logo

Genes within 1Mb (chr1:30693578:T:TG):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 6.11e-01 0.0461 0.0904 0.291 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0148 0.0724 0.291 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 9.39e-02 0.102 0.0604 0.291 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -30007 sc-eQTL 3.81e-02 -0.132 0.0632 0.291 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 5.67e-01 0.0287 0.05 0.291 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 4.67e-01 0.055 0.0754 0.291 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 3.04e-01 0.0603 0.0585 0.291 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 1.11e-02 0.175 0.0683 0.291 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 2.79e-01 -0.086 0.0792 0.291 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 7.43e-02 0.111 0.0616 0.291 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0054 0.0553 0.291 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 9.87e-01 0.000988 0.0612 0.291 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 2.28e-01 0.0771 0.0638 0.291 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 4.54e-01 0.0411 0.0547 0.291 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0139 0.0656 0.291 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 4.35e-01 0.0812 0.104 0.291 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0344 0.0692 0.291 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 9.65e-01 0.00267 0.0609 0.291 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0682 0.059 0.291 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 5.23e-01 0.0466 0.0728 0.291 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0305 0.0693 0.291 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0159 0.0871 0.291 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 5.12e-01 0.0624 0.095 0.286 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 1.53e-01 0.161 0.112 0.286 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0579 0.0881 0.286 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 8.75e-01 -0.00994 0.063 0.286 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0264 0.102 0.286 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -715987 sc-eQTL 8.47e-01 0.0201 0.104 0.286 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -812648 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0784 0.0686 0.286 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0319 0.0996 0.286 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 1.87e-01 0.0952 0.0719 0.291 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00285 0.0895 0.291 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 3.96e-01 0.0487 0.0573 0.291 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 4.05e-01 0.044 0.0527 0.291 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -215180 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0183 0.101 0.291 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 6.50e-01 0.0323 0.0711 0.291 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -715987 sc-eQTL 6.45e-01 0.0502 0.109 0.291 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -812648 sc-eQTL 9.31e-02 -0.161 0.0952 0.291 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0999 0.0835 0.291 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 9.33e-01 0.00834 0.0994 0.29 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 8.91e-01 -0.00935 0.068 0.29 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 2.18e-01 0.0879 0.0711 0.29 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0237 0.0821 0.29 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 8.55e-01 -0.011 0.0599 0.29 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 2.59e-01 -0.104 0.092 0.29 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 6.23e-01 0.042 0.0852 0.29 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 5.37e-01 0.047 0.076 0.291 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 8.23e-01 0.0182 0.0813 0.291 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 8.11e-02 -0.127 0.0726 0.291 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0532 0.0598 0.291 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0651 0.0799 0.291 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 5.94e-01 0.0523 0.0981 0.291 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 4.56e-01 0.0762 0.102 0.291 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00569 0.119 0.293 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0313 0.12 0.293 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 4.63e-01 0.0821 0.112 0.293 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -30007 sc-eQTL 6.40e-01 0.0458 0.0976 0.293 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 5.31e-01 0.0427 0.0681 0.293 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 7.13e-02 0.208 0.115 0.293 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 2.72e-01 0.121 0.11 0.293 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 1.71e-01 0.133 0.0968 0.293 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 7.59e-01 0.0351 0.114 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 5.77e-01 0.0531 0.0952 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 1.81e-01 0.12 0.0894 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -30007 sc-eQTL 8.02e-01 0.0235 0.0935 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 2.47e-01 0.0664 0.0572 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 8.51e-01 -0.02 0.107 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 4.29e-01 0.0637 0.0804 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 7.54e-01 0.0282 0.0901 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 1.96e-01 0.144 0.111 0.293 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 9.11e-01 0.0115 0.103 0.293 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0207 0.0897 0.293 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -30007 sc-eQTL 8.82e-02 -0.146 0.0852 0.293 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 1.64e-01 0.106 0.0757 0.293 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 6.44e-01 -0.047 0.102 0.293 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 6.75e-01 0.0365 0.087 0.293 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0735 0.102 0.293 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 8.32e-01 0.0213 0.1 0.291 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0387 0.0865 0.291 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 1.64e-01 0.106 0.076 0.291 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -30007 sc-eQTL 3.55e-03 -0.224 0.0759 0.291 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 5.87e-01 0.0281 0.0517 0.291 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 9.18e-02 0.153 0.0906 0.291 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 9.13e-01 0.00746 0.0679 0.291 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 1.61e-03 0.262 0.0819 0.291 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 6.19e-01 0.0533 0.107 0.292 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0874 0.0882 0.292 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0295 0.0865 0.292 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -30007 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0938 0.0828 0.292 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 1.97e-01 0.0726 0.0562 0.292 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 5.10e-01 0.0676 0.102 0.292 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 7.11e-01 0.0305 0.0821 0.292 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 9.02e-01 0.0109 0.0887 0.292 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 1.61e-01 -0.147 0.104 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0174 0.103 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 3.71e-01 0.0904 0.101 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 7.39e-02 -0.161 0.0894 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0161 0.0923 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 7.08e-01 0.037 0.0985 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 1.37e-01 -0.129 0.0865 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0066 0.0837 0.291 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 3.40e-01 0.0708 0.0741 0.291 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 7.05e-01 0.0225 0.0592 0.291 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 5.99e-01 0.0334 0.0635 0.291 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 9.76e-02 0.115 0.0692 0.291 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 3.46e-01 0.0607 0.0643 0.291 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 5.83e-01 0.0407 0.074 0.291 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0283 0.103 0.291 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 5.17e-01 0.0541 0.0833 0.291 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0451 0.0738 0.291 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 9.35e-01 0.00497 0.0612 0.291 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 1.99e-01 0.105 0.0818 0.291 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 8.17e-01 0.018 0.0777 0.291 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 1.22e-02 -0.215 0.0853 0.291 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0327 0.103 0.291 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 8.97e-01 0.0126 0.098 0.291 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 7.82e-01 0.0226 0.0816 0.291 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 2.20e-01 0.101 0.0823 0.291 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 5.50e-01 0.0553 0.0924 0.291 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0477 0.0965 0.291 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00576 0.0952 0.291 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 7.07e-01 0.0425 0.113 0.291 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00793 0.0864 0.291 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0487 0.0839 0.291 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 2.68e-01 -0.103 0.0927 0.291 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 5.10e-01 0.0534 0.0809 0.291 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0136 0.0977 0.291 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0455 0.0919 0.291 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 9.91e-01 0.00114 0.104 0.291 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0785 0.0895 0.291 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 8.64e-01 0.0124 0.0721 0.291 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 7.74e-01 0.0199 0.0691 0.291 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0142 0.0961 0.291 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 7.26e-01 0.0303 0.0863 0.291 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0344 0.0939 0.291 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 3.03e-01 -0.123 0.119 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0485 0.109 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0926 0.103 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0479 0.108 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 5.88e-01 0.0597 0.11 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0104 0.0996 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 2.88e-01 -0.107 0.1 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 2.23e-01 0.133 0.109 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 2.77e-01 0.114 0.104 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 1.99e-01 -0.137 0.106 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 9.04e-01 0.0122 0.1 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 4.02e-01 0.0792 0.0944 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0676 0.104 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 2.32e-01 -0.113 0.094 0.285 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 2.98e-01 0.115 0.11 0.29 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0114 0.0977 0.29 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0767 0.0935 0.29 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0505 0.0883 0.29 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0729 0.097 0.29 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 9.80e-01 0.00243 0.0984 0.29 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 7.91e-01 0.027 0.101 0.29 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 6.43e-01 -0.052 0.112 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 5.69e-01 0.0541 0.0947 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 5.64e-01 0.0576 0.0995 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 1.30e-01 0.148 0.0977 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0816 0.0952 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 9.62e-03 0.254 0.0971 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 6.14e-02 0.181 0.0964 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0162 0.105 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00382 0.0779 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 4.63e-01 0.0588 0.0799 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0691 0.0851 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00238 0.0759 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 2.54e-01 -0.122 0.106 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0574 0.088 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0591 0.111 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 1.36e-01 0.148 0.0988 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0457 0.0968 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0786 0.0922 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0842 0.104 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0553 0.0982 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0205 0.095 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 6.11e-01 0.0519 0.102 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0069 0.0796 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 2.01e-01 0.11 0.0858 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0117 0.0948 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0472 0.0807 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0775 0.1 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 3.47e-01 0.0879 0.0933 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 1.35e-01 0.177 0.117 0.278 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0106 0.138 0.278 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 7.22e-01 0.0425 0.119 0.278 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -30007 sc-eQTL 9.70e-01 0.00419 0.111 0.278 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0592 0.0794 0.278 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0196 0.122 0.278 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0392 0.109 0.278 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 5.79e-01 0.0644 0.116 0.278 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0366 0.0831 0.289 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 6.15e-01 0.0532 0.106 0.289 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 4.78e-01 0.0699 0.0984 0.289 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 7.79e-01 0.0199 0.0706 0.289 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 1.53e-01 0.148 0.103 0.289 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 2.25e-01 -0.12 0.0984 0.289 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 8.42e-01 0.0181 0.0908 0.289 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 3.91e-01 0.092 0.107 0.291 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 4.23e-01 0.0831 0.104 0.291 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0916 0.0828 0.291 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0612 0.095 0.291 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 1.60e-01 -0.144 0.102 0.291 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 9.41e-01 0.00713 0.0969 0.291 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 6.03e-01 0.0504 0.0967 0.291 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 5.02e-01 0.0756 0.112 0.285 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 3.71e-01 -0.109 0.122 0.285 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 1.97e-01 -0.135 0.104 0.285 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 1.33e-01 0.11 0.073 0.285 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0297 0.106 0.285 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -715987 sc-eQTL 7.83e-01 0.026 0.0942 0.285 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -812648 sc-eQTL 2.05e-02 0.213 0.0913 0.285 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 5.35e-01 0.062 0.0996 0.285 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 3.51e-01 0.0807 0.0864 0.291 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 6.15e-01 0.0487 0.0965 0.291 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0364 0.0653 0.291 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 2.02e-01 0.0731 0.0571 0.291 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -215180 sc-eQTL 6.19e-01 0.0538 0.108 0.291 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0706 0.0882 0.291 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -715987 sc-eQTL 9.07e-01 0.0128 0.109 0.291 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -812648 sc-eQTL 1.37e-01 -0.144 0.0962 0.291 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0294 0.0902 0.291 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0174 0.0911 0.291 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0806 0.107 0.291 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 4.59e-02 0.155 0.077 0.291 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 5.38e-01 0.0369 0.0597 0.291 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -215180 sc-eQTL 2.80e-01 0.112 0.103 0.291 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 7.18e-01 0.0337 0.0932 0.291 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -715987 sc-eQTL 6.60e-01 0.0482 0.109 0.291 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -812648 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0799 0.0886 0.291 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0299 0.0892 0.291 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0628 0.138 0.285 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0368 0.118 0.285 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 6.99e-01 0.0473 0.122 0.285 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0817 0.133 0.285 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0402 0.121 0.285 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 8.49e-01 0.0233 0.123 0.285 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 9.88e-01 -0.0018 0.119 0.285 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 6.58e-01 0.0456 0.103 0.284 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0567 0.111 0.284 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 4.87e-01 0.0653 0.0938 0.284 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 2.62e-01 0.0827 0.0734 0.284 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -215180 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0107 0.101 0.284 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 4.96e-01 0.0721 0.106 0.284 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -715987 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00809 0.106 0.284 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -812648 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0777 0.0999 0.284 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0746 0.0999 0.284 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 6.95e-01 0.0373 0.0951 0.287 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 3.64e-01 0.0922 0.101 0.287 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 2.22e-02 0.189 0.0818 0.287 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0832 0.0751 0.287 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -215180 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00436 0.0844 0.287 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 3.75e-02 0.201 0.0958 0.287 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -715987 sc-eQTL 7.59e-01 0.0283 0.0921 0.287 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -812648 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0364 0.092 0.287 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 2.81e-02 -0.209 0.0943 0.287 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 7.90e-01 0.0292 0.11 0.282 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 1.05e-01 0.194 0.119 0.282 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 9.50e-01 0.00624 0.0997 0.282 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0334 0.0926 0.282 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 5.45e-01 0.0728 0.12 0.282 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -715987 sc-eQTL 2.04e-01 -0.143 0.112 0.282 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -812648 sc-eQTL 7.48e-02 -0.155 0.0864 0.282 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 7.73e-01 0.0297 0.103 0.282 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 4.50e-01 0.0824 0.109 0.291 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 3.20e-01 0.0902 0.0905 0.291 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 5.36e-01 0.0497 0.0803 0.291 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -30007 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00562 0.0916 0.291 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 2.82e-01 0.0619 0.0574 0.291 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0376 0.0953 0.291 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 3.32e-01 0.0738 0.076 0.291 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 7.18e-01 -0.03 0.083 0.291 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 9.45e-01 0.00667 0.097 0.291 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0573 0.0766 0.291 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 7.32e-01 0.0248 0.0725 0.291 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -30007 sc-eQTL 3.90e-03 -0.2 0.0685 0.291 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 6.89e-01 0.0197 0.0491 0.291 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 1.24e-01 0.138 0.0893 0.291 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 8.34e-01 0.0134 0.0635 0.291 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 7.69e-03 0.2 0.0742 0.291 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 3.58e-01 0.0752 0.0816 0.291 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00184 0.0926 0.291 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 3.40e-01 0.0564 0.059 0.291 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 2.15e-01 0.0643 0.0518 0.291 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -215180 sc-eQTL 4.43e-01 0.0814 0.106 0.291 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 7.38e-01 -0.025 0.0745 0.291 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -715987 sc-eQTL 5.96e-01 0.0578 0.109 0.291 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -812648 sc-eQTL 1.07e-01 -0.144 0.0888 0.291 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0342 0.0836 0.291 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 7.36e-01 0.0309 0.0916 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 6.93e-01 0.0396 0.1 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 2.12e-01 0.102 0.0818 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 7.30e-01 0.0227 0.0657 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -215180 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0303 0.0959 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 1.34e-01 0.13 0.0867 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -715987 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0172 0.0995 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -812648 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0875 0.0942 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 3.46e-02 -0.199 0.0935 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -603210 sc-eQTL 8.82e-01 0.0148 0.0998 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -603404 sc-eQTL 8.89e-01 -0.00951 0.0682 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -372413 sc-eQTL 2.70e-01 0.0823 0.0745 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -64196 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0533 0.0834 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -951318 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00662 0.0634 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 sc-eQTL 9.30e-02 -0.161 0.0957 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -38115 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0308 0.0831 0.289 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162510 MATN1 -30007 eQTL 0.0135 -0.0507 0.0205 0.0 0.0 0.319
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -24926 eQTL 4.42e-02 0.0265 0.0132 0.0 0.0 0.319
ENSG00000284543 LINC01226 -812703 eQTL 0.0306 -0.0717 0.0331 0.0 0.0 0.319

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina