logo

Genes within 1Mb (chr1:30690546:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00316 0.106 0.171 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 8.77e-02 -0.145 0.0844 0.171 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 2.89e-01 0.0756 0.0711 0.171 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -33039 sc-eQTL 1.92e-01 0.0976 0.0746 0.171 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 1.27e-01 0.0893 0.0584 0.171 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 6.30e-01 0.0427 0.0885 0.171 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0845 0.0685 0.171 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 2.76e-01 0.0887 0.0812 0.171 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 2.86e-01 0.0991 0.0927 0.171 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 4.47e-01 0.0553 0.0725 0.171 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 8.24e-02 -0.112 0.0642 0.171 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 6.46e-01 0.0329 0.0716 0.171 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0286 0.0749 0.171 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 6.44e-02 -0.118 0.0636 0.171 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0104 0.0768 0.171 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 3.63e-01 -0.111 0.122 0.171 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0286 0.0813 0.171 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 9.91e-01 0.00077 0.0716 0.171 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 2.01e-01 0.0889 0.0693 0.171 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 4.10e-02 -0.174 0.0848 0.171 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00212 0.0815 0.171 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0294 0.102 0.171 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0759 0.11 0.164 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 2.47e-01 -0.15 0.13 0.164 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 9.26e-01 0.00951 0.102 0.164 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 7.97e-01 0.0187 0.0727 0.164 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00532 0.118 0.164 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -719019 sc-eQTL 4.00e-01 0.101 0.12 0.164 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -815680 sc-eQTL 2.75e-01 0.0867 0.0792 0.164 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 3.79e-01 -0.101 0.115 0.164 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 1.17e-01 0.133 0.0842 0.171 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 8.89e-02 0.178 0.104 0.171 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 3.26e-01 0.0662 0.0672 0.171 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0393 0.0619 0.171 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -218212 sc-eQTL 2.60e-02 -0.264 0.118 0.171 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0108 0.0835 0.171 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -719019 sc-eQTL 6.83e-01 0.0522 0.128 0.171 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -815680 sc-eQTL 5.59e-02 0.214 0.112 0.171 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 2.19e-01 0.121 0.098 0.171 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 9.35e-02 0.196 0.116 0.17 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 1.13e-01 -0.127 0.0797 0.17 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0267 0.0841 0.17 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 8.04e-01 0.024 0.0968 0.17 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 7.99e-01 -0.018 0.0706 0.17 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 1.85e-01 0.144 0.108 0.17 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 2.16e-01 -0.124 0.1 0.17 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 8.75e-01 0.0137 0.087 0.171 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0477 0.0929 0.171 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 6.41e-02 -0.154 0.0829 0.171 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 3.41e-01 0.0652 0.0684 0.171 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 2.78e-01 0.0992 0.0913 0.171 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 3.69e-01 -0.101 0.112 0.171 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0805 0.117 0.171 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 6.83e-01 0.0577 0.141 0.176 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 2.67e-01 0.158 0.142 0.176 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 3.30e-01 -0.129 0.132 0.176 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -33039 sc-eQTL 7.43e-01 -0.038 0.116 0.176 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0307 0.0806 0.176 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0599 0.137 0.176 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 5.03e-01 0.0873 0.13 0.176 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 8.33e-01 0.0243 0.115 0.176 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0791 0.131 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 3.45e-01 -0.103 0.109 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0133 0.103 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -33039 sc-eQTL 5.56e-01 0.0633 0.107 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 4.95e-01 0.045 0.0659 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00118 0.122 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 1.16e-02 -0.232 0.0911 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0463 0.104 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 3.63e-01 -0.117 0.128 0.17 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 9.59e-01 0.00606 0.118 0.17 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 3.52e-01 0.0961 0.103 0.17 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -33039 sc-eQTL 6.61e-01 0.0433 0.0986 0.17 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 6.31e-01 0.0421 0.0874 0.17 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 6.99e-01 0.0451 0.117 0.17 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0433 0.1 0.17 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 6.97e-02 0.212 0.116 0.17 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 2.14e-01 0.146 0.117 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 3.22e-01 -0.101 0.101 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 3.24e-01 0.0884 0.0894 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -33039 sc-eQTL 8.74e-01 0.0144 0.0909 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 3.14e-02 0.13 0.0601 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 3.52e-02 0.225 0.106 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 1.68e-01 -0.11 0.0794 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 9.37e-01 0.00777 0.0985 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 1.25e-01 -0.192 0.125 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 2.51e-01 -0.119 0.103 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 9.22e-01 0.00997 0.101 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -33039 sc-eQTL 6.19e-01 0.0485 0.0974 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 1.05e-01 0.107 0.0658 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0724 0.12 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 8.93e-01 0.013 0.0963 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 5.31e-01 0.0652 0.104 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 3.01e-01 0.129 0.124 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 9.12e-01 0.0135 0.122 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 1.55e-01 -0.171 0.119 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 2.05e-01 0.136 0.107 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 4.85e-01 0.0767 0.11 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 3.71e-01 0.105 0.117 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 8.12e-04 0.342 0.1 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0756 0.0969 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 8.14e-01 0.0202 0.086 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 7.38e-02 -0.122 0.0681 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 7.93e-01 0.0194 0.0736 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 7.92e-01 0.0213 0.0807 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 5.76e-03 -0.205 0.0733 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 4.85e-01 0.06 0.0857 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 1.32e-01 0.184 0.122 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 9.32e-01 0.00839 0.0988 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 4.82e-01 0.0615 0.0874 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0151 0.0726 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 1.72e-01 -0.133 0.0969 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 1.86e-01 -0.122 0.0917 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0279 0.103 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 7.24e-01 0.0435 0.123 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 3.69e-02 0.244 0.116 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 7.90e-01 0.026 0.0976 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0919 0.0986 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 6.42e-01 0.0515 0.111 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 8.62e-01 0.0201 0.116 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 9.97e-01 0.000413 0.114 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0527 0.132 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 2.33e-01 0.121 0.101 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 3.79e-02 0.204 0.0976 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 3.77e-01 0.0965 0.109 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0498 0.095 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0456 0.115 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0326 0.108 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 1.99e-01 -0.156 0.121 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 8.64e-02 -0.179 0.104 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 1.67e-01 -0.116 0.0839 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 4.07e-01 0.0669 0.0806 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 1.92e-01 -0.146 0.112 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00732 0.101 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 3.18e-01 0.11 0.109 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0148 0.136 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 1.37e-01 0.184 0.124 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000661 0.117 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 8.42e-01 0.0244 0.122 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 7.13e-02 -0.225 0.124 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 5.35e-01 0.0702 0.113 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 4.23e-01 0.0916 0.114 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0964 0.134 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 1.74e-01 -0.174 0.128 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 2.81e-01 -0.141 0.131 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 2.00e-01 0.158 0.123 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0102 0.116 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 3.14e-01 -0.129 0.128 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 5.07e-01 -0.077 0.116 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 2.74e-01 -0.142 0.129 0.171 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 3.55e-01 -0.106 0.115 0.171 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0358 0.11 0.171 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 8.05e-01 0.0257 0.104 0.171 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0687 0.114 0.171 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0171 0.116 0.171 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 6.27e-01 -0.058 0.119 0.171 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 3.39e-01 0.127 0.132 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 2.59e-01 -0.126 0.112 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 1.82e-01 0.157 0.117 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0688 0.116 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 5.69e-01 0.0643 0.113 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 1.46e-01 -0.17 0.116 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0951 0.115 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 7.63e-01 0.0373 0.124 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 2.63e-01 -0.102 0.0913 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0827 0.0938 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 6.62e-01 0.0438 0.1 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0389 0.0891 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 4.37e-01 0.0976 0.125 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 3.58e-01 0.0952 0.103 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 2.82e-01 -0.146 0.135 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 7.45e-01 0.0396 0.121 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 2.60e-01 -0.133 0.118 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 9.18e-01 0.0116 0.113 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 9.38e-01 0.00992 0.127 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 3.85e-02 0.247 0.119 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 7.69e-01 0.0342 0.116 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 1.44e-01 0.182 0.124 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0568 0.0971 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0405 0.105 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 5.41e-01 0.0708 0.116 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0896 0.0983 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0133 0.123 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 5.61e-01 0.0664 0.114 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 3.39e-01 0.135 0.141 0.185 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 1.00e+00 -5.41e-05 0.164 0.185 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0959 0.142 0.185 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -33039 sc-eQTL 1.38e-01 0.196 0.131 0.185 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 4.51e-01 0.0714 0.0945 0.185 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 7.35e-01 0.0495 0.146 0.185 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0481 0.13 0.185 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 8.28e-01 -0.03 0.138 0.185 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 4.06e-01 0.0779 0.0936 0.174 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0327 0.119 0.174 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 2.72e-01 -0.122 0.111 0.174 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 8.75e-01 0.0125 0.0796 0.174 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 3.66e-01 0.106 0.117 0.174 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 4.48e-02 -0.222 0.11 0.174 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 2.81e-02 -0.224 0.101 0.174 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 9.97e-01 0.000458 0.126 0.171 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 9.99e-01 0.000162 0.122 0.171 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0299 0.0978 0.171 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0342 0.112 0.171 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0585 0.121 0.171 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 8.47e-01 0.022 0.114 0.171 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 3.24e-01 -0.112 0.114 0.171 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 1.64e-01 -0.174 0.124 0.171 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0898 0.135 0.171 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 3.77e-01 0.103 0.116 0.171 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 5.89e-01 -0.044 0.0814 0.171 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 5.01e-01 0.0795 0.118 0.171 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -719019 sc-eQTL 2.05e-01 0.132 0.104 0.171 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -815680 sc-eQTL 1.13e-01 -0.163 0.102 0.171 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 2.70e-01 -0.122 0.11 0.171 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 2.16e-01 0.126 0.102 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 2.75e-01 0.125 0.114 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 4.68e-01 0.056 0.0771 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0744 0.0675 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -218212 sc-eQTL 5.40e-02 -0.245 0.126 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 6.16e-01 0.0523 0.104 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -719019 sc-eQTL 5.92e-01 0.0692 0.129 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -815680 sc-eQTL 1.25e-01 0.175 0.114 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 2.22e-01 0.13 0.106 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 9.81e-02 0.177 0.107 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 9.14e-02 0.214 0.126 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 4.03e-01 0.0766 0.0915 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 6.09e-01 -0.036 0.0704 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -218212 sc-eQTL 7.41e-02 -0.217 0.121 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0643 0.11 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -719019 sc-eQTL 5.41e-01 0.0788 0.129 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -815680 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0496 0.105 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0727 0.105 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 4.71e-01 0.115 0.159 0.182 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 3.96e-01 0.116 0.136 0.182 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0919 0.141 0.182 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 3.93e-01 -0.131 0.153 0.182 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 2.65e-01 0.156 0.139 0.182 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 1.14e-01 -0.223 0.14 0.182 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 1.50e-01 -0.197 0.136 0.182 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 3.17e-01 -0.119 0.119 0.167 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 6.30e-01 0.0619 0.128 0.167 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0364 0.109 0.167 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 3.18e-01 0.0852 0.0852 0.167 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -218212 sc-eQTL 6.06e-02 -0.219 0.116 0.167 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 5.26e-01 0.0779 0.123 0.167 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -719019 sc-eQTL 3.66e-01 0.111 0.122 0.167 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -815680 sc-eQTL 1.92e-01 0.151 0.115 0.167 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 1.82e-02 0.272 0.114 0.167 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 3.45e-01 0.105 0.111 0.172 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0166 0.119 0.172 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 9.88e-01 0.00145 0.0969 0.172 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 2.34e-01 0.105 0.0877 0.172 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -218212 sc-eQTL 9.42e-02 -0.165 0.0979 0.172 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0636 0.113 0.172 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -719019 sc-eQTL 9.40e-01 0.00811 0.108 0.172 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -815680 sc-eQTL 9.96e-02 0.177 0.107 0.172 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 3.65e-01 0.101 0.111 0.172 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 9.55e-01 0.00709 0.125 0.167 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0662 0.137 0.167 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0228 0.113 0.167 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 5.04e-01 0.0705 0.105 0.167 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0221 0.137 0.167 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -719019 sc-eQTL 4.26e-01 0.102 0.128 0.167 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -815680 sc-eQTL 3.62e-01 0.0904 0.0989 0.167 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 8.02e-01 0.0294 0.117 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0918 0.125 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 4.53e-01 -0.078 0.104 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 5.07e-01 0.0611 0.0919 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -33039 sc-eQTL 3.97e-01 0.0888 0.105 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 3.70e-01 0.0591 0.0658 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0463 0.109 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 1.41e-01 -0.128 0.0867 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 3.10e-01 0.0965 0.0948 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 6.77e-01 0.0476 0.114 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 1.04e-01 -0.146 0.0896 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 2.17e-01 0.105 0.085 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -33039 sc-eQTL 7.38e-01 0.0275 0.0821 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 1.15e-02 0.145 0.057 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 7.85e-02 0.185 0.105 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0915 0.0744 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 2.38e-01 0.105 0.0884 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 1.26e-01 0.148 0.0963 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 6.09e-02 0.205 0.109 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 1.95e-01 0.0905 0.0697 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0609 0.0613 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -218212 sc-eQTL 3.09e-02 -0.27 0.124 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 8.65e-01 0.015 0.0882 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -719019 sc-eQTL 6.68e-01 0.0553 0.129 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -815680 sc-eQTL 2.44e-01 0.123 0.105 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 6.05e-01 0.0513 0.099 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 3.41e-01 0.101 0.105 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00353 0.116 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0505 0.0946 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 5.83e-01 0.0416 0.0757 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -218212 sc-eQTL 8.70e-02 -0.189 0.11 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0236 0.101 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -719019 sc-eQTL 3.84e-01 0.1 0.115 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -815680 sc-eQTL 1.80e-02 0.256 0.107 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 1.25e-01 0.167 0.108 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -606242 sc-eQTL 2.05e-01 0.15 0.118 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -606436 sc-eQTL 1.67e-01 -0.112 0.0805 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -375445 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0604 0.0885 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -67228 sc-eQTL 8.66e-01 0.0167 0.0991 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -954350 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0495 0.0752 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 sc-eQTL 9.47e-02 0.191 0.114 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -41147 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0292 0.0986 0.17 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -27958 eQTL 1.95e-02 -0.0386 0.0165 0.0 0.0 0.17
ENSG00000284543 LINC01226 -815735 eQTL 0.0115 -0.105 0.0415 0.00123 0.0 0.17

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000237329 \N -346188 1.17e-06 6.56e-07 1.05e-07 4.39e-07 1.07e-07 2.77e-07 5.8e-07 1.4e-07 5.06e-07 2.82e-07 8.15e-07 4.03e-07 9.65e-07 1.59e-07 2.81e-07 2.36e-07 3.63e-07 4.11e-07 2.57e-07 1.76e-07 2.52e-07 4.31e-07 4.01e-07 1.8e-07 1.06e-06 2.54e-07 2.71e-07 2.73e-07 4.22e-07 7.39e-07 3.67e-07 6.37e-08 5.47e-08 2.08e-07 3.8e-07 1.49e-07 1.31e-07 1.09e-07 7.54e-08 2.15e-08 1.47e-07 6.81e-07 2.99e-08 1.06e-08 1.45e-07 2.64e-08 1.07e-07 3.17e-08 5.86e-08
ENSG00000284543 LINC01226 -815735 2.67e-07 1.3e-07 3.88e-08 1.82e-07 9.25e-08 9.76e-08 1.49e-07 5.37e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.57e-07 8.55e-08 1.47e-07 7.13e-08 6.04e-08 7.3e-08 3.87e-08 1.26e-07 5.75e-08 4.23e-08 1.21e-07 1.28e-07 1.44e-07 3.23e-08 1.46e-07 1.14e-07 1.06e-07 9.61e-08 1.09e-07 1.03e-07 9.7e-08 2.93e-08 3.66e-08 8.23e-08 6.67e-08 3.49e-08 5.45e-08 8.63e-08 6.59e-08 3.86e-08 5.28e-08 1.36e-07 5.27e-08 1.13e-08 4.7e-08 1.86e-08 1.21e-07 1.91e-09 5e-08