logo

Genes within 1Mb (chr1:30712601:CTT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 1.66e-01 -0.172 0.123 0.1 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 2.97e-01 -0.104 0.0991 0.1 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0374 0.0833 0.1 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -10984 sc-eQTL 8.29e-01 0.019 0.0876 0.1 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 3.63e-01 0.0624 0.0685 0.1 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00185 0.104 0.1 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 7.92e-01 0.0212 0.0804 0.1 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0119 0.0952 0.1 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 3.45e-01 -0.1 0.106 0.1 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0477 0.0828 0.1 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 2.41e-01 0.0865 0.0735 0.1 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 6.05e-02 0.153 0.081 0.1 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 8.94e-01 0.0114 0.0854 0.1 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 3.93e-02 -0.15 0.0724 0.1 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 4.42e-01 0.0673 0.0874 0.1 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0444 0.139 0.1 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 4.38e-02 -0.185 0.0914 0.1 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 6.00e-03 0.222 0.0798 0.1 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 2.09e-03 0.24 0.0772 0.1 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 6.07e-01 0.0501 0.0972 0.1 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0662 0.0924 0.1 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 4.77e-02 0.229 0.115 0.1 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0484 0.125 0.101 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0371 0.148 0.101 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 8.29e-03 -0.303 0.114 0.101 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 6.70e-01 0.0353 0.0827 0.101 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 8.75e-01 0.0211 0.134 0.101 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -696964 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0236 0.136 0.101 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -793625 sc-eQTL 9.12e-01 0.01 0.0903 0.101 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 4.71e-01 0.0944 0.131 0.101 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 8.93e-01 0.013 0.096 0.1 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0241 0.119 0.1 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0327 0.0762 0.1 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00545 0.0702 0.1 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -196157 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0627 0.135 0.1 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 8.20e-01 0.0216 0.0946 0.1 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -696964 sc-eQTL 5.15e-01 0.0942 0.145 0.1 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -793625 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0758 0.127 0.1 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 7.96e-02 0.195 0.111 0.1 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 2.04e-01 0.168 0.132 0.101 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0611 0.0903 0.101 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00721 0.0948 0.101 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 2.37e-05 0.452 0.105 0.101 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 3.59e-01 0.0731 0.0795 0.101 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0573 0.123 0.101 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 5.69e-02 0.215 0.112 0.101 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 4.54e-01 0.0748 0.0998 0.1 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 2.81e-01 -0.115 0.106 0.1 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 4.70e-01 0.0694 0.0959 0.1 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 1.33e-01 0.118 0.0783 0.1 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0247 0.105 0.1 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0759 0.129 0.1 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 1.43e-01 0.196 0.134 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 3.82e-01 -0.145 0.166 0.092 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 5.25e-01 -0.107 0.168 0.092 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 3.84e-01 -0.136 0.156 0.092 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -10984 sc-eQTL 1.85e-01 0.181 0.136 0.092 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 9.23e-01 0.00922 0.095 0.092 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0493 0.162 0.092 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0508 0.153 0.092 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 8.45e-01 0.0266 0.136 0.092 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 3.09e-01 -0.152 0.15 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0282 0.125 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 6.29e-01 -0.057 0.118 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -10984 sc-eQTL 1.35e-01 -0.183 0.122 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 1.19e-01 0.117 0.0749 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 1.69e-01 0.192 0.139 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 9.33e-01 0.00889 0.106 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 7.69e-01 0.0348 0.118 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 1.40e-01 -0.217 0.146 0.099 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00154 0.136 0.099 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 8.00e-01 0.0299 0.118 0.099 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -10984 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0571 0.113 0.099 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0767 0.0999 0.099 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 3.13e-01 0.135 0.133 0.099 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 6.56e-01 -0.051 0.114 0.099 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 2.78e-01 0.145 0.134 0.099 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 8.57e-01 0.0244 0.135 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 1.10e-01 -0.186 0.116 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 2.40e-01 0.121 0.103 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -10984 sc-eQTL 2.10e-01 0.131 0.104 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 2.10e-01 0.0876 0.0696 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 7.22e-01 0.0438 0.123 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 9.82e-01 0.00205 0.0918 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 8.88e-01 -0.016 0.113 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 1.54e-02 -0.343 0.14 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 6.60e-01 0.0518 0.118 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 1.61e-01 -0.161 0.115 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -10984 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0309 0.11 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 2.69e-01 0.0829 0.0748 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 3.31e-01 -0.133 0.136 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0929 0.109 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 4.89e-01 0.0816 0.118 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 2.78e-02 0.309 0.139 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 3.06e-01 -0.142 0.138 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 5.77e-01 -0.076 0.136 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 8.35e-03 0.318 0.119 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 6.93e-01 0.0491 0.124 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 8.16e-01 -0.031 0.133 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00285 0.117 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 1.45e-01 -0.16 0.109 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0275 0.0975 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 4.16e-01 0.0634 0.0777 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 1.44e-01 0.122 0.083 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0821 0.0913 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 8.44e-02 -0.146 0.0841 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0489 0.0972 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 3.76e-01 -0.123 0.139 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 2.61e-01 -0.126 0.112 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 4.98e-02 0.194 0.0984 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 2.45e-02 0.184 0.0814 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 8.36e-01 0.0228 0.11 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 9.42e-02 -0.175 0.104 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 5.06e-02 0.227 0.115 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 3.17e-01 -0.138 0.138 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 4.73e-01 0.0943 0.131 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 1.29e-01 0.166 0.109 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 1.02e-02 0.283 0.109 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 8.28e-01 0.0269 0.124 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 7.17e-01 0.047 0.129 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0992 0.127 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0918 0.15 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0174 0.115 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 5.78e-01 0.0621 0.111 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 9.74e-03 0.317 0.122 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 8.20e-02 0.187 0.107 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 1.65e-01 -0.18 0.129 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 1.14e-01 0.193 0.121 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 1.80e-01 -0.184 0.137 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 8.19e-02 -0.206 0.118 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 3.70e-02 0.198 0.0945 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 1.11e-02 0.231 0.0901 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 3.01e-01 -0.131 0.127 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 3.21e-01 -0.113 0.114 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 9.69e-01 0.00481 0.124 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 5.25e-01 0.097 0.152 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 4.25e-01 -0.112 0.14 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 2.39e-01 0.155 0.131 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 1.16e-01 0.216 0.137 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0233 0.141 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 1.38e-01 -0.189 0.127 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0336 0.129 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 4.78e-01 0.102 0.143 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0667 0.137 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 4.55e-01 0.105 0.14 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 3.70e-02 0.274 0.131 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0162 0.124 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 8.87e-02 0.233 0.136 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0279 0.124 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0462 0.147 0.102 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0846 0.13 0.102 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 3.66e-01 0.113 0.125 0.102 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 1.30e-02 0.291 0.116 0.102 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0634 0.13 0.102 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 5.63e-01 -0.076 0.131 0.102 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 7.29e-01 0.047 0.135 0.102 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00446 0.149 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0504 0.126 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 8.50e-01 0.025 0.133 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 2.18e-01 0.161 0.13 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 7.31e-01 0.0438 0.127 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 4.57e-01 0.0978 0.131 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 1.20e-01 -0.201 0.129 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 4.82e-01 0.0984 0.14 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 6.37e-01 0.0488 0.103 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 8.85e-01 0.0153 0.106 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 4.60e-05 0.452 0.109 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 1.53e-01 0.144 0.1 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 3.63e-01 -0.129 0.141 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 1.86e-02 0.274 0.115 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 1.93e-01 0.194 0.148 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 4.89e-02 -0.261 0.132 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 2.51e-02 -0.289 0.128 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 2.90e-05 0.506 0.118 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0789 0.139 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 4.45e-01 -0.101 0.131 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 1.88e-03 0.391 0.124 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 2.60e-01 0.154 0.136 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 7.02e-01 0.0408 0.107 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 9.62e-01 0.00555 0.115 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 7.43e-04 0.423 0.124 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 6.95e-01 0.0425 0.108 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 4.63e-01 0.0989 0.135 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00344 0.125 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 2.83e-01 -0.191 0.177 0.089 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 9.04e-01 0.0248 0.206 0.089 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 3.96e-01 0.152 0.178 0.089 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -10984 sc-eQTL 2.88e-01 -0.177 0.166 0.089 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 7.30e-01 0.0413 0.119 0.089 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 8.10e-01 0.0441 0.183 0.089 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00365 0.163 0.089 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 4.38e-01 0.135 0.173 0.089 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 3.40e-01 0.105 0.11 0.1 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 1.44e-01 -0.204 0.139 0.1 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 9.06e-02 0.22 0.129 0.1 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 7.96e-01 0.0242 0.0933 0.1 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 2.29e-03 -0.414 0.134 0.1 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 3.23e-01 0.129 0.13 0.1 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 1.88e-01 0.158 0.119 0.1 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 2.27e-01 0.173 0.143 0.1 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 1.04e-01 0.225 0.138 0.1 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0151 0.111 0.1 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 6.19e-03 0.346 0.125 0.1 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 2.39e-01 -0.162 0.137 0.1 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 3.12e-01 -0.131 0.129 0.1 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 5.39e-01 0.0795 0.129 0.1 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 5.82e-01 0.08 0.145 0.105 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0753 0.157 0.105 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 3.07e-01 -0.138 0.135 0.105 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 4.69e-01 0.0687 0.0946 0.105 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 4.79e-01 0.0972 0.137 0.105 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -696964 sc-eQTL 9.97e-01 0.000517 0.122 0.105 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -793625 sc-eQTL 7.20e-02 -0.214 0.118 0.105 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 4.03e-01 0.108 0.128 0.105 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0707 0.116 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0245 0.13 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0452 0.0879 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0108 0.0772 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -196157 sc-eQTL 4.30e-01 0.115 0.145 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 3.66e-01 0.107 0.119 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -696964 sc-eQTL 2.69e-01 0.162 0.147 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -793625 sc-eQTL 4.03e-01 -0.109 0.13 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 8.55e-02 0.208 0.12 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 3.59e-01 0.111 0.121 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 2.84e-01 -0.153 0.143 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0225 0.103 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 3.52e-01 -0.074 0.0794 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -196157 sc-eQTL 2.92e-01 -0.145 0.137 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0853 0.124 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -696964 sc-eQTL 7.63e-01 0.0439 0.145 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -793625 sc-eQTL 1.79e-01 -0.159 0.118 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 5.91e-01 0.0638 0.119 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 7.03e-01 0.0681 0.178 0.109 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00157 0.153 0.109 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 3.12e-01 -0.159 0.157 0.109 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 1.45e-01 0.249 0.17 0.109 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 6.89e-01 0.0629 0.157 0.109 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0887 0.158 0.109 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0782 0.153 0.109 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 3.04e-01 0.138 0.134 0.102 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 1.06e-01 0.233 0.143 0.102 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 7.47e-02 -0.218 0.122 0.102 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 1.83e-01 0.128 0.0957 0.102 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -196157 sc-eQTL 2.17e-01 -0.163 0.131 0.102 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 3.30e-02 0.294 0.137 0.102 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -696964 sc-eQTL 3.99e-02 0.282 0.136 0.102 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -793625 sc-eQTL 7.25e-02 0.234 0.13 0.102 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 3.61e-01 0.119 0.13 0.102 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0506 0.127 0.1 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 2.45e-01 0.157 0.135 0.1 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0975 0.11 0.1 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0493 0.1 0.1 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -196157 sc-eQTL 6.78e-01 0.0468 0.113 0.1 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0776 0.129 0.1 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -696964 sc-eQTL 2.59e-01 0.139 0.122 0.1 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -793625 sc-eQTL 7.50e-01 0.0391 0.123 0.1 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 1.51e-01 0.183 0.127 0.1 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 2.01e-01 -0.181 0.141 0.107 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 7.83e-01 0.0429 0.156 0.107 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 2.41e-01 -0.151 0.128 0.107 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0728 0.12 0.107 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 7.16e-01 0.0566 0.156 0.107 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -696964 sc-eQTL 2.25e-01 0.176 0.145 0.107 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -793625 sc-eQTL 3.34e-01 0.109 0.113 0.107 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0887 0.133 0.107 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 4.60e-02 -0.282 0.141 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0177 0.118 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0374 0.105 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -10984 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0999 0.119 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0126 0.075 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 1.03e-01 0.202 0.123 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0697 0.099 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 5.00e-01 0.0729 0.108 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 2.89e-01 -0.139 0.131 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 2.77e-01 -0.113 0.104 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00341 0.0982 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -10984 sc-eQTL 3.80e-01 0.083 0.0944 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 1.62e-01 0.0931 0.0663 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 9.57e-01 0.00663 0.122 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 9.21e-01 0.00852 0.086 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0284 0.102 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 7.62e-01 0.0333 0.11 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0932 0.125 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0207 0.0796 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0232 0.07 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -196157 sc-eQTL 8.60e-01 0.0252 0.143 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 8.23e-01 0.0225 0.1 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -696964 sc-eQTL 4.95e-01 0.1 0.147 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -793625 sc-eQTL 1.68e-01 -0.166 0.12 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 1.96e-01 0.146 0.112 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 7.26e-01 0.0425 0.121 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 1.30e-01 0.2 0.132 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 6.09e-02 -0.203 0.108 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 8.51e-01 0.0163 0.0868 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -196157 sc-eQTL 1.78e-01 -0.171 0.126 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 8.76e-01 0.018 0.115 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -696964 sc-eQTL 9.60e-02 0.218 0.131 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -793625 sc-eQTL 2.47e-01 0.144 0.124 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 1.04e-01 0.203 0.124 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -584187 sc-eQTL 1.27e-01 0.203 0.132 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0268 0.0909 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -353390 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00161 0.0996 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 sc-eQTL 1.60e-05 0.47 0.106 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -932295 sc-eQTL 3.37e-01 0.0812 0.0844 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -5903 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0875 0.128 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -19092 sc-eQTL 9.35e-04 0.362 0.108 0.101 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 eQTL 4.89e-02 -0.0639 0.0324 0.0 0.0 0.0731
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 eQTL 1.39e-06 0.0877 0.0181 0.0 0.0 0.0731
ENSG00000162512 SDC3 -196157 eQTL 0.022 -0.103 0.0449 0.0 0.0 0.0731

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000121766 ZCCHC17 -584381 4.65e-06 1.36e-06 2.62e-07 6.75e-07 9.26e-08 7.96e-07 1.31e-06 1.59e-07 1.49e-06 2.72e-07 1.89e-06 5.64e-07 2.84e-06 2.81e-07 5.35e-07 6.7e-07 8.37e-07 6.8e-07 8.41e-07 3.42e-07 7.95e-07 1.74e-06 1.18e-06 2.39e-07 2.29e-06 3.06e-07 4.7e-07 4.75e-07 1.63e-06 1.66e-06 7.32e-07 2.9e-08 4.37e-08 7.27e-07 5.3e-07 3.95e-07 1.97e-07 8.04e-08 1.71e-07 6.43e-08 4.67e-08 1.6e-06 5.94e-08 1.86e-08 4.36e-08 9.77e-08 9.52e-08 1.9e-09 5.04e-08
ENSG00000162511 LAPTM5 -45173 0.000136 3.42e-05 6.45e-06 9.47e-06 2.38e-06 1.34e-05 3.18e-05 2.12e-06 1.6e-05 6.02e-06 2.42e-05 8.78e-06 3.56e-05 6.73e-06 5.81e-06 9.02e-06 1.73e-05 1.59e-05 4.95e-06 3.2e-06 7.34e-06 1.73e-05 2.83e-05 5.44e-06 2.77e-05 5.39e-06 7.21e-06 4.97e-06 3.47e-05 1.7e-05 1.16e-05 9.71e-07 1.15e-06 3.37e-06 9.03e-06 4.5e-06 1.71e-06 2.72e-06 2.59e-06 7.19e-07 9.41e-07 4.48e-05 3.39e-06 2.62e-07 1.36e-06 2.97e-06 2.42e-06 8.11e-07 6.37e-07
ENSG00000162512 SDC3 -196157 1.46e-05 4.89e-06 5.93e-07 2.95e-06 4.72e-07 2.51e-06 7.3e-06 4.25e-07 3.07e-06 1.09e-06 6.04e-06 2.48e-06 7.66e-06 1.54e-06 1.3e-06 1.77e-06 1.92e-06 3.55e-06 1.45e-06 1.27e-06 2.69e-06 3.9e-06 4.56e-06 9.91e-07 4.89e-06 1.63e-06 1.21e-06 1.79e-06 4.42e-06 4.67e-06 2.13e-06 2.56e-07 2.89e-07 2.15e-06 2e-06 1.18e-06 9.23e-07 4.93e-07 1.3e-06 3.15e-07 3.59e-07 5.65e-06 5.96e-07 2.15e-07 3.07e-07 1.25e-06 4.02e-07 5.98e-08 4.96e-08