logo

Genes within 1Mb (chr1:30698826:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 1.31e-01 -0.189 0.125 0.098 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 3.02e-01 -0.104 0.1 0.098 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0274 0.0842 0.098 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -24759 sc-eQTL 7.05e-01 0.0336 0.0886 0.098 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 4.28e-01 0.0551 0.0693 0.098 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00801 0.105 0.098 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0115 0.0813 0.098 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0137 0.0962 0.098 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 3.45e-01 -0.101 0.107 0.098 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0488 0.0837 0.098 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 1.40e-01 0.11 0.0742 0.098 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 8.75e-02 0.141 0.082 0.098 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 7.90e-01 0.0231 0.0864 0.098 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 4.14e-02 -0.15 0.0732 0.098 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 5.00e-01 0.0598 0.0884 0.098 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0557 0.14 0.098 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 4.84e-02 -0.183 0.092 0.098 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 4.39e-03 0.231 0.0802 0.098 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 1.52e-03 0.249 0.0775 0.098 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 5.96e-01 0.0519 0.0978 0.098 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0834 0.0929 0.098 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 3.05e-02 0.252 0.116 0.098 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0721 0.126 0.099 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0588 0.149 0.099 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 1.39e-02 -0.285 0.115 0.099 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 5.97e-01 0.0441 0.0832 0.099 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 6.77e-01 0.0563 0.135 0.099 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -710739 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00807 0.137 0.099 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -807400 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0263 0.091 0.099 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 4.24e-01 0.105 0.132 0.099 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 9.78e-01 0.00271 0.0967 0.098 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 8.45e-01 0.0235 0.12 0.098 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0344 0.0768 0.098 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000512 0.0707 0.098 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -209932 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0837 0.136 0.098 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 9.69e-01 0.00369 0.0953 0.098 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -710739 sc-eQTL 4.56e-01 0.109 0.146 0.098 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -807400 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0679 0.128 0.098 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 8.80e-02 0.191 0.111 0.098 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 2.48e-01 0.153 0.133 0.099 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0571 0.0909 0.099 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00452 0.0955 0.099 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 3.87e-05 0.444 0.105 0.099 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 4.74e-01 0.0574 0.0801 0.099 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0712 0.123 0.099 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 3.87e-02 0.235 0.113 0.099 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 2.78e-01 0.109 0.1 0.098 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0986 0.107 0.098 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 6.14e-01 0.0488 0.0966 0.098 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 1.83e-01 0.105 0.0789 0.098 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0147 0.106 0.098 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 4.06e-01 -0.108 0.129 0.098 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 1.36e-01 0.201 0.134 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 3.02e-01 -0.174 0.168 0.089 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 4.63e-01 -0.125 0.169 0.089 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 4.41e-01 -0.121 0.157 0.089 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -24759 sc-eQTL 1.55e-01 0.196 0.137 0.089 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00378 0.0961 0.089 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0839 0.163 0.089 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0794 0.155 0.089 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 8.35e-01 0.0287 0.137 0.089 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 2.52e-01 -0.173 0.151 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0612 0.126 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0453 0.119 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -24759 sc-eQTL 1.50e-01 -0.178 0.123 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 1.30e-01 0.115 0.0755 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 1.29e-01 0.214 0.14 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0146 0.107 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 7.50e-01 0.0381 0.119 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 1.42e-01 -0.217 0.148 0.097 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 8.52e-01 0.0255 0.137 0.097 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 9.09e-01 0.0135 0.119 0.097 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -24759 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0488 0.114 0.097 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0776 0.101 0.097 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 3.50e-01 0.126 0.134 0.097 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0613 0.115 0.097 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 1.96e-01 0.175 0.135 0.097 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 8.84e-01 0.0199 0.137 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 1.20e-01 -0.183 0.117 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 2.40e-01 0.122 0.104 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -24759 sc-eQTL 2.42e-01 0.123 0.105 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 2.69e-01 0.0779 0.0703 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 8.32e-01 0.0264 0.124 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0265 0.0926 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 8.95e-01 0.0151 0.114 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 1.03e-02 -0.366 0.141 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 5.39e-01 0.0728 0.118 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 1.92e-01 -0.151 0.115 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -24759 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0194 0.111 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 3.61e-01 0.0691 0.0754 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 2.70e-01 -0.152 0.137 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 2.57e-01 -0.125 0.11 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 5.32e-01 0.0744 0.119 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 4.23e-02 0.287 0.141 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 2.96e-01 -0.146 0.139 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0964 0.137 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 6.38e-03 0.331 0.12 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 6.02e-01 0.0654 0.125 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0306 0.134 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 9.77e-01 0.00337 0.118 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 1.67e-01 -0.153 0.111 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 8.16e-01 -0.023 0.0986 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 2.67e-01 0.0874 0.0785 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 1.77e-01 0.114 0.084 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0674 0.0924 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 7.89e-02 -0.15 0.085 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0639 0.0982 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 3.11e-01 -0.142 0.14 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 2.35e-01 -0.134 0.113 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 2.74e-02 0.22 0.099 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 2.94e-02 0.18 0.0821 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 7.60e-01 0.034 0.111 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 1.08e-01 -0.169 0.105 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 5.13e-02 0.228 0.116 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 3.78e-01 -0.122 0.139 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 5.22e-01 0.0848 0.132 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 1.26e-01 0.168 0.11 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 1.26e-02 0.276 0.11 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000155 0.125 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 7.16e-01 0.0475 0.13 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 3.81e-01 -0.113 0.128 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0963 0.151 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0166 0.116 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 5.36e-01 0.0695 0.112 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 7.39e-03 0.33 0.122 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 9.36e-02 0.181 0.107 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 1.29e-01 -0.198 0.13 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 8.77e-02 0.209 0.122 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 1.52e-01 -0.198 0.138 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 6.91e-02 -0.217 0.119 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 2.13e-02 0.221 0.0951 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 7.64e-03 0.244 0.0907 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 2.91e-01 -0.135 0.128 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 3.07e-01 -0.118 0.115 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 9.77e-01 0.00357 0.125 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 5.12e-01 0.101 0.154 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 4.12e-01 -0.116 0.141 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 2.42e-01 0.155 0.132 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 1.09e-01 0.222 0.138 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0144 0.142 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 9.43e-02 -0.215 0.128 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0117 0.13 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 4.93e-01 0.099 0.144 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0563 0.138 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 4.33e-01 0.111 0.141 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 4.15e-02 0.27 0.132 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0168 0.125 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 1.05e-01 0.223 0.137 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00798 0.125 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00313 0.148 0.1 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0735 0.131 0.1 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 5.34e-01 0.0784 0.126 0.1 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 1.85e-02 0.278 0.117 0.1 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0507 0.13 0.1 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 4.09e-01 -0.109 0.132 0.1 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 7.02e-01 0.0522 0.136 0.1 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 9.64e-01 0.00683 0.151 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0671 0.127 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 8.99e-01 0.017 0.134 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 2.76e-01 0.143 0.131 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 8.08e-01 0.0311 0.128 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 4.91e-01 0.0912 0.132 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 1.66e-01 -0.181 0.13 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 5.14e-01 0.0919 0.141 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 5.71e-01 0.0591 0.104 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 9.19e-01 0.0109 0.107 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 6.01e-05 0.449 0.11 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 1.70e-01 0.139 0.101 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 3.59e-01 -0.131 0.142 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 2.00e-02 0.272 0.116 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 2.80e-01 0.162 0.15 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 5.76e-02 -0.254 0.133 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 2.99e-02 -0.282 0.129 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 4.18e-05 0.501 0.119 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 4.01e-01 -0.118 0.14 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0811 0.133 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 2.01e-03 0.392 0.125 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 2.82e-01 0.148 0.137 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 7.15e-01 0.0393 0.108 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 9.15e-01 0.0124 0.116 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 9.83e-04 0.417 0.125 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 7.36e-01 0.0368 0.109 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 5.85e-01 0.0741 0.136 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 7.99e-01 0.0321 0.126 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 2.83e-01 -0.191 0.177 0.089 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 9.04e-01 0.0248 0.206 0.089 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 3.96e-01 0.152 0.178 0.089 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -24759 sc-eQTL 2.88e-01 -0.177 0.166 0.089 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 7.30e-01 0.0413 0.119 0.089 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 8.10e-01 0.0441 0.183 0.089 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00365 0.163 0.089 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 4.38e-01 0.135 0.173 0.089 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 3.98e-01 0.0939 0.111 0.098 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 7.40e-02 -0.251 0.14 0.098 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 4.83e-02 0.259 0.13 0.098 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 8.67e-01 0.0158 0.0943 0.098 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 2.85e-03 -0.409 0.135 0.098 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 2.80e-01 0.142 0.131 0.098 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 3.13e-01 0.122 0.121 0.098 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 2.49e-01 0.167 0.144 0.098 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 6.55e-02 0.257 0.139 0.098 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 9.02e-01 0.0138 0.112 0.098 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 7.89e-03 0.338 0.126 0.098 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 1.95e-01 -0.179 0.138 0.098 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 3.07e-01 -0.134 0.13 0.098 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 3.91e-01 0.112 0.13 0.098 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 7.18e-01 0.0528 0.146 0.102 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 5.18e-01 -0.102 0.158 0.102 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 4.36e-01 -0.106 0.136 0.102 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 5.14e-01 0.0622 0.0953 0.102 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 3.15e-01 0.139 0.138 0.102 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -710739 sc-eQTL 8.76e-01 0.0191 0.122 0.102 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -807400 sc-eQTL 8.88e-02 -0.204 0.119 0.102 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 4.08e-01 0.107 0.129 0.102 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 6.15e-01 -0.059 0.117 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 8.78e-01 0.02 0.131 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0506 0.0884 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00367 0.0777 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -209932 sc-eQTL 5.89e-01 0.079 0.146 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 4.40e-01 0.0923 0.119 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -710739 sc-eQTL 2.12e-01 0.185 0.148 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -807400 sc-eQTL 3.88e-01 -0.113 0.131 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 6.27e-02 0.227 0.121 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 4.56e-01 0.0909 0.122 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 4.74e-01 -0.103 0.144 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 8.40e-01 -0.021 0.104 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0662 0.0799 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -209932 sc-eQTL 3.13e-01 -0.14 0.138 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0989 0.125 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -710739 sc-eQTL 7.39e-01 0.0488 0.146 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -807400 sc-eQTL 2.49e-01 -0.137 0.119 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 6.96e-01 0.0467 0.119 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 8.59e-01 0.0319 0.18 0.106 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 6.87e-01 0.0623 0.154 0.106 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 4.16e-01 -0.13 0.159 0.106 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 1.64e-01 0.24 0.172 0.106 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 7.97e-01 0.0408 0.158 0.106 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 4.49e-01 -0.121 0.159 0.106 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0545 0.155 0.106 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 4.47e-01 0.103 0.135 0.1 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 1.47e-01 0.211 0.145 0.1 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 8.53e-02 -0.212 0.122 0.1 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 2.00e-01 0.124 0.0963 0.1 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -209932 sc-eQTL 1.87e-01 -0.175 0.132 0.1 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 4.88e-02 0.273 0.138 0.1 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -710739 sc-eQTL 4.36e-02 0.279 0.137 0.1 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -807400 sc-eQTL 9.51e-02 0.219 0.13 0.1 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 4.31e-01 0.104 0.131 0.1 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0552 0.128 0.097 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 2.13e-01 0.17 0.136 0.097 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 3.61e-01 -0.102 0.111 0.097 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0527 0.101 0.097 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -209932 sc-eQTL 7.03e-01 0.0433 0.113 0.097 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0952 0.13 0.097 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -710739 sc-eQTL 1.96e-01 0.16 0.123 0.097 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -807400 sc-eQTL 6.70e-01 0.0528 0.124 0.097 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 1.71e-01 0.175 0.127 0.097 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 1.57e-01 -0.202 0.142 0.105 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 7.70e-01 0.046 0.157 0.105 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 3.03e-01 -0.134 0.13 0.105 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0434 0.121 0.105 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 6.38e-01 0.0741 0.157 0.105 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -710739 sc-eQTL 2.15e-01 0.182 0.146 0.105 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -807400 sc-eQTL 7.32e-01 0.0391 0.114 0.105 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0754 0.134 0.105 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 3.86e-02 -0.295 0.142 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0325 0.119 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0306 0.105 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -24759 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0868 0.12 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0152 0.0755 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 9.76e-02 0.207 0.124 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0959 0.0997 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 4.63e-01 0.0799 0.109 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 2.33e-01 -0.158 0.132 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 3.65e-01 -0.095 0.105 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 9.59e-01 0.00512 0.0992 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -24759 sc-eQTL 3.54e-01 0.0885 0.0953 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 2.41e-01 0.0787 0.067 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0113 0.123 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0247 0.0868 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0258 0.103 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 7.97e-01 0.0286 0.111 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0279 0.126 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0223 0.0801 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0156 0.0704 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -209932 sc-eQTL 9.99e-01 0.000153 0.144 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 9.57e-01 0.00542 0.101 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -710739 sc-eQTL 4.37e-01 0.115 0.148 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -807400 sc-eQTL 1.80e-01 -0.162 0.121 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 1.78e-01 0.153 0.113 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 8.00e-01 0.0309 0.122 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 1.26e-01 0.203 0.132 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 5.66e-02 -0.207 0.108 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 9.03e-01 0.0106 0.0873 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -209932 sc-eQTL 1.57e-01 -0.18 0.127 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 9.86e-01 0.00199 0.116 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -710739 sc-eQTL 8.67e-02 0.226 0.131 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -807400 sc-eQTL 2.57e-01 0.142 0.125 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 1.27e-01 0.192 0.125 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -597962 sc-eQTL 1.63e-01 0.187 0.133 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0188 0.0915 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -367165 sc-eQTL 9.72e-01 0.00347 0.1 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 sc-eQTL 2.36e-05 0.464 0.107 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -946070 sc-eQTL 4.31e-01 0.0671 0.085 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -19678 sc-eQTL 4.38e-01 -0.1 0.129 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -32867 sc-eQTL 5.61e-04 0.38 0.108 0.099 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 eQTL 4.90e-02 -0.0645 0.0327 0.0 0.0 0.0716
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 eQTL 1.52e-06 0.0883 0.0182 0.0 0.0 0.0716
ENSG00000162512 SDC3 -209932 eQTL 0.00855 -0.119 0.0453 0.0 0.0 0.0716

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000121766 ZCCHC17 -598156 3.71e-07 1.83e-07 6.86e-08 2.25e-07 1.07e-07 8.85e-08 2.86e-07 5.89e-08 1.89e-07 1.11e-07 2.18e-07 1.72e-07 2.94e-07 8.54e-08 6.93e-08 1.06e-07 5.42e-08 2.21e-07 7.76e-08 6.73e-08 1.23e-07 1.89e-07 1.86e-07 4.34e-08 2.59e-07 1.56e-07 1.29e-07 1.36e-07 1.36e-07 2.02e-07 1.43e-07 4.71e-08 4.27e-08 1.01e-07 4.04e-08 4.6e-08 6.14e-08 7.61e-08 5.78e-08 7.17e-08 4.53e-08 2.19e-07 3.13e-08 1.07e-08 5.49e-08 8.31e-09 7.12e-08 0.0 4.68e-08
ENSG00000162511 LAPTM5 -58948 8.18e-06 9.91e-06 1.58e-06 5.34e-06 2.43e-06 4.24e-06 1.09e-05 1.92e-06 9.4e-06 5.03e-06 1.24e-05 5.44e-06 1.53e-05 3.54e-06 2.82e-06 6.34e-06 4.66e-06 7.79e-06 2.93e-06 2.79e-06 5.26e-06 9.17e-06 8.08e-06 3.39e-06 1.42e-05 4.12e-06 4.68e-06 3.97e-06 1.03e-05 1.05e-05 5.54e-06 1.09e-06 1.22e-06 3.49e-06 4.59e-06 2.83e-06 1.82e-06 1.95e-06 2.11e-06 1.23e-06 9.34e-07 1.3e-05 1.43e-06 2.01e-07 7.68e-07 1.73e-06 1.66e-06 7.37e-07 5.02e-07
ENSG00000162512 SDC3 -209932 1.89e-06 2.35e-06 2.8e-07 1.35e-06 4.83e-07 7.12e-07 1.3e-06 3.78e-07 1.78e-06 7.54e-07 1.86e-06 1.47e-06 3.07e-06 9.33e-07 4.02e-07 1.1e-06 1.13e-06 1.34e-06 5.76e-07 7.68e-07 6.39e-07 1.94e-06 1.71e-06 9.82e-07 2.56e-06 1.07e-06 1.01e-06 1.05e-06 1.66e-06 1.79e-06 9.07e-07 2.81e-07 3.79e-07 8.83e-07 7.4e-07 7.22e-07 7.35e-07 3.45e-07 6.79e-07 2.23e-07 3.3e-07 2.89e-06 4.07e-07 1.74e-07 3.38e-07 3.04e-07 3.8e-07 2.24e-07 2.23e-07