logo

Genes within 1Mb (chr1:30687530:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 3.59e-01 0.114 0.124 0.107 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0467 0.0992 0.107 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 1.27e-01 -0.127 0.0828 0.107 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -36055 sc-eQTL 6.71e-01 0.0372 0.0875 0.107 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 6.93e-01 0.0271 0.0685 0.107 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0701 0.103 0.107 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 7.50e-01 0.0256 0.0803 0.107 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0862 0.0949 0.107 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 7.37e-02 -0.191 0.106 0.107 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 4.76e-01 0.0597 0.0836 0.107 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0192 0.0745 0.107 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 4.67e-02 0.164 0.0818 0.107 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 3.03e-01 0.089 0.0861 0.107 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0544 0.0738 0.107 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00283 0.0885 0.107 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 2.15e-01 -0.172 0.138 0.107 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0405 0.0924 0.107 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 4.41e-01 0.0628 0.0813 0.107 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 1.92e-01 0.103 0.0788 0.107 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0927 0.0972 0.107 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0818 0.0925 0.107 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0169 0.116 0.107 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 1.19e-01 -0.194 0.124 0.106 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 7.16e-01 0.0537 0.147 0.106 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 3.07e-01 -0.118 0.115 0.106 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 8.14e-01 0.0194 0.0824 0.106 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 5.31e-02 0.258 0.132 0.106 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -722035 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0469 0.136 0.106 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -818696 sc-eQTL 7.72e-01 0.0261 0.0901 0.106 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0932 0.13 0.106 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 4.89e-01 0.0664 0.0959 0.107 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0299 0.119 0.107 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0508 0.0762 0.107 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 5.08e-01 0.0465 0.0701 0.107 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -221228 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0521 0.135 0.107 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0975 0.0944 0.107 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -722035 sc-eQTL 2.42e-01 0.169 0.144 0.107 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -818696 sc-eQTL 8.40e-01 0.0257 0.127 0.107 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 2.20e-01 0.137 0.111 0.107 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 5.79e-01 0.0745 0.134 0.107 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0597 0.0917 0.107 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 3.27e-02 -0.205 0.0953 0.107 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 2.00e-03 0.339 0.108 0.107 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 8.55e-01 0.0148 0.0809 0.107 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 3.86e-01 0.108 0.124 0.107 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 4.73e-01 0.0826 0.115 0.107 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 2.81e-01 0.107 0.0992 0.107 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 2.18e-01 -0.131 0.106 0.107 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 7.46e-01 0.031 0.0956 0.107 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0599 0.0783 0.107 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0981 0.104 0.107 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0645 0.128 0.107 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 6.99e-01 0.0517 0.134 0.107 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 8.00e-03 -0.419 0.156 0.112 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 9.17e-01 0.0168 0.161 0.112 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0737 0.149 0.112 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -36055 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0369 0.13 0.112 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0164 0.091 0.112 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0144 0.155 0.112 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 4.77e-01 0.105 0.147 0.112 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 5.09e-01 0.086 0.13 0.112 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0191 0.15 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 7.04e-02 -0.226 0.124 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 8.39e-01 -0.024 0.118 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -36055 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00379 0.123 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 3.58e-01 0.0693 0.0753 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 6.58e-01 0.0619 0.14 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0277 0.106 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0213 0.118 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 5.83e-01 0.0798 0.145 0.106 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0566 0.134 0.106 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0397 0.117 0.106 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -36055 sc-eQTL 4.35e-01 0.0871 0.111 0.106 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 5.35e-01 0.0614 0.0987 0.106 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 8.17e-01 0.0306 0.132 0.106 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0433 0.113 0.106 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 3.85e-01 -0.115 0.132 0.106 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 1.88e-01 0.176 0.134 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 1.88e-01 -0.152 0.115 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0443 0.102 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -36055 sc-eQTL 7.26e-01 0.0364 0.104 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 4.07e-01 0.0574 0.0692 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0265 0.122 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0236 0.091 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0204 0.112 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 2.00e-01 -0.182 0.141 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0152 0.117 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 2.55e-01 -0.13 0.114 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -36055 sc-eQTL 1.26e-01 -0.168 0.109 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 1.41e-01 0.11 0.0743 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 1.01e-02 -0.347 0.134 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0857 0.109 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 2.99e-01 -0.122 0.117 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 8.73e-01 0.0229 0.142 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 2.88e-01 0.149 0.14 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 6.90e-01 0.0549 0.137 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 1.10e-01 0.195 0.122 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 1.02e-01 0.204 0.125 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 4.99e-01 0.0905 0.134 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0121 0.118 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 6.00e-02 -0.209 0.11 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 3.62e-01 0.0899 0.0984 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 9.31e-01 0.00685 0.0788 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 1.68e-01 0.116 0.084 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 9.30e-01 0.00811 0.0925 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0231 0.0856 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0349 0.0983 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0658 0.14 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 7.42e-02 -0.202 0.112 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 9.92e-01 0.00106 0.1 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 3.87e-02 0.171 0.0823 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0633 0.111 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0803 0.105 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00107 0.118 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 3.07e-01 -0.141 0.138 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 1.00e-01 0.216 0.131 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 7.14e-01 0.0401 0.109 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 6.44e-02 0.204 0.11 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 2.07e-01 0.157 0.124 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00183 0.13 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0026 0.128 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0354 0.15 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0714 0.115 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 1.96e-01 0.144 0.111 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 3.89e-01 0.107 0.124 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 7.18e-01 0.039 0.108 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 4.04e-01 -0.109 0.13 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00434 0.122 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 8.19e-02 -0.241 0.138 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 9.14e-01 0.0129 0.12 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 6.00e-01 0.0506 0.0962 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 4.87e-02 0.181 0.0914 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0641 0.128 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 2.07e-01 -0.145 0.115 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 5.94e-01 -0.067 0.125 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 6.06e-01 0.0789 0.153 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 6.61e-01 0.0616 0.14 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 7.49e-01 0.0423 0.132 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 1.40e-01 0.203 0.137 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 2.75e-01 0.154 0.141 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 9.24e-01 0.0121 0.128 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0904 0.129 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 6.88e-01 0.0586 0.146 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0843 0.14 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 4.80e-01 0.101 0.143 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0994 0.134 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0825 0.127 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0581 0.14 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 3.11e-02 -0.271 0.125 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 5.09e-01 0.0992 0.15 0.106 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 2.53e-01 -0.152 0.133 0.106 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0921 0.127 0.106 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 6.22e-01 0.0593 0.12 0.106 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 9.82e-02 -0.218 0.131 0.106 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 9.46e-01 -0.009 0.134 0.106 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 4.49e-01 -0.105 0.138 0.106 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 1.62e-01 0.211 0.151 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 1.07e-01 -0.205 0.127 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0735 0.134 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0552 0.132 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 7.19e-01 0.0464 0.129 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0717 0.133 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 7.55e-02 -0.233 0.13 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 9.73e-01 0.00481 0.143 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 7.44e-01 0.0345 0.105 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 6.31e-02 -0.201 0.107 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 8.38e-03 0.302 0.114 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 7.29e-01 0.0356 0.103 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 2.71e-01 0.159 0.144 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 1.14e-01 0.188 0.119 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0583 0.151 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 2.75e-01 -0.148 0.135 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 7.56e-01 0.041 0.132 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 1.14e-02 0.316 0.124 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 3.96e-03 -0.405 0.139 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 8.84e-01 0.0196 0.134 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 6.34e-03 0.35 0.127 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0283 0.138 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 9.29e-01 0.0096 0.108 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 6.11e-02 -0.218 0.116 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 5.71e-03 0.353 0.126 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 9.48e-01 0.00715 0.11 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0212 0.136 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 1.20e-01 -0.197 0.126 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 6.39e-03 0.436 0.157 0.111 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0608 0.188 0.111 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 8.45e-02 -0.281 0.161 0.111 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -36055 sc-eQTL 2.95e-01 0.16 0.152 0.111 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 2.18e-01 0.134 0.108 0.111 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 9.10e-01 0.0191 0.168 0.111 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 3.92e-01 -0.128 0.149 0.111 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0662 0.159 0.111 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 4.59e-01 0.0813 0.11 0.107 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0312 0.139 0.107 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0635 0.13 0.107 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0362 0.0932 0.107 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 6.65e-01 0.0593 0.137 0.107 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 3.62e-01 -0.119 0.13 0.107 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0655 0.12 0.107 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0307 0.144 0.107 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 1.08e-01 0.223 0.139 0.107 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 3.09e-01 -0.113 0.111 0.107 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 7.44e-02 0.227 0.127 0.107 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0674 0.138 0.107 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 3.54e-01 0.121 0.13 0.107 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 5.75e-01 0.0729 0.13 0.107 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 4.19e-02 -0.29 0.142 0.11 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 8.64e-01 0.0266 0.155 0.11 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 2.97e-01 -0.139 0.133 0.11 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 4.31e-01 0.0735 0.0932 0.11 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 1.60e-02 0.323 0.133 0.11 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -722035 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0266 0.12 0.11 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -818696 sc-eQTL 1.24e-01 -0.181 0.117 0.11 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0802 0.127 0.11 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0664 0.116 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 2.16e-01 -0.16 0.129 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0311 0.0877 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 6.30e-01 0.0371 0.077 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -221228 sc-eQTL 6.15e-01 -0.073 0.145 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0887 0.118 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -722035 sc-eQTL 9.03e-02 0.248 0.146 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -818696 sc-eQTL 9.05e-01 0.0154 0.13 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 2.68e-01 0.134 0.121 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 5.94e-01 0.0654 0.122 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0255 0.145 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 1.63e-01 -0.146 0.104 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0398 0.0804 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -221228 sc-eQTL 2.52e-01 -0.159 0.139 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0988 0.125 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -722035 sc-eQTL 2.13e-01 0.183 0.147 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -818696 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0931 0.119 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 9.98e-01 0.000346 0.12 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 1.99e-01 0.234 0.181 0.103 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 1.56e-01 0.222 0.155 0.103 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0365 0.161 0.103 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 2.37e-01 -0.207 0.175 0.103 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 8.23e-01 -0.036 0.16 0.103 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 9.43e-01 0.0116 0.162 0.103 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 8.48e-01 0.0302 0.157 0.103 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 3.86e-02 0.279 0.134 0.109 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 2.95e-01 0.152 0.145 0.109 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 1.95e-02 -0.287 0.122 0.109 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 1.40e-01 0.143 0.0963 0.109 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -221228 sc-eQTL 1.85e-01 -0.175 0.132 0.109 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 1.81e-01 0.186 0.139 0.109 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -722035 sc-eQTL 1.47e-01 0.201 0.138 0.109 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -818696 sc-eQTL 3.85e-01 0.114 0.131 0.109 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 1.98e-01 0.169 0.131 0.109 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 2.58e-01 0.141 0.124 0.106 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 6.35e-01 0.0632 0.133 0.106 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 9.17e-01 0.0114 0.109 0.106 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 2.83e-01 0.106 0.0985 0.106 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -221228 sc-eQTL 8.43e-01 0.022 0.111 0.106 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0365 0.127 0.106 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -722035 sc-eQTL 3.49e-01 0.113 0.121 0.106 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -818696 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0547 0.121 0.106 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0852 0.125 0.106 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0588 0.136 0.121 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 3.98e-01 -0.127 0.149 0.121 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 4.00e-01 -0.104 0.124 0.121 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0102 0.115 0.121 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 6.93e-01 0.0591 0.149 0.121 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -722035 sc-eQTL 4.14e-01 0.114 0.14 0.121 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -818696 sc-eQTL 8.96e-01 0.0142 0.109 0.121 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 4.18e-01 -0.103 0.127 0.121 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0589 0.142 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 2.11e-01 -0.148 0.118 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0601 0.105 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -36055 sc-eQTL 4.84e-01 0.0836 0.119 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 4.72e-01 0.054 0.075 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 7.88e-01 0.0335 0.124 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 9.82e-01 0.00218 0.0993 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 8.00e-01 0.0274 0.108 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 4.76e-01 0.0932 0.131 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0531 0.103 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0462 0.0978 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -36055 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0374 0.0942 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 3.83e-01 0.0579 0.0662 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 1.57e-01 -0.171 0.121 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0399 0.0856 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 2.73e-01 -0.111 0.101 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0135 0.11 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 3.84e-01 -0.109 0.125 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0595 0.0797 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 7.17e-01 0.0254 0.0701 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -221228 sc-eQTL 3.25e-01 -0.141 0.143 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 2.97e-01 -0.105 0.1 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -722035 sc-eQTL 1.76e-01 0.199 0.147 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -818696 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000395 0.121 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 2.98e-01 0.118 0.113 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 7.04e-02 0.216 0.119 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 4.85e-01 0.0913 0.131 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 2.06e-01 -0.135 0.107 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 9.73e-02 0.142 0.0851 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -221228 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0581 0.125 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0635 0.114 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -722035 sc-eQTL 2.66e-01 0.144 0.129 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -818696 sc-eQTL 6.92e-01 0.0488 0.123 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 2.52e-01 0.141 0.123 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -609258 sc-eQTL 7.50e-01 0.0429 0.135 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -609452 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00792 0.092 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -378461 sc-eQTL 4.48e-02 -0.201 0.0998 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -70244 sc-eQTL 1.52e-03 0.353 0.11 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -957366 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0114 0.0855 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -30974 sc-eQTL 3.77e-01 0.115 0.13 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -44163 sc-eQTL 2.73e-01 0.123 0.112 0.108 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162512 \N -221228 1.35e-06 1.33e-06 2.56e-07 1.27e-06 3.09e-07 6.64e-07 1.51e-06 3.65e-07 1.49e-06 5.98e-07 1.85e-06 6.58e-07 2.73e-06 2.98e-07 4.95e-07 8.79e-07 9.18e-07 8e-07 8.04e-07 5.23e-07 6.13e-07 1.78e-06 8.95e-07 6.47e-07 2.39e-06 3.91e-07 9.54e-07 7.24e-07 1.46e-06 1.31e-06 8.11e-07 1.53e-07 2.55e-07 7.11e-07 5.67e-07 4.5e-07 7.3e-07 2.03e-07 4.84e-07 2.04e-07 3.03e-07 1.86e-06 3.59e-07 9.64e-08 1.86e-07 1.17e-07 2.3e-07 8.31e-08 1.16e-07