logo

Genes within 1Mb (chr1:30688733:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0747 0.0974 0.199 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0429 0.0781 0.199 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0156 0.0656 0.199 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -34852 sc-eQTL 8.01e-03 -0.181 0.0678 0.199 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 5.07e-01 0.0358 0.0539 0.199 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 1.20e-01 0.127 0.081 0.199 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 3.24e-01 0.0624 0.0631 0.199 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 2.18e-01 0.0923 0.0746 0.199 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 4.30e-01 0.0669 0.0847 0.199 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 5.01e-01 0.0446 0.0662 0.199 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0209 0.059 0.199 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 5.54e-01 0.0387 0.0653 0.199 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 6.15e-01 0.0344 0.0683 0.199 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 1.91e-01 0.0764 0.0583 0.199 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 8.37e-01 0.0145 0.0701 0.199 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 2.19e-01 0.138 0.112 0.199 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 1.01e-01 -0.122 0.0743 0.199 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 4.48e-01 0.05 0.0658 0.199 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0493 0.0639 0.199 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 9.41e-01 0.00581 0.0788 0.199 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0244 0.0749 0.199 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 6.00e-01 0.0495 0.0941 0.199 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0663 0.0977 0.205 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0722 0.116 0.205 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0686 0.0906 0.205 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 3.53e-02 0.136 0.0641 0.205 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0454 0.105 0.205 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -720832 sc-eQTL 4.77e-01 0.0761 0.107 0.205 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -817493 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0638 0.0707 0.205 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0682 0.102 0.205 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 4.86e-01 0.0528 0.0757 0.199 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0614 0.0938 0.199 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 7.67e-01 0.0179 0.0602 0.199 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 9.44e-01 0.00392 0.0554 0.199 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -220025 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0166 0.106 0.199 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0091 0.0747 0.199 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -720832 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0465 0.114 0.199 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -817493 sc-eQTL 1.44e-01 -0.147 0.1 0.199 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0714 0.0878 0.199 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 2.34e-01 0.126 0.106 0.197 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0525 0.0725 0.197 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 1.58e-01 0.107 0.0758 0.197 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 7.29e-01 0.0304 0.0877 0.197 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 4.98e-01 0.0434 0.0639 0.197 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0537 0.0985 0.197 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 3.12e-01 0.092 0.0908 0.197 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 7.28e-01 0.0277 0.0797 0.199 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0927 0.085 0.199 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0646 0.0765 0.199 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 4.81e-02 0.124 0.0622 0.199 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 9.84e-01 0.00165 0.0839 0.199 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 2.15e-01 0.127 0.103 0.199 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 5.75e-01 0.0601 0.107 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 9.24e-01 0.0122 0.128 0.199 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0204 0.129 0.199 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0677 0.12 0.199 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -34852 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0787 0.105 0.199 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 2.01e-01 0.0935 0.0728 0.199 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 9.57e-03 0.32 0.122 0.199 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 3.66e-01 0.107 0.118 0.199 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 5.52e-01 0.0622 0.104 0.199 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0457 0.121 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 6.38e-01 0.0473 0.1 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 7.39e-01 0.0317 0.0948 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -34852 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00968 0.0987 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 2.24e-01 0.0736 0.0604 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0176 0.112 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 5.52e-01 0.0506 0.0849 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 5.11e-01 0.0625 0.095 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0121 0.12 0.198 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 8.15e-02 0.192 0.11 0.198 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00778 0.096 0.198 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -34852 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0781 0.0917 0.198 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 5.61e-01 0.0474 0.0814 0.198 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 6.42e-01 0.0506 0.109 0.198 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 7.55e-01 0.0291 0.0932 0.198 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0996 0.109 0.198 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 2.39e-01 0.124 0.105 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 3.60e-01 0.0836 0.0912 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 3.87e-01 0.0698 0.0804 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -34852 sc-eQTL 1.63e-02 -0.195 0.0806 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 4.83e-01 0.0383 0.0545 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 3.51e-01 0.0898 0.0961 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 5.62e-01 0.0416 0.0717 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 7.31e-02 0.158 0.0879 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 7.49e-01 0.0362 0.113 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 4.32e-03 -0.264 0.0914 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 1.05e-02 -0.232 0.0898 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -34852 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0754 0.0874 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 3.33e-01 0.0576 0.0593 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 3.74e-02 0.224 0.107 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 5.64e-01 0.0499 0.0865 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 9.55e-01 0.00525 0.0936 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 6.12e-01 -0.057 0.112 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 2.89e-01 -0.117 0.11 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 8.58e-02 0.186 0.108 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0754 0.0964 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 1.94e-01 -0.128 0.0986 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 1.77e-01 0.142 0.105 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 1.30e-02 -0.23 0.0918 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 2.06e-01 0.112 0.0887 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 7.03e-01 0.0301 0.0789 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0186 0.063 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 2.85e-01 0.0721 0.0673 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 4.10e-01 0.0611 0.0739 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 2.02e-01 0.0873 0.0682 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 2.83e-01 0.0845 0.0785 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 6.51e-01 0.0503 0.111 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00206 0.0897 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0273 0.0794 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0303 0.0658 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 2.96e-01 0.0922 0.0881 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 2.91e-01 0.0882 0.0834 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 3.67e-01 -0.084 0.0929 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 4.40e-01 0.0844 0.109 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0695 0.104 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 7.63e-01 0.0262 0.0868 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 1.46e-01 0.128 0.0874 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 1.88e-01 -0.129 0.0979 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0835 0.103 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 1.55e-01 -0.144 0.101 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0302 0.119 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0462 0.0914 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 9.98e-01 0.000277 0.0888 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00973 0.0984 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 6.80e-01 0.0353 0.0856 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 3.97e-01 0.0877 0.103 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0508 0.0972 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 1.90e-01 0.145 0.11 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 6.33e-02 -0.177 0.0947 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 3.99e-01 0.0649 0.0767 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 3.82e-01 0.0645 0.0735 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 5.00e-01 0.0691 0.102 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 2.08e-01 0.116 0.0916 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 6.92e-01 0.0398 0.1 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0547 0.126 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 7.66e-01 0.0343 0.115 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0161 0.108 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00291 0.113 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 1.56e-01 -0.164 0.115 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 2.31e-01 -0.125 0.104 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0776 0.106 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 6.74e-01 0.0483 0.114 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 6.95e-01 0.0431 0.11 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 3.23e-01 -0.111 0.112 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 3.72e-01 0.0942 0.105 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 2.68e-01 -0.11 0.0991 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0328 0.11 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00331 0.0991 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 2.19e-01 0.144 0.117 0.199 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 8.95e-01 0.0137 0.104 0.199 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00707 0.0994 0.199 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 7.18e-02 0.168 0.093 0.199 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 4.20e-01 0.0832 0.103 0.199 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0108 0.104 0.199 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0198 0.108 0.199 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 7.75e-01 0.0336 0.117 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0268 0.0989 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 1.67e-01 0.143 0.103 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 2.10e-03 0.312 0.1 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0454 0.0995 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 7.02e-01 0.0395 0.103 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 1.74e-01 0.138 0.101 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 8.44e-01 0.0221 0.112 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 1.71e-01 -0.114 0.0827 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 3.29e-01 0.0832 0.085 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00535 0.0909 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 9.92e-01 0.000803 0.0809 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0158 0.114 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0161 0.0939 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 3.54e-01 0.108 0.116 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 2.16e-01 0.128 0.103 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0675 0.101 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 6.57e-01 0.0429 0.0964 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 7.44e-01 0.0355 0.109 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 7.63e-01 -0.031 0.103 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 5.39e-01 -0.061 0.0991 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 7.81e-01 0.03 0.108 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0155 0.0843 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 2.80e-01 0.0985 0.0909 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 8.81e-01 0.015 0.1 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 6.76e-01 0.0358 0.0855 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 9.24e-01 0.0101 0.106 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 5.29e-01 0.0624 0.0989 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 8.08e-01 0.0334 0.137 0.181 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 2.81e-01 -0.171 0.158 0.181 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00156 0.138 0.181 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -34852 sc-eQTL 1.69e-01 -0.177 0.128 0.181 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 2.11e-01 -0.115 0.0914 0.181 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0321 0.142 0.181 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 5.61e-01 0.0734 0.126 0.181 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 7.61e-01 -0.041 0.134 0.181 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 2.05e-01 -0.111 0.0876 0.196 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00524 0.112 0.196 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 9.25e-01 0.00976 0.104 0.196 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0297 0.0746 0.196 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0203 0.11 0.196 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 2.90e-01 -0.11 0.104 0.196 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 6.77e-01 -0.04 0.0959 0.196 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 9.47e-01 0.00753 0.112 0.199 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 6.99e-01 0.042 0.109 0.199 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 8.46e-01 0.0169 0.087 0.199 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 3.01e-01 0.103 0.0993 0.199 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 3.58e-01 0.099 0.107 0.199 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 6.42e-01 0.0473 0.101 0.199 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 7.95e-01 0.0264 0.101 0.199 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 3.98e-01 0.0962 0.114 0.207 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0563 0.123 0.207 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 7.42e-02 -0.188 0.105 0.207 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 4.25e-02 0.15 0.0733 0.207 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0536 0.107 0.207 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -720832 sc-eQTL 7.15e-01 0.0347 0.0952 0.207 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -817493 sc-eQTL 4.81e-02 0.184 0.0925 0.207 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 7.61e-01 0.0306 0.101 0.207 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 6.50e-02 0.167 0.0899 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 9.95e-01 0.000645 0.101 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 4.88e-01 0.0475 0.0684 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0149 0.0601 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -220025 sc-eQTL 6.95e-01 0.0444 0.113 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0197 0.0924 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -720832 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0174 0.115 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -817493 sc-eQTL 3.14e-01 -0.102 0.101 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0397 0.0944 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 6.07e-01 0.0492 0.0953 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0482 0.113 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 8.27e-01 0.0179 0.0815 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 5.44e-01 0.0381 0.0626 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -220025 sc-eQTL 2.37e-01 0.128 0.108 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0622 0.0976 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -720832 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0275 0.115 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -817493 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0595 0.0929 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0538 0.0933 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0639 0.136 0.209 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 7.13e-01 -0.043 0.117 0.209 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 3.83e-01 0.105 0.12 0.209 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 2.04e-01 0.166 0.13 0.209 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0835 0.12 0.209 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 5.33e-01 0.0754 0.121 0.209 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 8.29e-01 0.0252 0.117 0.209 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 6.11e-01 0.0549 0.108 0.2 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0927 0.116 0.2 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 3.95e-01 0.0837 0.0982 0.2 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0189 0.0772 0.2 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -220025 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0811 0.106 0.2 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 8.81e-02 0.189 0.11 0.2 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -720832 sc-eQTL 2.68e-01 -0.123 0.11 0.2 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -817493 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0304 0.105 0.2 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 8.31e-01 0.0225 0.105 0.2 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 9.96e-02 -0.161 0.0972 0.201 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 1.86e-01 0.138 0.104 0.201 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 7.44e-01 0.0279 0.0852 0.201 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0465 0.0774 0.201 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -220025 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0643 0.0867 0.201 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 2.00e-02 0.23 0.0982 0.201 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -720832 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00676 0.0948 0.201 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -817493 sc-eQTL 6.73e-01 -0.04 0.0946 0.201 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0949 0.0979 0.201 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 4.54e-02 -0.223 0.111 0.198 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 8.86e-01 0.0177 0.123 0.198 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 4.81e-01 0.072 0.102 0.198 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 6.33e-01 0.0454 0.0948 0.198 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 9.04e-01 0.0149 0.123 0.198 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -720832 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0224 0.115 0.198 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -817493 sc-eQTL 3.96e-02 -0.183 0.0881 0.198 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0977 0.105 0.198 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 9.27e-01 0.0107 0.116 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 3.10e-01 0.0982 0.0965 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0132 0.0857 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -34852 sc-eQTL 8.93e-02 -0.166 0.097 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 8.14e-02 0.107 0.061 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0166 0.102 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 2.74e-01 0.0889 0.081 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 8.38e-01 0.0181 0.0885 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 5.71e-01 0.0581 0.102 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0695 0.0809 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0582 0.0766 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -34852 sc-eQTL 4.28e-02 -0.149 0.0731 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 5.59e-01 0.0304 0.0519 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 1.39e-01 0.14 0.0944 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 5.83e-01 0.0369 0.0671 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 3.24e-01 0.0787 0.0796 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 1.50e-01 0.124 0.0859 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0163 0.0978 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 4.78e-01 0.0442 0.0623 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 8.11e-01 0.0131 0.0548 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -220025 sc-eQTL 2.97e-01 0.117 0.112 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0803 0.0784 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -720832 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0263 0.115 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -817493 sc-eQTL 1.82e-01 -0.126 0.0939 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0282 0.0883 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 1.94e-01 -0.124 0.0949 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0562 0.104 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 6.91e-01 0.034 0.0854 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0239 0.0683 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -220025 sc-eQTL 2.41e-01 -0.117 0.0994 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 2.37e-02 0.204 0.0896 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -720832 sc-eQTL 1.98e-01 -0.133 0.103 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -817493 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0924 0.098 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0868 0.0982 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -608055 sc-eQTL 2.44e-01 0.124 0.106 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -608249 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0493 0.0728 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -377258 sc-eQTL 2.86e-01 0.0852 0.0796 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000866 0.0893 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -956163 sc-eQTL 5.98e-01 0.0358 0.0678 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0603 0.103 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -42960 sc-eQTL 7.00e-01 0.0343 0.0888 0.198 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162511 LAPTM5 -69041 eQTL 0.00478 -0.032 0.0113 0.0 0.0 0.217
ENSG00000162517 PEF1 -956163 eQTL 0.0218 0.0387 0.0169 0.0 0.0 0.217
ENSG00000168528 SERINC2 -720832 eQTL 0.0158 0.106 0.0437 0.0 0.0 0.217
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 eQTL 4.33e-04 0.0502 0.0142 0.0 0.0 0.217

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000168528 SERINC2 -720832 3.02e-07 1.34e-07 5.82e-08 2.01e-07 9.21e-08 7.75e-08 1.81e-07 5.4e-08 1.44e-07 5.42e-08 1.56e-07 1.01e-07 1.45e-07 7.64e-08 5.69e-08 7.5e-08 3.88e-08 1.4e-07 7.18e-08 4.89e-08 1.25e-07 1.24e-07 1.44e-07 3.23e-08 1.46e-07 1.25e-07 1.12e-07 9.74e-08 1.23e-07 1.11e-07 9.73e-08 3.65e-08 3.66e-08 9.52e-08 3.81e-08 3.53e-08 4.62e-08 8.72e-08 6.59e-08 3.76e-08 5.43e-08 1.33e-07 3.19e-08 7.39e-09 4.25e-08 1.8e-08 1.21e-07 1.88e-09 5.04e-08
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -29771 4.04e-05 2.56e-05 4.1e-06 1.27e-05 4e-06 1.27e-05 3.36e-05 3.72e-06 2.12e-05 1.13e-05 2.82e-05 1.08e-05 3.59e-05 1.07e-05 5.37e-06 1.53e-05 1.19e-05 2.17e-05 6.32e-06 4.62e-06 1.04e-05 2.43e-05 2.47e-05 6.4e-06 4.3e-05 5.96e-06 1.11e-05 8.79e-06 2.21e-05 1.88e-05 1.35e-05 1.65e-06 1.56e-06 5.21e-06 9.49e-06 3.76e-06 1.89e-06 2.74e-06 3.25e-06 2.42e-06 1.63e-06 3.1e-05 3.38e-06 3.55e-07 2.13e-06 2.79e-06 3.4e-06 1.3e-06 1.03e-06