logo

Genes within 1Mb (chr1:30708125:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 6.25e-01 0.0487 0.0996 0.19 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 9.53e-01 0.00473 0.0798 0.19 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 8.33e-01 0.0141 0.067 0.19 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -15460 sc-eQTL 2.40e-04 -0.255 0.0682 0.19 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 6.59e-01 0.0243 0.0551 0.19 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 4.10e-01 0.0687 0.0831 0.19 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 1.86e-01 0.0853 0.0644 0.19 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 2.54e-02 0.17 0.0756 0.19 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0432 0.087 0.19 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 5.55e-01 0.0402 0.068 0.19 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0374 0.0605 0.19 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 8.55e-01 0.0123 0.0671 0.19 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 6.15e-01 0.0354 0.0701 0.19 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 7.27e-02 0.107 0.0596 0.19 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 9.97e-01 -0.0003 0.0719 0.19 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 4.95e-01 0.0788 0.115 0.19 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 6.64e-02 -0.141 0.0763 0.19 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00448 0.0677 0.19 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 1.52e-01 -0.0941 0.0654 0.19 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 8.13e-01 0.0192 0.081 0.19 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 2.35e-01 0.0915 0.0768 0.19 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 9.65e-01 0.00423 0.0968 0.19 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0186 0.103 0.194 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0325 0.122 0.194 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0338 0.0952 0.194 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 1.48e-01 0.0982 0.0677 0.194 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 9.92e-01 0.00106 0.11 0.194 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -701440 sc-eQTL 6.68e-01 0.0482 0.112 0.194 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -798101 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0593 0.0742 0.194 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00833 0.108 0.194 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 2.17e-01 0.0966 0.0781 0.19 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0663 0.097 0.19 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 2.28e-01 0.075 0.062 0.19 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 9.76e-01 0.00173 0.0573 0.19 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -200633 sc-eQTL 9.79e-01 0.00296 0.11 0.19 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0465 0.0771 0.19 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -701440 sc-eQTL 7.92e-01 0.0312 0.118 0.19 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -798101 sc-eQTL 2.24e-01 -0.127 0.104 0.19 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0653 0.0908 0.19 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 2.09e-02 0.25 0.107 0.189 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0582 0.0743 0.189 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 5.05e-01 0.0521 0.078 0.189 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 4.26e-01 0.0715 0.0897 0.189 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 3.60e-01 0.06 0.0654 0.189 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 6.18e-01 0.0504 0.101 0.189 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 2.99e-01 0.0967 0.0929 0.189 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 2.50e-01 0.0955 0.0828 0.19 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0395 0.0888 0.19 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 5.53e-02 -0.153 0.0792 0.19 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 6.67e-01 0.0282 0.0654 0.19 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0393 0.0874 0.19 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 2.81e-01 0.115 0.107 0.19 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00518 0.112 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 5.30e-01 0.082 0.13 0.196 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 4.73e-01 0.0945 0.131 0.196 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 8.86e-01 0.0176 0.122 0.196 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -15460 sc-eQTL 9.29e-01 0.00954 0.107 0.196 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 5.34e-01 0.0465 0.0745 0.196 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 7.87e-02 0.222 0.126 0.196 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 5.38e-01 0.0741 0.12 0.196 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 8.90e-01 0.0148 0.107 0.196 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0549 0.124 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 8.60e-01 0.0182 0.103 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 2.38e-01 0.115 0.0972 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -15460 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0489 0.101 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 4.05e-01 0.0519 0.0622 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0525 0.116 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 2.84e-01 0.0936 0.0872 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 7.91e-02 0.171 0.0971 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 2.58e-01 0.137 0.121 0.192 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0171 0.112 0.192 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0144 0.0971 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -15460 sc-eQTL 3.18e-02 -0.199 0.0919 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 7.06e-01 0.0311 0.0823 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 7.02e-01 0.0421 0.11 0.192 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 4.10e-01 0.0777 0.0941 0.192 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0489 0.11 0.192 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 3.63e-01 0.0996 0.109 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 2.91e-01 0.0998 0.0943 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 3.94e-01 0.0711 0.0832 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -15460 sc-eQTL 4.86e-05 -0.337 0.0813 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 7.76e-01 0.0161 0.0565 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 7.73e-01 0.0288 0.0996 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 5.08e-01 0.0492 0.0741 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 3.80e-03 0.263 0.0899 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 7.47e-01 0.0381 0.118 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 2.46e-02 -0.218 0.0961 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 2.89e-02 -0.207 0.0941 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -15460 sc-eQTL 1.36e-01 -0.136 0.0909 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 7.95e-01 0.0162 0.062 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 1.36e-01 0.168 0.112 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 8.26e-02 0.156 0.0897 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0388 0.0976 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0603 0.116 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0992 0.113 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 1.40e-01 0.164 0.111 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 4.16e-01 -0.081 0.0992 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0514 0.102 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 4.12e-01 0.0892 0.109 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 1.04e-01 -0.156 0.0953 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0237 0.0911 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 5.58e-01 0.0474 0.0807 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0474 0.0644 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 4.95e-01 0.0472 0.0691 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 4.42e-01 0.0583 0.0757 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 1.59e-01 0.0988 0.0698 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 4.10e-01 0.0664 0.0805 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 9.23e-01 0.0111 0.114 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0474 0.0918 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0162 0.0813 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00492 0.0674 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 4.07e-01 0.075 0.0902 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 1.47e-01 0.124 0.0851 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 2.32e-01 -0.114 0.095 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00228 0.113 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00655 0.108 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 5.15e-01 0.0583 0.0895 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 2.06e-01 0.115 0.0902 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0602 0.101 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 6.46e-01 0.0488 0.106 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 2.46e-01 -0.121 0.104 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0697 0.124 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 1.15e-01 -0.15 0.095 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0151 0.0928 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0684 0.103 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00766 0.0895 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 3.11e-01 0.109 0.108 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0675 0.101 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 2.01e-01 0.145 0.113 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 1.67e-01 -0.135 0.0976 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 7.34e-01 0.0268 0.0789 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 9.18e-01 0.00781 0.0756 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 4.99e-01 0.0711 0.105 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 6.79e-02 0.172 0.0936 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 6.36e-01 0.0487 0.103 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 4.06e-01 -0.109 0.131 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 4.97e-01 0.0815 0.12 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0957 0.113 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0287 0.118 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 9.09e-01 0.0138 0.121 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0621 0.109 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0659 0.11 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 1.93e-01 0.155 0.119 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 4.87e-01 0.0794 0.114 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0849 0.117 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00522 0.11 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 9.80e-01 0.0026 0.103 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 7.19e-01 0.0411 0.114 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 7.13e-01 -0.038 0.103 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 1.76e-01 0.164 0.121 0.19 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 8.84e-01 0.0157 0.107 0.19 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 5.87e-01 -0.056 0.103 0.19 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 3.24e-01 0.0957 0.0968 0.19 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0236 0.107 0.19 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00261 0.108 0.19 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0825 0.111 0.19 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 6.31e-01 0.0587 0.122 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0575 0.103 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 2.77e-01 0.118 0.108 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 3.80e-02 0.221 0.106 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0303 0.104 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 1.70e-01 0.147 0.107 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 1.74e-01 0.144 0.105 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 1.89e-01 0.152 0.116 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0878 0.0856 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 8.03e-01 0.022 0.0881 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0205 0.0939 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 6.14e-01 0.0422 0.0835 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 7.23e-01 0.0418 0.118 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 9.22e-01 0.00951 0.0971 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 5.63e-01 0.0705 0.122 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 9.61e-02 0.18 0.108 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 2.55e-01 -0.121 0.106 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 6.39e-01 0.0475 0.101 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 9.86e-01 -0.002 0.114 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0734 0.107 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 6.16e-01 0.0522 0.104 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 2.25e-01 0.136 0.111 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 5.07e-01 -0.058 0.0872 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 2.77e-01 0.103 0.0941 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 5.68e-01 0.0593 0.104 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00929 0.0885 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 7.20e-01 0.0395 0.11 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 3.43e-01 0.0972 0.102 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 1.79e-02 0.332 0.138 0.17 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0733 0.164 0.17 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0828 0.142 0.17 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -15460 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0469 0.133 0.17 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0562 0.0949 0.17 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 2.88e-01 -0.156 0.146 0.17 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 7.67e-01 0.0386 0.13 0.17 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 5.23e-01 0.0887 0.138 0.17 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0616 0.0898 0.189 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0372 0.114 0.189 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0417 0.106 0.189 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0529 0.0763 0.189 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 9.94e-01 0.000892 0.112 0.189 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0882 0.107 0.189 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0339 0.0981 0.189 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 5.62e-01 0.068 0.117 0.19 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 5.52e-01 0.0674 0.113 0.19 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0719 0.0904 0.19 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 9.37e-01 0.00821 0.104 0.19 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 9.93e-01 0.00104 0.112 0.19 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 3.96e-01 0.0897 0.105 0.19 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 3.71e-01 0.0944 0.105 0.19 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 3.88e-01 0.105 0.121 0.195 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0233 0.131 0.195 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 1.30e-01 -0.17 0.112 0.195 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 5.09e-02 0.153 0.078 0.195 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 8.50e-01 0.0216 0.114 0.195 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -701440 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0302 0.101 0.195 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -798101 sc-eQTL 1.91e-02 0.232 0.098 0.195 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 8.76e-01 0.0168 0.107 0.195 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 7.76e-02 0.166 0.0936 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0287 0.105 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 5.59e-01 0.0416 0.0711 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 7.91e-01 0.0166 0.0624 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -200633 sc-eQTL 9.97e-01 0.000494 0.118 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 7.23e-01 -0.034 0.0961 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -701440 sc-eQTL 7.41e-01 0.0394 0.119 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -798101 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0853 0.105 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0836 0.098 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 6.80e-01 0.0408 0.0988 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0495 0.117 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 2.43e-01 0.0984 0.0841 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 7.27e-01 0.0227 0.0648 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -200633 sc-eQTL 1.45e-01 0.163 0.111 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0891 0.101 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -701440 sc-eQTL 6.09e-01 0.0608 0.119 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -798101 sc-eQTL 2.95e-01 -0.101 0.0961 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 9.92e-01 0.000916 0.0968 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000758 0.149 0.194 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0296 0.128 0.194 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 8.65e-01 0.0225 0.132 0.194 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0652 0.144 0.194 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 3.66e-01 -0.119 0.131 0.194 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 2.32e-01 0.158 0.132 0.194 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0332 0.128 0.194 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 9.36e-02 0.188 0.112 0.191 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0798 0.121 0.191 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 2.69e-01 0.113 0.102 0.191 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 6.34e-01 0.0384 0.0806 0.191 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -200633 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0302 0.11 0.191 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 1.47e-01 0.168 0.115 0.191 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -701440 sc-eQTL 3.37e-01 -0.111 0.115 0.191 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -798101 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0914 0.109 0.191 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 5.25e-01 0.0696 0.109 0.191 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0477 0.101 0.195 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 2.18e-01 0.133 0.108 0.195 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 6.91e-02 0.16 0.0876 0.195 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0563 0.0802 0.195 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -200633 sc-eQTL 4.64e-01 -0.066 0.0899 0.195 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 1.56e-02 0.248 0.102 0.195 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -701440 sc-eQTL 7.22e-01 0.035 0.0982 0.195 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -798101 sc-eQTL 8.99e-01 0.0125 0.0981 0.195 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 1.48e-01 -0.147 0.101 0.195 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0749 0.115 0.198 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0379 0.127 0.198 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 1.50e-01 0.151 0.104 0.198 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 7.28e-01 0.034 0.0977 0.198 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 7.71e-01 0.037 0.127 0.198 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -701440 sc-eQTL 9.35e-01 0.00969 0.119 0.198 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -798101 sc-eQTL 7.13e-02 -0.165 0.091 0.198 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0345 0.108 0.198 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 5.10e-01 0.0777 0.118 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 8.15e-01 0.0229 0.0981 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 7.23e-01 0.0309 0.0869 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -15460 sc-eQTL 2.27e-01 -0.12 0.0988 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 2.33e-01 0.0743 0.0621 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0478 0.103 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 1.19e-01 0.128 0.0819 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 5.31e-01 0.0564 0.0897 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 6.35e-01 0.0508 0.107 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0312 0.0843 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0471 0.0797 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -15460 sc-eQTL 8.97e-05 -0.296 0.0741 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00307 0.0541 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 5.48e-01 0.0594 0.0987 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 4.12e-01 0.0573 0.0698 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 8.39e-02 0.143 0.0824 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 1.71e-01 0.123 0.0891 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0455 0.101 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 1.77e-01 0.0873 0.0644 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 7.29e-01 0.0197 0.0568 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -200633 sc-eQTL 4.57e-01 0.0864 0.116 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0949 0.0813 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -701440 sc-eQTL 6.68e-01 0.0513 0.119 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -798101 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0963 0.0976 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0307 0.0916 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 7.10e-01 0.0368 0.0988 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 6.84e-01 -0.044 0.108 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 2.49e-01 0.102 0.0883 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0196 0.0708 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -200633 sc-eQTL 2.75e-01 -0.113 0.103 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 1.03e-01 0.153 0.0934 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -701440 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0951 0.107 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -798101 sc-eQTL 4.50e-01 -0.077 0.102 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0692 0.102 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -588663 sc-eQTL 2.52e-02 0.244 0.108 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -588857 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0522 0.0747 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -357866 sc-eQTL 6.69e-01 0.0351 0.0818 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 sc-eQTL 6.51e-01 0.0414 0.0915 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -936771 sc-eQTL 4.77e-01 0.0494 0.0694 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 sc-eQTL 8.03e-01 0.0264 0.106 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -23568 sc-eQTL 6.11e-01 0.0463 0.091 0.19 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162511 LAPTM5 -49649 eQTL 8.23e-05 -0.0447 0.0113 0.0 0.0 0.226
ENSG00000168528 SERINC2 -701440 eQTL 0.0226 0.1 0.0439 0.0 0.0 0.226
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 eQTL 1.18e-07 0.0754 0.0141 0.00254 0.00711 0.226

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10379 0.000121 2.54e-05 5.92e-06 1.15e-05 3.22e-06 2.15e-05 3.43e-05 2.18e-06 2.31e-05 9.71e-06 2.37e-05 8.22e-06 3.85e-05 8.55e-06 5.19e-06 1.42e-05 1e-05 2.56e-05 6.02e-06 3.83e-06 1.12e-05 2.83e-05 2.61e-05 6.42e-06 2.93e-05 5.96e-06 8.26e-06 7.58e-06 2.59e-05 2.03e-05 1.29e-05 1.2e-06 1.52e-06 5.15e-06 6.46e-06 3.41e-06 1.78e-06 2.18e-06 2.73e-06 2e-06 1.05e-06 3.36e-05 4.52e-06 1.56e-07 2.07e-06 1.96e-06 3.42e-06 7.41e-07 5.35e-07