logo

Genes within 1Mb (chr1:30708302:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 6.25e-01 0.0487 0.0996 0.19 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 9.53e-01 0.00473 0.0798 0.19 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 8.33e-01 0.0141 0.067 0.19 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -15283 sc-eQTL 2.40e-04 -0.255 0.0682 0.19 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 6.59e-01 0.0243 0.0551 0.19 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 4.10e-01 0.0687 0.0831 0.19 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 1.86e-01 0.0853 0.0644 0.19 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 2.54e-02 0.17 0.0756 0.19 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0432 0.087 0.19 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 5.55e-01 0.0402 0.068 0.19 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0374 0.0605 0.19 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 8.55e-01 0.0123 0.0671 0.19 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 6.15e-01 0.0354 0.0701 0.19 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 7.27e-02 0.107 0.0596 0.19 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 9.97e-01 -0.0003 0.0719 0.19 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 4.95e-01 0.0788 0.115 0.19 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 6.64e-02 -0.141 0.0763 0.19 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00448 0.0677 0.19 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 1.52e-01 -0.0941 0.0654 0.19 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 8.13e-01 0.0192 0.081 0.19 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 2.35e-01 0.0915 0.0768 0.19 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 9.65e-01 0.00423 0.0968 0.19 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0186 0.103 0.194 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0325 0.122 0.194 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0338 0.0952 0.194 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 1.48e-01 0.0982 0.0677 0.194 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 9.92e-01 0.00106 0.11 0.194 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -701263 sc-eQTL 6.68e-01 0.0482 0.112 0.194 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -797924 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0593 0.0742 0.194 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00833 0.108 0.194 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 2.17e-01 0.0966 0.0781 0.19 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0663 0.097 0.19 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 2.28e-01 0.075 0.062 0.19 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 9.76e-01 0.00173 0.0573 0.19 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -200456 sc-eQTL 9.79e-01 0.00296 0.11 0.19 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0465 0.0771 0.19 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -701263 sc-eQTL 7.92e-01 0.0312 0.118 0.19 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -797924 sc-eQTL 2.24e-01 -0.127 0.104 0.19 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0653 0.0908 0.19 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 2.09e-02 0.25 0.107 0.189 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0582 0.0743 0.189 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 5.05e-01 0.0521 0.078 0.189 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 4.26e-01 0.0715 0.0897 0.189 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 3.60e-01 0.06 0.0654 0.189 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 6.18e-01 0.0504 0.101 0.189 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 2.99e-01 0.0967 0.0929 0.189 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 2.50e-01 0.0955 0.0828 0.19 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0395 0.0888 0.19 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 5.53e-02 -0.153 0.0792 0.19 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 6.67e-01 0.0282 0.0654 0.19 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0393 0.0874 0.19 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 2.81e-01 0.115 0.107 0.19 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00518 0.112 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 5.30e-01 0.082 0.13 0.196 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 4.73e-01 0.0945 0.131 0.196 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 8.86e-01 0.0176 0.122 0.196 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -15283 sc-eQTL 9.29e-01 0.00954 0.107 0.196 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 5.34e-01 0.0465 0.0745 0.196 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 7.87e-02 0.222 0.126 0.196 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 5.38e-01 0.0741 0.12 0.196 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 8.90e-01 0.0148 0.107 0.196 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0549 0.124 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 8.60e-01 0.0182 0.103 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 2.38e-01 0.115 0.0972 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -15283 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0489 0.101 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 4.05e-01 0.0519 0.0622 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0525 0.116 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 2.84e-01 0.0936 0.0872 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 7.91e-02 0.171 0.0971 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 2.58e-01 0.137 0.121 0.192 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0171 0.112 0.192 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0144 0.0971 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -15283 sc-eQTL 3.18e-02 -0.199 0.0919 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 7.06e-01 0.0311 0.0823 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 7.02e-01 0.0421 0.11 0.192 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 4.10e-01 0.0777 0.0941 0.192 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0489 0.11 0.192 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 3.63e-01 0.0996 0.109 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 2.91e-01 0.0998 0.0943 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 3.94e-01 0.0711 0.0832 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -15283 sc-eQTL 4.86e-05 -0.337 0.0813 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 7.76e-01 0.0161 0.0565 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 7.73e-01 0.0288 0.0996 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 5.08e-01 0.0492 0.0741 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 3.80e-03 0.263 0.0899 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 7.47e-01 0.0381 0.118 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 2.46e-02 -0.218 0.0961 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 2.89e-02 -0.207 0.0941 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -15283 sc-eQTL 1.36e-01 -0.136 0.0909 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 7.95e-01 0.0162 0.062 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 1.36e-01 0.168 0.112 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 8.26e-02 0.156 0.0897 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0388 0.0976 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0603 0.116 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0992 0.113 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 1.40e-01 0.164 0.111 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 4.16e-01 -0.081 0.0992 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0514 0.102 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 4.12e-01 0.0892 0.109 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 1.04e-01 -0.156 0.0953 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0237 0.0911 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 5.58e-01 0.0474 0.0807 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0474 0.0644 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 4.95e-01 0.0472 0.0691 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 4.42e-01 0.0583 0.0757 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 1.59e-01 0.0988 0.0698 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 4.10e-01 0.0664 0.0805 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 9.23e-01 0.0111 0.114 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0474 0.0918 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0162 0.0813 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00492 0.0674 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 4.07e-01 0.075 0.0902 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 1.47e-01 0.124 0.0851 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 2.32e-01 -0.114 0.095 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00228 0.113 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00655 0.108 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 5.15e-01 0.0583 0.0895 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 2.06e-01 0.115 0.0902 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0602 0.101 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 6.46e-01 0.0488 0.106 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 2.46e-01 -0.121 0.104 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0697 0.124 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 1.15e-01 -0.15 0.095 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0151 0.0928 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0684 0.103 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00766 0.0895 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 3.11e-01 0.109 0.108 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0675 0.101 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 2.01e-01 0.145 0.113 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 1.67e-01 -0.135 0.0976 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 7.34e-01 0.0268 0.0789 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 9.18e-01 0.00781 0.0756 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 4.99e-01 0.0711 0.105 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 6.79e-02 0.172 0.0936 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 6.36e-01 0.0487 0.103 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 4.06e-01 -0.109 0.131 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 4.97e-01 0.0815 0.12 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0957 0.113 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0287 0.118 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 9.09e-01 0.0138 0.121 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0621 0.109 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0659 0.11 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 1.93e-01 0.155 0.119 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 4.87e-01 0.0794 0.114 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0849 0.117 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00522 0.11 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 9.80e-01 0.0026 0.103 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 7.19e-01 0.0411 0.114 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 7.13e-01 -0.038 0.103 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 1.76e-01 0.164 0.121 0.19 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 8.84e-01 0.0157 0.107 0.19 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 5.87e-01 -0.056 0.103 0.19 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 3.24e-01 0.0957 0.0968 0.19 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0236 0.107 0.19 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00261 0.108 0.19 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0825 0.111 0.19 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 6.31e-01 0.0587 0.122 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0575 0.103 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 2.77e-01 0.118 0.108 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 3.80e-02 0.221 0.106 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0303 0.104 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 1.70e-01 0.147 0.107 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 1.74e-01 0.144 0.105 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 1.89e-01 0.152 0.116 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0878 0.0856 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 8.03e-01 0.022 0.0881 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0205 0.0939 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 6.14e-01 0.0422 0.0835 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 7.23e-01 0.0418 0.118 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 9.22e-01 0.00951 0.0971 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 5.63e-01 0.0705 0.122 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 9.61e-02 0.18 0.108 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 2.55e-01 -0.121 0.106 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 6.39e-01 0.0475 0.101 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 9.86e-01 -0.002 0.114 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0734 0.107 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 6.16e-01 0.0522 0.104 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 2.25e-01 0.136 0.111 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 5.07e-01 -0.058 0.0872 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 2.77e-01 0.103 0.0941 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 5.68e-01 0.0593 0.104 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00929 0.0885 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 7.20e-01 0.0395 0.11 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 3.43e-01 0.0972 0.102 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 1.79e-02 0.332 0.138 0.17 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0733 0.164 0.17 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0828 0.142 0.17 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -15283 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0469 0.133 0.17 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0562 0.0949 0.17 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 2.88e-01 -0.156 0.146 0.17 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 7.67e-01 0.0386 0.13 0.17 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 5.23e-01 0.0887 0.138 0.17 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0616 0.0898 0.189 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0372 0.114 0.189 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0417 0.106 0.189 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0529 0.0763 0.189 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 9.94e-01 0.000892 0.112 0.189 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0882 0.107 0.189 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0339 0.0981 0.189 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 5.62e-01 0.068 0.117 0.19 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 5.52e-01 0.0674 0.113 0.19 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0719 0.0904 0.19 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 9.37e-01 0.00821 0.104 0.19 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 9.93e-01 0.00104 0.112 0.19 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 3.96e-01 0.0897 0.105 0.19 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 3.71e-01 0.0944 0.105 0.19 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 3.88e-01 0.105 0.121 0.195 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0233 0.131 0.195 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 1.30e-01 -0.17 0.112 0.195 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 5.09e-02 0.153 0.078 0.195 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 8.50e-01 0.0216 0.114 0.195 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -701263 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0302 0.101 0.195 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -797924 sc-eQTL 1.91e-02 0.232 0.098 0.195 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 8.76e-01 0.0168 0.107 0.195 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 7.76e-02 0.166 0.0936 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0287 0.105 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 5.59e-01 0.0416 0.0711 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 7.91e-01 0.0166 0.0624 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -200456 sc-eQTL 9.97e-01 0.000494 0.118 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 7.23e-01 -0.034 0.0961 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -701263 sc-eQTL 7.41e-01 0.0394 0.119 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -797924 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0853 0.105 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0836 0.098 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 6.80e-01 0.0408 0.0988 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0495 0.117 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 2.43e-01 0.0984 0.0841 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 7.27e-01 0.0227 0.0648 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -200456 sc-eQTL 1.45e-01 0.163 0.111 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0891 0.101 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -701263 sc-eQTL 6.09e-01 0.0608 0.119 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -797924 sc-eQTL 2.95e-01 -0.101 0.0961 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 9.92e-01 0.000916 0.0968 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000758 0.149 0.194 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0296 0.128 0.194 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 8.65e-01 0.0225 0.132 0.194 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0652 0.144 0.194 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 3.66e-01 -0.119 0.131 0.194 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 2.32e-01 0.158 0.132 0.194 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0332 0.128 0.194 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 9.36e-02 0.188 0.112 0.191 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0798 0.121 0.191 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 2.69e-01 0.113 0.102 0.191 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 6.34e-01 0.0384 0.0806 0.191 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -200456 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0302 0.11 0.191 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 1.47e-01 0.168 0.115 0.191 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -701263 sc-eQTL 3.37e-01 -0.111 0.115 0.191 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -797924 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0914 0.109 0.191 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 5.25e-01 0.0696 0.109 0.191 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0477 0.101 0.195 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 2.18e-01 0.133 0.108 0.195 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 6.91e-02 0.16 0.0876 0.195 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0563 0.0802 0.195 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -200456 sc-eQTL 4.64e-01 -0.066 0.0899 0.195 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 1.56e-02 0.248 0.102 0.195 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -701263 sc-eQTL 7.22e-01 0.035 0.0982 0.195 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -797924 sc-eQTL 8.99e-01 0.0125 0.0981 0.195 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 1.48e-01 -0.147 0.101 0.195 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0749 0.115 0.198 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0379 0.127 0.198 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 1.50e-01 0.151 0.104 0.198 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 7.28e-01 0.034 0.0977 0.198 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 7.71e-01 0.037 0.127 0.198 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -701263 sc-eQTL 9.35e-01 0.00969 0.119 0.198 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -797924 sc-eQTL 7.13e-02 -0.165 0.091 0.198 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0345 0.108 0.198 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 5.10e-01 0.0777 0.118 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 8.15e-01 0.0229 0.0981 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 7.23e-01 0.0309 0.0869 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -15283 sc-eQTL 2.27e-01 -0.12 0.0988 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 2.33e-01 0.0743 0.0621 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0478 0.103 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 1.19e-01 0.128 0.0819 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 5.31e-01 0.0564 0.0897 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 6.35e-01 0.0508 0.107 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0312 0.0843 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0471 0.0797 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -15283 sc-eQTL 8.97e-05 -0.296 0.0741 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00307 0.0541 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 5.48e-01 0.0594 0.0987 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 4.12e-01 0.0573 0.0698 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 8.39e-02 0.143 0.0824 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 1.71e-01 0.123 0.0891 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0455 0.101 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 1.77e-01 0.0873 0.0644 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 7.29e-01 0.0197 0.0568 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -200456 sc-eQTL 4.57e-01 0.0864 0.116 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0949 0.0813 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -701263 sc-eQTL 6.68e-01 0.0513 0.119 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -797924 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0963 0.0976 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0307 0.0916 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 7.10e-01 0.0368 0.0988 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 6.84e-01 -0.044 0.108 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 2.49e-01 0.102 0.0883 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0196 0.0708 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -200456 sc-eQTL 2.75e-01 -0.113 0.103 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 1.03e-01 0.153 0.0934 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -701263 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0951 0.107 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -797924 sc-eQTL 4.50e-01 -0.077 0.102 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0692 0.102 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -588486 sc-eQTL 2.52e-02 0.244 0.108 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588680 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0522 0.0747 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -357689 sc-eQTL 6.69e-01 0.0351 0.0818 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 sc-eQTL 6.51e-01 0.0414 0.0915 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -936594 sc-eQTL 4.77e-01 0.0494 0.0694 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 sc-eQTL 8.03e-01 0.0264 0.106 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -23391 sc-eQTL 6.11e-01 0.0463 0.091 0.19 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162511 LAPTM5 -49472 eQTL 8.2e-05 -0.0447 0.0113 0.0 0.0 0.226
ENSG00000168528 SERINC2 -701263 eQTL 0.0226 0.1 0.0438 0.0 0.0 0.226
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 eQTL 1.16e-07 0.0755 0.0141 0.00258 0.00722 0.226

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10202 0.000122 8.31e-05 9.59e-06 2.48e-05 9.87e-06 3.22e-05 8.32e-05 8.21e-06 6.86e-05 2.96e-05 8.35e-05 3.73e-05 0.000109 3.17e-05 1.27e-05 5.28e-05 3.88e-05 4.44e-05 1.61e-05 1.24e-05 2.74e-05 8.61e-05 6.81e-05 1.82e-05 0.000107 1.74e-05 3.12e-05 2.68e-05 6.58e-05 3.44e-05 4.74e-05 3.49e-06 6.08e-06 1.24e-05 1.72e-05 9.35e-06 4.68e-06 4.69e-06 8.53e-06 5.26e-06 2.23e-06 8.37e-05 7.13e-06 4.02e-07 4.33e-06 6.83e-06 8.87e-06 2.67e-06 2.3e-06