logo

Genes within 1Mb (chr1:30708227:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 8.82e-02 0.203 0.118 0.122 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 2.42e-01 0.112 0.0951 0.122 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0861 0.0798 0.122 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -15358 sc-eQTL 2.57e-01 0.0953 0.0839 0.122 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 1.69e-01 -0.0905 0.0656 0.122 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 2.42e-01 -0.116 0.0991 0.122 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 3.47e-01 0.0726 0.0771 0.122 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0255 0.0914 0.122 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 2.42e-01 0.121 0.103 0.122 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 6.57e-01 0.0359 0.0806 0.122 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 8.19e-01 0.0165 0.0718 0.122 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 7.62e-01 0.0241 0.0796 0.122 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 6.11e-02 -0.155 0.0825 0.122 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 3.27e-01 0.0698 0.071 0.122 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 1.76e-01 0.115 0.0849 0.122 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 2.66e-01 0.153 0.137 0.122 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 7.68e-02 0.162 0.091 0.122 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0323 0.0807 0.122 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0653 0.0782 0.122 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 5.13e-01 0.0632 0.0964 0.122 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 2.70e-01 0.101 0.0916 0.122 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 9.45e-01 0.00803 0.115 0.122 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 4.21e-01 0.0986 0.122 0.126 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0726 0.145 0.126 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 2.03e-01 -0.145 0.113 0.126 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0627 0.0811 0.126 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 2.45e-01 0.153 0.131 0.126 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -701338 sc-eQTL 5.01e-01 0.0902 0.134 0.126 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -797999 sc-eQTL 5.85e-01 0.0485 0.0886 0.126 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00164 0.128 0.126 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 2.06e-02 -0.219 0.0937 0.122 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 6.51e-01 0.0533 0.118 0.122 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 8.21e-01 0.0171 0.0754 0.122 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 9.99e-01 -5.01e-05 0.0694 0.122 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -200531 sc-eQTL 4.22e-01 0.107 0.133 0.122 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 2.80e-01 0.101 0.0933 0.122 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -701338 sc-eQTL 7.49e-01 0.0458 0.143 0.122 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -797999 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0115 0.126 0.122 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 5.86e-02 -0.208 0.109 0.122 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 7.46e-01 0.0422 0.13 0.122 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 3.41e-01 0.0848 0.0889 0.122 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 7.52e-02 -0.166 0.0928 0.122 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 8.11e-01 0.0258 0.108 0.122 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 4.97e-01 0.0534 0.0785 0.122 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 9.80e-01 0.00307 0.121 0.122 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 7.01e-01 0.0428 0.112 0.122 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 3.38e-01 0.095 0.0991 0.122 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 2.90e-01 0.112 0.106 0.122 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 2.00e-01 0.122 0.095 0.122 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 1.94e-01 -0.102 0.0779 0.122 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0814 0.104 0.122 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0111 0.128 0.122 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 4.13e-01 -0.109 0.133 0.122 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0411 0.159 0.115 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0242 0.16 0.115 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0929 0.149 0.115 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -15358 sc-eQTL 5.05e-01 0.0868 0.13 0.115 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0585 0.0907 0.115 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 4.15e-01 -0.126 0.154 0.115 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0255 0.147 0.115 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 4.76e-01 0.0925 0.129 0.115 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 3.87e-01 -0.126 0.146 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 1.98e-01 0.156 0.121 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0856 0.114 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -15358 sc-eQTL 2.08e-01 -0.15 0.119 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0952 0.0729 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0546 0.136 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 1.97e-01 0.132 0.102 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00895 0.115 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 9.27e-01 0.0131 0.143 0.121 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 9.25e-01 0.0125 0.132 0.121 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 7.91e-01 0.0304 0.115 0.121 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -15358 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0315 0.11 0.121 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0581 0.0972 0.121 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 1.20e-01 0.202 0.129 0.121 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0784 0.111 0.121 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 2.44e-01 -0.152 0.13 0.121 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 2.36e-02 0.295 0.129 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 3.47e-01 0.106 0.113 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0289 0.0997 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -15358 sc-eQTL 4.44e-02 0.203 0.1 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 1.07e-01 -0.109 0.0672 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 1.70e-01 -0.163 0.119 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 1.56e-01 0.126 0.0884 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 1.09e-01 -0.175 0.109 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 1.60e-02 0.335 0.138 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 2.34e-01 0.137 0.115 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 9.38e-01 0.00879 0.113 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -15358 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0124 0.108 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 6.34e-02 -0.136 0.0731 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 3.81e-01 0.117 0.134 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 4.65e-02 0.213 0.106 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 2.09e-01 0.146 0.115 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0896 0.14 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 4.16e-01 -0.112 0.138 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 2.47e-01 0.156 0.135 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 5.24e-01 0.0768 0.12 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0702 0.123 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 4.03e-01 -0.11 0.131 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 7.41e-03 0.309 0.114 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 5.24e-01 0.0688 0.108 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 1.48e-01 0.138 0.0953 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 8.73e-01 0.0122 0.0764 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 7.21e-01 0.0293 0.0819 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0989 0.0896 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 3.13e-01 0.0839 0.0829 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 6.62e-01 0.0417 0.0954 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 6.15e-01 0.0679 0.135 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 6.95e-01 0.0426 0.109 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0617 0.0961 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 8.59e-01 0.0142 0.0798 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 2.07e-01 -0.135 0.107 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 6.03e-01 0.0527 0.101 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 4.73e-02 0.223 0.112 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 9.07e-02 0.23 0.135 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 2.41e-01 -0.152 0.129 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 6.82e-01 0.0443 0.108 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 5.75e-01 0.0614 0.109 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 7.37e-01 0.0412 0.122 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 6.06e-01 0.0661 0.128 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 6.67e-01 0.0543 0.126 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 7.26e-01 0.0516 0.147 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 4.70e-02 0.223 0.112 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0689 0.109 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 1.06e-01 0.196 0.121 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 5.39e-01 0.0649 0.105 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 1.56e-02 0.306 0.126 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0329 0.12 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 3.75e-01 0.122 0.137 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 9.13e-01 -0.013 0.118 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 4.95e-01 0.0649 0.095 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 1.87e-02 -0.213 0.0899 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 3.58e-01 0.116 0.126 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 1.98e-01 0.146 0.113 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0511 0.124 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00493 0.151 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 8.10e-01 0.0333 0.139 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 5.49e-01 0.0782 0.13 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0464 0.136 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 4.25e-01 0.111 0.139 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 5.22e-01 0.0809 0.126 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0418 0.128 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 4.93e-01 0.0974 0.142 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 4.52e-01 -0.102 0.136 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 7.17e-01 0.0505 0.139 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 3.12e-01 -0.132 0.13 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0594 0.123 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 2.42e-01 0.159 0.135 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 1.58e-02 0.295 0.121 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 7.40e-01 0.0486 0.146 0.121 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 9.72e-01 0.00463 0.129 0.121 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 4.95e-01 0.0847 0.124 0.121 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 7.05e-01 0.0443 0.117 0.121 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 9.93e-01 0.00107 0.129 0.121 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0851 0.13 0.121 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 7.19e-01 0.0484 0.134 0.121 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 9.41e-01 0.0112 0.151 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 1.19e-01 0.198 0.126 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 6.03e-03 -0.364 0.131 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 3.10e-01 0.134 0.131 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 3.31e-01 0.124 0.128 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 1.27e-02 -0.328 0.13 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0579 0.13 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 6.35e-01 0.0654 0.138 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 1.13e-01 0.161 0.101 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 2.58e-01 -0.118 0.104 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0392 0.111 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 8.64e-01 0.0171 0.0992 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0476 0.14 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 8.64e-01 0.0198 0.115 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0293 0.152 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0949 0.135 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 1.67e-01 -0.182 0.131 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 2.78e-01 -0.137 0.126 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 5.43e-01 0.0865 0.142 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 2.67e-01 0.149 0.134 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00578 0.13 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 3.94e-01 0.116 0.136 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 2.26e-01 -0.129 0.106 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 7.43e-01 0.0377 0.115 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0209 0.127 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 5.70e-01 0.0613 0.108 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 8.25e-01 0.0296 0.134 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 7.52e-01 0.0395 0.125 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 3.39e-01 -0.157 0.164 0.119 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 2.88e-01 -0.203 0.19 0.119 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 8.20e-01 0.0377 0.166 0.119 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -15358 sc-eQTL 3.20e-01 -0.154 0.154 0.119 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0577 0.11 0.119 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 4.27e-02 0.342 0.167 0.119 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 3.62e-01 0.138 0.151 0.119 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 1.64e-01 -0.224 0.159 0.119 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 9.87e-02 0.174 0.105 0.124 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 5.41e-02 0.257 0.133 0.124 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0678 0.125 0.124 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0539 0.0894 0.124 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0627 0.131 0.124 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 7.02e-01 0.0479 0.125 0.124 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 8.24e-01 0.0256 0.115 0.124 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0517 0.139 0.122 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 1.64e-02 -0.322 0.133 0.122 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0199 0.108 0.122 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0352 0.124 0.122 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0149 0.133 0.122 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 7.61e-01 0.0383 0.126 0.122 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0574 0.126 0.122 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 8.21e-01 0.0327 0.144 0.122 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 3.58e-01 0.144 0.156 0.122 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 1.11e-01 -0.214 0.133 0.122 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0114 0.094 0.122 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 9.45e-01 0.00946 0.136 0.122 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -701338 sc-eQTL 4.67e-01 0.0878 0.121 0.122 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -797999 sc-eQTL 2.34e-01 -0.141 0.118 0.122 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 9.39e-01 0.00976 0.128 0.122 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0761 0.112 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 7.43e-01 0.0411 0.125 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 4.43e-01 0.0648 0.0844 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 5.81e-01 -0.041 0.0742 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -200531 sc-eQTL 5.67e-01 0.0801 0.14 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 8.70e-01 0.0188 0.114 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -701338 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00326 0.142 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -797999 sc-eQTL 2.87e-01 -0.133 0.125 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 5.75e-03 -0.32 0.115 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0723 0.119 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 9.73e-01 0.00485 0.141 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0624 0.102 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0235 0.0784 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -200531 sc-eQTL 4.18e-01 -0.11 0.135 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 2.84e-01 0.131 0.122 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -701338 sc-eQTL 8.18e-01 0.0331 0.143 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -797999 sc-eQTL 5.63e-01 0.0676 0.116 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0898 0.117 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 5.59e-01 0.104 0.177 0.13 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 4.10e-01 0.125 0.152 0.13 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 8.67e-01 0.0263 0.157 0.13 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 1.99e-01 -0.219 0.169 0.13 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00125 0.156 0.13 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 4.46e-01 0.12 0.157 0.13 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0791 0.152 0.13 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 4.18e-01 -0.105 0.129 0.124 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 5.97e-01 0.0736 0.139 0.124 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 9.88e-01 0.00173 0.118 0.124 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0967 0.0924 0.124 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -200531 sc-eQTL 4.29e-01 0.101 0.127 0.124 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 5.87e-01 0.0725 0.133 0.124 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -701338 sc-eQTL 2.48e-01 0.153 0.132 0.124 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -797999 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0241 0.126 0.124 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 3.82e-02 -0.26 0.125 0.124 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 4.89e-02 -0.25 0.126 0.122 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0168 0.136 0.122 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0721 0.111 0.122 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 1.56e-01 0.143 0.1 0.122 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -200531 sc-eQTL 4.84e-01 0.0792 0.113 0.122 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 8.08e-01 0.0316 0.13 0.122 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -701338 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0356 0.123 0.122 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -797999 sc-eQTL 3.38e-01 0.118 0.123 0.122 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 1.23e-01 0.197 0.127 0.122 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 2.98e-02 0.307 0.14 0.121 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 6.58e-01 -0.069 0.156 0.121 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0272 0.129 0.121 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 3.31e-01 -0.117 0.12 0.121 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 6.84e-01 0.0636 0.156 0.121 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -701338 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0502 0.146 0.121 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -797999 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0647 0.113 0.121 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0256 0.133 0.121 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0845 0.14 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 2.06e-01 0.147 0.116 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 1.84e-01 -0.137 0.103 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -15358 sc-eQTL 3.65e-01 -0.106 0.117 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0983 0.0735 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 7.99e-01 0.0312 0.122 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 4.75e-01 0.0698 0.0975 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 8.41e-01 0.0214 0.106 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 2.05e-03 0.392 0.126 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 2.30e-01 0.122 0.101 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 6.93e-01 -0.038 0.0961 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -15358 sc-eQTL 5.21e-02 0.179 0.0918 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 1.13e-01 -0.103 0.0648 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 3.69e-01 -0.107 0.119 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 9.83e-02 0.139 0.0836 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00866 0.1 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 9.75e-02 -0.178 0.107 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 8.84e-01 0.0179 0.122 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0175 0.0777 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0259 0.0683 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -200531 sc-eQTL 7.87e-01 0.0378 0.139 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 8.57e-01 0.0177 0.098 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -701338 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0116 0.143 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -797999 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0292 0.118 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 3.14e-02 -0.236 0.109 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 8.00e-02 -0.209 0.119 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 9.36e-01 0.0105 0.131 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 7.98e-01 0.0275 0.107 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 8.94e-01 0.0115 0.0856 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -200531 sc-eQTL 3.75e-01 0.111 0.125 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 1.26e-01 0.173 0.113 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -701338 sc-eQTL 3.29e-01 0.127 0.129 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -797999 sc-eQTL 8.15e-01 0.0289 0.123 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0536 0.123 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -588561 sc-eQTL 8.01e-01 0.0331 0.131 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588755 sc-eQTL 6.13e-01 0.0455 0.0897 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -357764 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0686 0.0982 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -49547 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0094 0.11 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -936669 sc-eQTL 8.24e-01 0.0185 0.0834 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10277 sc-eQTL 5.13e-01 0.0829 0.127 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -23466 sc-eQTL 4.13e-01 0.0896 0.109 0.121 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162511 \N -49547 1.88e-05 1.9e-05 3.08e-06 1.13e-05 3.02e-06 8.91e-06 2.62e-05 3.34e-06 1.73e-05 8.86e-06 2.37e-05 8.87e-06 3.35e-05 7.53e-06 5.1e-06 9.88e-06 9.13e-06 1.25e-05 4.21e-06 3.57e-06 8.59e-06 1.67e-05 1.66e-05 4.78e-06 2.45e-05 5.36e-06 8.02e-06 6.92e-06 1.75e-05 1.35e-05 1.04e-05 1.41e-06 1.71e-06 4.01e-06 8.27e-06 3.63e-06 2.24e-06 2.51e-06 2.2e-06 2.11e-06 1.64e-06 2.08e-05 2.68e-06 2.2e-07 9.2e-07 2.56e-06 3.02e-06 1.29e-06 1.24e-06