logo

Genes within 1Mb (chr1:30693941:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 8.63e-01 0.0153 0.0886 0.226 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 8.05e-01 0.0175 0.0709 0.226 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0695 0.0593 0.226 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -29644 sc-eQTL 2.53e-01 0.0715 0.0624 0.226 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0387 0.0489 0.226 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0852 0.0737 0.226 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 5.68e-01 0.0329 0.0574 0.226 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0464 0.0679 0.226 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 6.37e-01 0.0366 0.0774 0.226 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 7.30e-01 -0.021 0.0605 0.226 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 5.04e-02 0.105 0.0534 0.226 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 2.03e-01 0.0761 0.0595 0.226 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0856 0.0622 0.226 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0336 0.0534 0.226 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 1.67e-01 0.0884 0.0637 0.226 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 5.16e-01 0.067 0.103 0.226 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 8.31e-01 0.0147 0.0686 0.226 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 2.19e-02 0.138 0.0596 0.226 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 1.73e-01 0.0799 0.0584 0.226 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 2.99e-01 0.075 0.072 0.226 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0128 0.0687 0.226 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 1.38e-01 0.128 0.0859 0.226 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 9.62e-01 0.00424 0.0897 0.232 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0764 0.106 0.232 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 1.32e-02 -0.205 0.0819 0.232 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0195 0.0594 0.232 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 2.13e-01 0.12 0.0959 0.232 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -715624 sc-eQTL 5.97e-01 0.0518 0.0979 0.232 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -812285 sc-eQTL 8.47e-01 0.0126 0.0649 0.232 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 5.66e-01 0.0539 0.0938 0.232 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 1.36e-01 -0.104 0.0695 0.226 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 6.40e-01 0.0406 0.0866 0.226 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 8.02e-01 -0.014 0.0555 0.226 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0132 0.0511 0.226 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -214817 sc-eQTL 9.24e-01 0.00932 0.0982 0.226 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 4.78e-01 0.0489 0.0688 0.226 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -715624 sc-eQTL 3.82e-01 0.0922 0.105 0.226 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -812285 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0369 0.0928 0.226 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 6.57e-01 -0.036 0.0811 0.226 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 1.30e-01 0.145 0.0955 0.227 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 5.71e-01 0.0373 0.0657 0.227 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 1.19e-01 -0.107 0.0686 0.227 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 3.07e-03 0.233 0.0777 0.227 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 2.90e-01 0.0613 0.0578 0.227 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0479 0.0891 0.227 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 1.63e-01 0.115 0.082 0.227 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 1.58e-01 0.103 0.0724 0.226 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 6.44e-01 0.036 0.0777 0.226 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 1.22e-01 0.108 0.0695 0.226 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00494 0.0573 0.226 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0489 0.0765 0.226 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0445 0.0938 0.226 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 5.73e-01 0.0551 0.0977 0.226 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 3.40e-01 -0.117 0.122 0.209 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0545 0.123 0.209 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 3.28e-01 -0.112 0.114 0.209 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -29644 sc-eQTL 1.79e-01 0.134 0.0995 0.209 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0623 0.0696 0.209 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 2.31e-01 -0.142 0.118 0.209 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0553 0.113 0.209 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 6.23e-01 0.049 0.0995 0.209 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 1.50e-01 -0.157 0.109 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 4.09e-01 0.0753 0.091 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0723 0.0858 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -29644 sc-eQTL 6.47e-02 -0.165 0.0888 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00741 0.0549 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 3.35e-01 0.0984 0.102 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 5.06e-01 0.0514 0.077 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 8.88e-01 0.0122 0.0863 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 2.71e-01 -0.118 0.106 0.224 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 8.81e-01 0.0147 0.0984 0.224 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 6.05e-01 0.0444 0.0856 0.224 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -29644 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0365 0.0819 0.224 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 1.85e-01 -0.0961 0.0723 0.224 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 9.46e-02 0.162 0.0963 0.224 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0627 0.083 0.224 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0114 0.0973 0.224 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 7.25e-02 0.174 0.0962 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0261 0.0837 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 6.11e-01 0.0375 0.0738 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -29644 sc-eQTL 1.45e-02 0.182 0.0738 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0489 0.0499 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0933 0.088 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 3.36e-01 0.0633 0.0656 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 1.16e-01 -0.127 0.0807 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00705 0.104 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 2.52e-01 0.098 0.0853 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0794 0.0836 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -29644 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0199 0.0804 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0623 0.0545 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0547 0.0993 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 4.03e-01 0.0666 0.0794 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 2.31e-01 0.103 0.0856 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 2.82e-01 0.113 0.105 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0968 0.103 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 2.68e-01 0.113 0.101 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 1.15e-02 0.227 0.0891 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 9.08e-01 0.0108 0.0928 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 5.58e-01 -0.058 0.099 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 4.37e-02 0.176 0.0865 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0104 0.0804 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 6.99e-01 0.0275 0.0712 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 1.21e-01 0.0881 0.0566 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 2.89e-01 0.0646 0.0608 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 1.28e-01 -0.102 0.0665 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0233 0.0619 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 7.89e-01 -0.019 0.0711 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0343 0.101 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 6.32e-01 -0.039 0.0811 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 2.03e-01 0.0914 0.0716 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 1.02e-01 0.0973 0.0592 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0757 0.0797 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0762 0.0755 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 1.91e-03 0.259 0.0823 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 4.30e-01 0.08 0.101 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0448 0.0966 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 7.24e-02 0.144 0.0799 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 3.32e-02 0.173 0.0805 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 7.86e-01 0.0248 0.0912 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 6.08e-01 0.0489 0.0952 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0264 0.0938 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0186 0.11 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 1.54e-01 0.12 0.0839 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 8.32e-01 0.0173 0.0819 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 4.33e-03 0.257 0.089 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 8.16e-02 0.137 0.0784 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 8.57e-01 0.0172 0.0953 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 3.60e-01 0.082 0.0895 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0203 0.102 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 4.39e-01 -0.068 0.0877 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 2.28e-02 0.16 0.0698 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 7.40e-01 0.0225 0.0677 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00229 0.0942 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 8.35e-01 0.0177 0.0846 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0172 0.0921 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 4.60e-01 0.0831 0.112 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0408 0.103 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 5.66e-02 0.184 0.096 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 3.86e-01 0.0879 0.101 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 6.76e-01 0.0433 0.104 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0696 0.0938 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0306 0.0949 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 1.40e-01 0.158 0.106 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0677 0.102 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 1.96e-01 0.135 0.104 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 5.30e-01 0.0619 0.0983 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0462 0.0926 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 2.46e-02 0.228 0.101 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 8.67e-02 0.158 0.0918 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 7.93e-01 0.028 0.106 0.227 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0069 0.0944 0.227 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 1.86e-01 0.119 0.0901 0.227 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 8.53e-02 0.146 0.0847 0.227 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00991 0.0938 0.227 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0914 0.0948 0.227 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 5.94e-01 0.0523 0.0979 0.227 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 7.46e-01 0.0357 0.11 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 3.56e-01 0.0858 0.0927 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 4.12e-02 -0.198 0.0965 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 1.75e-01 0.131 0.0958 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 3.06e-01 0.0958 0.0932 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 1.01e-01 -0.158 0.096 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 2.12e-01 -0.119 0.0949 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 1.77e-01 0.137 0.101 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 1.40e-01 0.111 0.0749 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0542 0.0771 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 1.73e-02 0.195 0.0812 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 2.08e-01 0.0923 0.073 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0964 0.103 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 1.59e-01 0.12 0.0847 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 3.20e-01 0.111 0.111 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 1.26e-01 -0.152 0.0989 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 9.74e-03 -0.249 0.0953 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 3.28e-02 0.197 0.0915 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0236 0.104 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 9.33e-01 0.00824 0.0985 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 4.99e-02 0.186 0.0943 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 1.14e-01 0.159 0.0999 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0345 0.0784 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00183 0.0848 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 3.38e-02 0.197 0.0924 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 3.59e-01 0.073 0.0794 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 7.39e-01 0.0331 0.099 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 7.29e-01 0.0319 0.0921 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 1.73e-01 -0.165 0.121 0.211 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 4.64e-01 -0.103 0.141 0.211 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 4.13e-01 0.101 0.122 0.211 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -29644 sc-eQTL 1.14e-01 -0.18 0.113 0.211 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0104 0.0817 0.211 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 1.23e-01 0.194 0.124 0.211 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 4.08e-01 0.0925 0.112 0.211 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0768 0.119 0.211 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 7.29e-02 0.141 0.0781 0.228 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 7.24e-01 0.0353 0.0998 0.228 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 4.93e-01 0.0639 0.0931 0.228 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0138 0.0668 0.228 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 1.91e-02 -0.229 0.0968 0.228 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 2.31e-01 0.112 0.0931 0.228 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 3.56e-01 0.0793 0.0857 0.228 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 5.08e-01 0.0691 0.104 0.226 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0376 0.101 0.226 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 8.49e-01 0.0154 0.0808 0.226 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 1.32e-01 0.139 0.0921 0.226 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0971 0.0998 0.226 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0425 0.0943 0.226 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00435 0.0942 0.226 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 6.38e-01 0.0498 0.106 0.232 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 7.68e-01 0.0338 0.114 0.232 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 1.86e-01 -0.13 0.0977 0.232 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 8.90e-01 0.00957 0.0688 0.232 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 4.38e-01 0.0774 0.0995 0.232 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -715624 sc-eQTL 5.53e-01 0.0524 0.0883 0.232 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -812285 sc-eQTL 3.81e-02 -0.179 0.0858 0.232 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 6.55e-01 0.0418 0.0934 0.232 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0746 0.0832 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 7.75e-01 0.0265 0.0929 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 9.11e-01 0.00701 0.0629 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 5.38e-01 -0.034 0.0552 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -214817 sc-eQTL 4.74e-01 0.0745 0.104 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 5.29e-01 0.0536 0.0849 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -715624 sc-eQTL 3.32e-01 0.102 0.105 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -812285 sc-eQTL 1.96e-01 -0.12 0.0927 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 2.31e-01 -0.104 0.0865 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 6.75e-01 0.0372 0.0888 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0544 0.105 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0776 0.0756 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0681 0.0581 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -214817 sc-eQTL 1.57e-01 -0.142 0.1 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 7.67e-01 0.027 0.0909 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -715624 sc-eQTL 6.46e-01 0.049 0.107 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -812285 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0309 0.0866 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0274 0.0869 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 6.56e-01 0.0583 0.131 0.242 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 2.95e-01 0.117 0.112 0.242 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0644 0.115 0.242 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 8.56e-01 0.0228 0.126 0.242 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00508 0.115 0.242 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 8.79e-01 0.0176 0.116 0.242 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0302 0.112 0.242 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 9.10e-01 -0.011 0.0974 0.231 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 1.82e-01 0.139 0.104 0.231 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0974 0.0886 0.231 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0082 0.0697 0.231 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -214817 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0389 0.0954 0.231 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 1.31e-01 0.151 0.0997 0.231 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -715624 sc-eQTL 1.92e-02 0.232 0.0985 0.231 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -812285 sc-eQTL 3.54e-01 0.0878 0.0944 0.231 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 2.14e-01 -0.118 0.0943 0.231 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 1.11e-01 -0.145 0.0907 0.226 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 4.27e-01 0.0774 0.0972 0.226 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0629 0.0794 0.226 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 4.83e-01 0.0507 0.0721 0.226 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -214817 sc-eQTL 3.16e-01 0.0812 0.0808 0.226 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0631 0.0928 0.226 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -715624 sc-eQTL 3.89e-01 0.0761 0.0882 0.226 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -812285 sc-eQTL 4.42e-01 0.0679 0.0882 0.226 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 3.51e-02 0.192 0.0905 0.226 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 7.00e-01 0.041 0.106 0.234 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0339 0.117 0.234 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0906 0.0964 0.234 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 2.65e-01 -0.1 0.0895 0.234 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 6.47e-01 0.0535 0.116 0.234 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -715624 sc-eQTL 5.22e-01 0.0699 0.109 0.234 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -812285 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0407 0.0845 0.234 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0238 0.0995 0.234 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 4.82e-02 -0.205 0.103 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 3.57e-01 0.0798 0.0865 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0715 0.0766 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -29644 sc-eQTL 2.15e-01 -0.108 0.0872 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 1.71e-01 -0.0751 0.0548 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 1.22e-01 0.141 0.0906 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 8.48e-01 -0.014 0.0727 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 6.19e-01 0.0395 0.0792 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 1.76e-01 0.127 0.0938 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 8.24e-01 0.0166 0.0745 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0294 0.0704 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -29644 sc-eQTL 2.56e-02 0.151 0.067 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0447 0.0477 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0982 0.087 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 2.66e-01 0.0686 0.0615 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0484 0.0732 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0721 0.0793 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00862 0.09 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0361 0.0573 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0346 0.0504 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -214817 sc-eQTL 9.09e-01 0.0118 0.103 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 8.73e-01 0.0116 0.0723 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -715624 sc-eQTL 5.56e-01 0.0624 0.106 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -812285 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0901 0.0866 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0771 0.0811 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0898 0.0877 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 2.52e-01 0.11 0.0959 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0666 0.0787 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 9.33e-01 0.00531 0.063 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -214817 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0406 0.092 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 4.58e-01 0.0621 0.0836 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -715624 sc-eQTL 3.73e-02 0.198 0.0945 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -812285 sc-eQTL 4.61e-01 0.0668 0.0905 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 4.64e-01 0.0665 0.0906 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -602847 sc-eQTL 1.05e-01 0.157 0.0963 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603041 sc-eQTL 6.35e-01 0.0315 0.0661 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -372050 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0521 0.0724 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 sc-eQTL 5.36e-03 0.224 0.0795 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -950955 sc-eQTL 4.46e-01 0.0469 0.0615 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24563 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0225 0.0934 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -37752 sc-eQTL 8.55e-03 0.211 0.0793 0.226 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000134644 PUM1 -372050 eQTL 0.0381 0.0357 0.0172 0.0 0.0 0.195
ENSG00000162511 LAPTM5 -63833 eQTL 0.0374 0.0253 0.0121 0.0 0.0 0.195
ENSG00000162517 PEF1 -950955 eQTL 0.0146 0.0442 0.0181 0.0 0.0 0.195

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162510 \N -29644 1.09e-05 1.12e-05 1.25e-06 5.03e-06 2.25e-06 5.23e-06 1.06e-05 1.51e-06 8.22e-06 4.38e-06 1.2e-05 5.25e-06 1.48e-05 3.74e-06 2.17e-06 5.78e-06 4.52e-06 6.43e-06 2.64e-06 2.63e-06 4.68e-06 8.39e-06 7.23e-06 2.87e-06 1.54e-05 3.09e-06 4.35e-06 2.62e-06 9.77e-06 9.7e-06 5.38e-06 5.57e-07 8.43e-07 2.88e-06 3.93e-06 2.1e-06 1.65e-06 1.53e-06 1.64e-06 1.02e-06 7.83e-07 1.3e-05 1.42e-06 1.32e-07 8.11e-07 9.69e-07 9.16e-07 6.73e-07 4.98e-07