logo

Genes within 1Mb (chr1:30705792:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 6.25e-01 0.0487 0.0996 0.19 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 9.53e-01 0.00473 0.0798 0.19 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 8.33e-01 0.0141 0.067 0.19 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -17793 sc-eQTL 2.40e-04 -0.255 0.0682 0.19 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 6.59e-01 0.0243 0.0551 0.19 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 4.10e-01 0.0687 0.0831 0.19 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 1.86e-01 0.0853 0.0644 0.19 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 2.54e-02 0.17 0.0756 0.19 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0432 0.087 0.19 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 5.55e-01 0.0402 0.068 0.19 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0374 0.0605 0.19 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 8.55e-01 0.0123 0.0671 0.19 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 6.15e-01 0.0354 0.0701 0.19 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 7.27e-02 0.107 0.0596 0.19 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 9.97e-01 -0.0003 0.0719 0.19 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 4.95e-01 0.0788 0.115 0.19 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 6.64e-02 -0.141 0.0763 0.19 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00448 0.0677 0.19 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 1.52e-01 -0.0941 0.0654 0.19 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 8.13e-01 0.0192 0.081 0.19 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 2.35e-01 0.0915 0.0768 0.19 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 9.65e-01 0.00423 0.0968 0.19 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0186 0.103 0.194 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0325 0.122 0.194 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0338 0.0952 0.194 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 1.48e-01 0.0982 0.0677 0.194 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 9.92e-01 0.00106 0.11 0.194 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -703773 sc-eQTL 6.68e-01 0.0482 0.112 0.194 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -800434 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0593 0.0742 0.194 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00833 0.108 0.194 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 2.17e-01 0.0966 0.0781 0.19 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0663 0.097 0.19 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 2.28e-01 0.075 0.062 0.19 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 9.76e-01 0.00173 0.0573 0.19 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -202966 sc-eQTL 9.79e-01 0.00296 0.11 0.19 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0465 0.0771 0.19 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -703773 sc-eQTL 7.92e-01 0.0312 0.118 0.19 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -800434 sc-eQTL 2.24e-01 -0.127 0.104 0.19 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0653 0.0908 0.19 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 2.09e-02 0.25 0.107 0.189 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0582 0.0743 0.189 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 5.05e-01 0.0521 0.078 0.189 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 4.26e-01 0.0715 0.0897 0.189 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 3.60e-01 0.06 0.0654 0.189 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 6.18e-01 0.0504 0.101 0.189 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 2.99e-01 0.0967 0.0929 0.189 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 2.50e-01 0.0955 0.0828 0.19 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0395 0.0888 0.19 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 5.53e-02 -0.153 0.0792 0.19 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 6.67e-01 0.0282 0.0654 0.19 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0393 0.0874 0.19 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 2.81e-01 0.115 0.107 0.19 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00518 0.112 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 5.30e-01 0.082 0.13 0.196 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 4.73e-01 0.0945 0.131 0.196 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 8.86e-01 0.0176 0.122 0.196 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -17793 sc-eQTL 9.29e-01 0.00954 0.107 0.196 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 5.34e-01 0.0465 0.0745 0.196 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 7.87e-02 0.222 0.126 0.196 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 5.38e-01 0.0741 0.12 0.196 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 8.90e-01 0.0148 0.107 0.196 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0549 0.124 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 8.60e-01 0.0182 0.103 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 2.38e-01 0.115 0.0972 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -17793 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0489 0.101 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 4.05e-01 0.0519 0.0622 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0525 0.116 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 2.84e-01 0.0936 0.0872 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 7.91e-02 0.171 0.0971 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 2.58e-01 0.137 0.121 0.192 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0171 0.112 0.192 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0144 0.0971 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -17793 sc-eQTL 3.18e-02 -0.199 0.0919 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 7.06e-01 0.0311 0.0823 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 7.02e-01 0.0421 0.11 0.192 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 4.10e-01 0.0777 0.0941 0.192 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0489 0.11 0.192 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 3.63e-01 0.0996 0.109 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 2.91e-01 0.0998 0.0943 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 3.94e-01 0.0711 0.0832 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -17793 sc-eQTL 4.86e-05 -0.337 0.0813 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 7.76e-01 0.0161 0.0565 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 7.73e-01 0.0288 0.0996 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 5.08e-01 0.0492 0.0741 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 3.80e-03 0.263 0.0899 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 7.47e-01 0.0381 0.118 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 2.46e-02 -0.218 0.0961 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 2.89e-02 -0.207 0.0941 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -17793 sc-eQTL 1.36e-01 -0.136 0.0909 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 7.95e-01 0.0162 0.062 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 1.36e-01 0.168 0.112 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 8.26e-02 0.156 0.0897 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0388 0.0976 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0603 0.116 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0992 0.113 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 1.40e-01 0.164 0.111 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 4.16e-01 -0.081 0.0992 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0514 0.102 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 4.12e-01 0.0892 0.109 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 1.04e-01 -0.156 0.0953 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0237 0.0911 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 5.58e-01 0.0474 0.0807 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0474 0.0644 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 4.95e-01 0.0472 0.0691 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 4.42e-01 0.0583 0.0757 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 1.59e-01 0.0988 0.0698 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 4.10e-01 0.0664 0.0805 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 9.23e-01 0.0111 0.114 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0474 0.0918 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0162 0.0813 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00492 0.0674 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 4.07e-01 0.075 0.0902 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 1.47e-01 0.124 0.0851 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 2.32e-01 -0.114 0.095 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00228 0.113 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00655 0.108 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 5.15e-01 0.0583 0.0895 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 2.06e-01 0.115 0.0902 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0602 0.101 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 6.46e-01 0.0488 0.106 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 2.46e-01 -0.121 0.104 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0697 0.124 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 1.15e-01 -0.15 0.095 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0151 0.0928 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0684 0.103 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00766 0.0895 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 3.11e-01 0.109 0.108 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0675 0.101 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 2.01e-01 0.145 0.113 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 1.67e-01 -0.135 0.0976 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 7.34e-01 0.0268 0.0789 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 9.18e-01 0.00781 0.0756 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 4.99e-01 0.0711 0.105 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 6.79e-02 0.172 0.0936 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 6.36e-01 0.0487 0.103 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 4.06e-01 -0.109 0.131 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 4.97e-01 0.0815 0.12 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0957 0.113 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0287 0.118 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 9.09e-01 0.0138 0.121 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0621 0.109 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0659 0.11 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 1.93e-01 0.155 0.119 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 4.87e-01 0.0794 0.114 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0849 0.117 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00522 0.11 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 9.80e-01 0.0026 0.103 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 7.19e-01 0.0411 0.114 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 7.13e-01 -0.038 0.103 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 1.76e-01 0.164 0.121 0.19 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 8.84e-01 0.0157 0.107 0.19 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 5.87e-01 -0.056 0.103 0.19 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 3.24e-01 0.0957 0.0968 0.19 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0236 0.107 0.19 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00261 0.108 0.19 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0825 0.111 0.19 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 6.31e-01 0.0587 0.122 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0575 0.103 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 2.77e-01 0.118 0.108 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 3.80e-02 0.221 0.106 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0303 0.104 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 1.70e-01 0.147 0.107 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 1.74e-01 0.144 0.105 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 1.89e-01 0.152 0.116 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0878 0.0856 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 8.03e-01 0.022 0.0881 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0205 0.0939 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 6.14e-01 0.0422 0.0835 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 7.23e-01 0.0418 0.118 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 9.22e-01 0.00951 0.0971 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 5.63e-01 0.0705 0.122 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 9.61e-02 0.18 0.108 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 2.55e-01 -0.121 0.106 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 6.39e-01 0.0475 0.101 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 9.86e-01 -0.002 0.114 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0734 0.107 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 6.16e-01 0.0522 0.104 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 2.25e-01 0.136 0.111 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 5.07e-01 -0.058 0.0872 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 2.77e-01 0.103 0.0941 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 5.68e-01 0.0593 0.104 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00929 0.0885 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 7.20e-01 0.0395 0.11 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 3.43e-01 0.0972 0.102 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 1.79e-02 0.332 0.138 0.17 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0733 0.164 0.17 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0828 0.142 0.17 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -17793 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0469 0.133 0.17 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0562 0.0949 0.17 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 2.88e-01 -0.156 0.146 0.17 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 7.67e-01 0.0386 0.13 0.17 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 5.23e-01 0.0887 0.138 0.17 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0616 0.0898 0.189 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0372 0.114 0.189 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0417 0.106 0.189 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0529 0.0763 0.189 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 9.94e-01 0.000892 0.112 0.189 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0882 0.107 0.189 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0339 0.0981 0.189 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 5.62e-01 0.068 0.117 0.19 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 5.52e-01 0.0674 0.113 0.19 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0719 0.0904 0.19 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 9.37e-01 0.00821 0.104 0.19 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 9.93e-01 0.00104 0.112 0.19 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 3.96e-01 0.0897 0.105 0.19 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 3.71e-01 0.0944 0.105 0.19 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 3.88e-01 0.105 0.121 0.195 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0233 0.131 0.195 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 1.30e-01 -0.17 0.112 0.195 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 5.09e-02 0.153 0.078 0.195 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 8.50e-01 0.0216 0.114 0.195 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -703773 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0302 0.101 0.195 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -800434 sc-eQTL 1.91e-02 0.232 0.098 0.195 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 8.76e-01 0.0168 0.107 0.195 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 7.76e-02 0.166 0.0936 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0287 0.105 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 5.59e-01 0.0416 0.0711 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 7.91e-01 0.0166 0.0624 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -202966 sc-eQTL 9.97e-01 0.000494 0.118 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 7.23e-01 -0.034 0.0961 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -703773 sc-eQTL 7.41e-01 0.0394 0.119 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -800434 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0853 0.105 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0836 0.098 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 6.80e-01 0.0408 0.0988 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0495 0.117 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 2.43e-01 0.0984 0.0841 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 7.27e-01 0.0227 0.0648 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -202966 sc-eQTL 1.45e-01 0.163 0.111 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0891 0.101 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -703773 sc-eQTL 6.09e-01 0.0608 0.119 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -800434 sc-eQTL 2.95e-01 -0.101 0.0961 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 9.92e-01 0.000916 0.0968 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000758 0.149 0.194 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0296 0.128 0.194 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 8.65e-01 0.0225 0.132 0.194 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0652 0.144 0.194 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 3.66e-01 -0.119 0.131 0.194 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 2.32e-01 0.158 0.132 0.194 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0332 0.128 0.194 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 9.36e-02 0.188 0.112 0.191 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0798 0.121 0.191 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 2.69e-01 0.113 0.102 0.191 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 6.34e-01 0.0384 0.0806 0.191 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -202966 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0302 0.11 0.191 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 1.47e-01 0.168 0.115 0.191 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -703773 sc-eQTL 3.37e-01 -0.111 0.115 0.191 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -800434 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0914 0.109 0.191 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 5.25e-01 0.0696 0.109 0.191 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0477 0.101 0.195 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 2.18e-01 0.133 0.108 0.195 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 6.91e-02 0.16 0.0876 0.195 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0563 0.0802 0.195 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -202966 sc-eQTL 4.64e-01 -0.066 0.0899 0.195 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 1.56e-02 0.248 0.102 0.195 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -703773 sc-eQTL 7.22e-01 0.035 0.0982 0.195 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -800434 sc-eQTL 8.99e-01 0.0125 0.0981 0.195 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 1.48e-01 -0.147 0.101 0.195 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0749 0.115 0.198 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0379 0.127 0.198 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 1.50e-01 0.151 0.104 0.198 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 7.28e-01 0.034 0.0977 0.198 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 7.71e-01 0.037 0.127 0.198 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -703773 sc-eQTL 9.35e-01 0.00969 0.119 0.198 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -800434 sc-eQTL 7.13e-02 -0.165 0.091 0.198 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0345 0.108 0.198 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 5.10e-01 0.0777 0.118 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 8.15e-01 0.0229 0.0981 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 7.23e-01 0.0309 0.0869 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -17793 sc-eQTL 2.27e-01 -0.12 0.0988 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 2.33e-01 0.0743 0.0621 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0478 0.103 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 1.19e-01 0.128 0.0819 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 5.31e-01 0.0564 0.0897 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 6.35e-01 0.0508 0.107 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0312 0.0843 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0471 0.0797 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -17793 sc-eQTL 8.97e-05 -0.296 0.0741 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00307 0.0541 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 5.48e-01 0.0594 0.0987 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 4.12e-01 0.0573 0.0698 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 8.39e-02 0.143 0.0824 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 1.71e-01 0.123 0.0891 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0455 0.101 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 1.77e-01 0.0873 0.0644 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 7.29e-01 0.0197 0.0568 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -202966 sc-eQTL 4.57e-01 0.0864 0.116 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0949 0.0813 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -703773 sc-eQTL 6.68e-01 0.0513 0.119 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -800434 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0963 0.0976 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0307 0.0916 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 7.10e-01 0.0368 0.0988 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 6.84e-01 -0.044 0.108 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 2.49e-01 0.102 0.0883 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0196 0.0708 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -202966 sc-eQTL 2.75e-01 -0.113 0.103 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 1.03e-01 0.153 0.0934 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -703773 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0951 0.107 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -800434 sc-eQTL 4.50e-01 -0.077 0.102 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0692 0.102 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -590996 sc-eQTL 2.52e-02 0.244 0.108 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591190 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0522 0.0747 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -360199 sc-eQTL 6.69e-01 0.0351 0.0818 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 sc-eQTL 6.51e-01 0.0414 0.0915 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -939104 sc-eQTL 4.77e-01 0.0494 0.0694 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 sc-eQTL 8.03e-01 0.0264 0.106 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -25901 sc-eQTL 6.11e-01 0.0463 0.091 0.19 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162511 LAPTM5 -51982 eQTL 8.29e-05 -0.0446 0.0113 0.0 0.0 0.226
ENSG00000168528 SERINC2 -703773 eQTL 0.0226 0.1 0.0438 0.0 0.0 0.226
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 eQTL 1.16e-07 0.0755 0.0141 0.00258 0.00723 0.226

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12712 3.63e-05 3.46e-05 6.39e-06 1.62e-05 6.22e-06 1.63e-05 4.74e-05 5.66e-06 3.52e-05 1.73e-05 4.45e-05 1.94e-05 5.36e-05 1.5e-05 7.75e-06 2.14e-05 1.86e-05 2.69e-05 8.46e-06 7.53e-06 1.76e-05 3.5e-05 3.36e-05 9.9e-06 4.97e-05 8.74e-06 1.69e-05 1.43e-05 3.47e-05 2.85e-05 2.42e-05 1.71e-06 3.22e-06 7.58e-06 1.27e-05 6.44e-06 3.58e-06 3.5e-06 5.44e-06 3.61e-06 1.75e-06 4e-05 3.55e-06 4.16e-07 2.73e-06 4.85e-06 4.53e-06 2.06e-06 1.47e-06