logo

Genes within 1Mb (chr1:30727347:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 9.23e-01 0.0101 0.104 0.162 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 1.18e-01 -0.13 0.0829 0.162 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 5.59e-01 0.0409 0.0699 0.162 B L1
ENSG00000162510 MATN1 3762 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00278 0.0735 0.162 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 4.18e-01 0.0467 0.0575 0.162 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 1.98e-01 -0.112 0.0866 0.162 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 1.11e-01 -0.107 0.0671 0.162 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 1.89e-01 -0.105 0.0795 0.162 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0546 0.0896 0.162 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0378 0.0701 0.162 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 6.50e-01 0.0283 0.0624 0.162 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 1.31e-02 0.171 0.0682 0.162 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 4.13e-01 0.0592 0.0722 0.162 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 7.35e-01 -0.021 0.0618 0.162 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 2.07e-02 -0.171 0.0732 0.162 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 3.11e-01 -0.121 0.119 0.162 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 3.47e-01 0.0743 0.0789 0.162 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 3.29e-01 0.068 0.0695 0.162 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 5.37e-03 0.187 0.0664 0.162 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00649 0.0833 0.162 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0479 0.0792 0.162 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 2.18e-01 -0.123 0.0993 0.162 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0486 0.104 0.167 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0301 0.123 0.167 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 7.74e-02 0.17 0.0959 0.167 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 3.01e-01 0.0714 0.0689 0.167 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 6.16e-01 0.0563 0.112 0.167 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -682218 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0471 0.114 0.167 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -778879 sc-eQTL 3.37e-01 0.0724 0.0752 0.167 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0582 0.109 0.167 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 6.94e-01 0.0321 0.0815 0.162 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0352 0.101 0.162 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 8.14e-01 0.0152 0.0648 0.162 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0485 0.0595 0.162 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -181411 sc-eQTL 2.68e-01 -0.127 0.114 0.162 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0661 0.0803 0.162 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -682218 sc-eQTL 2.19e-01 -0.151 0.123 0.162 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -778879 sc-eQTL 4.69e-01 0.0785 0.108 0.162 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 7.35e-01 0.0321 0.0946 0.162 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 6.00e-01 0.0602 0.115 0.163 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 1.48e-01 -0.113 0.0781 0.163 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 5.68e-01 0.0471 0.0822 0.163 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 2.75e-01 0.103 0.0945 0.163 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000675 0.0691 0.163 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0115 0.106 0.163 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0137 0.0983 0.163 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 3.32e-01 0.0835 0.0858 0.162 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0604 0.0918 0.162 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 1.46e-01 -0.12 0.0823 0.162 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 1.88e-02 0.158 0.0669 0.162 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 3.04e-01 0.093 0.0903 0.162 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 7.68e-01 0.0327 0.111 0.162 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 4.93e-02 -0.226 0.115 0.162 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 3.48e-01 0.126 0.133 0.166 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 4.98e-01 0.0915 0.135 0.166 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0431 0.125 0.166 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 3762 sc-eQTL 1.32e-01 -0.165 0.109 0.166 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0188 0.0763 0.166 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 2.45e-01 -0.151 0.129 0.166 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 5.94e-01 0.0657 0.123 0.166 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 6.11e-02 -0.204 0.108 0.166 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 6.17e-01 0.0643 0.128 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0358 0.107 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0241 0.101 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 3762 sc-eQTL 2.88e-01 0.112 0.105 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 4.64e-01 0.0473 0.0644 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 2.83e-01 -0.129 0.119 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0133 0.0906 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0771 0.101 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 7.22e-01 0.0443 0.125 0.162 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 2.66e-01 -0.128 0.114 0.162 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 7.16e-01 0.0364 0.0998 0.162 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 3762 sc-eQTL 4.05e-01 0.0797 0.0954 0.162 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0181 0.0847 0.162 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0473 0.113 0.162 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0867 0.0967 0.162 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 9.31e-01 0.00991 0.114 0.162 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 5.49e-01 0.0687 0.114 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000879 0.0987 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 8.25e-01 0.0193 0.0871 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 3762 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00447 0.0884 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 4.22e-01 0.0475 0.0589 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0224 0.104 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0981 0.0772 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 8.19e-01 -0.022 0.0958 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 7.66e-02 -0.212 0.119 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 1.45e-02 -0.24 0.0975 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 1.58e-01 0.137 0.0963 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 3762 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0685 0.0928 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 8.65e-01 0.0108 0.0631 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 4.97e-02 -0.225 0.114 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0534 0.0918 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 2.59e-01 -0.112 0.099 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0421 0.121 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 4.29e-01 0.0944 0.119 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0474 0.117 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 9.62e-01 0.00495 0.104 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 8.55e-01 0.0195 0.107 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 7.51e-01 0.0363 0.114 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0456 0.101 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 1.22e-01 -0.146 0.094 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0399 0.0838 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 7.60e-01 0.0205 0.0669 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 4.99e-02 0.14 0.0711 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0187 0.0786 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 2.06e-01 -0.092 0.0725 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0536 0.0835 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0121 0.119 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 5.04e-01 0.0639 0.0955 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 5.70e-01 0.0481 0.0846 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 6.57e-04 0.236 0.0683 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 6.55e-01 0.0421 0.0941 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 9.02e-01 0.0109 0.0891 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 2.59e-01 -0.112 0.0989 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 6.41e-01 0.055 0.118 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0571 0.112 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 5.67e-01 0.0535 0.0934 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 3.70e-01 0.0847 0.0944 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 2.65e-01 0.118 0.106 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 8.60e-01 0.0196 0.111 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00706 0.109 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0998 0.129 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 2.34e-01 -0.117 0.0984 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 4.23e-03 0.272 0.094 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 7.03e-01 0.0405 0.106 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0438 0.0924 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 2.66e-01 -0.124 0.111 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 8.49e-01 -0.02 0.105 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0529 0.118 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 1.74e-02 0.24 0.1 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0408 0.0816 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 6.22e-03 0.212 0.0769 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0317 0.109 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0606 0.0976 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0218 0.106 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 9.59e-01 0.00673 0.132 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 9.54e-01 0.00701 0.121 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 5.02e-01 0.0762 0.113 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 3.74e-01 0.106 0.119 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0285 0.121 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 3.40e-01 0.105 0.11 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 2.53e-01 0.127 0.111 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 9.99e-01 0.000219 0.131 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 9.31e-01 0.0109 0.126 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0401 0.129 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0664 0.121 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 8.09e-01 0.0276 0.114 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 2.43e-03 -0.377 0.123 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 7.58e-01 -0.035 0.114 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 4.98e-01 0.0861 0.127 0.162 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 2.94e-01 0.118 0.112 0.162 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 2.67e-01 -0.12 0.108 0.162 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 1.67e-01 0.14 0.101 0.162 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 3.15e-01 0.112 0.112 0.162 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 3.31e-01 0.11 0.113 0.162 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 1.79e-01 -0.157 0.116 0.162 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 2.80e-01 0.137 0.127 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 3.82e-02 -0.222 0.106 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0377 0.113 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 7.42e-01 0.0367 0.111 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0908 0.108 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 4.79e-03 -0.313 0.11 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 8.18e-01 0.0254 0.11 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0316 0.121 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 1.48e-01 -0.129 0.0888 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 6.50e-01 0.0416 0.0915 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 2.04e-01 0.124 0.0973 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0354 0.0868 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 3.90e-01 0.105 0.122 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 4.70e-01 0.0729 0.101 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0741 0.128 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00601 0.114 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 1.85e-01 0.148 0.111 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 6.28e-01 0.0516 0.106 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0563 0.12 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 4.90e-01 0.078 0.113 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 6.06e-01 0.0564 0.109 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 3.48e-01 0.111 0.118 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0465 0.0923 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 6.51e-01 0.0452 0.0998 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 6.40e-01 0.0515 0.11 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 2.23e-01 0.114 0.0934 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 8.13e-01 0.0276 0.117 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0195 0.108 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0587 0.14 0.174 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0223 0.163 0.174 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 4.75e-01 -0.101 0.141 0.174 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 3762 sc-eQTL 4.10e-01 0.109 0.131 0.174 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 3.54e-01 0.0874 0.0938 0.174 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 7.36e-01 0.049 0.145 0.174 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 1.96e-01 0.167 0.128 0.174 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 6.23e-02 -0.254 0.135 0.174 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00127 0.093 0.161 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 1.73e-02 -0.279 0.116 0.161 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 1.03e-01 -0.179 0.109 0.161 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 2.75e-01 0.0862 0.0788 0.161 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0774 0.116 0.161 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 9.45e-01 0.00761 0.11 0.161 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 2.75e-01 -0.111 0.101 0.161 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 4.09e-01 0.101 0.122 0.162 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 9.99e-01 0.000153 0.118 0.162 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 5.06e-01 0.0628 0.0943 0.162 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 2.51e-01 0.124 0.108 0.162 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 2.32e-01 0.14 0.116 0.162 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 3.72e-01 0.0984 0.11 0.162 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 1.24e-01 -0.169 0.109 0.162 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 3.16e-01 -0.121 0.12 0.171 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 5.95e-01 0.0694 0.13 0.171 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 1.44e-02 0.272 0.11 0.171 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 8.60e-01 0.0139 0.0785 0.171 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 2.77e-01 0.124 0.113 0.171 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -682218 sc-eQTL 1.37e-01 -0.15 0.1 0.171 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -778879 sc-eQTL 3.16e-01 0.0994 0.0988 0.171 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 2.51e-01 -0.122 0.106 0.171 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0417 0.0988 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0966 0.11 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 6.84e-01 0.0304 0.0746 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0755 0.0653 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -181411 sc-eQTL 1.27e-01 -0.188 0.123 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0366 0.101 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -682218 sc-eQTL 3.41e-01 -0.119 0.125 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -778879 sc-eQTL 9.99e-01 0.00014 0.11 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0178 0.103 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 4.07e-01 0.086 0.104 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 3.60e-01 0.112 0.122 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0807 0.0884 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0407 0.068 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -181411 sc-eQTL 5.17e-01 0.0762 0.117 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0765 0.106 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -682218 sc-eQTL 2.92e-01 -0.131 0.124 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -778879 sc-eQTL 7.75e-01 0.0289 0.101 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0473 0.102 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0713 0.153 0.155 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 7.03e-01 0.0501 0.131 0.155 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00758 0.135 0.155 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0278 0.147 0.155 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 1.18e-01 0.21 0.133 0.155 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0404 0.136 0.155 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 2.67e-01 -0.146 0.131 0.155 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0143 0.116 0.164 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0274 0.124 0.164 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0195 0.105 0.164 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 9.21e-01 0.00821 0.0827 0.164 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -181411 sc-eQTL 3.13e-01 -0.114 0.113 0.164 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 2.40e-01 -0.14 0.119 0.164 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -682218 sc-eQTL 1.53e-01 -0.169 0.118 0.164 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -778879 sc-eQTL 6.45e-01 0.0518 0.112 0.164 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0805 0.112 0.164 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 2.61e-02 0.239 0.107 0.163 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 2.59e-01 -0.13 0.115 0.163 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0346 0.094 0.163 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 3.77e-02 0.177 0.0845 0.163 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -181411 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0624 0.0956 0.163 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 3.29e-01 -0.107 0.11 0.163 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -682218 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0364 0.104 0.163 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -778879 sc-eQTL 9.83e-01 0.00227 0.104 0.163 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0679 0.108 0.163 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 4.55e-01 0.0911 0.122 0.172 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0211 0.134 0.172 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 9.03e-01 0.0136 0.111 0.172 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 4.61e-01 0.076 0.103 0.172 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0191 0.134 0.172 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -682218 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0569 0.125 0.172 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -778879 sc-eQTL 8.94e-01 -0.013 0.097 0.172 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 7.76e-01 0.0326 0.114 0.172 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 3.68e-01 0.11 0.122 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0899 0.101 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 7.80e-01 0.0252 0.0901 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 3762 sc-eQTL 4.25e-01 0.082 0.103 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 2.38e-01 0.0761 0.0643 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 2.18e-01 -0.132 0.106 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0325 0.0853 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0766 0.0929 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0597 0.111 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 2.28e-01 -0.106 0.0875 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 2.08e-01 0.104 0.0828 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 3762 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0129 0.08 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 3.75e-01 0.05 0.0562 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 1.47e-01 -0.149 0.102 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 1.39e-01 -0.107 0.0723 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0401 0.0863 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00308 0.0939 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0152 0.106 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0124 0.0678 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 1.10e-01 -0.0951 0.0593 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -181411 sc-eQTL 3.74e-01 -0.108 0.121 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0338 0.0855 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -682218 sc-eQTL 2.71e-01 -0.138 0.125 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -778879 sc-eQTL 6.60e-01 0.0452 0.103 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0117 0.096 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 5.00e-02 0.2 0.101 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0852 0.112 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 9.85e-01 0.00174 0.0917 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 3.22e-01 0.0727 0.0732 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -181411 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0786 0.107 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 1.38e-01 -0.144 0.0969 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -682218 sc-eQTL 3.63e-01 -0.101 0.111 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -778879 sc-eQTL 7.11e-01 0.0391 0.105 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 8.99e-01 0.0135 0.106 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -569441 sc-eQTL 6.42e-01 0.0535 0.115 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -569635 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0734 0.0785 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -338644 sc-eQTL 4.79e-01 0.061 0.086 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -30427 sc-eQTL 2.44e-01 0.112 0.0959 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -917549 sc-eQTL 6.90e-01 0.0292 0.0731 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 sc-eQTL 7.06e-01 0.0419 0.111 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -4346 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0493 0.0958 0.164 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162510 MATN1 3762 eQTL 0.0176 0.0599 0.0252 0.0 0.0 0.174
ENSG00000186056 MATN1-AS1 8843 eQTL 2.66e-04 -0.0589 0.0161 0.0 0.0 0.174

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162510 MATN1 3762 3.98e-05 3.3e-05 6.4e-06 1.55e-05 5.91e-06 1.48e-05 4.55e-05 4.5e-06 3.18e-05 1.55e-05 3.84e-05 1.77e-05 4.85e-05 1.41e-05 7.03e-06 1.92e-05 1.77e-05 2.59e-05 7.86e-06 6.6e-06 1.54e-05 3.41e-05 3.29e-05 8.98e-06 4.44e-05 8.02e-06 1.42e-05 1.28e-05 3.26e-05 2.53e-05 2.03e-05 1.63e-06 2.59e-06 7.07e-06 1.16e-05 5.77e-06 3.13e-06 3.17e-06 4.62e-06 3.3e-06 1.77e-06 3.89e-05 3.68e-06 3.59e-07 2.49e-06 3.81e-06 4.08e-06 1.6e-06 1.52e-06