logo

Genes within 1Mb (chr1:30693602:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 9.03e-01 0.0151 0.123 0.105 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0448 0.0986 0.105 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 5.89e-02 0.156 0.0821 0.105 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -29983 sc-eQTL 7.67e-02 0.154 0.0864 0.105 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 9.28e-01 0.0062 0.0681 0.105 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 8.01e-01 0.0259 0.103 0.105 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0315 0.0798 0.105 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 4.25e-01 0.0754 0.0944 0.105 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0878 0.105 0.105 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 6.73e-02 0.15 0.0814 0.105 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 3.78e-01 0.0644 0.0729 0.105 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0435 0.0809 0.105 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 4.55e-01 0.0632 0.0845 0.105 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0769 0.0722 0.105 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0187 0.0867 0.105 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 4.49e-01 0.106 0.14 0.105 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 1.12e-01 0.148 0.0927 0.105 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 8.55e-01 -0.015 0.0821 0.105 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00246 0.0797 0.105 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 5.37e-01 0.0607 0.0981 0.105 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 2.68e-02 -0.206 0.0923 0.105 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0373 0.117 0.105 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 2.49e-01 0.157 0.136 0.095 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 1.65e-02 0.385 0.159 0.095 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 7.17e-01 -0.046 0.127 0.095 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 2.12e-02 -0.207 0.0892 0.095 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0857 0.146 0.095 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -715963 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0653 0.149 0.095 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -812624 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0573 0.0987 0.095 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0917 0.143 0.095 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00604 0.0985 0.105 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 2.24e-01 0.149 0.122 0.105 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0338 0.0783 0.105 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 2.19e-01 0.0885 0.0718 0.105 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -215156 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0598 0.138 0.105 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 2.17e-01 0.12 0.0968 0.105 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -715963 sc-eQTL 8.44e-01 0.0292 0.149 0.105 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -812624 sc-eQTL 3.17e-01 -0.131 0.131 0.105 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0887 0.114 0.105 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 4.23e-03 -0.379 0.131 0.105 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 3.14e-01 0.0921 0.0913 0.105 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 4.67e-01 0.0699 0.0958 0.105 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 1.73e-01 -0.15 0.11 0.105 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 1.51e-01 -0.116 0.0802 0.105 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 3.65e-02 -0.259 0.123 0.105 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0585 0.115 0.105 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0702 0.103 0.105 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 6.46e-01 0.0506 0.11 0.105 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 8.13e-01 0.0235 0.0992 0.105 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 5.47e-02 -0.156 0.0806 0.105 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0383 0.109 0.105 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 4.24e-01 -0.106 0.133 0.105 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 4.77e-01 0.0987 0.138 0.105 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 2.91e-01 -0.177 0.167 0.099 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 1.53e-01 -0.241 0.168 0.099 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 2.76e-01 0.171 0.156 0.099 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -29983 sc-eQTL 6.86e-01 0.0554 0.137 0.099 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00772 0.0956 0.099 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 7.12e-01 0.0601 0.163 0.099 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 3.62e-01 0.141 0.154 0.099 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 8.68e-02 0.233 0.135 0.099 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 3.24e-01 0.155 0.157 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 4.81e-01 0.0923 0.131 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 9.23e-01 0.0119 0.124 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -29983 sc-eQTL 3.01e-01 0.133 0.128 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 5.70e-01 0.0449 0.0789 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00208 0.147 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0244 0.111 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 1.66e-01 -0.172 0.123 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 7.30e-01 0.0539 0.156 0.106 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 7.70e-01 0.042 0.144 0.106 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0405 0.125 0.106 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -29983 sc-eQTL 7.91e-01 0.0317 0.12 0.106 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 1.67e-01 0.147 0.106 0.106 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 2.40e-01 -0.166 0.141 0.106 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0677 0.121 0.106 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0387 0.142 0.106 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0903 0.135 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 8.55e-02 -0.2 0.116 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 5.06e-01 0.0686 0.103 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -29983 sc-eQTL 2.69e-01 0.115 0.104 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 9.80e-01 0.00176 0.0698 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 2.83e-02 0.269 0.122 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0723 0.0916 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 4.10e-01 0.0934 0.113 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 8.10e-01 0.035 0.145 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 2.91e-01 0.127 0.119 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 3.53e-02 0.246 0.116 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -29983 sc-eQTL 7.94e-01 0.0294 0.113 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 1.54e-01 0.109 0.0761 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 3.95e-01 -0.118 0.139 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 7.97e-02 -0.195 0.11 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 4.95e-01 0.082 0.12 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 1.37e-01 -0.212 0.142 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 7.26e-01 0.0492 0.14 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0723 0.138 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 2.54e-01 -0.14 0.122 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 7.47e-01 0.0407 0.126 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 4.93e-01 -0.092 0.134 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 9.27e-01 0.0109 0.118 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 7.31e-01 0.0384 0.111 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 4.66e-01 0.0721 0.0986 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 1.29e-01 0.119 0.0784 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0407 0.0844 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 2.31e-01 0.111 0.0923 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 7.09e-01 -0.032 0.0857 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00879 0.0984 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0683 0.138 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 1.11e-01 0.177 0.111 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0216 0.0984 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00351 0.0817 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 6.88e-01 0.044 0.109 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 1.65e-01 -0.144 0.103 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 2.81e-02 -0.252 0.114 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0505 0.14 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 7.49e-01 0.0427 0.133 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0159 0.111 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0252 0.112 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 1.25e-01 0.193 0.125 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 3.46e-01 -0.124 0.131 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 2.86e-01 0.138 0.129 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 1.75e-01 0.208 0.152 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 4.37e-02 0.236 0.116 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0919 0.114 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 3.41e-01 -0.12 0.126 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 2.96e-01 0.115 0.11 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 1.71e-01 -0.182 0.132 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0206 0.125 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 2.66e-01 -0.154 0.138 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 6.20e-01 0.0592 0.119 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0526 0.096 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0114 0.0921 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 2.42e-01 -0.15 0.128 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 5.63e-02 -0.219 0.114 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 4.16e-01 -0.102 0.125 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0387 0.168 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 2.50e-01 -0.177 0.153 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0427 0.145 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0276 0.151 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 4.07e-01 0.128 0.154 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 4.00e-01 0.118 0.14 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 3.66e-01 -0.128 0.141 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 9.32e-01 0.0127 0.149 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 7.06e-01 0.0538 0.142 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 6.26e-01 -0.071 0.146 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 8.58e-01 0.0246 0.137 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 1.62e-01 0.18 0.128 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 2.18e-01 -0.175 0.142 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 2.12e-01 -0.161 0.128 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 9.05e-01 -0.018 0.151 0.104 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 5.11e-01 -0.088 0.133 0.104 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0243 0.128 0.104 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 2.41e-02 -0.271 0.119 0.104 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0595 0.133 0.104 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00422 0.135 0.104 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 3.79e-01 0.122 0.138 0.104 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 1.58e-01 -0.214 0.151 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 1.79e-01 0.172 0.128 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0616 0.134 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0935 0.133 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0798 0.129 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 5.33e-02 0.257 0.132 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 4.52e-01 0.0988 0.131 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 5.91e-02 -0.271 0.143 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 1.75e-01 0.145 0.106 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 4.86e-01 0.0762 0.109 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 3.83e-01 -0.102 0.116 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0609 0.104 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 3.79e-02 -0.302 0.145 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 3.64e-01 -0.109 0.12 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 1.37e-01 -0.22 0.147 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00327 0.132 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 4.50e-01 0.0976 0.129 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 7.31e-02 -0.22 0.122 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 1.88e-01 -0.182 0.138 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 8.78e-01 0.0201 0.131 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0756 0.127 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 3.62e-01 -0.126 0.138 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 4.34e-01 0.0844 0.108 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 7.34e-01 0.0397 0.117 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 4.12e-01 -0.105 0.128 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 3.31e-01 -0.106 0.109 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 1.72e-01 -0.186 0.135 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 9.85e-01 0.00242 0.127 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0226 0.153 0.115 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 6.00e-01 0.0935 0.178 0.115 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 1.81e-01 0.206 0.153 0.115 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -29983 sc-eQTL 3.60e-01 0.132 0.144 0.115 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0816 0.103 0.115 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 1.65e-01 0.219 0.157 0.115 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 4.42e-01 -0.108 0.141 0.115 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0632 0.15 0.115 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 9.47e-01 0.00745 0.113 0.104 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 2.26e-01 0.174 0.143 0.104 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 1.27e-01 0.204 0.133 0.104 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 2.64e-01 0.107 0.0957 0.104 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 4.93e-02 0.276 0.139 0.104 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 4.07e-01 -0.111 0.134 0.104 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 7.37e-01 0.0415 0.123 0.104 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 7.83e-01 0.0396 0.144 0.105 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 6.43e-01 0.0646 0.139 0.105 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0638 0.111 0.105 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 1.90e-01 -0.167 0.127 0.105 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 2.29e-02 -0.312 0.136 0.105 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 1.73e-01 -0.177 0.129 0.105 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0323 0.13 0.105 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 9.50e-01 0.01 0.161 0.093 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 3.29e-01 -0.17 0.174 0.093 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 8.57e-01 0.0271 0.15 0.093 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0437 0.105 0.093 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 3.84e-01 -0.132 0.152 0.093 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -715963 sc-eQTL 6.09e-01 0.0689 0.135 0.093 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -812624 sc-eQTL 7.88e-01 0.0357 0.132 0.093 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 6.11e-01 0.0726 0.142 0.093 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 2.66e-01 -0.132 0.118 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 2.40e-01 0.155 0.132 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 1.10e-01 -0.143 0.0889 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 9.73e-02 0.13 0.078 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -215156 sc-eQTL 3.89e-01 0.127 0.148 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0916 0.121 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -715963 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0404 0.15 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -812624 sc-eQTL 2.66e-01 -0.147 0.132 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 5.22e-01 0.0791 0.123 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 2.35e-01 -0.151 0.127 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0462 0.15 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 3.11e-01 0.11 0.108 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 5.82e-01 0.046 0.0834 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -215156 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0761 0.144 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 1.07e-01 0.21 0.129 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -715963 sc-eQTL 8.96e-01 -0.02 0.153 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -812624 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0235 0.124 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0781 0.124 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 4.28e-01 -0.152 0.191 0.094 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0561 0.165 0.094 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 6.48e-01 0.0777 0.17 0.094 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 5.18e-01 -0.12 0.184 0.094 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 5.65e-01 0.0973 0.169 0.094 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 1.86e-01 -0.225 0.169 0.094 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 5.97e-01 0.0873 0.165 0.094 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 1.40e-01 -0.212 0.144 0.098 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 5.25e-01 0.0988 0.155 0.098 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 7.56e-01 -0.041 0.132 0.098 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 3.12e-01 0.105 0.103 0.098 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -215156 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0409 0.141 0.098 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 4.80e-01 -0.105 0.148 0.098 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -715963 sc-eQTL 3.00e-01 0.153 0.148 0.098 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -812624 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0176 0.14 0.098 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 7.14e-02 -0.252 0.139 0.098 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 3.27e-01 0.135 0.137 0.097 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 8.24e-01 0.0328 0.147 0.097 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 3.70e-01 0.108 0.12 0.097 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0817 0.109 0.097 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -215156 sc-eQTL 6.06e-01 0.0631 0.122 0.097 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0328 0.14 0.097 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -715963 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0297 0.133 0.097 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -812624 sc-eQTL 2.95e-01 -0.14 0.133 0.097 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 2.11e-01 -0.173 0.138 0.097 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 3.55e-01 0.145 0.156 0.088 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 8.38e-03 0.449 0.168 0.088 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 8.58e-02 -0.244 0.141 0.088 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 2.36e-01 -0.157 0.132 0.088 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 7.15e-01 0.0629 0.172 0.088 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -715963 sc-eQTL 5.91e-02 -0.302 0.159 0.088 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -812624 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0279 0.125 0.088 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 5.67e-01 0.0843 0.147 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 9.22e-01 0.0148 0.151 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 3.34e-01 0.121 0.125 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 8.74e-01 0.0177 0.111 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -29983 sc-eQTL 1.56e-01 0.18 0.126 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 9.00e-01 0.01 0.0798 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0234 0.132 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0411 0.105 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 3.18e-01 -0.115 0.115 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0435 0.132 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0703 0.104 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 3.15e-01 0.099 0.0982 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -29983 sc-eQTL 3.39e-01 0.0906 0.0946 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 7.71e-01 0.0195 0.0667 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 1.01e-01 0.199 0.121 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0779 0.086 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 1.36e-01 0.152 0.102 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0902 0.112 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 4.73e-01 0.091 0.127 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0452 0.0808 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 1.49e-01 0.103 0.0707 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -215156 sc-eQTL 8.44e-01 0.0286 0.145 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 3.71e-01 0.0913 0.102 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -715963 sc-eQTL 8.81e-01 0.0224 0.149 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -812624 sc-eQTL 2.49e-01 -0.141 0.122 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0104 0.115 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00749 0.126 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 1.05e-01 0.224 0.137 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 6.72e-01 0.048 0.113 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 4.95e-01 0.0619 0.0906 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -215156 sc-eQTL 6.03e-01 0.0689 0.132 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 9.57e-01 0.00645 0.12 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -715963 sc-eQTL 5.25e-01 0.0873 0.137 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -812624 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0627 0.13 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 2.81e-02 -0.285 0.129 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -603186 sc-eQTL 7.65e-03 -0.356 0.132 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603380 sc-eQTL 3.81e-01 0.0805 0.0918 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -372389 sc-eQTL 3.80e-01 0.0885 0.101 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 sc-eQTL 1.66e-01 -0.156 0.112 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -951294 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0965 0.0853 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 sc-eQTL 1.00e-02 -0.332 0.128 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -38091 sc-eQTL 3.10e-01 -0.114 0.112 0.103 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162510 MATN1 -29983 eQTL 0.000376 -0.116 0.0325 0.0102 0.00808 0.0962
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 eQTL 8.64e-11 0.107 0.0163 0.0 0.0 0.0962
ENSG00000168528 SERINC2 -715963 eQTL 0.0413 -0.131 0.0642 0.0 0.0 0.0962
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24902 eQTL 3.61e-05 -0.0864 0.0208 0.00142 0.0018 0.0962
ENSG00000284543 LINC01226 -812679 eQTL 0.00483 -0.149 0.0526 0.00251 0.00107 0.0962

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162511 LAPTM5 -64172 7.22e-06 5.1e-06 7.66e-07 2.73e-06 1.33e-06 1.56e-06 4.58e-06 1.01e-06 4.4e-06 2.17e-06 5.33e-06 3.46e-06 7.71e-06 2.24e-06 1.42e-06 3.42e-06 2.06e-06 3.83e-06 1.42e-06 1.02e-06 2.95e-06 4.49e-06 4.09e-06 1.65e-06 6.39e-06 2.01e-06 2.26e-06 1.47e-06 4.42e-06 4.23e-06 2.32e-06 3.98e-07 7.92e-07 1.85e-06 2.22e-06 9.61e-07 1e-06 4.72e-07 1.3e-06 3.79e-07 2.78e-07 5.76e-06 6.61e-07 1.41e-07 5.92e-07 3.41e-07 7.44e-07 2.72e-07 3.35e-07