logo

Genes within 1Mb (chr1:30688914:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 4.68e-01 0.0772 0.106 0.167 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 6.18e-02 -0.159 0.0846 0.167 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 4.44e-01 0.0547 0.0714 0.167 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -34671 sc-eQTL 3.00e-01 0.0779 0.075 0.167 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 1.89e-01 0.0773 0.0586 0.167 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 5.16e-01 0.0578 0.0888 0.167 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0824 0.0688 0.167 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 2.24e-01 0.0993 0.0814 0.167 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 4.64e-01 0.0683 0.093 0.167 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 5.05e-01 0.0486 0.0727 0.167 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 4.00e-02 -0.133 0.0641 0.167 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 6.52e-01 0.0324 0.0718 0.167 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 9.47e-01 0.00496 0.0751 0.167 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0615 0.0641 0.167 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0324 0.0769 0.167 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 4.06e-01 -0.102 0.122 0.167 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00981 0.0816 0.167 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0168 0.0719 0.167 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 3.31e-01 0.0678 0.0696 0.167 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 7.05e-02 -0.155 0.0853 0.167 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00397 0.0818 0.167 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0357 0.103 0.167 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 1.20e-01 -0.172 0.11 0.16 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 2.84e-01 -0.14 0.131 0.16 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 6.93e-01 0.0405 0.103 0.16 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 6.43e-01 0.034 0.0732 0.16 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0339 0.119 0.16 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -720651 sc-eQTL 4.19e-01 0.0976 0.121 0.16 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -817312 sc-eQTL 3.25e-01 0.0787 0.0798 0.16 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 2.07e-01 -0.146 0.115 0.16 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 3.25e-01 0.0838 0.0848 0.167 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 4.96e-02 0.206 0.104 0.167 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 4.84e-01 0.0473 0.0675 0.167 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 8.60e-01 -0.011 0.0622 0.167 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -219844 sc-eQTL 5.88e-02 -0.225 0.118 0.167 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0288 0.0838 0.167 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -720651 sc-eQTL 2.90e-01 0.136 0.128 0.167 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -817312 sc-eQTL 1.68e-01 0.156 0.112 0.167 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 1.52e-01 0.141 0.0982 0.167 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 2.10e-01 0.147 0.117 0.165 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 7.55e-02 -0.142 0.0796 0.165 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0439 0.084 0.165 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 9.67e-01 0.00401 0.0968 0.165 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0133 0.0707 0.165 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 4.51e-01 0.082 0.109 0.165 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0941 0.1 0.165 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0211 0.0871 0.167 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0626 0.093 0.167 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 1.24e-02 -0.208 0.0825 0.167 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 4.05e-01 0.0571 0.0685 0.167 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 6.91e-01 0.0364 0.0916 0.167 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0892 0.112 0.167 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0411 0.117 0.167 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 4.61e-01 0.105 0.142 0.171 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 4.93e-01 0.0984 0.143 0.171 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 2.65e-01 -0.149 0.133 0.171 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -34671 sc-eQTL 1.98e-01 -0.15 0.116 0.171 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0278 0.0812 0.171 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0811 0.138 0.171 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 3.60e-01 0.12 0.131 0.171 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00893 0.116 0.171 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0865 0.132 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0968 0.11 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0224 0.104 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -34671 sc-eQTL 4.65e-01 0.0791 0.108 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 6.46e-01 0.0306 0.0663 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 7.85e-01 0.0337 0.123 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 1.43e-02 -0.227 0.0918 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0448 0.104 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0481 0.129 0.166 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00595 0.119 0.166 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 4.76e-01 0.0737 0.103 0.166 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -34671 sc-eQTL 8.58e-01 0.0178 0.099 0.166 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 8.88e-01 0.0124 0.0878 0.166 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 5.79e-01 0.065 0.117 0.166 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 6.55e-01 -0.045 0.1 0.166 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 2.32e-01 0.141 0.117 0.166 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 8.15e-02 0.205 0.117 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 2.60e-01 -0.115 0.102 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 3.58e-01 0.0828 0.0898 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -34671 sc-eQTL 9.62e-01 0.00431 0.0913 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 3.24e-02 0.13 0.0603 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 1.17e-02 0.269 0.106 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0894 0.0799 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 6.98e-01 0.0385 0.0989 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 2.14e-01 -0.156 0.125 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 2.05e-01 -0.132 0.103 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0162 0.102 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -34671 sc-eQTL 7.64e-01 0.0293 0.0976 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 1.59e-01 0.0931 0.066 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 7.84e-01 -0.033 0.121 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 9.65e-01 0.00429 0.0965 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 3.70e-01 0.0936 0.104 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 3.93e-01 0.107 0.124 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 9.39e-01 0.00934 0.122 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 5.25e-02 -0.232 0.119 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 1.69e-01 0.147 0.107 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 3.27e-01 0.108 0.11 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 3.57e-01 0.108 0.117 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 2.12e-03 0.314 0.101 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 2.72e-01 -0.107 0.0968 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 9.42e-01 0.00628 0.0861 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 3.35e-02 -0.146 0.068 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 6.86e-01 0.0298 0.0736 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 6.21e-01 0.04 0.0807 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 5.22e-02 -0.145 0.0741 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 6.81e-01 0.0354 0.0858 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 1.14e-01 0.193 0.122 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 9.30e-01 0.00867 0.0988 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 4.39e-01 0.0677 0.0874 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0235 0.0726 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0991 0.097 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0789 0.0919 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0851 0.102 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 4.15e-01 0.1 0.123 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 2.75e-02 0.257 0.116 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000971 0.0977 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0872 0.0986 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 5.56e-01 0.0652 0.111 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 5.71e-01 0.0655 0.116 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 9.77e-01 0.00335 0.114 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0224 0.132 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 1.90e-01 0.133 0.101 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 6.32e-02 0.183 0.0977 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 6.61e-01 0.0478 0.109 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0697 0.0949 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0145 0.115 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0299 0.108 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 2.63e-01 -0.136 0.122 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 1.44e-01 -0.153 0.105 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 9.73e-02 -0.14 0.084 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 5.41e-01 0.0496 0.081 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0919 0.112 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0238 0.101 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 3.27e-01 0.108 0.11 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0556 0.136 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 1.96e-01 0.161 0.124 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0145 0.117 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 6.86e-01 0.0497 0.123 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 9.93e-02 -0.206 0.124 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 7.87e-01 0.0307 0.114 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 4.34e-01 0.0899 0.115 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 3.20e-01 -0.134 0.134 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 1.59e-01 -0.182 0.128 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0927 0.132 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 3.52e-01 0.116 0.124 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0301 0.117 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 1.52e-01 -0.184 0.128 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 5.77e-01 -0.065 0.116 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 1.70e-01 -0.179 0.13 0.167 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0198 0.116 0.167 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0698 0.111 0.167 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 8.36e-01 0.0218 0.105 0.167 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 3.13e-01 -0.116 0.115 0.167 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 9.62e-01 0.00557 0.117 0.167 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 8.16e-01 -0.028 0.12 0.167 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 6.50e-01 0.0607 0.133 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 2.08e-01 -0.142 0.112 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 9.18e-02 0.199 0.118 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 3.13e-01 -0.118 0.117 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 5.01e-01 0.0764 0.113 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 7.52e-02 -0.208 0.117 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 3.35e-01 -0.112 0.115 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 9.86e-01 0.00215 0.124 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 1.73e-01 -0.125 0.0912 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0959 0.0937 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 6.94e-01 0.0394 0.1 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0632 0.0891 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 9.40e-01 0.00948 0.126 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 4.24e-01 0.0828 0.103 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 3.00e-01 -0.142 0.136 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 8.40e-01 0.0247 0.122 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 3.86e-01 -0.103 0.119 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 9.13e-01 0.0125 0.114 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 9.08e-01 0.0148 0.128 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 6.74e-02 0.22 0.12 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 3.63e-01 0.106 0.117 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 4.20e-01 0.1 0.124 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0451 0.097 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0891 0.105 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 6.14e-01 0.0583 0.115 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0679 0.0983 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 9.52e-01 0.00738 0.122 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 5.02e-01 0.0766 0.114 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 2.89e-01 0.147 0.137 0.181 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00156 0.16 0.181 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0733 0.139 0.181 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -34671 sc-eQTL 2.34e-01 0.154 0.129 0.181 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0123 0.0926 0.181 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 6.60e-01 0.0629 0.143 0.181 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0291 0.127 0.181 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00662 0.135 0.181 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 6.40e-01 0.0439 0.0938 0.17 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0531 0.119 0.17 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 1.73e-01 -0.151 0.111 0.17 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0209 0.0797 0.17 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 4.18e-01 0.0948 0.117 0.17 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 5.77e-02 -0.211 0.11 0.17 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 5.38e-02 -0.197 0.102 0.17 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 9.97e-01 0.000513 0.127 0.167 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 8.10e-01 0.0295 0.123 0.167 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0598 0.098 0.167 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0583 0.112 0.167 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00093 0.121 0.167 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 9.01e-01 0.0142 0.114 0.167 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0667 0.114 0.167 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 4.50e-02 -0.253 0.125 0.166 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 4.07e-01 -0.114 0.137 0.166 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 2.12e-01 0.147 0.117 0.166 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0283 0.0824 0.166 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 6.69e-01 0.051 0.119 0.166 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -720651 sc-eQTL 1.55e-01 0.151 0.105 0.166 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -817312 sc-eQTL 6.09e-02 -0.194 0.103 0.166 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 3.68e-01 -0.101 0.112 0.166 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 2.35e-01 0.121 0.102 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 2.88e-01 0.121 0.114 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 5.73e-01 0.0436 0.0772 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0552 0.0677 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -219844 sc-eQTL 4.61e-02 -0.254 0.127 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 6.29e-01 0.0504 0.104 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -720651 sc-eQTL 2.19e-01 0.159 0.129 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -817312 sc-eQTL 4.58e-01 0.0848 0.114 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 1.45e-01 0.155 0.106 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 2.40e-01 0.127 0.108 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 6.45e-02 0.236 0.127 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 4.94e-01 0.0633 0.0924 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 8.86e-01 0.0102 0.0711 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -219844 sc-eQTL 1.99e-01 -0.158 0.122 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0928 0.111 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -720651 sc-eQTL 2.38e-01 0.153 0.13 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -817312 sc-eQTL 9.79e-01 -0.0028 0.106 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0443 0.106 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 6.08e-01 0.0815 0.159 0.173 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 7.69e-01 0.0401 0.136 0.173 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 1.96e-01 -0.181 0.14 0.173 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0534 0.153 0.173 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 1.67e-01 0.193 0.139 0.173 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 1.53e-01 -0.201 0.14 0.173 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 1.51e-01 -0.196 0.136 0.173 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 1.02e-01 -0.197 0.12 0.16 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 8.99e-01 0.0165 0.13 0.16 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0591 0.11 0.16 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 2.85e-01 0.0924 0.0862 0.16 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -219844 sc-eQTL 1.09e-01 -0.189 0.118 0.16 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 4.56e-01 0.0928 0.124 0.16 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -720651 sc-eQTL 1.56e-01 0.175 0.123 0.16 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -817312 sc-eQTL 3.58e-01 0.108 0.117 0.16 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 3.20e-02 0.251 0.116 0.16 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 7.21e-01 0.0398 0.111 0.167 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 9.09e-01 0.0135 0.119 0.167 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00135 0.0971 0.167 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 3.79e-01 0.0775 0.088 0.167 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -219844 sc-eQTL 2.16e-01 -0.122 0.0984 0.167 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0961 0.113 0.167 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -720651 sc-eQTL 7.89e-01 0.0288 0.108 0.167 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -817312 sc-eQTL 2.49e-01 0.124 0.107 0.167 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 3.81e-01 0.0978 0.111 0.167 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0455 0.124 0.164 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0374 0.136 0.164 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 7.34e-01 0.0384 0.113 0.164 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 5.44e-01 0.0639 0.105 0.164 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0392 0.136 0.164 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -720651 sc-eQTL 5.07e-01 0.0847 0.127 0.164 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -817312 sc-eQTL 4.72e-01 0.0712 0.0988 0.164 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 8.98e-01 -0.015 0.116 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0393 0.125 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0826 0.104 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 6.86e-01 0.0374 0.0924 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -34671 sc-eQTL 6.43e-01 0.0489 0.105 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 6.31e-01 0.0318 0.0662 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0331 0.11 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 1.44e-01 -0.128 0.0871 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 5.37e-01 0.059 0.0954 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 4.01e-01 0.0961 0.114 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 7.44e-02 -0.161 0.0897 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 3.89e-01 0.0736 0.0854 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -34671 sc-eQTL 8.73e-01 0.0132 0.0823 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 1.03e-02 0.148 0.0571 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 2.71e-02 0.233 0.105 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0798 0.0747 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 1.15e-01 0.14 0.0884 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 2.04e-01 0.123 0.0967 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 4.36e-02 0.221 0.109 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 2.66e-01 0.078 0.07 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0213 0.0616 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -219844 sc-eQTL 4.52e-02 -0.251 0.125 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00137 0.0885 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -720651 sc-eQTL 2.76e-01 0.141 0.129 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -817312 sc-eQTL 4.59e-01 0.0787 0.106 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 3.96e-01 0.0843 0.0992 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 8.46e-01 0.0206 0.106 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 8.37e-01 0.0239 0.116 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0597 0.095 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 7.01e-01 0.0293 0.076 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -219844 sc-eQTL 1.50e-01 -0.16 0.111 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0468 0.101 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -720651 sc-eQTL 2.38e-01 0.136 0.115 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -817312 sc-eQTL 1.42e-01 0.16 0.109 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 1.84e-01 0.145 0.109 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -607874 sc-eQTL 4.03e-01 0.0991 0.118 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608068 sc-eQTL 1.35e-01 -0.121 0.0804 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -377077 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0895 0.0883 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -68860 sc-eQTL 9.77e-01 0.00289 0.0989 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -955982 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0453 0.0751 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 sc-eQTL 2.08e-01 0.144 0.114 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -42779 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00942 0.0985 0.166 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29590 eQTL 3.37e-02 -0.0355 0.0167 0.0 0.0 0.165
ENSG00000284543 LINC01226 -817367 eQTL 0.00689 -0.114 0.042 0.00151 0.0 0.165

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162511 \N -68860 2.22e-05 4.7e-06 8.75e-07 3.4e-06 1.73e-06 6.2e-06 7.26e-06 1.03e-06 4.09e-06 1.98e-06 5.19e-06 2.65e-06 7.74e-06 2.29e-06 1.43e-06 4e-06 1.83e-06 3.97e-06 1.36e-06 1.41e-06 2.75e-06 5.63e-06 4.58e-06 1.7e-06 7.08e-06 1.54e-06 2.53e-06 1.78e-06 4.5e-06 4.15e-06 1.99e-06 5.77e-07 5.21e-07 1.86e-06 1.98e-06 8.85e-07 9.55e-07 4.08e-07 8.1e-07 7.22e-07 8.54e-07 8.39e-06 4.32e-06 1.38e-07 7.91e-07 3.49e-07 9.2e-07 2.87e-07 1.41e-07
ENSG00000237329 \N -347820 1.26e-06 2.4e-07 6.57e-08 4.34e-07 1.1e-07 4.77e-07 5.8e-07 7.98e-08 2.35e-07 1.37e-07 2.98e-07 1.59e-07 4.88e-07 9.18e-08 5.97e-08 1.84e-07 6.17e-08 4.2e-07 9.69e-08 1.73e-07 2.89e-07 2.7e-07 3.07e-07 1.13e-07 5.75e-07 2.42e-07 1.85e-07 1.48e-07 2.19e-07 4.1e-07 1.35e-07 3.9e-08 9.79e-08 1.39e-07 3.63e-07 5.14e-08 6.39e-08 1.24e-07 4.37e-08 3.05e-08 1.35e-07 4.82e-07 6.16e-07 1.7e-08 1.27e-07 8.24e-09 1.29e-07 0.0 4.97e-08
ENSG00000284543 LINC01226 -817367 2.95e-07 1.06e-07 3.35e-08 1.82e-07 9.02e-08 8.45e-08 1.44e-07 5.49e-08 1.42e-07 4.24e-08 1.63e-07 8.03e-08 1.26e-07 6.21e-08 4.84e-08 7.5e-08 4.94e-08 1.18e-07 5.19e-08 4.07e-08 1.19e-07 1.28e-07 1.32e-07 4.53e-08 1.33e-07 1.14e-07 1.12e-07 8.71e-08 1.02e-07 1.12e-07 9.58e-08 3.76e-08 3.35e-08 8.65e-08 8.21e-08 3.87e-08 4.78e-08 9.22e-08 7.63e-08 3.18e-08 4.02e-08 1.35e-07 3.25e-08 2.96e-08 7.91e-08 1.72e-08 1.22e-07 4.26e-09 4.77e-08