logo

Genes within 1Mb (chr1:30723617:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 3.96e-01 0.0839 0.0986 0.19 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 6.53e-01 0.0356 0.079 0.19 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 6.99e-01 0.0257 0.0663 0.19 B L1
ENSG00000162510 MATN1 32 sc-eQTL 1.24e-03 -0.223 0.068 0.19 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 8.20e-01 0.0125 0.0546 0.19 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 5.66e-01 0.0473 0.0824 0.19 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 2.25e-01 0.0777 0.0638 0.19 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 1.53e-02 0.183 0.0747 0.19 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00845 0.0864 0.19 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 4.12e-01 0.0553 0.0674 0.19 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0363 0.06 0.19 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0141 0.0666 0.19 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00646 0.0696 0.19 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 4.79e-02 0.117 0.059 0.19 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 8.95e-01 -0.00944 0.0713 0.19 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 2.86e-01 0.122 0.114 0.19 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 1.75e-01 -0.103 0.0755 0.19 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0582 0.0667 0.19 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 5.11e-02 -0.126 0.0643 0.19 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 6.66e-01 0.0346 0.0799 0.19 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 1.55e-01 0.108 0.0757 0.19 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 9.73e-01 0.00326 0.0955 0.19 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00646 0.103 0.191 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0646 0.121 0.191 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0624 0.095 0.191 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 3.48e-01 0.0638 0.0678 0.191 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0279 0.11 0.191 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -685948 sc-eQTL 5.01e-01 0.0755 0.112 0.191 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -782609 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0345 0.0742 0.191 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0243 0.107 0.191 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 1.49e-01 0.112 0.0771 0.19 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0323 0.096 0.19 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 2.55e-01 0.0701 0.0614 0.19 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00329 0.0566 0.19 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -185141 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00587 0.109 0.19 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0513 0.0763 0.19 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -685948 sc-eQTL 6.61e-01 0.0513 0.117 0.19 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -782609 sc-eQTL 1.62e-01 -0.144 0.102 0.19 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0603 0.0898 0.19 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 8.96e-03 0.278 0.105 0.189 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0303 0.0733 0.189 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 6.38e-01 0.0363 0.0769 0.189 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00266 0.0886 0.189 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 4.62e-01 0.0476 0.0646 0.189 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 5.50e-01 0.0596 0.0994 0.189 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 3.29e-01 0.0896 0.0917 0.189 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 5.40e-01 0.0505 0.0824 0.19 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0363 0.0881 0.19 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 1.01e-01 -0.13 0.0788 0.19 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0116 0.065 0.19 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0645 0.0866 0.19 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 2.41e-01 0.125 0.106 0.19 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0121 0.111 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 5.60e-01 0.0749 0.128 0.196 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 5.27e-01 0.0818 0.129 0.196 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 4.93e-01 0.0824 0.12 0.196 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 32 sc-eQTL 9.67e-01 0.00436 0.105 0.196 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 6.77e-01 0.0306 0.0732 0.196 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 7.28e-02 0.223 0.123 0.196 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 4.09e-01 0.0976 0.118 0.196 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 9.55e-01 0.00587 0.105 0.196 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0474 0.123 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 4.89e-01 0.0708 0.102 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 2.16e-01 0.119 0.0961 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 32 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0288 0.1 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 6.37e-01 0.0291 0.0616 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0828 0.114 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 2.46e-01 0.1 0.0862 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 7.38e-02 0.173 0.0961 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 1.02e-01 0.196 0.119 0.192 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 9.54e-01 0.00632 0.11 0.192 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0406 0.0961 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 32 sc-eQTL 2.67e-02 -0.203 0.0909 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 6.54e-01 0.0366 0.0815 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 5.75e-01 0.0611 0.109 0.192 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 4.45e-01 0.0712 0.0931 0.192 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0482 0.109 0.192 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 3.36e-01 0.104 0.108 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 1.64e-01 0.13 0.093 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 4.80e-01 0.0583 0.0823 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 32 sc-eQTL 3.00e-04 -0.298 0.0811 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00204 0.0559 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 8.02e-01 0.0248 0.0985 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 4.91e-01 0.0505 0.0733 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 1.69e-03 0.282 0.0885 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 5.35e-01 0.0722 0.116 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 1.54e-02 -0.231 0.0946 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 8.66e-02 -0.16 0.0932 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 32 sc-eQTL 6.51e-02 -0.166 0.0894 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 9.71e-01 0.00226 0.0612 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 2.03e-01 0.142 0.111 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 1.30e-01 0.135 0.0886 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0605 0.0961 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 3.68e-01 -0.103 0.114 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 3.23e-01 -0.111 0.112 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 1.58e-01 0.155 0.109 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0916 0.0977 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0923 0.1 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 3.92e-01 0.0917 0.107 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 1.81e-01 -0.126 0.094 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 8.49e-01 0.0172 0.0904 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 5.38e-01 0.0493 0.0801 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0562 0.0639 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 7.78e-01 0.0194 0.0685 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 7.00e-01 0.029 0.0751 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 1.13e-01 0.11 0.0692 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 4.06e-01 0.0664 0.0798 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 6.67e-01 0.0484 0.113 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0154 0.0908 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 9.47e-01 0.00539 0.0804 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 8.57e-01 -0.012 0.0667 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 6.84e-01 0.0364 0.0893 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 1.06e-01 0.137 0.0841 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 1.67e-01 -0.13 0.0938 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00666 0.112 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 9.52e-01 0.00646 0.106 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 4.74e-01 0.0635 0.0885 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 4.74e-01 0.0642 0.0896 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0538 0.1 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 7.33e-01 0.0358 0.105 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 2.68e-01 -0.114 0.103 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0419 0.123 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 2.75e-01 -0.103 0.094 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0528 0.0915 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 3.11e-01 -0.103 0.101 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0221 0.0883 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 1.98e-01 0.137 0.106 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 4.37e-01 -0.078 0.1 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 1.15e-01 0.177 0.111 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 2.02e-01 -0.123 0.0963 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0268 0.0778 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0318 0.0745 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 4.32e-01 0.0815 0.104 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 5.27e-02 0.18 0.0923 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 6.99e-01 0.0392 0.101 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0483 0.129 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 3.17e-01 0.118 0.118 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0864 0.111 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0467 0.116 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 8.30e-01 0.0256 0.119 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 7.18e-01 -0.039 0.108 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0694 0.109 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 1.53e-01 0.168 0.117 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 5.75e-01 0.0632 0.113 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0273 0.115 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0401 0.108 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 7.85e-01 0.0279 0.102 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 6.65e-01 0.0488 0.112 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0113 0.102 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 2.67e-01 0.133 0.119 0.19 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 8.60e-01 0.0187 0.106 0.19 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0596 0.102 0.19 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 5.62e-01 0.0557 0.0958 0.19 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 8.06e-01 -0.026 0.105 0.19 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 7.28e-01 0.0372 0.107 0.19 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 3.51e-01 -0.103 0.11 0.19 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 4.80e-01 0.0853 0.121 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0506 0.102 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 4.19e-01 0.0866 0.107 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 1.52e-01 0.151 0.105 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0157 0.103 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 2.17e-01 0.131 0.106 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 2.25e-01 0.127 0.104 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 1.30e-01 0.172 0.114 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0607 0.0843 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 7.51e-01 0.0275 0.0866 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0786 0.0922 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 5.49e-01 0.0493 0.0821 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 7.22e-01 0.0412 0.116 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 9.54e-01 0.00557 0.0954 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 3.81e-01 0.105 0.12 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 7.87e-02 0.188 0.106 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 1.95e-01 -0.135 0.104 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00166 0.0996 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0358 0.112 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 6.04e-01 -0.055 0.106 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 3.64e-01 0.0931 0.102 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 2.09e-01 0.138 0.11 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 7.90e-01 -0.023 0.0861 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 3.70e-01 0.0835 0.093 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0273 0.103 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0225 0.0874 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 6.02e-01 0.0568 0.109 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 5.10e-01 0.0668 0.101 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 1.02e-02 0.351 0.134 0.174 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0563 0.16 0.174 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0426 0.139 0.174 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 32 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00247 0.13 0.174 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0695 0.0925 0.174 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 4.09e-01 -0.118 0.142 0.174 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 7.61e-01 0.0387 0.127 0.174 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 6.74e-01 0.0569 0.135 0.174 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0791 0.0889 0.189 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 9.42e-01 0.00818 0.113 0.189 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00987 0.105 0.189 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0891 0.0754 0.189 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 9.84e-01 0.00217 0.111 0.189 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0986 0.106 0.189 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0616 0.0972 0.189 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 5.16e-01 0.0751 0.116 0.19 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 4.82e-01 0.0788 0.112 0.19 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0604 0.0895 0.19 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 8.23e-01 -0.023 0.103 0.19 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 7.45e-01 -0.036 0.111 0.19 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 4.50e-01 0.079 0.104 0.19 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 3.99e-01 0.0881 0.104 0.19 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 4.23e-01 0.0976 0.121 0.193 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0656 0.132 0.193 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 6.83e-02 -0.206 0.112 0.193 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 8.42e-02 0.137 0.0787 0.193 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00699 0.115 0.193 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -685948 sc-eQTL 9.78e-01 0.00278 0.102 0.193 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -782609 sc-eQTL 1.35e-02 0.246 0.0984 0.193 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 8.00e-01 0.0273 0.108 0.193 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 2.65e-02 0.206 0.0921 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00551 0.104 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 5.78e-01 0.0392 0.0703 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 7.95e-01 0.016 0.0617 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -185141 sc-eQTL 8.48e-01 0.0224 0.116 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0502 0.095 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -685948 sc-eQTL 5.55e-01 0.0695 0.118 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -782609 sc-eQTL 3.33e-01 -0.101 0.104 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0586 0.097 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 7.11e-01 0.0361 0.0973 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0135 0.115 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 2.77e-01 0.0904 0.0829 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 6.49e-01 0.0291 0.0639 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -185141 sc-eQTL 2.31e-01 0.132 0.11 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 4.05e-01 -0.083 0.0995 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -685948 sc-eQTL 4.79e-01 0.0828 0.117 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -782609 sc-eQTL 2.21e-01 -0.116 0.0946 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 8.75e-01 0.0151 0.0953 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0361 0.148 0.191 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 8.25e-01 -0.028 0.127 0.191 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 6.63e-01 0.0571 0.131 0.191 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 4.34e-01 -0.111 0.142 0.191 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 2.43e-01 -0.152 0.129 0.191 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 3.11e-01 0.133 0.131 0.191 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00534 0.127 0.191 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 1.49e-01 0.161 0.111 0.191 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0803 0.12 0.191 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 3.50e-01 0.0951 0.101 0.191 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 5.74e-01 0.0448 0.0797 0.191 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -185141 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0403 0.109 0.191 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 1.62e-01 0.16 0.114 0.191 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -685948 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0899 0.114 0.191 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -782609 sc-eQTL 3.23e-01 -0.107 0.108 0.191 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 6.66e-01 0.0469 0.108 0.191 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 6.62e-01 -0.044 0.1 0.195 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 1.01e-01 0.175 0.106 0.195 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 4.82e-02 0.172 0.0866 0.195 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0873 0.0792 0.195 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -185141 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0784 0.0889 0.195 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 1.00e-02 0.261 0.1 0.195 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -685948 sc-eQTL 7.52e-01 0.0308 0.0972 0.195 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -782609 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00568 0.0971 0.195 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 9.81e-02 -0.166 0.1 0.195 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0343 0.116 0.195 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0465 0.127 0.195 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 1.87e-01 0.139 0.105 0.195 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0388 0.0978 0.195 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 7.37e-01 0.0426 0.127 0.195 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -685948 sc-eQTL 7.89e-01 0.0318 0.119 0.195 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -782609 sc-eQTL 1.83e-01 -0.123 0.0916 0.195 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 6.25e-01 -0.053 0.108 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 3.59e-01 0.107 0.116 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 5.35e-01 0.0602 0.0969 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 7.29e-01 0.0298 0.0859 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 32 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0877 0.0978 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 3.12e-01 0.0623 0.0614 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 5.63e-01 -0.059 0.102 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 1.19e-01 0.127 0.0809 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 5.39e-01 0.0546 0.0886 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 4.16e-01 0.0859 0.105 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0158 0.0834 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0367 0.0788 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 32 sc-eQTL 2.07e-04 -0.278 0.0735 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0179 0.0534 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 5.85e-01 0.0534 0.0976 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 4.16e-01 0.0562 0.0689 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 5.98e-02 0.154 0.0813 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 9.84e-02 0.146 0.0879 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0159 0.1 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 1.97e-01 0.0823 0.0636 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 6.90e-01 0.0224 0.0561 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -185141 sc-eQTL 4.34e-01 0.0896 0.114 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 2.08e-01 -0.101 0.0803 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -685948 sc-eQTL 4.88e-01 0.0818 0.118 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -782609 sc-eQTL 2.64e-01 -0.108 0.0963 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00188 0.0905 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 7.30e-01 0.0338 0.0977 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 9.04e-01 -0.013 0.107 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 2.27e-01 0.106 0.0873 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0451 0.07 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -185141 sc-eQTL 2.46e-01 -0.119 0.102 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 7.67e-02 0.164 0.0923 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -685948 sc-eQTL 3.29e-01 -0.104 0.106 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -782609 sc-eQTL 3.99e-01 -0.085 0.101 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 3.06e-01 -0.103 0.101 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -573171 sc-eQTL 1.29e-02 0.266 0.106 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573365 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0194 0.0736 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -342374 sc-eQTL 6.83e-01 0.033 0.0806 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0282 0.0901 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -921279 sc-eQTL 6.00e-01 0.0359 0.0685 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 sc-eQTL 6.89e-01 0.0417 0.104 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -8076 sc-eQTL 6.86e-01 0.0364 0.0897 0.19 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162511 LAPTM5 -34157 eQTL 2.95e-05 -0.0475 0.0113 0.0 0.0 0.227
ENSG00000168528 SERINC2 -685948 eQTL 0.0311 0.0949 0.044 0.0 0.0 0.227
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 eQTL 1.05e-07 0.0759 0.0142 0.00279 0.00721 0.227

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000186056 MATN1-AS1 5113 0.000174 4.26e-05 5.11e-06 1.59e-05 5.6e-06 3.22e-05 5.58e-05 3.82e-06 3.47e-05 1.45e-05 4.29e-05 1.58e-05 6.15e-05 1.64e-05 7.47e-06 2.6e-05 2.4e-05 4.47e-05 8.79e-06 6.5e-06 1.88e-05 4.19e-05 5.12e-05 1.02e-05 5.65e-05 8.55e-06 1.71e-05 1.28e-05 3.91e-05 3.25e-05 1.96e-05 1.31e-06 2.23e-06 6.69e-06 1.19e-05 4.5e-06 1.97e-06 2.39e-06 4.24e-06 3.13e-06 1.64e-06 6.87e-05 1.17e-05 1.65e-07 3.41e-06 3.07e-06 4.08e-06 1.11e-06 1.32e-06