116 0.162 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 2.80e-01 0.137 0.127 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 3.82e-02 -0.222 0.106 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0377 0.113 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 7.42e-01 0.0367 0.111 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0908 0.108 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 4.79e-03 -0.313 0.11 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 8.18e-01 0.0254 0.11 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0316 0.121 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 1.48e-01 -0.129 0.0888 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 6.50e-01 0.0416 0.0915 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 2.04e-01 0.124 0.0973 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0354 0.0868 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 3.90e-01 0.105 0.122 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 4.70e-01 0.0729 0.101 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0741 0.128 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00601 0.114 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 1.85e-01 0.148 0.111 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 6.28e-01 0.0516 0.106 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0563 0.12 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 4.90e-01 0.078 0.113 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 6.06e-01 0.0564 0.109 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 3.48e-01 0.111 0.118 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0465 0.0923 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 6.51e-01 0.0452 0.0998 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 6.40e-01 0.0515 0.11 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 2.23e-01 0.114 0.0934 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 8.13e-01 0.0276 0.117 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0195 0.108 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0587 0.14 0.174 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0223 0.163 0.174 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 4.75e-01 -0.101 0.141 0.174 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 4004 sc-eQTL 4.10e-01 0.109 0.131 0.174 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 3.54e-01 0.0874 0.0938 0.174 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 7.36e-01 0.049 0.145 0.174 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 1.96e-01 0.167 0.128 0.174 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 6.23e-02 -0.254 0.135 0.174 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00127 0.093 0.161 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 1.73e-02 -0.279 0.116 0.161 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 1.03e-01 -0.179 0.109 0.161 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 2.75e-01 0.0862 0.0788 0.161 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0774 0.116 0.161 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 9.45e-01 0.00761 0.11 0.161 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 2.75e-01 -0.111 0.101 0.161 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 4.09e-01 0.101 0.122 0.162 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 9.99e-01 0.000153 0.118 0.162 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 5.06e-01 0.0628 0.0943 0.162 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 2.51e-01 0.124 0.108 0.162 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 2.32e-01 0.14 0.116 0.162 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 3.72e-01 0.0984 0.11 0.162 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 1.24e-01 -0.169 0.109 0.162 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 3.16e-01 -0.121 0.12 0.171 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 5.95e-01 0.0694 0.13 0.171 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 1.44e-02 0.272 0.11 0.171 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 8.60e-01 0.0139 0.0785 0.171 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 2.77e-01 0.124 0.113 0.171 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -681976 sc-eQTL 1.37e-01 -0.15 0.1 0.171 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -778637 sc-eQTL 3.16e-01 0.0994 0.0988 0.171 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 2.51e-01 -0.122 0.106 0.171 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0417 0.0988 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0966 0.11 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 6.84e-01 0.0304 0.0746 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0755 0.0653 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -181169 sc-eQTL 1.27e-01 -0.188 0.123 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0366 0.101 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -681976 sc-eQTL 3.41e-01 -0.119 0.125 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -778637 sc-eQTL 9.99e-01 0.00014 0.11 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0178 0.103 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 4.07e-01 0.086 0.104 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 3.60e-01 0.112 0.122 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0807 0.0884 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0407 0.068 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -181169 sc-eQTL 5.17e-01 0.0762 0.117 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0765 0.106 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -681976 sc-eQTL 2.92e-01 -0.131 0.124 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -778637 sc-eQTL 7.75e-01 0.0289 0.101 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0473 0.102 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0713 0.153 0.155 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 7.03e-01 0.0501 0.131 0.155 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00758 0.135 0.155 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0278 0.147 0.155 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 1.18e-01 0.21 0.133 0.155 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0404 0.136 0.155 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 2.67e-01 -0.146 0.131 0.155 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0143 0.116 0.164 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0274 0.124 0.164 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0195 0.105 0.164 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 9.21e-01 0.00821 0.0827 0.164 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -181169 sc-eQTL 3.13e-01 -0.114 0.113 0.164 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 2.40e-01 -0.14 0.119 0.164 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -681976 sc-eQTL 1.53e-01 -0.169 0.118 0.164 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -778637 sc-eQTL 6.45e-01 0.0518 0.112 0.164 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0805 0.112 0.164 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 2.61e-02 0.239 0.107 0.163 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 2.59e-01 -0.13 0.115 0.163 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0346 0.094 0.163 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 3.77e-02 0.177 0.0845 0.163 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -181169 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0624 0.0956 0.163 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 3.29e-01 -0.107 0.11 0.163 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -681976 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0364 0.104 0.163 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -778637 sc-eQTL 9.83e-01 0.00227 0.104 0.163 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0679 0.108 0.163 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 4.55e-01 0.0911 0.122 0.172 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0211 0.134 0.172 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 9.03e-01 0.0136 0.111 0.172 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 4.61e-01 0.076 0.103 0.172 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0191 0.134 0.172 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -681976 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0569 0.125 0.172 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -778637 sc-eQTL 8.94e-01 -0.013 0.097 0.172 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 7.76e-01 0.0326 0.114 0.172 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 3.68e-01 0.11 0.122 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0899 0.101 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 7.80e-01 0.0252 0.0901 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 4004 sc-eQTL 4.25e-01 0.082 0.103 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 2.38e-01 0.0761 0.0643 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 2.18e-01 -0.132 0.106 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0325 0.0853 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0766 0.0929 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0597 0.111 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 2.28e-01 -0.106 0.0875 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 2.08e-01 0.104 0.0828 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 4004 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0129 0.08 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 3.75e-01 0.05 0.0562 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 1.47e-01 -0.149 0.102 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 1.39e-01 -0.107 0.0723 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0401 0.0863 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00308 0.0939 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0152 0.106 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0124 0.0678 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 1.10e-01 -0.0951 0.0593 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -181169 sc-eQTL 3.74e-01 -0.108 0.121 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0338 0.0855 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -681976 sc-eQTL 2.71e-01 -0.138 0.125 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -778637 sc-eQTL 6.60e-01 0.0452 0.103 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0117 0.096 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 5.00e-02 0.2 0.101 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0852 0.112 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 9.85e-01 0.00174 0.0917 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 3.22e-01 0.0727 0.0732 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -181169 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0786 0.107 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 1.38e-01 -0.144 0.0969 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -681976 sc-eQTL 3.63e-01 -0.101 0.111 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -778637 sc-eQTL 7.11e-01 0.0391 0.105 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 8.99e-01 0.0135 0.106 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -569199 sc-eQTL 6.42e-01 0.0535 0.115 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569393 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0734 0.0785 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -338402 sc-eQTL 4.79e-01 0.061 0.086 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -30185 sc-eQTL 2.44e-01 0.112 0.0959 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -917307 sc-eQTL 6.90e-01 0.0292 0.0731 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 sc-eQTL 7.06e-01 0.0419 0.111 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -4104 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0493 0.0958 0.164 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162510 MATN1 4004 eQTL 0.0175 0.0599 0.0252 0.0 0.0 0.174
ENSG00000186056 MATN1-AS1 9085 eQTL 2.68e-04 -0.0588 0.0161 0.0 0.0 0.174

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162510 MATN1 4004 3.75e-05 3.29e-05 6.4e-06 1.58e-05 5.91e-06 1.45e-05 4.47e-05 4.74e-06 3.16e-05 1.56e-05 3.9e-05 1.77e-05 4.85e-05 1.41e-05 7.05e-06 1.94e-05 1.73e-05 2.56e-05 7.91e-06 7.07e-06 1.56e-05 3.41e-05 3.2e-05 9.45e-06 4.49e-05 8.28e-06 1.44e-05 1.29e-05 3.19e-05 2.67e-05 2.07e-05 1.63e-06 2.68e-06 7.18e-06 1.2e-05 5.85e-06 3.22e-06 3.17e-06 5e-06 3.56e-06 1.66e-06 3.89e-05 3.74e-06 3.73e-07 2.59e-06 3.94e-06 4.05e-06 1.69e-06 1.54e-06