logo

Genes within 1Mb (chr1:30707914:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 6.25e-01 0.0487 0.0996 0.19 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 9.53e-01 0.00473 0.0798 0.19 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 8.33e-01 0.0141 0.067 0.19 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -15671 sc-eQTL 2.40e-04 -0.255 0.0682 0.19 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 6.59e-01 0.0243 0.0551 0.19 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 4.10e-01 0.0687 0.0831 0.19 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 1.86e-01 0.0853 0.0644 0.19 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 2.54e-02 0.17 0.0756 0.19 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0432 0.087 0.19 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 5.55e-01 0.0402 0.068 0.19 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0374 0.0605 0.19 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 8.55e-01 0.0123 0.0671 0.19 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 6.15e-01 0.0354 0.0701 0.19 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 7.27e-02 0.107 0.0596 0.19 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 9.97e-01 -0.0003 0.0719 0.19 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 4.95e-01 0.0788 0.115 0.19 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 6.64e-02 -0.141 0.0763 0.19 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00448 0.0677 0.19 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 1.52e-01 -0.0941 0.0654 0.19 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 8.13e-01 0.0192 0.081 0.19 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 2.35e-01 0.0915 0.0768 0.19 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 9.65e-01 0.00423 0.0968 0.19 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0186 0.103 0.194 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0325 0.122 0.194 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0338 0.0952 0.194 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 1.48e-01 0.0982 0.0677 0.194 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 9.92e-01 0.00106 0.11 0.194 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -701651 sc-eQTL 6.68e-01 0.0482 0.112 0.194 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -798312 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0593 0.0742 0.194 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00833 0.108 0.194 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 2.17e-01 0.0966 0.0781 0.19 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0663 0.097 0.19 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 2.28e-01 0.075 0.062 0.19 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 9.76e-01 0.00173 0.0573 0.19 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -200844 sc-eQTL 9.79e-01 0.00296 0.11 0.19 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0465 0.0771 0.19 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -701651 sc-eQTL 7.92e-01 0.0312 0.118 0.19 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -798312 sc-eQTL 2.24e-01 -0.127 0.104 0.19 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0653 0.0908 0.19 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 2.09e-02 0.25 0.107 0.189 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0582 0.0743 0.189 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 5.05e-01 0.0521 0.078 0.189 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 4.26e-01 0.0715 0.0897 0.189 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 3.60e-01 0.06 0.0654 0.189 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 6.18e-01 0.0504 0.101 0.189 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 2.99e-01 0.0967 0.0929 0.189 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 2.50e-01 0.0955 0.0828 0.19 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0395 0.0888 0.19 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 5.53e-02 -0.153 0.0792 0.19 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 6.67e-01 0.0282 0.0654 0.19 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0393 0.0874 0.19 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 2.81e-01 0.115 0.107 0.19 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00518 0.112 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 5.30e-01 0.082 0.13 0.196 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 4.73e-01 0.0945 0.131 0.196 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 8.86e-01 0.0176 0.122 0.196 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -15671 sc-eQTL 9.29e-01 0.00954 0.107 0.196 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 5.34e-01 0.0465 0.0745 0.196 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 7.87e-02 0.222 0.126 0.196 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 5.38e-01 0.0741 0.12 0.196 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 8.90e-01 0.0148 0.107 0.196 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0549 0.124 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 8.60e-01 0.0182 0.103 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 2.38e-01 0.115 0.0972 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -15671 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0489 0.101 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 4.05e-01 0.0519 0.0622 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0525 0.116 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 2.84e-01 0.0936 0.0872 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 7.91e-02 0.171 0.0971 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 2.58e-01 0.137 0.121 0.192 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0171 0.112 0.192 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0144 0.0971 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -15671 sc-eQTL 3.18e-02 -0.199 0.0919 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 7.06e-01 0.0311 0.0823 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 7.02e-01 0.0421 0.11 0.192 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 4.10e-01 0.0777 0.0941 0.192 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0489 0.11 0.192 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 3.63e-01 0.0996 0.109 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 2.91e-01 0.0998 0.0943 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 3.94e-01 0.0711 0.0832 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -15671 sc-eQTL 4.86e-05 -0.337 0.0813 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 7.76e-01 0.0161 0.0565 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 7.73e-01 0.0288 0.0996 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 5.08e-01 0.0492 0.0741 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 3.80e-03 0.263 0.0899 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 7.47e-01 0.0381 0.118 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 2.46e-02 -0.218 0.0961 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 2.89e-02 -0.207 0.0941 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -15671 sc-eQTL 1.36e-01 -0.136 0.0909 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 7.95e-01 0.0162 0.062 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 1.36e-01 0.168 0.112 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 8.26e-02 0.156 0.0897 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0388 0.0976 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0603 0.116 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0992 0.113 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 1.40e-01 0.164 0.111 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 4.16e-01 -0.081 0.0992 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0514 0.102 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 4.12e-01 0.0892 0.109 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 1.04e-01 -0.156 0.0953 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0237 0.0911 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 5.58e-01 0.0474 0.0807 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0474 0.0644 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 4.95e-01 0.0472 0.0691 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 4.42e-01 0.0583 0.0757 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 1.59e-01 0.0988 0.0698 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 4.10e-01 0.0664 0.0805 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 9.23e-01 0.0111 0.114 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0474 0.0918 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0162 0.0813 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00492 0.0674 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 4.07e-01 0.075 0.0902 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 1.47e-01 0.124 0.0851 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 2.32e-01 -0.114 0.095 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00228 0.113 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00655 0.108 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 5.15e-01 0.0583 0.0895 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 2.06e-01 0.115 0.0902 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0602 0.101 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 6.46e-01 0.0488 0.106 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 2.46e-01 -0.121 0.104 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0697 0.124 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 1.15e-01 -0.15 0.095 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0151 0.0928 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0684 0.103 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00766 0.0895 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 3.11e-01 0.109 0.108 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0675 0.101 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 2.01e-01 0.145 0.113 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 1.67e-01 -0.135 0.0976 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 7.34e-01 0.0268 0.0789 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 9.18e-01 0.00781 0.0756 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 4.99e-01 0.0711 0.105 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 6.79e-02 0.172 0.0936 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 6.36e-01 0.0487 0.103 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 4.06e-01 -0.109 0.131 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 4.97e-01 0.0815 0.12 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0957 0.113 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0287 0.118 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 9.09e-01 0.0138 0.121 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0621 0.109 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0659 0.11 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 1.93e-01 0.155 0.119 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 4.87e-01 0.0794 0.114 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0849 0.117 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00522 0.11 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 9.80e-01 0.0026 0.103 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 7.19e-01 0.0411 0.114 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 7.13e-01 -0.038 0.103 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 1.76e-01 0.164 0.121 0.19 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 8.84e-01 0.0157 0.107 0.19 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 5.87e-01 -0.056 0.103 0.19 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 3.24e-01 0.0957 0.0968 0.19 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0236 0.107 0.19 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00261 0.108 0.19 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0825 0.111 0.19 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 6.31e-01 0.0587 0.122 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0575 0.103 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 2.77e-01 0.118 0.108 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 3.80e-02 0.221 0.106 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0303 0.104 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 1.70e-01 0.147 0.107 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 1.74e-01 0.144 0.105 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 1.89e-01 0.152 0.116 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0878 0.0856 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 8.03e-01 0.022 0.0881 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0205 0.0939 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 6.14e-01 0.0422 0.0835 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 7.23e-01 0.0418 0.118 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 9.22e-01 0.00951 0.0971 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 5.63e-01 0.0705 0.122 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 9.61e-02 0.18 0.108 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 2.55e-01 -0.121 0.106 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 6.39e-01 0.0475 0.101 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 9.86e-01 -0.002 0.114 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0734 0.107 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 6.16e-01 0.0522 0.104 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 2.25e-01 0.136 0.111 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 5.07e-01 -0.058 0.0872 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 2.77e-01 0.103 0.0941 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 5.68e-01 0.0593 0.104 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00929 0.0885 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 7.20e-01 0.0395 0.11 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 3.43e-01 0.0972 0.102 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 1.79e-02 0.332 0.138 0.17 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0733 0.164 0.17 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0828 0.142 0.17 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -15671 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0469 0.133 0.17 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0562 0.0949 0.17 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 2.88e-01 -0.156 0.146 0.17 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 7.67e-01 0.0386 0.13 0.17 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 5.23e-01 0.0887 0.138 0.17 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0616 0.0898 0.189 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0372 0.114 0.189 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0417 0.106 0.189 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0529 0.0763 0.189 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 9.94e-01 0.000892 0.112 0.189 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0882 0.107 0.189 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0339 0.0981 0.189 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 5.62e-01 0.068 0.117 0.19 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 5.52e-01 0.0674 0.113 0.19 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0719 0.0904 0.19 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 9.37e-01 0.00821 0.104 0.19 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 9.93e-01 0.00104 0.112 0.19 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 3.96e-01 0.0897 0.105 0.19 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 3.71e-01 0.0944 0.105 0.19 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 3.88e-01 0.105 0.121 0.195 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0233 0.131 0.195 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 1.30e-01 -0.17 0.112 0.195 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 5.09e-02 0.153 0.078 0.195 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 8.50e-01 0.0216 0.114 0.195 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -701651 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0302 0.101 0.195 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -798312 sc-eQTL 1.91e-02 0.232 0.098 0.195 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 8.76e-01 0.0168 0.107 0.195 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 7.76e-02 0.166 0.0936 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0287 0.105 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 5.59e-01 0.0416 0.0711 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 7.91e-01 0.0166 0.0624 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -200844 sc-eQTL 9.97e-01 0.000494 0.118 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 7.23e-01 -0.034 0.0961 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -701651 sc-eQTL 7.41e-01 0.0394 0.119 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -798312 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0853 0.105 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0836 0.098 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 6.80e-01 0.0408 0.0988 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0495 0.117 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 2.43e-01 0.0984 0.0841 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 7.27e-01 0.0227 0.0648 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -200844 sc-eQTL 1.45e-01 0.163 0.111 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0891 0.101 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -701651 sc-eQTL 6.09e-01 0.0608 0.119 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -798312 sc-eQTL 2.95e-01 -0.101 0.0961 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 9.92e-01 0.000916 0.0968 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000758 0.149 0.194 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0296 0.128 0.194 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 8.65e-01 0.0225 0.132 0.194 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0652 0.144 0.194 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 3.66e-01 -0.119 0.131 0.194 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 2.32e-01 0.158 0.132 0.194 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0332 0.128 0.194 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 9.36e-02 0.188 0.112 0.191 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0798 0.121 0.191 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 2.69e-01 0.113 0.102 0.191 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 6.34e-01 0.0384 0.0806 0.191 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -200844 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0302 0.11 0.191 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 1.47e-01 0.168 0.115 0.191 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -701651 sc-eQTL 3.37e-01 -0.111 0.115 0.191 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -798312 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0914 0.109 0.191 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 5.25e-01 0.0696 0.109 0.191 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0477 0.101 0.195 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 2.18e-01 0.133 0.108 0.195 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 6.91e-02 0.16 0.0876 0.195 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0563 0.0802 0.195 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -200844 sc-eQTL 4.64e-01 -0.066 0.0899 0.195 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 1.56e-02 0.248 0.102 0.195 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -701651 sc-eQTL 7.22e-01 0.035 0.0982 0.195 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -798312 sc-eQTL 8.99e-01 0.0125 0.0981 0.195 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 1.48e-01 -0.147 0.101 0.195 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0749 0.115 0.198 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0379 0.127 0.198 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 1.50e-01 0.151 0.104 0.198 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 7.28e-01 0.034 0.0977 0.198 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 7.71e-01 0.037 0.127 0.198 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -701651 sc-eQTL 9.35e-01 0.00969 0.119 0.198 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -798312 sc-eQTL 7.13e-02 -0.165 0.091 0.198 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0345 0.108 0.198 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 5.10e-01 0.0777 0.118 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 8.15e-01 0.0229 0.0981 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 7.23e-01 0.0309 0.0869 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -15671 sc-eQTL 2.27e-01 -0.12 0.0988 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 2.33e-01 0.0743 0.0621 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0478 0.103 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 1.19e-01 0.128 0.0819 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 5.31e-01 0.0564 0.0897 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 6.35e-01 0.0508 0.107 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0312 0.0843 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0471 0.0797 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -15671 sc-eQTL 8.97e-05 -0.296 0.0741 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00307 0.0541 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 5.48e-01 0.0594 0.0987 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 4.12e-01 0.0573 0.0698 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 8.39e-02 0.143 0.0824 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 1.71e-01 0.123 0.0891 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0455 0.101 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 1.77e-01 0.0873 0.0644 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 7.29e-01 0.0197 0.0568 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -200844 sc-eQTL 4.57e-01 0.0864 0.116 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0949 0.0813 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -701651 sc-eQTL 6.68e-01 0.0513 0.119 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -798312 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0963 0.0976 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0307 0.0916 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 7.10e-01 0.0368 0.0988 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 6.84e-01 -0.044 0.108 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 2.49e-01 0.102 0.0883 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0196 0.0708 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -200844 sc-eQTL 2.75e-01 -0.113 0.103 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 1.03e-01 0.153 0.0934 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -701651 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0951 0.107 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -798312 sc-eQTL 4.50e-01 -0.077 0.102 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0692 0.102 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -588874 sc-eQTL 2.52e-02 0.244 0.108 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -589068 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0522 0.0747 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -358077 sc-eQTL 6.69e-01 0.0351 0.0818 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 sc-eQTL 6.51e-01 0.0414 0.0915 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -936982 sc-eQTL 4.77e-01 0.0494 0.0694 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 sc-eQTL 8.03e-01 0.0264 0.106 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -23779 sc-eQTL 6.11e-01 0.0463 0.091 0.19 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162511 LAPTM5 -49860 eQTL 8.2e-05 -0.0447 0.0113 0.0 0.0 0.226
ENSG00000168528 SERINC2 -701651 eQTL 0.0226 0.1 0.0438 0.0 0.0 0.226
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 eQTL 1.16e-07 0.0755 0.0141 0.00258 0.00721 0.226

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -10590 2.22e-05 2.43e-05 4.37e-06 1.29e-05 3.82e-06 1e-05 3.16e-05 3.51e-06 2.05e-05 9.82e-06 2.6e-05 9.95e-06 3.55e-05 9.29e-06 5.6e-06 1.18e-05 1.19e-05 1.84e-05 6.52e-06 4.81e-06 9.62e-06 2.11e-05 2.22e-05 6.21e-06 3.43e-05 5.77e-06 8.66e-06 8.17e-06 2.39e-05 1.85e-05 1.46e-05 1.65e-06 2.02e-06 5.65e-06 8.6e-06 4.55e-06 2.05e-06 2.97e-06 3.71e-06 2.54e-06 1.63e-06 2.67e-05 2.68e-06 3.05e-07 1.9e-06 2.95e-06 3.42e-06 1.34e-06 1.04e-06