logo

Genes within 1Mb (chr1:30705761:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 6.25e-01 0.0487 0.0996 0.19 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 9.53e-01 0.00473 0.0798 0.19 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 8.33e-01 0.0141 0.067 0.19 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -17824 sc-eQTL 2.40e-04 -0.255 0.0682 0.19 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 6.59e-01 0.0243 0.0551 0.19 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 4.10e-01 0.0687 0.0831 0.19 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 1.86e-01 0.0853 0.0644 0.19 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 2.54e-02 0.17 0.0756 0.19 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0432 0.087 0.19 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 5.55e-01 0.0402 0.068 0.19 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0374 0.0605 0.19 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 8.55e-01 0.0123 0.0671 0.19 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 6.15e-01 0.0354 0.0701 0.19 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 7.27e-02 0.107 0.0596 0.19 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 9.97e-01 -0.0003 0.0719 0.19 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 4.95e-01 0.0788 0.115 0.19 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 6.64e-02 -0.141 0.0763 0.19 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00448 0.0677 0.19 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 1.52e-01 -0.0941 0.0654 0.19 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 8.13e-01 0.0192 0.081 0.19 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 2.35e-01 0.0915 0.0768 0.19 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 9.65e-01 0.00423 0.0968 0.19 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0186 0.103 0.194 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0325 0.122 0.194 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0338 0.0952 0.194 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 1.48e-01 0.0982 0.0677 0.194 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 9.92e-01 0.00106 0.11 0.194 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -703804 sc-eQTL 6.68e-01 0.0482 0.112 0.194 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -800465 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0593 0.0742 0.194 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00833 0.108 0.194 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 2.17e-01 0.0966 0.0781 0.19 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0663 0.097 0.19 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 2.28e-01 0.075 0.062 0.19 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 9.76e-01 0.00173 0.0573 0.19 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -202997 sc-eQTL 9.79e-01 0.00296 0.11 0.19 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0465 0.0771 0.19 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -703804 sc-eQTL 7.92e-01 0.0312 0.118 0.19 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -800465 sc-eQTL 2.24e-01 -0.127 0.104 0.19 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0653 0.0908 0.19 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 2.09e-02 0.25 0.107 0.189 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0582 0.0743 0.189 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 5.05e-01 0.0521 0.078 0.189 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 4.26e-01 0.0715 0.0897 0.189 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 3.60e-01 0.06 0.0654 0.189 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 6.18e-01 0.0504 0.101 0.189 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 2.99e-01 0.0967 0.0929 0.189 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 2.50e-01 0.0955 0.0828 0.19 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0395 0.0888 0.19 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 5.53e-02 -0.153 0.0792 0.19 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 6.67e-01 0.0282 0.0654 0.19 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0393 0.0874 0.19 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 2.81e-01 0.115 0.107 0.19 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00518 0.112 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 5.30e-01 0.082 0.13 0.196 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 4.73e-01 0.0945 0.131 0.196 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 8.86e-01 0.0176 0.122 0.196 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -17824 sc-eQTL 9.29e-01 0.00954 0.107 0.196 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 5.34e-01 0.0465 0.0745 0.196 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 7.87e-02 0.222 0.126 0.196 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 5.38e-01 0.0741 0.12 0.196 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 8.90e-01 0.0148 0.107 0.196 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0549 0.124 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 8.60e-01 0.0182 0.103 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 2.38e-01 0.115 0.0972 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -17824 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0489 0.101 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 4.05e-01 0.0519 0.0622 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0525 0.116 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 2.84e-01 0.0936 0.0872 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 7.91e-02 0.171 0.0971 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 2.58e-01 0.137 0.121 0.192 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0171 0.112 0.192 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0144 0.0971 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -17824 sc-eQTL 3.18e-02 -0.199 0.0919 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 7.06e-01 0.0311 0.0823 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 7.02e-01 0.0421 0.11 0.192 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 4.10e-01 0.0777 0.0941 0.192 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0489 0.11 0.192 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 3.63e-01 0.0996 0.109 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 2.91e-01 0.0998 0.0943 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 3.94e-01 0.0711 0.0832 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -17824 sc-eQTL 4.86e-05 -0.337 0.0813 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 7.76e-01 0.0161 0.0565 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 7.73e-01 0.0288 0.0996 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 5.08e-01 0.0492 0.0741 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 3.80e-03 0.263 0.0899 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 7.47e-01 0.0381 0.118 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 2.46e-02 -0.218 0.0961 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 2.89e-02 -0.207 0.0941 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -17824 sc-eQTL 1.36e-01 -0.136 0.0909 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 7.95e-01 0.0162 0.062 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 1.36e-01 0.168 0.112 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 8.26e-02 0.156 0.0897 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0388 0.0976 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0603 0.116 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0992 0.113 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 1.40e-01 0.164 0.111 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 4.16e-01 -0.081 0.0992 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0514 0.102 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 4.12e-01 0.0892 0.109 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 1.04e-01 -0.156 0.0953 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0237 0.0911 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 5.58e-01 0.0474 0.0807 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0474 0.0644 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 4.95e-01 0.0472 0.0691 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 4.42e-01 0.0583 0.0757 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 1.59e-01 0.0988 0.0698 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 4.10e-01 0.0664 0.0805 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 9.23e-01 0.0111 0.114 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0474 0.0918 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0162 0.0813 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00492 0.0674 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 4.07e-01 0.075 0.0902 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 1.47e-01 0.124 0.0851 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 2.32e-01 -0.114 0.095 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00228 0.113 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00655 0.108 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 5.15e-01 0.0583 0.0895 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 2.06e-01 0.115 0.0902 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0602 0.101 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 6.46e-01 0.0488 0.106 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 2.46e-01 -0.121 0.104 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0697 0.124 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 1.15e-01 -0.15 0.095 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0151 0.0928 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0684 0.103 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00766 0.0895 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 3.11e-01 0.109 0.108 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0675 0.101 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 2.01e-01 0.145 0.113 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 1.67e-01 -0.135 0.0976 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 7.34e-01 0.0268 0.0789 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 9.18e-01 0.00781 0.0756 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 4.99e-01 0.0711 0.105 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 6.79e-02 0.172 0.0936 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 6.36e-01 0.0487 0.103 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 4.06e-01 -0.109 0.131 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 4.97e-01 0.0815 0.12 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0957 0.113 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0287 0.118 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 9.09e-01 0.0138 0.121 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0621 0.109 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0659 0.11 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 1.93e-01 0.155 0.119 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 4.87e-01 0.0794 0.114 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0849 0.117 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00522 0.11 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 9.80e-01 0.0026 0.103 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 7.19e-01 0.0411 0.114 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 7.13e-01 -0.038 0.103 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 1.76e-01 0.164 0.121 0.19 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 8.84e-01 0.0157 0.107 0.19 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 5.87e-01 -0.056 0.103 0.19 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 3.24e-01 0.0957 0.0968 0.19 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0236 0.107 0.19 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00261 0.108 0.19 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0825 0.111 0.19 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 6.31e-01 0.0587 0.122 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0575 0.103 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 2.77e-01 0.118 0.108 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 3.80e-02 0.221 0.106 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0303 0.104 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 1.70e-01 0.147 0.107 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 1.74e-01 0.144 0.105 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 1.89e-01 0.152 0.116 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0878 0.0856 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 8.03e-01 0.022 0.0881 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0205 0.0939 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 6.14e-01 0.0422 0.0835 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 7.23e-01 0.0418 0.118 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 9.22e-01 0.00951 0.0971 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 5.63e-01 0.0705 0.122 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 9.61e-02 0.18 0.108 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 2.55e-01 -0.121 0.106 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 6.39e-01 0.0475 0.101 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 9.86e-01 -0.002 0.114 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0734 0.107 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 6.16e-01 0.0522 0.104 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 2.25e-01 0.136 0.111 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 5.07e-01 -0.058 0.0872 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 2.77e-01 0.103 0.0941 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 5.68e-01 0.0593 0.104 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00929 0.0885 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 7.20e-01 0.0395 0.11 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 3.43e-01 0.0972 0.102 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 1.79e-02 0.332 0.138 0.17 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0733 0.164 0.17 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0828 0.142 0.17 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -17824 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0469 0.133 0.17 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0562 0.0949 0.17 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 2.88e-01 -0.156 0.146 0.17 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 7.67e-01 0.0386 0.13 0.17 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 5.23e-01 0.0887 0.138 0.17 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0616 0.0898 0.189 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0372 0.114 0.189 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0417 0.106 0.189 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0529 0.0763 0.189 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 9.94e-01 0.000892 0.112 0.189 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0882 0.107 0.189 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0339 0.0981 0.189 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 5.62e-01 0.068 0.117 0.19 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 5.52e-01 0.0674 0.113 0.19 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0719 0.0904 0.19 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 9.37e-01 0.00821 0.104 0.19 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 9.93e-01 0.00104 0.112 0.19 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 3.96e-01 0.0897 0.105 0.19 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 3.71e-01 0.0944 0.105 0.19 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 3.88e-01 0.105 0.121 0.195 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0233 0.131 0.195 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 1.30e-01 -0.17 0.112 0.195 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 5.09e-02 0.153 0.078 0.195 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 8.50e-01 0.0216 0.114 0.195 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -703804 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0302 0.101 0.195 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -800465 sc-eQTL 1.91e-02 0.232 0.098 0.195 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 8.76e-01 0.0168 0.107 0.195 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 7.76e-02 0.166 0.0936 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0287 0.105 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 5.59e-01 0.0416 0.0711 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 7.91e-01 0.0166 0.0624 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -202997 sc-eQTL 9.97e-01 0.000494 0.118 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 7.23e-01 -0.034 0.0961 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -703804 sc-eQTL 7.41e-01 0.0394 0.119 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -800465 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0853 0.105 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0836 0.098 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 6.80e-01 0.0408 0.0988 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0495 0.117 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 2.43e-01 0.0984 0.0841 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 7.27e-01 0.0227 0.0648 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -202997 sc-eQTL 1.45e-01 0.163 0.111 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0891 0.101 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -703804 sc-eQTL 6.09e-01 0.0608 0.119 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -800465 sc-eQTL 2.95e-01 -0.101 0.0961 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 9.92e-01 0.000916 0.0968 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000758 0.149 0.194 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0296 0.128 0.194 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 8.65e-01 0.0225 0.132 0.194 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0652 0.144 0.194 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 3.66e-01 -0.119 0.131 0.194 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 2.32e-01 0.158 0.132 0.194 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0332 0.128 0.194 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 9.36e-02 0.188 0.112 0.191 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0798 0.121 0.191 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 2.69e-01 0.113 0.102 0.191 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 6.34e-01 0.0384 0.0806 0.191 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -202997 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0302 0.11 0.191 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 1.47e-01 0.168 0.115 0.191 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -703804 sc-eQTL 3.37e-01 -0.111 0.115 0.191 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -800465 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0914 0.109 0.191 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 5.25e-01 0.0696 0.109 0.191 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0477 0.101 0.195 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 2.18e-01 0.133 0.108 0.195 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 6.91e-02 0.16 0.0876 0.195 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0563 0.0802 0.195 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -202997 sc-eQTL 4.64e-01 -0.066 0.0899 0.195 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 1.56e-02 0.248 0.102 0.195 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -703804 sc-eQTL 7.22e-01 0.035 0.0982 0.195 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -800465 sc-eQTL 8.99e-01 0.0125 0.0981 0.195 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 1.48e-01 -0.147 0.101 0.195 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0749 0.115 0.198 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0379 0.127 0.198 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 1.50e-01 0.151 0.104 0.198 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 7.28e-01 0.034 0.0977 0.198 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 7.71e-01 0.037 0.127 0.198 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -703804 sc-eQTL 9.35e-01 0.00969 0.119 0.198 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -800465 sc-eQTL 7.13e-02 -0.165 0.091 0.198 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0345 0.108 0.198 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 5.10e-01 0.0777 0.118 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 8.15e-01 0.0229 0.0981 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 7.23e-01 0.0309 0.0869 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -17824 sc-eQTL 2.27e-01 -0.12 0.0988 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 2.33e-01 0.0743 0.0621 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0478 0.103 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 1.19e-01 0.128 0.0819 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 5.31e-01 0.0564 0.0897 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 6.35e-01 0.0508 0.107 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0312 0.0843 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0471 0.0797 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -17824 sc-eQTL 8.97e-05 -0.296 0.0741 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00307 0.0541 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 5.48e-01 0.0594 0.0987 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 4.12e-01 0.0573 0.0698 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 8.39e-02 0.143 0.0824 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 1.71e-01 0.123 0.0891 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0455 0.101 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 1.77e-01 0.0873 0.0644 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 7.29e-01 0.0197 0.0568 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -202997 sc-eQTL 4.57e-01 0.0864 0.116 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0949 0.0813 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -703804 sc-eQTL 6.68e-01 0.0513 0.119 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -800465 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0963 0.0976 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0307 0.0916 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 7.10e-01 0.0368 0.0988 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 6.84e-01 -0.044 0.108 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 2.49e-01 0.102 0.0883 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0196 0.0708 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -202997 sc-eQTL 2.75e-01 -0.113 0.103 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 1.03e-01 0.153 0.0934 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -703804 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0951 0.107 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -800465 sc-eQTL 4.50e-01 -0.077 0.102 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0692 0.102 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -591027 sc-eQTL 2.52e-02 0.244 0.108 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -591221 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0522 0.0747 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -360230 sc-eQTL 6.69e-01 0.0351 0.0818 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 sc-eQTL 6.51e-01 0.0414 0.0915 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -939135 sc-eQTL 4.77e-01 0.0494 0.0694 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 sc-eQTL 8.03e-01 0.0264 0.106 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -25932 sc-eQTL 6.11e-01 0.0463 0.091 0.19 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162511 LAPTM5 -52013 eQTL 8.46e-05 -0.0446 0.0113 0.0 0.0 0.226
ENSG00000168528 SERINC2 -703804 eQTL 0.0232 0.0998 0.0439 0.0 0.0 0.226
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 eQTL 1.11e-07 0.0756 0.0141 0.00266 0.00751 0.226

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -12743 3.12e-05 2.48e-05 4.87e-06 1.28e-05 4.22e-06 1.09e-05 3.43e-05 3.72e-06 2.31e-05 1.19e-05 2.88e-05 1.08e-05 3.78e-05 1.05e-05 5.81e-06 1.4e-05 1.17e-05 2.03e-05 6.27e-06 5.35e-06 1.12e-05 2.57e-05 2.39e-05 6.97e-06 3.36e-05 6.16e-06 1.02e-05 9.24e-06 2.52e-05 1.95e-05 1.54e-05 1.64e-06 2.15e-06 5.67e-06 9.01e-06 4.5e-06 2.37e-06 2.82e-06 3.71e-06 2.73e-06 1.63e-06 3.02e-05 2.88e-06 2.66e-07 2.07e-06 2.85e-06 3.35e-06 1.52e-06 1.4e-06