logo

Genes within 1Mb (chr1:30715469:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 5.55e-01 0.0527 0.0892 0.288 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0107 0.0715 0.288 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 1.84e-01 0.0797 0.0598 0.288 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -8116 sc-eQTL 2.19e-02 -0.144 0.0623 0.288 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 6.76e-01 0.0207 0.0494 0.288 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 4.57e-01 0.0555 0.0745 0.288 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 5.44e-01 0.0352 0.0578 0.288 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 1.29e-02 0.169 0.0675 0.288 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 3.32e-01 -0.076 0.0782 0.288 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 5.54e-02 0.117 0.0607 0.288 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00379 0.0545 0.288 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0127 0.0604 0.288 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 2.80e-01 0.0682 0.063 0.288 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 4.77e-01 0.0385 0.054 0.288 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 9.34e-01 0.00539 0.0647 0.288 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 3.96e-01 0.0869 0.102 0.288 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 5.68e-01 -0.039 0.0681 0.288 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 7.23e-01 0.0213 0.06 0.288 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0687 0.0581 0.288 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 5.93e-01 0.0384 0.0717 0.288 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0302 0.0683 0.288 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000134 0.0858 0.288 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 6.72e-01 0.0396 0.0933 0.284 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 1.91e-01 0.144 0.11 0.284 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0631 0.0864 0.284 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0168 0.0618 0.284 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0623 0.1 0.284 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -694096 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000736 0.102 0.284 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -790757 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0686 0.0673 0.284 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0561 0.0977 0.284 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 2.33e-01 0.085 0.0711 0.288 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 8.70e-01 0.0145 0.0884 0.288 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 3.43e-01 0.0538 0.0566 0.288 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 4.75e-01 0.0373 0.0521 0.288 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -193289 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0396 0.1 0.288 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 6.79e-01 0.0292 0.0703 0.288 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -694096 sc-eQTL 6.65e-01 0.0467 0.107 0.288 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -790757 sc-eQTL 4.91e-02 -0.186 0.0938 0.288 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0826 0.0826 0.288 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 8.55e-01 0.0179 0.0978 0.288 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 9.34e-01 0.00556 0.0669 0.288 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 2.98e-01 0.0731 0.07 0.288 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0288 0.0808 0.288 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0101 0.059 0.288 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 2.26e-01 -0.11 0.0905 0.288 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 6.31e-01 0.0403 0.0838 0.288 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 5.92e-01 0.04 0.0746 0.288 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 7.91e-01 0.0212 0.0798 0.288 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 1.29e-01 -0.109 0.0714 0.288 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0398 0.0588 0.288 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0561 0.0785 0.288 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 6.32e-01 0.0461 0.0963 0.288 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 4.97e-01 0.0683 0.1 0.288 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0433 0.119 0.288 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0278 0.12 0.288 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 4.91e-01 0.0767 0.111 0.288 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -8116 sc-eQTL 6.87e-01 0.0392 0.0971 0.288 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 4.40e-01 0.0524 0.0676 0.288 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 4.86e-02 0.226 0.114 0.288 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 4.00e-01 0.0922 0.109 0.288 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 2.13e-01 0.12 0.0964 0.288 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 6.09e-01 0.0579 0.113 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 5.30e-01 0.0592 0.0943 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 1.96e-01 0.115 0.0886 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -8116 sc-eQTL 8.06e-01 0.0228 0.0926 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 2.29e-01 0.0684 0.0567 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0445 0.106 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 6.56e-01 0.0356 0.0798 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 7.25e-01 0.0315 0.0893 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 2.46e-01 0.129 0.111 0.291 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 9.24e-01 0.00982 0.103 0.291 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0557 0.0893 0.291 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -8116 sc-eQTL 4.57e-02 -0.17 0.0847 0.291 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 2.14e-01 0.0942 0.0755 0.291 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0567 0.101 0.291 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 8.42e-01 0.0174 0.0867 0.291 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0516 0.101 0.291 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 6.06e-01 0.0512 0.0991 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0254 0.0856 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 2.13e-01 0.094 0.0753 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -8116 sc-eQTL 1.96e-03 -0.235 0.0749 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 7.88e-01 0.0138 0.0512 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 1.24e-01 0.139 0.0898 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0044 0.0673 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 1.03e-03 0.27 0.081 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 6.41e-01 0.0493 0.106 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0945 0.087 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0486 0.0853 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -8116 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0964 0.0817 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 2.65e-01 0.0621 0.0555 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 4.98e-01 0.0686 0.101 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 9.16e-01 0.00853 0.0811 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0138 0.0876 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 1.92e-01 -0.135 0.103 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0308 0.101 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 2.57e-01 0.113 0.0992 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 1.66e-01 -0.123 0.0883 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0157 0.0909 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 7.24e-01 0.0343 0.097 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 1.55e-01 -0.122 0.0852 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 9.05e-01 0.00987 0.0826 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 2.95e-01 0.0767 0.0731 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 6.08e-01 0.03 0.0585 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 7.67e-01 0.0186 0.0627 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 1.10e-01 0.11 0.0683 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 3.31e-01 0.0618 0.0635 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 4.62e-01 0.0537 0.073 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0152 0.102 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 5.64e-01 0.0475 0.0822 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 4.51e-01 -0.055 0.0727 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00134 0.0604 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 3.58e-01 0.0744 0.0808 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 8.72e-01 0.0124 0.0767 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 1.64e-02 -0.204 0.0843 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0468 0.102 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 8.84e-01 0.0141 0.0968 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 9.78e-01 0.00224 0.0807 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 3.57e-01 0.0751 0.0814 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 6.77e-01 0.0382 0.0914 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0471 0.0954 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0264 0.094 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 7.46e-01 0.036 0.111 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0213 0.0851 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0437 0.0826 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 2.32e-01 -0.109 0.0912 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 5.79e-01 0.0443 0.0797 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 8.19e-01 -0.022 0.0962 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0474 0.0904 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 9.13e-01 0.0113 0.103 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 5.42e-01 -0.054 0.0884 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 6.80e-01 0.0294 0.0712 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 7.94e-01 0.0178 0.0682 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0206 0.0949 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 7.24e-01 0.0301 0.0852 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00476 0.0928 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0929 0.119 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000689 0.109 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0664 0.102 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0417 0.107 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 7.67e-01 0.0326 0.11 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0128 0.0994 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 2.61e-01 -0.113 0.1 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 2.62e-01 0.12 0.107 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 3.12e-01 0.104 0.102 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0916 0.105 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 9.02e-01 0.0121 0.0988 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 4.09e-01 0.0769 0.0928 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0479 0.102 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0977 0.0925 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 2.99e-01 0.113 0.109 0.288 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 8.45e-01 -0.019 0.0966 0.288 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0349 0.0926 0.288 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 5.22e-01 -0.056 0.0873 0.288 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0429 0.096 0.288 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0116 0.0973 0.288 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 7.50e-01 0.0319 0.1 0.288 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0449 0.11 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 5.96e-01 0.0494 0.0932 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 5.71e-01 0.0555 0.0978 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 1.40e-01 0.142 0.0961 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0712 0.0937 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 1.01e-02 0.248 0.0955 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 4.28e-02 0.193 0.0947 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0103 0.104 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 9.60e-01 0.00384 0.0767 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 4.84e-01 0.0551 0.0786 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0766 0.0837 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 9.48e-01 0.00486 0.0746 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 2.12e-01 -0.131 0.105 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0648 0.0866 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0611 0.109 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 1.38e-01 0.145 0.0972 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0569 0.0952 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0816 0.0907 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0895 0.102 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0593 0.0966 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0162 0.0935 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 5.76e-01 0.0562 0.1 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 9.54e-01 0.00448 0.0783 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 2.46e-01 0.0983 0.0844 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 8.30e-01 -0.02 0.0933 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0458 0.0794 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0882 0.0987 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 4.05e-01 0.0765 0.0918 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 1.09e-01 0.185 0.114 0.281 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00517 0.134 0.281 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 7.52e-01 0.0369 0.117 0.281 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -8116 sc-eQTL 8.96e-01 0.0143 0.109 0.281 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0729 0.0774 0.281 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 1.00e+00 3.47e-05 0.12 0.281 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0373 0.106 0.281 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 7.08e-01 0.0425 0.113 0.281 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0481 0.0815 0.287 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 5.25e-01 0.0659 0.103 0.287 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 6.38e-01 0.0454 0.0965 0.287 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 6.28e-01 0.0336 0.0692 0.287 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 1.30e-01 0.154 0.101 0.287 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 1.70e-01 -0.133 0.0964 0.287 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 8.25e-01 0.0197 0.089 0.287 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 4.63e-01 0.0776 0.106 0.288 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 2.92e-01 0.108 0.102 0.288 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0892 0.0817 0.288 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0751 0.0936 0.288 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 1.56e-01 -0.144 0.101 0.288 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00524 0.0955 0.288 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 5.81e-01 0.0527 0.0954 0.288 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 4.92e-01 0.0757 0.11 0.283 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0794 0.119 0.283 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 1.57e-01 -0.145 0.102 0.283 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 1.09e-01 0.115 0.0712 0.283 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0684 0.104 0.283 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -694096 sc-eQTL 9.22e-01 0.00902 0.0921 0.283 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -790757 sc-eQTL 1.34e-02 0.222 0.089 0.283 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 7.24e-01 0.0345 0.0974 0.283 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 4.40e-01 0.066 0.0854 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 5.65e-01 0.0549 0.0953 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0278 0.0645 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 2.36e-01 0.0672 0.0565 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -193289 sc-eQTL 6.00e-01 0.056 0.107 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0724 0.0871 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -694096 sc-eQTL 9.17e-01 0.0113 0.108 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -790757 sc-eQTL 1.12e-01 -0.151 0.0949 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0306 0.0891 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0197 0.0898 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0608 0.106 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 5.59e-02 0.146 0.076 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 6.25e-01 0.0288 0.0589 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -193289 sc-eQTL 3.35e-01 0.0981 0.102 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 7.07e-01 0.0345 0.0919 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -694096 sc-eQTL 6.94e-01 0.0424 0.108 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -790757 sc-eQTL 2.42e-01 -0.102 0.0872 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0156 0.0879 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0694 0.137 0.279 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0366 0.118 0.279 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 7.15e-01 0.0445 0.122 0.279 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0594 0.132 0.279 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0787 0.121 0.279 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 6.80e-01 0.0504 0.122 0.279 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00373 0.118 0.279 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 6.79e-01 0.042 0.101 0.282 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 8.54e-01 -0.02 0.109 0.282 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 3.47e-01 0.0868 0.0922 0.282 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 3.28e-01 0.0709 0.0723 0.282 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -193289 sc-eQTL 7.10e-01 -0.037 0.0992 0.282 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 4.29e-01 0.0825 0.104 0.282 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -694096 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0103 0.104 0.282 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -790757 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0852 0.0983 0.282 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0639 0.0984 0.282 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 7.70e-01 0.0275 0.0938 0.285 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 2.87e-01 0.106 0.0997 0.285 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 1.62e-02 0.195 0.0805 0.285 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0844 0.074 0.285 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -193289 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0226 0.0832 0.285 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 3.58e-02 0.199 0.0944 0.285 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -694096 sc-eQTL 7.39e-01 0.0303 0.0908 0.285 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -790757 sc-eQTL 4.95e-01 -0.062 0.0906 0.285 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 5.05e-02 -0.183 0.0932 0.285 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 7.87e-01 -0.029 0.107 0.28 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 2.34e-01 0.14 0.117 0.28 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 9.29e-01 0.0087 0.0974 0.28 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0511 0.0904 0.28 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 7.36e-01 0.0396 0.117 0.28 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -694096 sc-eQTL 2.15e-01 -0.136 0.109 0.28 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -790757 sc-eQTL 8.41e-02 -0.147 0.0844 0.28 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 7.54e-01 0.0315 0.1 0.28 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 4.74e-01 0.0773 0.108 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 3.64e-01 0.0815 0.0895 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 6.87e-01 0.0321 0.0795 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -8116 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0231 0.0906 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 1.99e-01 0.0731 0.0567 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0549 0.0943 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 4.28e-01 0.0598 0.0752 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 8.46e-01 -0.016 0.0821 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 7.62e-01 0.0291 0.096 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0529 0.0758 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 9.57e-01 0.00386 0.0718 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -8116 sc-eQTL 2.94e-03 -0.204 0.0677 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 9.30e-01 0.00429 0.0487 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 1.42e-01 0.131 0.0884 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00144 0.0629 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 1.41e-02 0.182 0.0736 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 4.41e-01 0.0623 0.0807 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 8.90e-01 0.0127 0.0916 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 3.23e-01 0.0577 0.0583 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 2.78e-01 0.0557 0.0512 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -193289 sc-eQTL 4.63e-01 0.0769 0.105 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0252 0.0736 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -694096 sc-eQTL 6.18e-01 0.0538 0.108 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -790757 sc-eQTL 5.92e-02 -0.166 0.0876 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0214 0.0827 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 7.70e-01 0.0265 0.0904 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 5.47e-01 0.0596 0.0989 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 1.30e-01 0.123 0.0806 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 7.95e-01 0.0169 0.0648 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -193289 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0642 0.0946 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 1.24e-01 0.132 0.0856 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -694096 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0175 0.0982 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -790757 sc-eQTL 2.57e-01 -0.106 0.0929 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 5.41e-02 -0.179 0.0925 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -581319 sc-eQTL 8.04e-01 0.0244 0.0982 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -581513 sc-eQTL 9.66e-01 0.00286 0.0671 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -350522 sc-eQTL 3.76e-01 0.0651 0.0734 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -42305 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0585 0.0821 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -929427 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00376 0.0624 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 sc-eQTL 6.68e-02 -0.173 0.094 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -16224 sc-eQTL 6.77e-01 -0.034 0.0818 0.287 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162510 MATN1 -8116 eQTL 0.0171 -0.0484 0.0203 0.0 0.0 0.32
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3035 eQTL 2.66e-02 0.0289 0.013 0.0 0.0 0.32
ENSG00000284543 LINC01226 -790812 eQTL 0.0367 -0.0685 0.0327 0.0 0.0 0.32

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina