logo

Genes within 1Mb (chr1:30721937:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0297 0.131 0.094 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0578 0.105 0.094 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 1.73e-01 0.12 0.0879 0.094 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -1648 sc-eQTL 1.59e-01 0.131 0.0924 0.094 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 8.16e-01 0.0169 0.0727 0.094 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 6.94e-01 0.0433 0.11 0.094 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0598 0.0851 0.094 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 6.22e-01 0.0497 0.101 0.094 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 3.27e-01 -0.11 0.112 0.094 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 1.80e-01 0.118 0.0874 0.094 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 5.10e-01 0.0515 0.078 0.094 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0292 0.0866 0.094 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 2.95e-01 0.0948 0.0903 0.094 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0854 0.0772 0.094 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 8.51e-01 0.0175 0.0928 0.094 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 8.24e-01 0.0331 0.149 0.094 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 1.37e-01 0.147 0.0986 0.094 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 6.60e-01 0.0384 0.0872 0.094 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 7.22e-01 0.0302 0.0847 0.094 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 9.10e-01 0.0118 0.104 0.094 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 5.70e-02 -0.188 0.0985 0.094 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 6.37e-01 0.059 0.125 0.094 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 5.00e-01 0.098 0.145 0.086 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 3.12e-02 0.368 0.17 0.086 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 5.83e-01 -0.074 0.134 0.086 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 1.72e-02 -0.228 0.0947 0.086 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 5.18e-01 -0.101 0.156 0.086 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -687628 sc-eQTL 4.81e-01 -0.112 0.158 0.086 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -784289 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0763 0.105 0.086 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0809 0.152 0.086 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0242 0.103 0.094 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 3.73e-01 0.114 0.128 0.094 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0341 0.082 0.094 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 3.96e-01 0.064 0.0753 0.094 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -186821 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0679 0.145 0.094 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 1.51e-01 0.146 0.101 0.094 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -687628 sc-eQTL 9.89e-01 0.00212 0.156 0.094 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -784289 sc-eQTL 3.11e-01 -0.139 0.137 0.094 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0769 0.12 0.094 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 1.50e-02 -0.345 0.141 0.094 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 2.58e-01 0.111 0.0975 0.094 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 7.46e-01 0.0332 0.103 0.094 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 3.03e-01 -0.122 0.118 0.094 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0674 0.0861 0.094 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 2.60e-02 -0.294 0.131 0.094 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0919 0.122 0.094 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 7.94e-01 0.0288 0.11 0.094 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 4.49e-01 0.0893 0.118 0.094 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 5.36e-01 0.0657 0.106 0.094 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 1.92e-01 -0.113 0.0865 0.094 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 9.02e-01 0.0143 0.116 0.094 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0401 0.142 0.094 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 3.71e-01 0.133 0.148 0.094 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 1.83e-01 -0.238 0.178 0.089 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 1.96e-01 -0.234 0.18 0.089 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 4.81e-01 0.119 0.168 0.089 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -1648 sc-eQTL 7.14e-01 0.0539 0.147 0.089 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 7.10e-01 0.0381 0.102 0.089 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 5.69e-01 0.0994 0.174 0.089 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 6.64e-01 0.0719 0.165 0.089 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 1.63e-01 0.204 0.145 0.089 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 2.18e-01 0.208 0.168 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 4.72e-01 0.101 0.14 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0139 0.133 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -1648 sc-eQTL 2.55e-01 0.157 0.138 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 2.79e-01 0.0918 0.0845 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 9.22e-01 0.0154 0.157 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 3.53e-01 -0.111 0.119 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 1.78e-01 -0.179 0.133 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0452 0.169 0.095 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 6.40e-01 0.0727 0.155 0.095 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0954 0.135 0.095 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -1648 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0403 0.129 0.095 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 1.96e-01 0.148 0.114 0.095 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 2.12e-01 -0.191 0.153 0.095 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 3.76e-01 -0.116 0.131 0.095 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0379 0.154 0.095 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 2.81e-01 -0.155 0.144 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 3.71e-02 -0.258 0.123 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 4.95e-01 0.075 0.11 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -1648 sc-eQTL 4.00e-01 0.0937 0.111 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 8.13e-01 0.0176 0.0744 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 4.52e-02 0.262 0.13 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 2.91e-01 -0.103 0.0975 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 4.26e-01 0.0962 0.121 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 7.54e-01 0.0489 0.156 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 3.10e-01 0.131 0.128 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 1.01e-01 0.206 0.125 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -1648 sc-eQTL 7.31e-01 0.0417 0.121 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 1.65e-01 0.114 0.0818 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 5.61e-01 -0.087 0.149 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 1.72e-01 -0.163 0.119 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 6.21e-01 0.0639 0.129 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 2.66e-01 -0.171 0.153 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 6.88e-01 0.0608 0.151 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 8.19e-01 -0.034 0.148 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0772 0.132 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 5.70e-01 0.077 0.135 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0536 0.144 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 9.21e-01 0.0127 0.127 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 7.20e-01 0.0426 0.119 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 7.09e-01 0.0393 0.105 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 1.12e-01 0.133 0.0836 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0192 0.0901 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 2.00e-01 0.127 0.0984 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0279 0.0914 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00441 0.105 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 4.87e-01 -0.102 0.147 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 3.19e-01 0.118 0.119 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0856 0.105 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0237 0.0872 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 7.67e-01 0.0346 0.117 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 1.14e-01 -0.175 0.11 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 9.55e-02 -0.205 0.123 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 6.85e-01 -0.061 0.15 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 8.84e-01 0.0209 0.143 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 3.41e-01 -0.113 0.119 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00274 0.121 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 2.32e-01 0.161 0.135 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 1.99e-01 -0.181 0.14 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 2.50e-01 0.16 0.139 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 3.22e-01 0.162 0.163 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 1.13e-01 0.198 0.125 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0468 0.122 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0868 0.135 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 7.05e-01 0.0445 0.117 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 8.81e-02 -0.241 0.141 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 6.61e-01 0.0585 0.133 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 1.48e-01 -0.214 0.148 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 3.78e-01 0.113 0.128 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 9.62e-01 0.00495 0.103 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 6.40e-01 0.0462 0.0986 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 2.81e-01 -0.148 0.137 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 1.20e-01 -0.191 0.122 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0413 0.134 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0515 0.175 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 3.72e-01 -0.143 0.16 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 8.33e-01 -0.032 0.151 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0361 0.158 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 7.13e-01 0.0595 0.161 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 6.52e-01 0.066 0.146 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 3.82e-01 -0.129 0.148 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 9.97e-01 0.000557 0.16 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 5.87e-01 0.0837 0.154 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0723 0.157 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 7.03e-01 0.0563 0.148 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 3.15e-01 0.14 0.139 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 4.06e-01 -0.128 0.153 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 3.45e-01 -0.131 0.139 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 8.55e-01 0.0296 0.162 0.093 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0966 0.144 0.093 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 6.22e-01 0.068 0.138 0.093 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 5.54e-02 -0.248 0.129 0.093 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 9.82e-01 0.00316 0.143 0.093 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 9.62e-01 0.00697 0.145 0.093 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 2.43e-01 0.174 0.149 0.093 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 1.26e-01 -0.248 0.161 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 1.14e-01 0.216 0.136 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0755 0.144 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0523 0.142 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0642 0.138 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 8.80e-02 0.243 0.142 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 4.83e-01 0.0988 0.14 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 1.05e-01 -0.247 0.152 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 1.98e-01 0.145 0.112 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 6.43e-01 0.0536 0.116 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0774 0.123 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0203 0.11 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 4.35e-02 -0.311 0.153 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 2.99e-01 -0.133 0.127 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 1.83e-01 -0.209 0.156 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 8.16e-01 0.0328 0.14 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 4.06e-01 0.114 0.136 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 7.42e-02 -0.232 0.129 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 4.36e-01 -0.115 0.147 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0436 0.139 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 2.90e-01 -0.142 0.134 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0879 0.148 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 4.10e-01 0.0952 0.115 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0459 0.125 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 4.29e-01 -0.109 0.137 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0388 0.117 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 1.54e-01 -0.208 0.145 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00844 0.136 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0929 0.164 0.107 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 8.56e-01 0.0346 0.19 0.107 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 3.03e-01 0.17 0.165 0.107 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -1648 sc-eQTL 5.02e-01 0.104 0.154 0.107 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0374 0.11 0.107 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 1.35e-01 0.253 0.168 0.107 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 4.43e-01 -0.116 0.15 0.107 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0204 0.16 0.107 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 7.10e-01 0.0439 0.118 0.093 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 2.44e-01 0.174 0.149 0.093 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 2.57e-01 0.158 0.139 0.093 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 1.28e-01 0.152 0.0996 0.093 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 5.04e-02 0.287 0.146 0.093 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 4.42e-01 -0.108 0.14 0.093 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 3.61e-01 0.118 0.128 0.093 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 7.56e-01 0.0479 0.154 0.094 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 7.61e-01 0.0453 0.149 0.094 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0493 0.119 0.094 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 1.28e-01 -0.207 0.135 0.094 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 9.62e-02 -0.244 0.146 0.094 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 2.95e-01 -0.145 0.138 0.094 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0787 0.138 0.094 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0746 0.172 0.083 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 7.55e-01 -0.058 0.186 0.083 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 7.82e-01 0.0442 0.16 0.083 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0414 0.112 0.083 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 3.98e-01 -0.137 0.162 0.083 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -687628 sc-eQTL 7.02e-01 0.055 0.144 0.083 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -784289 sc-eQTL 6.06e-01 0.0728 0.141 0.083 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 8.36e-01 0.0316 0.152 0.083 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 1.41e-01 -0.184 0.124 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 3.24e-01 0.138 0.139 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 1.83e-01 -0.125 0.094 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 3.71e-01 0.0742 0.0827 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -186821 sc-eQTL 5.73e-01 0.088 0.156 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0372 0.127 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -687628 sc-eQTL 6.53e-01 -0.071 0.158 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -784289 sc-eQTL 3.66e-01 -0.126 0.139 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 6.20e-01 0.0647 0.13 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 2.99e-01 -0.136 0.131 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 6.76e-01 -0.065 0.155 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 2.86e-01 0.12 0.112 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 8.51e-01 0.0162 0.0862 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -186821 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0563 0.149 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 8.30e-02 0.233 0.134 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -687628 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0627 0.158 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -784289 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0284 0.128 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0784 0.129 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 4.68e-01 -0.145 0.199 0.085 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0242 0.171 0.085 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 7.62e-01 0.0534 0.176 0.085 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00908 0.192 0.085 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 7.93e-01 0.0461 0.175 0.085 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 3.20e-01 -0.176 0.176 0.085 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 7.65e-01 0.0512 0.171 0.085 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 1.72e-01 -0.204 0.149 0.089 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 4.83e-01 0.113 0.16 0.089 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0116 0.136 0.089 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 3.73e-01 0.0952 0.107 0.089 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -186821 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0511 0.146 0.089 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0805 0.154 0.089 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -687628 sc-eQTL 3.09e-01 0.156 0.153 0.089 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -784289 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00992 0.145 0.089 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 5.59e-02 -0.277 0.144 0.089 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 2.45e-01 0.167 0.143 0.088 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0626 0.153 0.088 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 4.14e-01 0.102 0.125 0.088 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0488 0.114 0.088 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -186821 sc-eQTL 6.57e-01 0.0567 0.128 0.088 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0564 0.146 0.088 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -687628 sc-eQTL 8.83e-01 0.0206 0.139 0.088 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -784289 sc-eQTL 2.29e-01 -0.167 0.139 0.088 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 3.88e-01 -0.124 0.144 0.088 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 7.13e-01 0.0628 0.17 0.076 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 1.02e-01 0.305 0.185 0.076 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 4.79e-02 -0.306 0.153 0.076 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 3.07e-01 -0.147 0.144 0.076 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 9.61e-01 0.00918 0.187 0.076 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -687628 sc-eQTL 3.29e-02 -0.371 0.172 0.076 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -784289 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0625 0.136 0.076 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 2.64e-01 0.178 0.159 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0207 0.162 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 2.69e-01 0.149 0.135 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0252 0.12 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -1648 sc-eQTL 2.31e-01 0.163 0.136 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 5.32e-01 0.0537 0.0857 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0074 0.142 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 3.19e-01 -0.113 0.113 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 3.00e-01 -0.128 0.123 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0819 0.14 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 3.50e-01 -0.104 0.111 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 4.63e-01 0.0771 0.105 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -1648 sc-eQTL 4.42e-01 0.0778 0.101 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 7.00e-01 0.0275 0.0712 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 1.03e-01 0.212 0.129 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 3.61e-01 -0.084 0.0918 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 2.57e-01 0.124 0.109 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 2.84e-01 -0.126 0.117 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 5.53e-01 0.0791 0.133 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 6.39e-01 -0.04 0.085 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 3.44e-01 0.0707 0.0746 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -186821 sc-eQTL 8.48e-01 0.0293 0.152 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 2.31e-01 0.128 0.107 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -687628 sc-eQTL 8.89e-01 -0.022 0.157 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -784289 sc-eQTL 2.41e-01 -0.151 0.128 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0028 0.12 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00711 0.131 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 2.48e-01 0.165 0.143 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 5.61e-01 0.0682 0.117 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 3.32e-01 0.0911 0.0936 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -186821 sc-eQTL 7.58e-01 0.0422 0.137 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0185 0.125 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -687628 sc-eQTL 4.04e-01 0.119 0.142 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -784289 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0851 0.135 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 5.75e-02 -0.256 0.134 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -574851 sc-eQTL 3.73e-02 -0.299 0.143 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -575045 sc-eQTL 3.86e-01 0.0855 0.0983 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -344054 sc-eQTL 7.47e-01 0.0348 0.108 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 sc-eQTL 2.39e-01 -0.142 0.12 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -922959 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0332 0.0916 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 sc-eQTL 5.94e-03 -0.38 0.137 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -9756 sc-eQTL 2.45e-01 -0.139 0.12 0.093 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162510 MATN1 -1648 eQTL 0.00049 -0.116 0.0331 0.00851 0.00638 0.0932
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 eQTL 1.11e-11 0.114 0.0165 0.0 0.0 0.0932
ENSG00000186056 MATN1-AS1 3433 eQTL 2.14e-05 -0.0903 0.0211 0.00175 0.00286 0.0932
ENSG00000284543 LINC01226 -784344 eQTL 0.00572 -0.148 0.0535 0.00192 0.0 0.0932

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162511 LAPTM5 -35837 3.22e-05 9.35e-06 1.32e-06 5e-06 1.74e-06 7.88e-06 1.01e-05 1.27e-06 9.65e-06 5.31e-06 1.02e-05 4.35e-06 1.36e-05 3.86e-06 1.66e-06 6.43e-06 3.8e-06 1.12e-05 2.19e-06 1.7e-06 5.18e-06 9.11e-06 6.82e-06 3.15e-06 1.26e-05 2.66e-06 4.51e-06 3.39e-06 6.95e-06 7.71e-06 4.61e-06 1.05e-06 7.42e-07 2.93e-06 3.56e-06 1.68e-06 1.05e-06 4.51e-07 1.37e-06 1.04e-06 8.2e-07 1.09e-05 2.24e-06 1.96e-07 8.27e-07 1.32e-06 9.63e-07 6.71e-07 5.83e-07