logo

Genes within 1Mb (chr1:30727448:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 3.90e-01 0.0861 0.1 0.188 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 5.99e-01 0.0422 0.0802 0.188 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 6.52e-01 0.0304 0.0673 0.188 B L1
ENSG00000162510 MATN1 3863 sc-eQTL 8.35e-04 -0.234 0.0689 0.188 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 7.77e-01 0.0157 0.0554 0.188 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 6.23e-01 0.0412 0.0836 0.188 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 2.20e-01 0.0796 0.0647 0.188 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 1.59e-02 0.184 0.0758 0.188 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 8.91e-01 -0.012 0.0879 0.188 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 4.16e-01 0.0558 0.0686 0.188 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0385 0.0611 0.188 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 9.92e-01 0.000711 0.0678 0.188 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 9.60e-01 0.00354 0.0709 0.188 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 5.46e-02 0.116 0.0601 0.188 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0142 0.0726 0.188 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 3.88e-01 0.1 0.116 0.188 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 1.31e-01 -0.117 0.0768 0.188 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0395 0.0679 0.188 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 6.28e-02 -0.122 0.0655 0.188 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 7.03e-01 0.031 0.0813 0.188 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 1.26e-01 0.118 0.0769 0.188 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 9.38e-01 0.00753 0.0972 0.188 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00646 0.103 0.191 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0646 0.121 0.191 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0624 0.095 0.191 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 3.48e-01 0.0638 0.0678 0.191 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0279 0.11 0.191 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -682117 sc-eQTL 5.01e-01 0.0755 0.112 0.191 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -778778 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0345 0.0742 0.191 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0243 0.107 0.191 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 1.21e-01 0.122 0.0782 0.188 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0571 0.0975 0.188 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 1.85e-01 0.0827 0.0623 0.188 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00771 0.0575 0.188 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -181310 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00381 0.111 0.188 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0421 0.0775 0.188 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -682117 sc-eQTL 6.67e-01 0.051 0.119 0.188 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -778778 sc-eQTL 1.40e-01 -0.154 0.104 0.188 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0549 0.0912 0.188 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 8.08e-03 0.286 0.107 0.187 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0389 0.0745 0.187 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 5.77e-01 0.0437 0.0781 0.187 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 9.92e-01 0.000933 0.09 0.187 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 4.27e-01 0.0522 0.0656 0.187 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 5.66e-01 0.058 0.101 0.187 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 3.32e-01 0.0906 0.0932 0.187 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 4.59e-01 0.0621 0.0837 0.188 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0261 0.0895 0.188 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 6.67e-02 -0.147 0.0799 0.188 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 9.26e-01 0.00614 0.066 0.188 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0736 0.088 0.188 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 2.92e-01 0.114 0.108 0.188 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0123 0.113 0.188 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 4.60e-01 0.0966 0.131 0.194 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 4.50e-01 0.0996 0.132 0.194 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 6.10e-01 0.0626 0.122 0.194 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 3863 sc-eQTL 8.80e-01 0.0162 0.107 0.194 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 5.82e-01 0.0412 0.0746 0.194 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 7.90e-02 0.223 0.126 0.194 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 4.74e-01 0.0864 0.12 0.194 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 9.34e-01 0.00887 0.107 0.194 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0513 0.124 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 5.25e-01 0.066 0.104 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 1.62e-01 0.137 0.0974 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 3863 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0251 0.102 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 5.87e-01 0.034 0.0625 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 5.07e-01 -0.077 0.116 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 2.58e-01 0.0992 0.0875 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 9.21e-02 0.165 0.0975 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 8.89e-02 0.206 0.121 0.19 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 8.56e-01 0.0203 0.112 0.19 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0364 0.0975 0.19 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 3863 sc-eQTL 2.83e-02 -0.204 0.0922 0.19 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 6.95e-01 0.0325 0.0827 0.19 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 6.40e-01 0.0517 0.11 0.19 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 3.98e-01 0.0799 0.0945 0.19 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0571 0.111 0.19 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 3.38e-01 0.105 0.11 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 1.51e-01 0.136 0.0944 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 4.70e-01 0.0604 0.0836 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 3863 sc-eQTL 1.84e-04 -0.313 0.0821 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 9.56e-01 0.0031 0.0567 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 9.01e-01 0.0124 0.1 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 4.79e-01 0.0527 0.0744 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 1.75e-03 0.285 0.0899 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 4.90e-01 0.0814 0.118 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 1.34e-02 -0.239 0.096 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 8.87e-02 -0.162 0.0946 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 3863 sc-eQTL 6.85e-02 -0.166 0.0908 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 9.69e-01 0.00243 0.0621 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 1.71e-01 0.155 0.113 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 1.50e-01 0.13 0.09 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0631 0.0976 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0966 0.116 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0953 0.114 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 1.28e-01 0.17 0.111 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 3.21e-01 -0.099 0.0995 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0886 0.102 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 3.45e-01 0.103 0.109 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 1.19e-01 -0.15 0.0957 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 8.68e-01 0.0153 0.0919 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 5.48e-01 0.049 0.0814 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0538 0.065 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 6.24e-01 0.0342 0.0697 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 6.44e-01 0.0354 0.0764 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 1.31e-01 0.107 0.0704 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 4.35e-01 0.0635 0.0812 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 6.89e-01 0.046 0.115 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0207 0.0924 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00814 0.0818 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 9.69e-01 0.00264 0.0679 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 5.57e-01 0.0535 0.0909 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 1.01e-01 0.141 0.0856 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 2.02e-01 -0.122 0.0956 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0143 0.113 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 9.87e-01 0.00178 0.108 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 5.93e-01 0.0482 0.09 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 3.61e-01 0.0832 0.0909 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0547 0.102 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 7.88e-01 0.0287 0.107 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 2.23e-01 -0.128 0.105 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0398 0.125 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 1.65e-01 -0.133 0.0953 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 6.99e-01 -0.036 0.0929 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0921 0.103 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0236 0.0896 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 2.15e-01 0.134 0.108 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0662 0.102 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 1.75e-01 0.155 0.113 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 2.11e-01 -0.123 0.0979 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00798 0.0791 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0131 0.0758 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 3.70e-01 0.0945 0.105 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 3.45e-02 0.199 0.0936 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 7.63e-01 0.0312 0.103 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0659 0.132 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 4.55e-01 0.0901 0.12 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0794 0.113 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0608 0.119 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 9.58e-01 0.00642 0.121 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0629 0.11 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0569 0.111 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 1.66e-01 0.165 0.119 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 4.46e-01 0.0873 0.114 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0478 0.117 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0405 0.11 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 9.88e-01 0.00159 0.104 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 7.40e-01 0.038 0.114 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00708 0.103 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 2.45e-01 0.141 0.121 0.188 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 8.13e-01 0.0256 0.108 0.188 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0723 0.103 0.188 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 4.09e-01 0.0804 0.0973 0.188 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0388 0.107 0.188 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 8.79e-01 0.0165 0.109 0.188 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0945 0.112 0.188 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 4.51e-01 0.0924 0.122 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 6.23e-01 -0.051 0.104 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 3.82e-01 0.0951 0.109 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 1.02e-01 0.175 0.107 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0145 0.104 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 2.13e-01 0.134 0.107 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 1.79e-01 0.143 0.106 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 1.17e-01 0.182 0.115 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0746 0.0857 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 7.15e-01 0.0321 0.0881 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 4.07e-01 -0.078 0.0938 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 5.82e-01 0.0461 0.0835 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 7.04e-01 0.0447 0.118 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 9.82e-01 0.00216 0.0971 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 4.56e-01 0.0911 0.122 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 7.28e-02 0.195 0.108 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 2.03e-01 -0.135 0.106 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 9.48e-01 0.00664 0.101 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0213 0.114 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0696 0.108 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 4.79e-01 0.0737 0.104 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 2.06e-01 0.142 0.112 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0253 0.0875 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 3.22e-01 0.0937 0.0944 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0269 0.104 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0117 0.0888 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 6.43e-01 0.0512 0.11 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 4.90e-01 0.071 0.103 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 1.79e-02 0.332 0.138 0.17 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0733 0.164 0.17 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0828 0.142 0.17 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 3863 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0469 0.133 0.17 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0562 0.0949 0.17 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 2.88e-01 -0.156 0.146 0.17 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 7.67e-01 0.0386 0.13 0.17 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 5.23e-01 0.0887 0.138 0.17 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0693 0.0905 0.187 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0116 0.115 0.187 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0234 0.107 0.187 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0799 0.0768 0.187 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00593 0.113 0.187 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 3.88e-01 -0.093 0.107 0.187 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0534 0.0989 0.187 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 4.67e-01 0.0854 0.117 0.188 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 4.74e-01 0.0814 0.113 0.188 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0652 0.0908 0.188 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 9.76e-01 0.00309 0.104 0.188 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0202 0.112 0.188 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 3.84e-01 0.0924 0.106 0.188 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 4.88e-01 0.0735 0.106 0.188 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 4.23e-01 0.0976 0.121 0.193 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0656 0.132 0.193 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 6.83e-02 -0.206 0.112 0.193 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 8.42e-02 0.137 0.0787 0.193 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00699 0.115 0.193 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -682117 sc-eQTL 9.78e-01 0.00278 0.102 0.193 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -778778 sc-eQTL 1.35e-02 0.246 0.0984 0.193 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 8.00e-01 0.0273 0.108 0.193 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 2.18e-02 0.216 0.0934 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0205 0.105 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 4.80e-01 0.0505 0.0713 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 9.67e-01 0.00262 0.0627 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -181310 sc-eQTL 9.17e-01 0.0123 0.118 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0339 0.0964 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -682117 sc-eQTL 5.97e-01 0.0633 0.119 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -778778 sc-eQTL 2.70e-01 -0.117 0.105 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0743 0.0984 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 5.72e-01 0.0559 0.0989 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0268 0.117 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 1.88e-01 0.111 0.0842 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 7.16e-01 0.0236 0.0649 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -181310 sc-eQTL 1.93e-01 0.146 0.112 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0863 0.101 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -682117 sc-eQTL 4.73e-01 0.0852 0.119 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -778778 sc-eQTL 2.50e-01 -0.111 0.0962 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 7.26e-01 0.034 0.0969 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0178 0.15 0.188 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00828 0.129 0.188 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 7.37e-01 0.0448 0.133 0.188 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0729 0.145 0.188 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 2.76e-01 -0.144 0.132 0.188 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 2.83e-01 0.143 0.133 0.188 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0276 0.129 0.188 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 1.50e-01 0.163 0.113 0.189 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 3.54e-01 -0.113 0.121 0.189 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 3.16e-01 0.103 0.103 0.189 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 7.12e-01 0.0299 0.0809 0.189 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -181310 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0273 0.111 0.189 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 1.85e-01 0.154 0.116 0.189 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -682117 sc-eQTL 4.08e-01 -0.096 0.116 0.189 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -778778 sc-eQTL 3.35e-01 -0.106 0.11 0.189 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 6.75e-01 0.0461 0.11 0.189 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0454 0.102 0.192 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 1.55e-01 0.154 0.108 0.192 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 3.97e-02 0.182 0.0877 0.192 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0852 0.0803 0.192 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -181310 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0724 0.0901 0.192 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 7.49e-03 0.275 0.102 0.192 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -682117 sc-eQTL 7.00e-01 0.0381 0.0985 0.192 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -778778 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00457 0.0984 0.192 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 1.21e-01 -0.158 0.101 0.192 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0343 0.116 0.195 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0465 0.127 0.195 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 1.87e-01 0.139 0.105 0.195 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0388 0.0978 0.195 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 7.37e-01 0.0426 0.127 0.195 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -682117 sc-eQTL 7.89e-01 0.0318 0.119 0.195 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -778778 sc-eQTL 1.83e-01 -0.123 0.0916 0.195 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 6.25e-01 -0.053 0.108 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 3.27e-01 0.116 0.118 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 4.79e-01 0.0697 0.0983 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 6.31e-01 0.0419 0.0871 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 3863 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0858 0.0992 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 3.03e-01 0.0643 0.0623 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0654 0.103 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 1.19e-01 0.129 0.0821 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 5.97e-01 0.0476 0.09 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 4.22e-01 0.086 0.107 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0128 0.0846 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0358 0.08 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 3863 sc-eQTL 1.45e-04 -0.288 0.0745 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0147 0.0542 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 6.24e-01 0.0486 0.099 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 4.17e-01 0.0569 0.07 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 5.72e-02 0.158 0.0825 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 7.36e-02 0.16 0.0891 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0295 0.102 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 1.35e-01 0.0968 0.0645 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 8.03e-01 0.0143 0.057 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -181310 sc-eQTL 4.34e-01 0.091 0.116 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0939 0.0815 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -682117 sc-eQTL 5.20e-01 0.0771 0.12 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -778778 sc-eQTL 2.17e-01 -0.121 0.0978 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00596 0.0919 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 7.63e-01 0.0299 0.0991 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0443 0.108 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 1.98e-01 0.114 0.0885 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0443 0.071 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -181310 sc-eQTL 2.70e-01 -0.115 0.104 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 7.07e-02 0.17 0.0936 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -682117 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0953 0.107 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -778778 sc-eQTL 3.89e-01 -0.088 0.102 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0893 0.102 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -569340 sc-eQTL 1.18e-02 0.274 0.108 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569534 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0277 0.0748 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -338543 sc-eQTL 6.33e-01 0.0392 0.0819 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0274 0.0916 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -917448 sc-eQTL 5.58e-01 0.0408 0.0696 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 sc-eQTL 7.21e-01 0.0378 0.106 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -4245 sc-eQTL 6.98e-01 0.0354 0.0912 0.188 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162511 LAPTM5 -30326 eQTL 2.9e-05 -0.0475 0.0113 0.0 0.0 0.228
ENSG00000168528 SERINC2 -682117 eQTL 0.0337 0.0935 0.0439 0.0 0.0 0.228
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 eQTL 8.61e-08 0.0764 0.0141 0.00323 0.00873 0.228

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8944 0.000149 9.98e-05 1.11e-05 2.22e-05 9.47e-06 3.49e-05 0.0001 7.48e-06 6.93e-05 2.49e-05 9.41e-05 3.58e-05 0.000121 3.61e-05 1.17e-05 5.28e-05 4.26e-05 4.84e-05 1.58e-05 1.11e-05 2.75e-05 8.79e-05 8.46e-05 1.56e-05 9.94e-05 1.67e-05 3.07e-05 2.4e-05 8.32e-05 4.28e-05 4.71e-05 2.34e-06 5.3e-06 9.71e-06 1.8e-05 8.39e-06 3.92e-06 3.76e-06 7.07e-06 4.35e-06 1.92e-06 0.000114 1.06e-05 3.05e-07 5.13e-06 6.36e-06 7.62e-06 2.24e-06 2.05e-06