logo

Genes within 1Mb (chr1:30687925:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0811 0.0981 0.192 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0088 0.0787 0.192 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0104 0.066 0.192 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -35660 sc-eQTL 3.16e-02 -0.149 0.0686 0.192 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 4.25e-01 0.0433 0.0543 0.192 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 2.04e-01 0.104 0.0817 0.192 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 3.80e-01 0.0559 0.0636 0.192 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 1.40e-01 0.111 0.075 0.192 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 2.12e-01 0.107 0.0851 0.192 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 4.05e-01 0.0556 0.0666 0.192 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0415 0.0594 0.192 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 5.74e-01 0.037 0.0658 0.192 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 8.52e-01 0.0128 0.0689 0.192 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 1.90e-01 0.0772 0.0587 0.192 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 8.54e-01 0.013 0.0705 0.192 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 1.75e-01 0.153 0.112 0.192 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 2.09e-01 -0.0941 0.0747 0.192 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 7.46e-01 0.0214 0.066 0.192 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0607 0.064 0.192 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 8.24e-01 0.0176 0.079 0.192 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00681 0.0751 0.192 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 6.92e-01 0.0374 0.0944 0.192 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0621 0.0974 0.198 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0586 0.115 0.198 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0657 0.0903 0.198 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 8.94e-02 0.109 0.0641 0.198 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0735 0.105 0.198 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -721640 sc-eQTL 4.12e-01 0.0874 0.106 0.198 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -818301 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0421 0.0705 0.198 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0593 0.102 0.198 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 4.61e-01 0.0562 0.0761 0.192 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0723 0.0943 0.192 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 8.59e-01 0.0108 0.0606 0.192 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00514 0.0557 0.192 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -220833 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0165 0.107 0.192 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0131 0.0751 0.192 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -721640 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0359 0.115 0.192 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -818301 sc-eQTL 1.10e-01 -0.162 0.101 0.192 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0581 0.0883 0.192 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 1.46e-01 0.155 0.106 0.191 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 3.66e-01 -0.066 0.0728 0.191 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 2.85e-01 0.0818 0.0763 0.191 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0178 0.088 0.191 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 5.07e-01 0.0427 0.0642 0.191 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0473 0.0989 0.191 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 4.12e-01 0.0749 0.0912 0.191 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 8.83e-01 0.0118 0.0798 0.192 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0735 0.0852 0.192 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0357 0.0767 0.192 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 6.01e-02 0.118 0.0623 0.192 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 9.84e-01 0.00164 0.084 0.192 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 1.73e-01 0.14 0.103 0.192 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 7.25e-01 0.0377 0.107 0.192 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 9.30e-01 0.0113 0.128 0.194 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0112 0.129 0.194 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0359 0.12 0.194 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -35660 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0519 0.105 0.194 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 1.20e-01 0.114 0.0727 0.194 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 6.60e-03 0.336 0.122 0.194 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 4.95e-01 0.0808 0.118 0.194 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 5.84e-01 0.0574 0.105 0.194 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0397 0.121 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 5.28e-01 0.0636 0.101 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 4.44e-01 0.0728 0.0949 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -35660 sc-eQTL 8.24e-01 0.022 0.0989 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 1.53e-01 0.0866 0.0604 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0245 0.113 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 5.57e-01 0.0502 0.0852 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 3.85e-01 0.0828 0.0952 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 9.83e-01 0.00262 0.12 0.192 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 3.78e-02 0.229 0.11 0.192 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0448 0.0963 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -35660 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0777 0.092 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 5.34e-01 0.0509 0.0816 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 5.82e-01 0.0602 0.109 0.192 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 7.14e-01 0.0343 0.0935 0.192 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0945 0.109 0.192 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 4.33e-01 0.0832 0.106 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 2.12e-01 0.114 0.0913 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 4.80e-01 0.0572 0.0808 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -35660 sc-eQTL 3.92e-02 -0.169 0.0812 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 4.34e-01 0.0429 0.0547 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 4.09e-01 0.0799 0.0965 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 6.61e-01 0.0316 0.072 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 5.28e-02 0.172 0.0881 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 5.82e-01 0.0623 0.113 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 3.02e-03 -0.274 0.0913 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 2.54e-02 -0.203 0.0901 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -35660 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0753 0.0874 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 3.04e-01 0.0611 0.0593 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 5.88e-02 0.204 0.107 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 7.37e-01 0.0291 0.0866 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 6.63e-01 0.0408 0.0935 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0981 0.112 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 3.24e-01 -0.109 0.11 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 4.30e-02 0.219 0.107 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0899 0.0966 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 8.07e-02 -0.173 0.0984 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 1.73e-01 0.144 0.105 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 1.01e-02 -0.239 0.0918 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 8.39e-02 0.155 0.089 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 6.98e-01 0.0309 0.0794 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0401 0.0634 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 2.85e-01 0.0726 0.0678 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 5.25e-01 0.0474 0.0745 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 1.59e-01 0.097 0.0686 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 2.40e-01 0.093 0.079 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 4.20e-01 0.0905 0.112 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 9.38e-01 0.00701 0.0904 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0342 0.08 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0299 0.0663 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 3.92e-01 0.0761 0.0888 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 3.08e-01 0.0858 0.084 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0885 0.0936 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 3.92e-01 0.0939 0.109 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0537 0.104 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 9.09e-01 0.00996 0.0871 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 1.22e-01 0.136 0.0876 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 1.93e-01 -0.128 0.0982 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 2.61e-01 -0.116 0.103 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 1.73e-01 -0.138 0.101 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 8.47e-01 0.0231 0.119 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0344 0.0914 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0215 0.0888 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 9.80e-01 0.00244 0.0984 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 9.05e-01 0.0102 0.0856 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 3.97e-01 0.0877 0.103 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0604 0.0972 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 2.97e-01 0.116 0.111 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 1.28e-01 -0.145 0.0951 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 7.05e-01 0.0291 0.0769 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 4.56e-01 0.055 0.0736 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 3.43e-01 0.0972 0.102 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 1.43e-01 0.135 0.0916 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 7.88e-01 0.027 0.1 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 9.05e-01 0.015 0.126 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 7.57e-01 0.0357 0.115 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0241 0.108 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0377 0.113 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 1.78e-01 -0.156 0.115 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 1.77e-01 -0.142 0.104 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0906 0.106 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 7.56e-01 0.0357 0.115 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 6.10e-01 0.056 0.11 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0553 0.112 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 2.90e-01 0.112 0.105 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 1.64e-01 -0.138 0.0989 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0397 0.11 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 7.48e-01 0.032 0.0991 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 2.60e-01 0.132 0.117 0.193 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 8.99e-01 0.0132 0.104 0.193 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 8.85e-01 0.0144 0.0996 0.193 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 6.31e-02 0.174 0.0932 0.193 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 4.41e-01 0.0797 0.103 0.193 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 8.69e-01 0.0173 0.105 0.193 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0465 0.108 0.193 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 7.46e-01 0.0381 0.117 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 9.90e-01 -0.0013 0.0991 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 2.02e-01 0.133 0.104 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 9.34e-03 0.265 0.101 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0329 0.0997 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 5.94e-01 0.055 0.103 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 3.34e-01 0.0982 0.101 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 6.38e-01 0.0531 0.113 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 1.42e-01 -0.122 0.083 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 4.27e-01 0.068 0.0854 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 6.46e-01 -0.042 0.0912 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 9.15e-01 0.0087 0.0812 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 8.61e-01 -0.02 0.114 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0295 0.0943 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 1.99e-01 0.149 0.116 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 1.34e-01 0.155 0.103 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0794 0.101 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 9.28e-01 0.00877 0.0966 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 7.14e-01 0.0399 0.109 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0232 0.103 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0561 0.0993 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 8.44e-01 0.0214 0.109 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0213 0.0847 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 4.39e-01 0.071 0.0915 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0274 0.101 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 6.63e-01 0.0375 0.0859 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 9.41e-01 0.00786 0.107 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 6.71e-01 0.0423 0.0994 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 9.73e-01 0.00458 0.137 0.178 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 3.09e-01 -0.162 0.159 0.178 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 8.86e-01 -0.02 0.138 0.178 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -35660 sc-eQTL 1.23e-01 -0.199 0.128 0.178 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 1.68e-01 -0.127 0.0914 0.178 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0506 0.142 0.178 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 4.42e-01 0.097 0.126 0.178 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 8.99e-01 -0.017 0.134 0.178 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0985 0.0879 0.189 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 8.97e-01 0.0145 0.112 0.189 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 6.44e-01 0.0482 0.104 0.189 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0473 0.0748 0.189 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00905 0.11 0.189 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0966 0.104 0.189 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0448 0.0962 0.189 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0163 0.112 0.192 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 5.05e-01 0.0725 0.109 0.192 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 8.94e-01 0.0116 0.0871 0.192 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 2.88e-01 0.106 0.0994 0.192 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 4.98e-01 0.073 0.108 0.192 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 4.85e-01 0.0709 0.101 0.192 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00286 0.101 0.192 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 4.07e-01 0.0942 0.113 0.2 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0445 0.123 0.2 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 7.82e-02 -0.186 0.105 0.2 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 8.63e-02 0.127 0.0735 0.2 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0594 0.107 0.2 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -721640 sc-eQTL 6.62e-01 0.0416 0.095 0.2 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -818301 sc-eQTL 2.38e-02 0.21 0.0921 0.2 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 5.87e-01 0.0547 0.1 0.2 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 4.83e-02 0.179 0.0901 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000704 0.101 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 4.86e-01 0.0479 0.0686 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 6.19e-01 -0.03 0.0602 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -220833 sc-eQTL 6.45e-01 0.0523 0.113 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0199 0.0927 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -721640 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00276 0.115 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -818301 sc-eQTL 2.19e-01 -0.125 0.101 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0249 0.0947 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 5.48e-01 0.0574 0.0955 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 6.78e-01 -0.047 0.113 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 8.55e-01 0.0149 0.0816 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 5.87e-01 0.0341 0.0627 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -220833 sc-eQTL 2.54e-01 0.123 0.108 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0592 0.0977 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -721640 sc-eQTL 9.03e-01 -0.014 0.115 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -818301 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0562 0.0931 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0352 0.0935 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0979 0.137 0.2 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0327 0.118 0.2 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 3.73e-01 0.108 0.121 0.2 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 2.10e-01 0.165 0.131 0.2 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0946 0.12 0.2 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 6.49e-01 0.0555 0.122 0.2 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 6.36e-01 0.056 0.118 0.2 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 7.52e-01 0.0342 0.108 0.193 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 3.48e-01 -0.109 0.116 0.193 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 4.58e-01 0.0733 0.0985 0.193 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0247 0.0774 0.193 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -220833 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0761 0.106 0.193 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 1.10e-01 0.178 0.111 0.193 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -721640 sc-eQTL 3.37e-01 -0.107 0.111 0.193 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -818301 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0219 0.105 0.193 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00717 0.105 0.193 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 1.10e-01 -0.156 0.0973 0.195 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 2.10e-01 0.131 0.104 0.195 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 8.31e-01 0.0183 0.0853 0.195 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0586 0.0774 0.195 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -220833 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0782 0.0867 0.195 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 1.02e-02 0.254 0.0979 0.195 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -721640 sc-eQTL 9.33e-01 0.008 0.0948 0.195 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -818301 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0626 0.0946 0.195 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0891 0.098 0.195 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 7.40e-02 -0.2 0.111 0.192 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 8.56e-01 0.0224 0.123 0.192 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 4.53e-01 0.0766 0.102 0.192 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 9.61e-01 0.00465 0.0949 0.192 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0127 0.123 0.192 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -721640 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00903 0.115 0.192 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -818301 sc-eQTL 5.99e-02 -0.167 0.0883 0.192 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 2.63e-01 -0.118 0.105 0.192 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 8.35e-01 0.0243 0.117 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 1.68e-01 0.134 0.0967 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00795 0.0861 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -35660 sc-eQTL 2.14e-01 -0.122 0.0978 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 5.20e-02 0.119 0.0611 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0143 0.102 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 3.26e-01 0.0802 0.0814 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 7.14e-01 0.0327 0.0889 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 6.57e-01 0.0456 0.103 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0499 0.0811 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0548 0.0767 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -35660 sc-eQTL 7.40e-02 -0.132 0.0734 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 4.96e-01 0.0355 0.052 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 1.65e-01 0.132 0.0946 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 6.62e-01 0.0294 0.0672 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 2.37e-01 0.0944 0.0796 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 1.24e-01 0.133 0.0861 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0165 0.0981 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 5.14e-01 0.0409 0.0625 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 9.25e-01 0.00517 0.055 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -220833 sc-eQTL 2.62e-01 0.126 0.112 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0847 0.0787 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -721640 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0104 0.115 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -818301 sc-eQTL 1.35e-01 -0.141 0.0941 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00448 0.0886 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 1.46e-01 -0.139 0.095 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0773 0.104 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 7.41e-01 0.0283 0.0856 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0331 0.0684 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -220833 sc-eQTL 2.24e-01 -0.122 0.0997 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 2.14e-02 0.208 0.0897 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -721640 sc-eQTL 2.18e-01 -0.128 0.103 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -818301 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0954 0.0982 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0988 0.0983 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -608863 sc-eQTL 1.50e-01 0.154 0.106 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609057 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0629 0.073 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -378066 sc-eQTL 4.31e-01 0.063 0.08 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0487 0.0894 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -956971 sc-eQTL 6.09e-01 0.0348 0.068 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0543 0.103 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -43768 sc-eQTL 8.01e-01 0.0225 0.0891 0.192 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162511 LAPTM5 -69849 eQTL 0.0055 -0.0316 0.0113 0.0 0.0 0.217
ENSG00000162517 PEF1 -956971 eQTL 0.0182 0.04 0.0169 0.0 0.0 0.217
ENSG00000168528 SERINC2 -721640 eQTL 0.0152 0.107 0.0438 0.0 0.0 0.217
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 eQTL 3.33e-04 0.0513 0.0142 0.0 0.0 0.217

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30579 1.57e-05 1.67e-05 2.45e-06 9.64e-06 2.32e-06 7.51e-06 1.7e-05 2.22e-06 1.49e-05 6.3e-06 1.82e-05 6.83e-06 2.46e-05 5.16e-06 3.97e-06 8.06e-06 7.91e-06 1.21e-05 3.61e-06 3.12e-06 6.76e-06 1.26e-05 1.23e-05 3.39e-06 2.34e-05 4.5e-06 7.34e-06 5.08e-06 1.41e-05 1.06e-05 1.07e-05 1.06e-06 1.22e-06 3.78e-06 6.28e-06 2.85e-06 1.78e-06 2.35e-06 2.22e-06 1.3e-06 9.58e-07 1.77e-05 2.71e-06 1.61e-07 7.93e-07 1.94e-06 2.11e-06 7.75e-07 4.65e-07