logo

Genes within 1Mb (chr1:30714705:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0224 0.127 0.096 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0451 0.102 0.096 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 1.17e-01 0.134 0.085 0.096 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -8880 sc-eQTL 1.71e-01 0.123 0.0895 0.096 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 7.55e-01 0.022 0.0704 0.096 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 9.03e-01 0.013 0.106 0.096 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0629 0.0824 0.096 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 6.22e-01 0.0482 0.0976 0.096 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0745 0.109 0.096 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 7.67e-02 0.15 0.0843 0.096 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 5.56e-01 0.0445 0.0755 0.096 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0253 0.0837 0.096 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 2.58e-01 0.0989 0.0873 0.096 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 1.69e-01 -0.103 0.0746 0.096 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 8.95e-01 0.0119 0.0897 0.096 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 7.75e-01 0.0415 0.145 0.096 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 1.60e-01 0.135 0.096 0.096 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 5.04e-01 0.0568 0.0848 0.096 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 6.01e-01 0.0432 0.0824 0.096 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 6.24e-01 0.0498 0.102 0.096 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 3.39e-02 -0.204 0.0956 0.096 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 9.22e-01 -0.012 0.121 0.096 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 4.04e-01 0.117 0.14 0.088 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 8.22e-03 0.435 0.163 0.088 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0248 0.13 0.088 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 2.12e-02 -0.213 0.0916 0.088 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 3.99e-01 -0.127 0.15 0.088 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -694860 sc-eQTL 4.67e-01 -0.111 0.153 0.088 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -791521 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0658 0.101 0.088 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 5.36e-01 -0.091 0.147 0.088 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0108 0.102 0.096 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 3.63e-01 0.115 0.126 0.096 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0301 0.0809 0.096 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 2.76e-01 0.0811 0.0742 0.096 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -194053 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0955 0.143 0.096 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 1.38e-01 0.149 0.0998 0.096 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -694860 sc-eQTL 8.66e-01 0.0259 0.153 0.096 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -791521 sc-eQTL 3.02e-01 -0.14 0.135 0.096 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0659 0.118 0.096 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 7.90e-03 -0.364 0.136 0.097 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 4.03e-01 0.0791 0.0944 0.097 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 6.76e-01 0.0414 0.0991 0.097 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 2.33e-01 -0.136 0.114 0.097 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0915 0.0831 0.097 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 3.70e-02 -0.266 0.127 0.097 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 3.97e-01 -0.1 0.118 0.097 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0395 0.107 0.096 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 2.83e-01 0.123 0.114 0.096 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 7.29e-01 0.0356 0.103 0.096 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 2.24e-01 -0.102 0.0839 0.096 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0183 0.112 0.096 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0792 0.138 0.096 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 2.98e-01 0.149 0.143 0.096 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 1.76e-01 -0.232 0.171 0.092 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 2.01e-01 -0.221 0.172 0.092 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 4.19e-01 0.13 0.16 0.092 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -8880 sc-eQTL 6.41e-01 0.0655 0.14 0.092 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 7.65e-01 0.0293 0.0979 0.092 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 5.92e-01 0.0893 0.167 0.092 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 6.83e-01 0.0647 0.158 0.092 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 1.05e-01 0.226 0.139 0.092 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 2.18e-01 0.201 0.162 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 6.47e-01 0.0623 0.136 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 7.39e-01 0.0428 0.128 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -8880 sc-eQTL 2.99e-01 0.138 0.133 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 3.16e-01 0.0821 0.0817 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00909 0.152 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0847 0.115 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 1.03e-01 -0.209 0.128 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0393 0.162 0.097 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 7.83e-01 0.0411 0.149 0.097 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0897 0.13 0.097 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -8880 sc-eQTL 9.81e-01 0.00293 0.124 0.097 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 1.86e-01 0.145 0.11 0.097 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 1.57e-01 -0.208 0.146 0.097 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0908 0.126 0.097 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0154 0.147 0.097 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 4.36e-01 -0.109 0.14 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 4.65e-02 -0.24 0.12 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 4.32e-01 0.084 0.107 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -8880 sc-eQTL 4.89e-01 0.075 0.108 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 7.66e-01 0.0215 0.0723 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 5.69e-02 0.242 0.126 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0935 0.0948 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 5.07e-01 0.0779 0.117 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 8.69e-01 0.0248 0.15 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 1.97e-01 0.16 0.124 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 9.21e-02 0.204 0.121 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -8880 sc-eQTL 6.53e-01 0.0526 0.117 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 1.46e-01 0.115 0.0788 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 4.34e-01 -0.113 0.144 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 6.72e-02 -0.211 0.114 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 5.77e-01 0.0695 0.125 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 2.83e-01 -0.159 0.148 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 5.28e-01 0.092 0.145 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 8.12e-01 -0.034 0.143 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 4.23e-01 -0.102 0.127 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 6.85e-01 0.053 0.13 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0718 0.139 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000935 0.123 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 6.16e-01 0.0578 0.115 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 5.29e-01 0.0643 0.102 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 1.08e-01 0.131 0.081 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0249 0.0873 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 1.55e-01 0.136 0.0953 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0515 0.0886 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00504 0.102 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0501 0.143 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 2.03e-01 0.146 0.115 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0935 0.102 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 9.30e-01 0.00745 0.0845 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 7.08e-01 0.0425 0.113 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 7.80e-02 -0.189 0.106 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 7.16e-02 -0.215 0.119 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0615 0.145 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 6.45e-01 0.0638 0.138 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0876 0.115 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 9.44e-01 0.00825 0.117 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 1.44e-01 0.191 0.13 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 1.99e-01 -0.175 0.136 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 2.52e-01 0.154 0.134 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 2.80e-01 0.171 0.158 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 1.18e-01 0.19 0.121 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0489 0.118 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0801 0.131 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 3.96e-01 0.0966 0.114 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 8.80e-02 -0.234 0.136 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 9.51e-01 0.00789 0.129 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 1.46e-01 -0.209 0.143 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 3.75e-01 0.11 0.124 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 9.01e-01 0.0124 0.0998 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 6.21e-01 0.0473 0.0955 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 2.67e-01 -0.147 0.133 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 7.48e-02 -0.212 0.118 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0753 0.13 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0515 0.175 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 3.72e-01 -0.143 0.16 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 8.33e-01 -0.032 0.151 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0361 0.158 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 7.13e-01 0.0595 0.161 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 6.52e-01 0.066 0.146 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 3.82e-01 -0.129 0.148 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0183 0.154 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 5.78e-01 0.0825 0.148 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0506 0.151 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 5.55e-01 0.084 0.142 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 2.44e-01 0.156 0.134 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 3.17e-01 -0.148 0.147 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 2.53e-01 -0.153 0.133 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0123 0.156 0.095 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0549 0.139 0.095 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 7.82e-01 0.0367 0.133 0.095 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 5.48e-02 -0.24 0.124 0.095 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 8.05e-01 -0.034 0.138 0.095 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0141 0.14 0.095 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 1.59e-01 0.202 0.143 0.095 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 1.70e-01 -0.215 0.156 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 1.31e-01 0.2 0.132 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0519 0.139 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 7.21e-01 -0.049 0.137 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0939 0.133 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 4.26e-02 0.279 0.137 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 3.64e-01 0.123 0.136 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 8.25e-02 -0.258 0.148 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 2.43e-01 0.128 0.11 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 7.33e-01 0.0386 0.113 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0896 0.12 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0462 0.107 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 4.13e-02 -0.307 0.149 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 1.59e-01 -0.175 0.124 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 1.44e-01 -0.222 0.151 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 8.79e-01 0.0208 0.136 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 5.26e-01 0.0839 0.132 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 6.22e-02 -0.235 0.125 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 3.71e-01 -0.127 0.142 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 9.08e-01 0.0155 0.134 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 2.17e-01 -0.16 0.129 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0927 0.143 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 5.65e-01 0.0641 0.111 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 8.92e-01 0.0163 0.12 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0892 0.132 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0454 0.113 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 9.42e-02 -0.235 0.14 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 9.28e-01 0.0119 0.131 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0676 0.156 0.111 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 6.60e-01 0.0797 0.181 0.111 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 2.86e-01 0.168 0.157 0.111 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -8880 sc-eQTL 5.72e-01 0.0829 0.147 0.111 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0642 0.105 0.111 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 2.41e-01 0.189 0.16 0.111 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 4.24e-01 -0.115 0.143 0.111 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0304 0.153 0.111 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 8.83e-01 0.017 0.116 0.096 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 2.30e-01 0.177 0.147 0.096 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 2.12e-01 0.171 0.137 0.096 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 1.01e-01 0.161 0.0978 0.096 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 3.01e-02 0.312 0.143 0.096 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 4.52e-01 -0.103 0.137 0.096 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 4.26e-01 0.101 0.126 0.096 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 8.30e-01 0.032 0.149 0.096 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 4.45e-01 0.11 0.144 0.096 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0655 0.115 0.096 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 2.18e-01 -0.162 0.131 0.096 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 5.51e-02 -0.272 0.141 0.096 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 3.23e-01 -0.133 0.134 0.096 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0657 0.134 0.096 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00149 0.167 0.085 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0773 0.18 0.085 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 7.82e-01 0.043 0.155 0.085 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0344 0.109 0.085 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 3.46e-01 -0.148 0.157 0.085 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -694860 sc-eQTL 7.15e-01 0.051 0.139 0.085 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -791521 sc-eQTL 5.50e-01 0.082 0.137 0.085 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 6.51e-01 0.0667 0.147 0.085 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 1.14e-01 -0.194 0.122 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 2.67e-01 0.152 0.137 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 1.43e-01 -0.136 0.0925 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 1.64e-01 0.113 0.0812 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -194053 sc-eQTL 5.52e-01 0.0914 0.154 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0669 0.125 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -694860 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0587 0.155 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -791521 sc-eQTL 3.01e-01 -0.142 0.137 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 5.59e-01 0.075 0.128 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 3.34e-01 -0.127 0.131 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0712 0.155 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 2.88e-01 0.119 0.112 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 8.60e-01 0.0152 0.0861 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -194053 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0515 0.149 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 7.84e-02 0.236 0.133 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -694860 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0353 0.158 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -791521 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0222 0.128 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0681 0.128 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 4.68e-01 -0.145 0.199 0.085 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0242 0.171 0.085 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 7.62e-01 0.0534 0.176 0.085 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00908 0.192 0.085 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 7.93e-01 0.0461 0.175 0.085 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 3.20e-01 -0.176 0.176 0.085 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 7.65e-01 0.0512 0.171 0.085 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 1.72e-01 -0.204 0.149 0.089 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 4.83e-01 0.113 0.16 0.089 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0116 0.136 0.089 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 3.73e-01 0.0952 0.107 0.089 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -194053 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0511 0.146 0.089 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0805 0.154 0.089 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -694860 sc-eQTL 3.09e-01 0.156 0.153 0.089 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -791521 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00992 0.145 0.089 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 5.59e-02 -0.277 0.144 0.089 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 2.45e-01 0.167 0.143 0.088 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0626 0.153 0.088 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 4.14e-01 0.102 0.125 0.088 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0488 0.114 0.088 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -194053 sc-eQTL 6.57e-01 0.0567 0.128 0.088 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0564 0.146 0.088 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -694860 sc-eQTL 8.83e-01 0.0206 0.139 0.088 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -791521 sc-eQTL 2.29e-01 -0.167 0.139 0.088 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 3.88e-01 -0.124 0.144 0.088 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 7.56e-01 0.0504 0.162 0.079 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 1.66e-02 0.424 0.175 0.079 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 9.77e-02 -0.244 0.146 0.079 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 3.57e-01 -0.127 0.137 0.079 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0507 0.178 0.079 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -694860 sc-eQTL 3.58e-02 -0.348 0.164 0.079 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -791521 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0638 0.129 0.079 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 3.74e-01 0.135 0.152 0.079 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0174 0.156 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 3.80e-01 0.114 0.13 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 9.10e-01 0.0131 0.115 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -8880 sc-eQTL 2.16e-01 0.163 0.131 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 5.86e-01 0.0451 0.0825 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0371 0.137 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0973 0.109 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 3.44e-01 -0.113 0.119 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0732 0.136 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 5.05e-01 -0.072 0.108 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 4.08e-01 0.0845 0.102 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -8880 sc-eQTL 4.62e-01 0.0723 0.0981 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 6.26e-01 0.0338 0.0691 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 1.47e-01 0.183 0.126 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0967 0.0891 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 2.82e-01 0.114 0.106 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 3.19e-01 -0.115 0.116 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 5.29e-01 0.0827 0.131 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0406 0.0836 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 2.67e-01 0.0817 0.0733 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -194053 sc-eQTL 9.50e-01 0.00943 0.15 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 2.53e-01 0.121 0.105 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -694860 sc-eQTL 9.70e-01 0.00584 0.154 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -791521 sc-eQTL 2.13e-01 -0.157 0.126 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00621 0.118 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 9.95e-01 0.000831 0.131 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 2.43e-01 0.167 0.142 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 6.22e-01 0.0578 0.117 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 2.89e-01 0.0993 0.0934 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -194053 sc-eQTL 7.20e-01 0.0492 0.137 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 9.94e-01 0.000955 0.124 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -694860 sc-eQTL 3.62e-01 0.129 0.142 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -791521 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0765 0.135 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 6.04e-02 -0.252 0.134 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -582083 sc-eQTL 1.72e-02 -0.33 0.137 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -582277 sc-eQTL 5.43e-01 0.0579 0.095 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -351286 sc-eQTL 7.05e-01 0.0396 0.104 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 sc-eQTL 1.91e-01 -0.152 0.116 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -930191 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0599 0.0884 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 sc-eQTL 6.61e-03 -0.362 0.132 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -16988 sc-eQTL 1.59e-01 -0.163 0.115 0.095 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162510 MATN1 -8880 eQTL 0.000463 -0.116 0.0331 0.00897 0.00672 0.0932
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 eQTL 8.26e-12 0.115 0.0166 0.0 0.0 0.0932
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -3799 eQTL 2.05e-05 -0.0906 0.0212 0.00178 0.00295 0.0932
ENSG00000284543 LINC01226 -791576 eQTL 0.00552 -0.149 0.0536 0.002 0.0 0.0932

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162511 LAPTM5 -43069 0.000112 1.31e-05 1.56e-06 8.12e-06 2.4e-06 1.7e-05 1.78e-05 2.14e-06 1.09e-05 5.93e-06 1.49e-05 6.14e-06 2.06e-05 4.21e-06 4.1e-06 9.02e-06 7.02e-06 1.84e-05 2.7e-06 2.99e-06 6.46e-06 1.26e-05 1.3e-05 3.3e-06 2.07e-05 4.65e-06 7.57e-06 4.92e-06 1.2e-05 1.1e-05 5.96e-06 1.06e-06 1.17e-06 3.52e-06 5.77e-06 2.05e-06 1.72e-06 1.95e-06 2.11e-06 1.3e-06 1.04e-06 1.82e-05 4.31e-06 1.58e-07 1.04e-06 1.31e-06 1.82e-06 6.21e-07 6.21e-07