logo

Genes within 1Mb (chr1:30723408:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 5.46e-02 0.233 0.121 0.113 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 3.22e-01 0.0965 0.0973 0.113 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 1.41e-01 -0.12 0.0814 0.113 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -177 sc-eQTL 3.80e-01 0.0755 0.0858 0.113 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0762 0.0671 0.113 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 1.63e-01 -0.141 0.101 0.113 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 4.23e-01 0.0632 0.0788 0.113 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0154 0.0934 0.113 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 3.99e-01 0.0888 0.105 0.113 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 7.32e-01 0.0282 0.0822 0.113 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00217 0.0732 0.113 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 7.19e-01 0.0292 0.0811 0.113 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 8.18e-02 -0.147 0.0842 0.113 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 3.29e-01 0.0709 0.0724 0.113 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 1.05e-01 0.141 0.0864 0.113 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 1.84e-01 0.186 0.139 0.113 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 5.91e-02 0.175 0.0924 0.113 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0437 0.082 0.113 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 4.90e-01 -0.055 0.0796 0.113 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 4.45e-01 0.0751 0.098 0.113 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 3.70e-01 0.0837 0.0932 0.113 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000376 0.117 0.113 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 5.68e-01 0.071 0.124 0.119 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 3.44e-01 -0.139 0.147 0.119 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 2.13e-01 -0.143 0.115 0.119 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0463 0.0821 0.119 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 3.87e-01 0.115 0.133 0.119 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -686157 sc-eQTL 5.82e-01 0.0747 0.135 0.119 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -782818 sc-eQTL 8.87e-01 0.0127 0.0898 0.119 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0339 0.13 0.119 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 6.23e-02 -0.179 0.0957 0.113 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 3.45e-01 0.113 0.119 0.113 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0164 0.0767 0.113 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 7.03e-01 -0.027 0.0705 0.113 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -185350 sc-eQTL 1.79e-01 0.182 0.135 0.113 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 1.74e-01 0.129 0.0947 0.113 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -686157 sc-eQTL 7.51e-01 0.0461 0.145 0.113 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -782818 sc-eQTL 8.52e-01 0.0239 0.128 0.113 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 2.73e-02 -0.246 0.111 0.113 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 9.93e-01 0.00116 0.133 0.114 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 2.25e-01 0.11 0.0908 0.114 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 4.72e-02 -0.189 0.0947 0.114 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 5.98e-01 0.0581 0.11 0.114 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 5.96e-01 0.0427 0.0803 0.114 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 9.30e-01 0.0108 0.124 0.114 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 7.47e-01 0.0368 0.114 0.114 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 6.75e-02 0.183 0.0996 0.113 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 2.05e-01 0.136 0.107 0.113 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 3.23e-01 0.0954 0.0963 0.113 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 1.71e-01 -0.108 0.0788 0.113 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 3.34e-01 -0.102 0.105 0.113 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 8.92e-01 0.0176 0.13 0.113 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 1.04e-01 -0.219 0.134 0.113 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0406 0.165 0.105 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0858 0.167 0.105 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 4.32e-01 -0.122 0.155 0.105 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -177 sc-eQTL 7.22e-01 0.0483 0.135 0.105 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0368 0.0945 0.105 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 2.51e-01 -0.185 0.16 0.105 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000184 0.153 0.105 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 5.45e-01 0.0818 0.135 0.105 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 3.77e-01 -0.132 0.149 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 2.19e-01 0.153 0.124 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 3.92e-01 -0.1 0.117 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -177 sc-eQTL 1.18e-01 -0.19 0.121 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0542 0.0748 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0847 0.139 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 1.18e-01 0.164 0.104 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 7.33e-01 0.0402 0.118 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 6.75e-01 0.061 0.145 0.112 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 7.45e-01 0.0436 0.134 0.112 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 8.77e-01 0.0181 0.117 0.112 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -177 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0349 0.112 0.112 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0376 0.0988 0.112 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 2.40e-01 0.155 0.132 0.112 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 2.63e-01 -0.127 0.113 0.112 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 8.77e-02 -0.226 0.132 0.112 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 2.83e-02 0.293 0.133 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 4.21e-01 0.0933 0.116 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 4.87e-01 -0.071 0.102 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -177 sc-eQTL 8.89e-02 0.176 0.103 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 1.20e-01 -0.107 0.0688 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 1.14e-01 -0.193 0.121 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 2.79e-01 0.0985 0.0907 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 1.24e-01 -0.173 0.112 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 1.08e-02 0.362 0.141 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 3.39e-01 0.113 0.118 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00307 0.115 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -177 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0143 0.111 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 6.77e-02 -0.137 0.0746 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 4.50e-01 0.104 0.137 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 4.58e-02 0.218 0.109 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 1.03e-01 0.192 0.118 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00852 0.143 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 3.12e-01 -0.142 0.14 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 2.27e-01 0.167 0.137 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 4.18e-01 0.0997 0.123 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0691 0.126 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 4.08e-01 -0.111 0.134 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 7.70e-03 0.314 0.117 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 6.37e-01 0.0519 0.11 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 2.22e-01 0.119 0.0972 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00184 0.0779 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 6.06e-01 0.043 0.0834 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0991 0.0913 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 3.52e-01 0.0789 0.0845 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 5.41e-01 0.0596 0.0972 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 9.91e-01 0.00151 0.137 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 5.86e-01 0.0604 0.111 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0857 0.0979 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 7.41e-01 0.0269 0.0813 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 2.86e-01 -0.116 0.109 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 5.17e-01 0.0669 0.103 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 6.28e-02 0.213 0.114 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 1.58e-01 0.196 0.139 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 2.07e-01 -0.167 0.132 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 7.67e-01 0.0328 0.111 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 4.60e-01 0.0826 0.112 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 7.67e-01 0.0371 0.125 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 2.69e-01 0.145 0.13 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 6.55e-01 0.0576 0.129 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 6.64e-01 0.0654 0.15 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 5.86e-02 0.217 0.114 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0809 0.112 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 7.47e-02 0.22 0.123 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 5.57e-01 0.0635 0.108 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 3.18e-02 0.279 0.129 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 7.38e-01 -0.041 0.123 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 3.56e-01 0.129 0.139 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 7.28e-01 0.0419 0.12 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 6.89e-01 0.0388 0.0969 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 2.71e-02 -0.204 0.0918 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 3.17e-01 0.129 0.129 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 2.78e-01 0.126 0.116 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0747 0.126 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0103 0.154 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 7.76e-01 0.0403 0.141 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 6.86e-01 0.0538 0.133 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0174 0.139 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 4.17e-01 0.115 0.142 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 5.44e-01 0.0781 0.128 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0497 0.13 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 2.34e-01 0.173 0.145 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0173 0.139 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 8.35e-01 0.0296 0.142 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 3.78e-01 -0.118 0.134 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0172 0.126 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 3.66e-01 0.126 0.139 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 1.13e-02 0.316 0.124 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 4.45e-01 0.114 0.148 0.113 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00235 0.132 0.113 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 8.32e-01 0.0268 0.126 0.113 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 7.07e-01 0.0448 0.119 0.113 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 8.75e-01 0.0205 0.131 0.113 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0354 0.132 0.113 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0184 0.137 0.113 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 7.27e-01 0.0536 0.153 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 5.01e-02 0.253 0.128 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 8.75e-03 -0.354 0.134 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 2.80e-01 0.145 0.134 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 4.43e-01 0.1 0.13 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 3.40e-02 -0.284 0.133 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 6.79e-01 -0.055 0.133 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 1.00e+00 5.4e-05 0.141 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 9.79e-02 0.172 0.104 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 1.78e-01 -0.144 0.107 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 9.94e-01 0.000904 0.114 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0194 0.102 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0937 0.143 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 7.70e-01 0.0345 0.118 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 4.77e-01 -0.111 0.155 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 4.61e-01 -0.102 0.139 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 2.14e-01 -0.168 0.135 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 3.75e-01 -0.115 0.129 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 6.03e-01 0.0757 0.145 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 3.94e-01 0.117 0.137 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 9.67e-01 0.00549 0.133 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 3.63e-01 0.126 0.139 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0975 0.108 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 8.15e-01 0.0275 0.117 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 9.90e-01 0.00161 0.129 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 7.67e-01 0.0326 0.11 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 6.55e-01 0.0611 0.137 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 9.44e-01 0.00887 0.127 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 3.14e-01 -0.169 0.167 0.111 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 2.36e-01 -0.23 0.193 0.111 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 7.16e-01 0.0617 0.169 0.111 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -177 sc-eQTL 4.54e-01 -0.118 0.157 0.111 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 9.71e-01 0.00405 0.113 0.111 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 2.28e-02 0.391 0.169 0.111 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 3.32e-01 0.149 0.153 0.111 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 1.29e-01 -0.249 0.162 0.111 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 3.32e-02 0.226 0.105 0.115 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 4.63e-02 0.269 0.134 0.115 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00352 0.126 0.115 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0828 0.0904 0.115 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 3.48e-01 -0.125 0.133 0.115 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 4.41e-01 0.0976 0.126 0.115 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0209 0.116 0.115 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0872 0.142 0.113 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 2.40e-02 -0.31 0.136 0.113 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00729 0.11 0.113 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 8.96e-01 0.0165 0.126 0.113 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0355 0.136 0.113 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00656 0.129 0.113 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 8.56e-01 0.0234 0.129 0.113 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 8.27e-01 0.0319 0.146 0.117 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 6.10e-01 0.0809 0.158 0.117 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 1.95e-01 -0.176 0.135 0.117 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 9.06e-01 0.0113 0.0953 0.117 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0211 0.138 0.117 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -686157 sc-eQTL 3.44e-01 0.116 0.122 0.117 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -782818 sc-eQTL 2.81e-01 -0.13 0.12 0.117 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 9.34e-01 0.0107 0.129 0.117 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0299 0.114 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 4.46e-01 0.097 0.127 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 5.87e-01 0.0468 0.086 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0491 0.0755 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -185350 sc-eQTL 4.11e-01 0.117 0.142 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 7.80e-01 0.0325 0.116 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -686157 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00502 0.144 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -782818 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0646 0.127 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 8.87e-03 -0.309 0.117 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0783 0.12 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 9.01e-01 0.0176 0.142 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0407 0.103 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0458 0.0788 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -185350 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0717 0.136 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 1.77e-01 0.166 0.122 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -686157 sc-eQTL 6.92e-01 0.0572 0.144 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -782818 sc-eQTL 5.76e-01 0.0656 0.117 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 1.88e-01 -0.155 0.117 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 4.43e-01 0.139 0.181 0.121 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 3.86e-01 0.135 0.155 0.121 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00382 0.161 0.121 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 2.98e-01 -0.182 0.174 0.121 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00796 0.16 0.121 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 9.49e-01 0.0103 0.161 0.121 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 2.81e-01 -0.168 0.155 0.121 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 2.94e-01 -0.138 0.131 0.118 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 4.37e-01 0.11 0.141 0.118 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 9.50e-01 0.00752 0.12 0.118 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 1.49e-01 -0.136 0.0937 0.118 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -185350 sc-eQTL 5.02e-01 0.0866 0.129 0.118 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 4.22e-01 0.109 0.135 0.118 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -686157 sc-eQTL 1.12e-01 0.214 0.134 0.118 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -782818 sc-eQTL 9.70e-01 0.00484 0.128 0.118 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 2.51e-02 -0.285 0.126 0.118 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 1.87e-02 -0.305 0.128 0.115 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 9.66e-01 0.00585 0.139 0.115 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0686 0.113 0.115 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 3.27e-01 0.101 0.103 0.115 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -185350 sc-eQTL 4.12e-01 0.0949 0.115 0.115 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 7.89e-01 0.0355 0.132 0.115 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -686157 sc-eQTL 8.06e-01 -0.031 0.126 0.115 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -782818 sc-eQTL 2.57e-01 0.143 0.126 0.115 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 1.80e-01 0.175 0.13 0.115 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 7.40e-02 0.256 0.142 0.119 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0894 0.157 0.119 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0313 0.131 0.119 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0981 0.121 0.119 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 4.98e-01 0.107 0.157 0.119 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -686157 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0591 0.147 0.119 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -782818 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0805 0.114 0.119 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0164 0.135 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 7.21e-01 -0.051 0.143 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 2.30e-01 0.142 0.118 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 1.10e-01 -0.168 0.105 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -177 sc-eQTL 2.42e-01 -0.14 0.12 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0646 0.0752 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0217 0.125 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 4.38e-01 0.0773 0.0995 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 9.07e-01 0.0127 0.109 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 1.61e-03 0.41 0.128 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 3.23e-01 0.103 0.104 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0781 0.0981 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -177 sc-eQTL 9.50e-02 0.158 0.094 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 1.10e-01 -0.106 0.0662 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 2.61e-01 -0.136 0.121 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 1.77e-01 0.116 0.0856 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 9.25e-01 0.00965 0.102 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0991 0.109 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 5.22e-01 0.0792 0.124 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0255 0.0789 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0251 0.0693 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -185350 sc-eQTL 5.53e-01 0.0839 0.141 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 5.64e-01 0.0574 0.0994 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -686157 sc-eQTL 1.00e+00 6.19e-05 0.145 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -782818 sc-eQTL 8.46e-01 0.0233 0.119 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 1.00e-02 -0.286 0.11 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 2.97e-02 -0.264 0.12 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 7.41e-01 0.0442 0.133 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0346 0.109 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0373 0.0873 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -185350 sc-eQTL 1.80e-01 0.171 0.127 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 1.48e-01 0.167 0.115 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -686157 sc-eQTL 1.88e-01 0.174 0.132 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -782818 sc-eQTL 4.89e-01 0.0869 0.125 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0977 0.126 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -573380 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00989 0.134 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -573574 sc-eQTL 4.48e-01 0.0697 0.0916 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -342583 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0914 0.1 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -34366 sc-eQTL 8.44e-01 0.0221 0.112 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -921488 sc-eQTL 9.93e-01 0.000792 0.0854 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 4904 sc-eQTL 5.40e-01 0.0795 0.129 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -8285 sc-eQTL 4.45e-01 0.0855 0.112 0.112 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162511 \N -34366 1.53e-05 1.57e-05 2.44e-06 9.8e-06 2.42e-06 7.23e-06 2.2e-05 2.14e-06 1.5e-05 7.59e-06 1.99e-05 7.82e-06 2.49e-05 6.34e-06 4.47e-06 1.01e-05 7.67e-06 1.18e-05 3.61e-06 3.13e-06 6.98e-06 1.42e-05 1.51e-05 4.56e-06 2.97e-05 4.86e-06 7.96e-06 6.54e-06 1.64e-05 1.2e-05 9.27e-06 1.27e-06 1.22e-06 3.99e-06 6.9e-06 2.82e-06 1.77e-06 2.35e-06 2.49e-06 2.03e-06 1.12e-06 2.01e-05 2.43e-06 3.33e-07 9.54e-07 2.52e-06 2.62e-06 7.89e-07 4.59e-07