logo

Genes within 1Mb (chr1:30695151:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 7.38e-01 0.0419 0.125 0.1 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0399 0.1 0.1 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 7.81e-02 0.148 0.0834 0.1 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -28434 sc-eQTL 1.88e-01 0.116 0.088 0.1 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 9.55e-01 0.00388 0.0692 0.1 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 8.56e-01 0.0189 0.104 0.1 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0557 0.081 0.1 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 5.25e-01 0.0611 0.0959 0.1 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0908 0.107 0.1 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 5.91e-02 0.157 0.0828 0.1 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 4.18e-01 0.0602 0.0742 0.1 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 7.07e-01 -0.031 0.0823 0.1 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 3.50e-01 0.0805 0.0859 0.1 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0966 0.0733 0.1 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0061 0.0882 0.1 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 7.21e-01 0.0509 0.143 0.1 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 1.87e-01 0.125 0.0945 0.1 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 6.95e-01 0.0328 0.0835 0.1 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 9.19e-01 0.00822 0.0811 0.1 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 5.89e-01 0.0541 0.0998 0.1 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 3.20e-02 -0.203 0.094 0.1 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0124 0.119 0.1 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 3.59e-01 0.127 0.138 0.092 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 2.13e-02 0.374 0.161 0.092 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0581 0.128 0.092 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 2.40e-02 -0.205 0.0901 0.092 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 4.64e-01 -0.109 0.148 0.092 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -714414 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0767 0.15 0.092 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -811075 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0401 0.0997 0.092 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 4.67e-01 -0.105 0.144 0.092 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 8.82e-01 0.0149 0.1 0.1 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 3.25e-01 0.122 0.124 0.1 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 9.69e-01 0.00307 0.0796 0.1 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 2.49e-01 0.0843 0.073 0.1 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -213607 sc-eQTL 6.14e-01 -0.071 0.141 0.1 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 1.48e-01 0.143 0.0982 0.1 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -714414 sc-eQTL 7.76e-01 0.0431 0.151 0.1 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -811075 sc-eQTL 2.78e-01 -0.144 0.133 0.1 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0657 0.116 0.1 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 3.78e-03 -0.39 0.133 0.101 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 3.35e-01 0.0896 0.0927 0.101 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 4.21e-01 0.0784 0.0973 0.101 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 1.67e-01 -0.155 0.112 0.101 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 1.31e-01 -0.124 0.0814 0.101 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 3.00e-02 -0.272 0.125 0.101 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0623 0.116 0.101 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0557 0.105 0.1 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 5.39e-01 0.069 0.112 0.1 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 8.41e-01 0.0203 0.101 0.1 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 1.08e-01 -0.132 0.0822 0.1 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 6.64e-01 -0.048 0.11 0.1 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 3.74e-01 -0.12 0.135 0.1 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 4.70e-01 0.102 0.141 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 2.09e-01 -0.213 0.169 0.094 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 1.59e-01 -0.241 0.17 0.094 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 4.28e-01 0.126 0.159 0.094 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -28434 sc-eQTL 5.48e-01 0.0836 0.139 0.094 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 6.89e-01 0.0388 0.0969 0.094 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 5.61e-01 0.096 0.165 0.094 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 6.12e-01 0.0795 0.156 0.094 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 1.29e-01 0.21 0.138 0.094 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 1.95e-01 0.207 0.159 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 5.16e-01 0.0866 0.133 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 7.35e-01 0.0425 0.126 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -28434 sc-eQTL 3.52e-01 0.122 0.13 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 6.93e-01 0.0317 0.0802 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 9.37e-01 0.0118 0.149 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0561 0.113 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 7.33e-02 -0.225 0.125 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 6.79e-01 0.0657 0.159 0.101 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 7.05e-01 0.0554 0.146 0.101 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0659 0.127 0.101 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -28434 sc-eQTL 8.66e-01 0.0205 0.122 0.101 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 1.70e-01 0.148 0.107 0.101 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 2.31e-01 -0.172 0.144 0.101 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0899 0.123 0.101 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0505 0.145 0.101 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0717 0.138 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 8.25e-02 -0.206 0.118 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 4.46e-01 0.0799 0.105 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -28434 sc-eQTL 4.59e-01 0.0789 0.106 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 9.41e-01 0.00523 0.0711 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 4.97e-02 0.245 0.124 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0886 0.0932 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 3.78e-01 0.102 0.115 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 7.21e-01 0.0526 0.147 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 2.81e-01 0.131 0.121 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 5.81e-02 0.225 0.118 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -28434 sc-eQTL 9.07e-01 0.0134 0.114 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 2.32e-01 0.0926 0.0773 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 4.16e-01 -0.115 0.141 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 5.35e-02 -0.217 0.112 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 6.38e-01 0.0575 0.122 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 1.90e-01 -0.19 0.144 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 5.67e-01 0.0817 0.142 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 6.52e-01 -0.063 0.14 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 2.44e-01 -0.145 0.124 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 7.17e-01 0.0463 0.128 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0948 0.136 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0216 0.12 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 7.44e-01 0.037 0.113 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 4.22e-01 0.0806 0.1 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 1.29e-01 0.122 0.0798 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0281 0.086 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 2.11e-01 0.118 0.0939 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0551 0.0872 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00237 0.1 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0664 0.14 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 1.42e-01 0.166 0.113 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0523 0.1 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 9.06e-01 0.00987 0.0831 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 5.93e-01 0.0596 0.111 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 1.27e-01 -0.161 0.105 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 5.29e-02 -0.227 0.116 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0953 0.142 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 8.35e-01 0.0283 0.136 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0693 0.113 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0192 0.114 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 1.17e-01 0.2 0.127 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 3.07e-01 -0.137 0.133 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 2.99e-01 0.137 0.131 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 2.20e-01 0.191 0.155 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 1.19e-01 0.186 0.119 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 5.99e-01 -0.061 0.116 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 3.52e-01 -0.12 0.128 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 3.14e-01 0.113 0.112 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 1.51e-01 -0.194 0.134 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 9.75e-01 0.00399 0.127 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 1.47e-01 -0.204 0.14 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 6.33e-01 0.058 0.121 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0089 0.0978 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 7.76e-01 0.0267 0.0937 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 2.67e-01 -0.145 0.13 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 6.18e-02 -0.218 0.116 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 4.20e-01 -0.103 0.127 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0297 0.171 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 2.25e-01 -0.19 0.156 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 9.32e-01 0.0126 0.147 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0434 0.154 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 6.14e-01 0.0796 0.158 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 5.70e-01 0.0812 0.143 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0877 0.144 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0143 0.152 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 5.36e-01 0.0899 0.145 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0837 0.148 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 8.80e-01 0.021 0.14 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 2.28e-01 0.158 0.131 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 1.63e-01 -0.202 0.144 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 3.07e-01 -0.134 0.131 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0155 0.154 0.1 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0939 0.136 0.1 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0357 0.131 0.1 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 3.80e-02 -0.255 0.122 0.1 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0721 0.135 0.1 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0249 0.137 0.1 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 2.59e-01 0.159 0.141 0.1 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 2.18e-01 -0.19 0.153 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 1.49e-01 0.187 0.13 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0462 0.137 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0505 0.135 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0886 0.131 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 7.29e-02 0.242 0.134 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 3.56e-01 0.123 0.133 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 3.69e-02 -0.305 0.145 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 1.69e-01 0.149 0.108 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 3.96e-01 0.0943 0.111 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 3.72e-01 -0.106 0.118 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0826 0.105 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 4.21e-02 -0.301 0.147 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 3.67e-01 -0.111 0.122 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 1.37e-01 -0.224 0.15 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00225 0.135 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 5.58e-01 0.0768 0.131 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 6.84e-02 -0.227 0.124 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 2.38e-01 -0.166 0.14 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 9.98e-01 0.000293 0.133 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 3.91e-01 -0.111 0.128 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 3.63e-01 -0.128 0.14 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 4.12e-01 0.0898 0.109 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 6.23e-01 0.0582 0.118 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 4.08e-01 -0.108 0.13 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0979 0.111 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 1.36e-01 -0.206 0.137 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00979 0.128 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0676 0.156 0.111 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 6.60e-01 0.0797 0.181 0.111 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 2.86e-01 0.168 0.157 0.111 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -28434 sc-eQTL 5.72e-01 0.0829 0.147 0.111 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0642 0.105 0.111 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 2.41e-01 0.189 0.16 0.111 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 4.24e-01 -0.115 0.143 0.111 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0304 0.153 0.111 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 9.62e-01 0.00554 0.115 0.1 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 2.80e-01 0.158 0.146 0.1 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 1.63e-01 0.19 0.136 0.1 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 1.52e-01 0.14 0.0973 0.1 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 3.51e-02 0.301 0.142 0.1 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 3.58e-01 -0.126 0.136 0.1 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 5.10e-01 0.0828 0.126 0.1 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 6.67e-01 0.063 0.146 0.1 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 5.23e-01 0.0905 0.141 0.1 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0447 0.113 0.1 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 2.61e-01 -0.146 0.129 0.1 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 4.52e-02 -0.279 0.139 0.1 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 2.50e-01 -0.152 0.132 0.1 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0511 0.132 0.1 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0286 0.163 0.09 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 3.97e-01 -0.149 0.176 0.09 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 9.36e-01 0.0122 0.151 0.09 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0108 0.106 0.09 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 2.90e-01 -0.163 0.153 0.09 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -714414 sc-eQTL 5.03e-01 0.0913 0.136 0.09 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -811075 sc-eQTL 7.00e-01 0.0516 0.134 0.09 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 7.17e-01 0.0522 0.144 0.09 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 2.91e-01 -0.128 0.12 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 2.64e-01 0.151 0.134 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 2.23e-01 -0.111 0.0909 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 1.65e-01 0.111 0.0797 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -213607 sc-eQTL 5.15e-01 0.0982 0.151 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0641 0.123 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -714414 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0383 0.153 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -811075 sc-eQTL 2.59e-01 -0.152 0.135 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 5.45e-01 0.0763 0.126 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 3.68e-01 -0.116 0.129 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0581 0.152 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 1.32e-01 0.166 0.11 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 7.09e-01 0.0316 0.0847 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -213607 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0711 0.146 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 1.11e-01 0.21 0.131 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -714414 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0148 0.155 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -811075 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0387 0.126 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0518 0.126 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 6.02e-01 -0.103 0.196 0.088 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 8.92e-01 -0.023 0.169 0.088 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 6.24e-01 0.0853 0.174 0.088 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0294 0.189 0.088 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 4.97e-01 0.117 0.173 0.088 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 2.41e-01 -0.204 0.174 0.088 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 8.30e-01 0.0364 0.169 0.088 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 1.40e-01 -0.215 0.145 0.093 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 6.88e-01 0.0631 0.157 0.093 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00241 0.133 0.093 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 4.09e-01 0.0864 0.104 0.093 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -213607 sc-eQTL 9.96e-01 0.000662 0.143 0.093 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 4.42e-01 -0.116 0.15 0.093 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -714414 sc-eQTL 2.35e-01 0.178 0.149 0.093 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -811075 sc-eQTL 9.42e-01 0.0103 0.142 0.093 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 7.18e-02 -0.255 0.141 0.093 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 3.12e-01 0.142 0.14 0.093 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0304 0.15 0.093 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 3.47e-01 0.115 0.122 0.093 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0741 0.111 0.093 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -213607 sc-eQTL 5.36e-01 0.0772 0.125 0.093 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0287 0.143 0.093 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -714414 sc-eQTL 9.66e-01 0.00585 0.136 0.093 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -811075 sc-eQTL 2.49e-01 -0.157 0.136 0.093 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 2.95e-01 -0.148 0.141 0.093 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 4.94e-01 0.108 0.158 0.085 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 1.87e-02 0.406 0.171 0.085 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 6.75e-02 -0.262 0.143 0.085 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 2.07e-01 -0.169 0.133 0.085 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 7.30e-01 0.0601 0.174 0.085 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -714414 sc-eQTL 4.05e-02 -0.331 0.16 0.085 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -811075 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00828 0.126 0.085 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 4.80e-01 0.105 0.148 0.085 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 7.31e-01 0.0528 0.153 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 3.14e-01 0.129 0.127 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 8.34e-01 0.0237 0.113 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -28434 sc-eQTL 2.01e-01 0.165 0.128 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 9.05e-01 0.00963 0.081 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0152 0.134 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0775 0.107 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 1.95e-01 -0.151 0.116 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0233 0.134 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0665 0.106 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 3.72e-01 0.0895 0.1 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -28434 sc-eQTL 5.34e-01 0.06 0.0964 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 8.18e-01 0.0156 0.0679 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 1.33e-01 0.186 0.123 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0939 0.0875 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 1.67e-01 0.144 0.104 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0691 0.114 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 4.98e-01 0.0873 0.129 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00569 0.0822 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 2.15e-01 0.0895 0.0719 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -213607 sc-eQTL 9.51e-01 0.00908 0.147 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 2.77e-01 0.113 0.103 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -714414 sc-eQTL 8.68e-01 0.0252 0.152 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -811075 sc-eQTL 1.83e-01 -0.165 0.124 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00372 0.116 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00809 0.128 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 2.16e-01 0.174 0.14 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 5.46e-01 0.0696 0.115 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 4.13e-01 0.0755 0.092 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -213607 sc-eQTL 5.25e-01 0.0856 0.134 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 9.67e-01 0.00501 0.122 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -714414 sc-eQTL 3.30e-01 0.136 0.139 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -811075 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0599 0.132 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 4.86e-02 -0.261 0.131 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -601637 sc-eQTL 6.27e-03 -0.371 0.134 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -601831 sc-eQTL 4.00e-01 0.0788 0.0933 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -370840 sc-eQTL 3.43e-01 0.0972 0.102 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 sc-eQTL 1.50e-01 -0.165 0.114 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -949745 sc-eQTL 2.40e-01 -0.102 0.0867 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 sc-eQTL 7.91e-03 -0.348 0.13 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -36542 sc-eQTL 2.97e-01 -0.119 0.114 0.099 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162510 MATN1 -28434 eQTL 0.00048 -0.115 0.0329 0.00847 0.00652 0.0937
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 eQTL 3.82e-11 0.11 0.0165 0.0 0.0 0.0937
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -23353 eQTL 2.07e-05 -0.09 0.021 0.00173 0.00283 0.0937
ENSG00000284543 LINC01226 -811130 eQTL 0.00554 -0.148 0.0532 0.00217 0.0 0.0937

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162511 LAPTM5 -62623 7.12e-06 8.23e-06 1.24e-06 3.98e-06 2.17e-06 3.41e-06 9.71e-06 1.55e-06 6.06e-06 4.22e-06 9.04e-06 4.23e-06 1.14e-05 3.22e-06 1.69e-06 5.43e-06 3.71e-06 5.21e-06 2.56e-06 2.64e-06 4.51e-06 7.66e-06 6.67e-06 2.87e-06 1.05e-05 3.09e-06 4.04e-06 2.64e-06 7.67e-06 7.77e-06 4.13e-06 7.35e-07 1.14e-06 2.91e-06 2.69e-06 2.09e-06 1.61e-06 1.86e-06 1.56e-06 9.98e-07 9.94e-07 8.07e-06 1.02e-06 1.61e-07 7.89e-07 1.2e-06 1.09e-06 6.92e-07 4.03e-07