logo

Genes within 1Mb (chr1:30710639:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 5.55e-01 0.0527 0.0892 0.288 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0107 0.0715 0.288 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 1.84e-01 0.0797 0.0598 0.288 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -12946 sc-eQTL 2.19e-02 -0.144 0.0623 0.288 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 6.76e-01 0.0207 0.0494 0.288 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 4.57e-01 0.0555 0.0745 0.288 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 5.44e-01 0.0352 0.0578 0.288 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 1.29e-02 0.169 0.0675 0.288 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 3.32e-01 -0.076 0.0782 0.288 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 5.54e-02 0.117 0.0607 0.288 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00379 0.0545 0.288 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0127 0.0604 0.288 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 2.80e-01 0.0682 0.063 0.288 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 4.77e-01 0.0385 0.054 0.288 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 9.34e-01 0.00539 0.0647 0.288 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 3.96e-01 0.0869 0.102 0.288 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 5.68e-01 -0.039 0.0681 0.288 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 7.23e-01 0.0213 0.06 0.288 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0687 0.0581 0.288 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 5.93e-01 0.0384 0.0717 0.288 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0302 0.0683 0.288 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000134 0.0858 0.288 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 6.72e-01 0.0396 0.0933 0.284 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 1.91e-01 0.144 0.11 0.284 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0631 0.0864 0.284 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0168 0.0618 0.284 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0623 0.1 0.284 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -698926 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000736 0.102 0.284 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -795587 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0686 0.0673 0.284 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0561 0.0977 0.284 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 2.33e-01 0.085 0.0711 0.288 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 8.70e-01 0.0145 0.0884 0.288 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 3.43e-01 0.0538 0.0566 0.288 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 4.75e-01 0.0373 0.0521 0.288 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -198119 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0396 0.1 0.288 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 6.79e-01 0.0292 0.0703 0.288 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -698926 sc-eQTL 6.65e-01 0.0467 0.107 0.288 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -795587 sc-eQTL 4.91e-02 -0.186 0.0938 0.288 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0826 0.0826 0.288 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 8.55e-01 0.0179 0.0978 0.288 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 9.34e-01 0.00556 0.0669 0.288 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 2.98e-01 0.0731 0.07 0.288 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0288 0.0808 0.288 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0101 0.059 0.288 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 2.26e-01 -0.11 0.0905 0.288 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 6.31e-01 0.0403 0.0838 0.288 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 5.92e-01 0.04 0.0746 0.288 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 7.91e-01 0.0212 0.0798 0.288 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 1.29e-01 -0.109 0.0714 0.288 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0398 0.0588 0.288 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0561 0.0785 0.288 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 6.32e-01 0.0461 0.0963 0.288 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 4.97e-01 0.0683 0.1 0.288 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0433 0.119 0.288 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0278 0.12 0.288 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 4.91e-01 0.0767 0.111 0.288 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -12946 sc-eQTL 6.87e-01 0.0392 0.0971 0.288 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 4.40e-01 0.0524 0.0676 0.288 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 4.86e-02 0.226 0.114 0.288 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 4.00e-01 0.0922 0.109 0.288 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 2.13e-01 0.12 0.0964 0.288 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 6.09e-01 0.0579 0.113 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 5.30e-01 0.0592 0.0943 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 1.96e-01 0.115 0.0886 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -12946 sc-eQTL 8.06e-01 0.0228 0.0926 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 2.29e-01 0.0684 0.0567 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0445 0.106 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 6.56e-01 0.0356 0.0798 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 7.25e-01 0.0315 0.0893 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 2.46e-01 0.129 0.111 0.291 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 9.24e-01 0.00982 0.103 0.291 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0557 0.0893 0.291 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -12946 sc-eQTL 4.57e-02 -0.17 0.0847 0.291 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 2.14e-01 0.0942 0.0755 0.291 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0567 0.101 0.291 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 8.42e-01 0.0174 0.0867 0.291 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0516 0.101 0.291 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 6.06e-01 0.0512 0.0991 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0254 0.0856 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 2.13e-01 0.094 0.0753 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -12946 sc-eQTL 1.96e-03 -0.235 0.0749 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 7.88e-01 0.0138 0.0512 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 1.24e-01 0.139 0.0898 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0044 0.0673 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 1.03e-03 0.27 0.081 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 6.41e-01 0.0493 0.106 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0945 0.087 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0486 0.0853 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -12946 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0964 0.0817 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 2.65e-01 0.0621 0.0555 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 4.98e-01 0.0686 0.101 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 9.16e-01 0.00853 0.0811 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0138 0.0876 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 1.92e-01 -0.135 0.103 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0308 0.101 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 2.57e-01 0.113 0.0992 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 1.66e-01 -0.123 0.0883 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0157 0.0909 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 7.24e-01 0.0343 0.097 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 1.55e-01 -0.122 0.0852 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 9.05e-01 0.00987 0.0826 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 2.95e-01 0.0767 0.0731 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 6.08e-01 0.03 0.0585 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 7.67e-01 0.0186 0.0627 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 1.10e-01 0.11 0.0683 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 3.31e-01 0.0618 0.0635 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 4.62e-01 0.0537 0.073 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0152 0.102 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 5.64e-01 0.0475 0.0822 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 4.51e-01 -0.055 0.0727 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00134 0.0604 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 3.58e-01 0.0744 0.0808 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 8.72e-01 0.0124 0.0767 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 1.64e-02 -0.204 0.0843 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0468 0.102 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 8.84e-01 0.0141 0.0968 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 9.78e-01 0.00224 0.0807 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 3.57e-01 0.0751 0.0814 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 6.77e-01 0.0382 0.0914 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0471 0.0954 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0264 0.094 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 7.46e-01 0.036 0.111 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0213 0.0851 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0437 0.0826 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 2.32e-01 -0.109 0.0912 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 5.79e-01 0.0443 0.0797 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 8.19e-01 -0.022 0.0962 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0474 0.0904 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 9.13e-01 0.0113 0.103 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 5.42e-01 -0.054 0.0884 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 6.80e-01 0.0294 0.0712 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 7.94e-01 0.0178 0.0682 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0206 0.0949 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 7.24e-01 0.0301 0.0852 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00476 0.0928 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0929 0.119 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000689 0.109 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0664 0.102 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0417 0.107 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 7.67e-01 0.0326 0.11 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0128 0.0994 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 2.61e-01 -0.113 0.1 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 2.62e-01 0.12 0.107 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 3.12e-01 0.104 0.102 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0916 0.105 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 9.02e-01 0.0121 0.0988 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 4.09e-01 0.0769 0.0928 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0479 0.102 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0977 0.0925 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 2.99e-01 0.113 0.109 0.288 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 8.45e-01 -0.019 0.0966 0.288 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0349 0.0926 0.288 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 5.22e-01 -0.056 0.0873 0.288 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0429 0.096 0.288 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0116 0.0973 0.288 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 7.50e-01 0.0319 0.1 0.288 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0449 0.11 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 5.96e-01 0.0494 0.0932 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 5.71e-01 0.0555 0.0978 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 1.40e-01 0.142 0.0961 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0712 0.0937 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 1.01e-02 0.248 0.0955 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 4.28e-02 0.193 0.0947 0.291 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0103 0.104 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 9.60e-01 0.00384 0.0767 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 4.84e-01 0.0551 0.0786 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0766 0.0837 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 9.48e-01 0.00486 0.0746 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 2.12e-01 -0.131 0.105 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0648 0.0866 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0611 0.109 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 1.38e-01 0.145 0.0972 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0569 0.0952 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0816 0.0907 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0895 0.102 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0593 0.0966 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0162 0.0935 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 5.76e-01 0.0562 0.1 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 9.54e-01 0.00448 0.0783 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 2.46e-01 0.0983 0.0844 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 8.30e-01 -0.02 0.0933 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0458 0.0794 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0882 0.0987 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 4.05e-01 0.0765 0.0918 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 1.09e-01 0.185 0.114 0.281 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00517 0.134 0.281 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 7.52e-01 0.0369 0.117 0.281 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -12946 sc-eQTL 8.96e-01 0.0143 0.109 0.281 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0729 0.0774 0.281 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 1.00e+00 3.47e-05 0.12 0.281 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0373 0.106 0.281 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 7.08e-01 0.0425 0.113 0.281 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0481 0.0815 0.287 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 5.25e-01 0.0659 0.103 0.287 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 6.38e-01 0.0454 0.0965 0.287 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 6.28e-01 0.0336 0.0692 0.287 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 1.30e-01 0.154 0.101 0.287 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 1.70e-01 -0.133 0.0964 0.287 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 8.25e-01 0.0197 0.089 0.287 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 4.63e-01 0.0776 0.106 0.288 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 2.92e-01 0.108 0.102 0.288 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0892 0.0817 0.288 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0751 0.0936 0.288 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 1.56e-01 -0.144 0.101 0.288 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00524 0.0955 0.288 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 5.81e-01 0.0527 0.0954 0.288 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 4.92e-01 0.0757 0.11 0.283 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0794 0.119 0.283 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 1.57e-01 -0.145 0.102 0.283 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 1.09e-01 0.115 0.0712 0.283 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0684 0.104 0.283 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -698926 sc-eQTL 9.22e-01 0.00902 0.0921 0.283 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -795587 sc-eQTL 1.34e-02 0.222 0.089 0.283 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 7.24e-01 0.0345 0.0974 0.283 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 4.40e-01 0.066 0.0854 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 5.65e-01 0.0549 0.0953 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0278 0.0645 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 2.36e-01 0.0672 0.0565 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -198119 sc-eQTL 6.00e-01 0.056 0.107 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0724 0.0871 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -698926 sc-eQTL 9.17e-01 0.0113 0.108 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -795587 sc-eQTL 1.12e-01 -0.151 0.0949 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0306 0.0891 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0197 0.0898 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0608 0.106 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 5.59e-02 0.146 0.076 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 6.25e-01 0.0288 0.0589 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -198119 sc-eQTL 3.35e-01 0.0981 0.102 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 7.07e-01 0.0345 0.0919 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -698926 sc-eQTL 6.94e-01 0.0424 0.108 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -795587 sc-eQTL 2.42e-01 -0.102 0.0872 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0156 0.0879 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0694 0.137 0.279 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0366 0.118 0.279 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 7.15e-01 0.0445 0.122 0.279 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0594 0.132 0.279 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0787 0.121 0.279 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 6.80e-01 0.0504 0.122 0.279 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00373 0.118 0.279 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 6.79e-01 0.042 0.101 0.282 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 8.54e-01 -0.02 0.109 0.282 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 3.47e-01 0.0868 0.0922 0.282 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 3.28e-01 0.0709 0.0723 0.282 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -198119 sc-eQTL 7.10e-01 -0.037 0.0992 0.282 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 4.29e-01 0.0825 0.104 0.282 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -698926 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0103 0.104 0.282 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -795587 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0852 0.0983 0.282 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0639 0.0984 0.282 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 7.70e-01 0.0275 0.0938 0.285 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 2.87e-01 0.106 0.0997 0.285 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 1.62e-02 0.195 0.0805 0.285 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0844 0.074 0.285 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -198119 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0226 0.0832 0.285 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 3.58e-02 0.199 0.0944 0.285 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -698926 sc-eQTL 7.39e-01 0.0303 0.0908 0.285 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -795587 sc-eQTL 4.95e-01 -0.062 0.0906 0.285 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 5.05e-02 -0.183 0.0932 0.285 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 7.87e-01 -0.029 0.107 0.28 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 2.34e-01 0.14 0.117 0.28 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 9.29e-01 0.0087 0.0974 0.28 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0511 0.0904 0.28 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 7.36e-01 0.0396 0.117 0.28 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -698926 sc-eQTL 2.15e-01 -0.136 0.109 0.28 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -795587 sc-eQTL 8.41e-02 -0.147 0.0844 0.28 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 7.54e-01 0.0315 0.1 0.28 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 4.74e-01 0.0773 0.108 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 3.64e-01 0.0815 0.0895 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 6.87e-01 0.0321 0.0795 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -12946 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0231 0.0906 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 1.99e-01 0.0731 0.0567 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0549 0.0943 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 4.28e-01 0.0598 0.0752 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 8.46e-01 -0.016 0.0821 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 7.62e-01 0.0291 0.096 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0529 0.0758 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 9.57e-01 0.00386 0.0718 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -12946 sc-eQTL 2.94e-03 -0.204 0.0677 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 9.30e-01 0.00429 0.0487 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 1.42e-01 0.131 0.0884 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00144 0.0629 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 1.41e-02 0.182 0.0736 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 4.41e-01 0.0623 0.0807 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 8.90e-01 0.0127 0.0916 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 3.23e-01 0.0577 0.0583 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 2.78e-01 0.0557 0.0512 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -198119 sc-eQTL 4.63e-01 0.0769 0.105 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0252 0.0736 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -698926 sc-eQTL 6.18e-01 0.0538 0.108 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -795587 sc-eQTL 5.92e-02 -0.166 0.0876 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0214 0.0827 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 7.70e-01 0.0265 0.0904 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 5.47e-01 0.0596 0.0989 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 1.30e-01 0.123 0.0806 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 7.95e-01 0.0169 0.0648 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -198119 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0642 0.0946 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 1.24e-01 0.132 0.0856 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -698926 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0175 0.0982 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -795587 sc-eQTL 2.57e-01 -0.106 0.0929 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 5.41e-02 -0.179 0.0925 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -586149 sc-eQTL 8.04e-01 0.0244 0.0982 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -586343 sc-eQTL 9.66e-01 0.00286 0.0671 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -355352 sc-eQTL 3.76e-01 0.0651 0.0734 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -47135 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0585 0.0821 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -934257 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00376 0.0624 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 sc-eQTL 6.68e-02 -0.173 0.094 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -21054 sc-eQTL 6.77e-01 -0.034 0.0818 0.287 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162510 MATN1 -12946 eQTL 0.0177 -0.0482 0.0203 0.0 0.0 0.32
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -7865 eQTL 2.75e-02 0.0287 0.013 0.0 0.0 0.32
ENSG00000284543 LINC01226 -795642 eQTL 0.0328 -0.07 0.0327 0.0 0.0 0.32

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina