logo

Genes within 1Mb (chr1:30683579:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0579 0.117 0.128 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 2.40e-01 -0.11 0.0936 0.128 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 1.92e-01 0.103 0.0785 0.128 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -40006 sc-eQTL 1.27e-01 0.126 0.0824 0.128 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 8.25e-01 0.0144 0.0649 0.128 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 7.24e-01 0.0347 0.0979 0.128 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 1.74e-01 -0.103 0.0757 0.128 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 6.14e-01 0.0454 0.0899 0.128 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 6.30e-01 0.05 0.104 0.128 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 6.40e-01 0.0379 0.0809 0.128 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0958 0.0718 0.128 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0418 0.0798 0.128 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0394 0.0835 0.128 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0864 0.0712 0.128 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0811 0.0854 0.128 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 3.44e-01 -0.129 0.136 0.128 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 3.07e-01 0.0923 0.0902 0.128 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00296 0.0797 0.128 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 2.14e-01 0.0961 0.0771 0.128 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 2.75e-01 -0.104 0.095 0.128 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 6.44e-01 0.0419 0.0906 0.128 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 9.68e-01 0.00457 0.114 0.128 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 9.93e-01 0.00111 0.122 0.122 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 2.81e-02 -0.316 0.143 0.122 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 5.21e-01 0.0726 0.113 0.122 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 8.32e-01 0.0171 0.0808 0.122 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0962 0.131 0.122 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -725986 sc-eQTL 9.75e-01 0.00417 0.133 0.122 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -822647 sc-eQTL 2.73e-01 0.0968 0.088 0.122 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0465 0.128 0.122 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 4.63e-01 0.0685 0.0932 0.128 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 4.82e-02 0.228 0.115 0.128 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 6.79e-01 0.0307 0.0742 0.128 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0464 0.0682 0.128 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -225179 sc-eQTL 1.09e-01 -0.21 0.13 0.128 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 4.37e-01 0.0715 0.0919 0.128 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -725986 sc-eQTL 8.86e-01 0.0202 0.141 0.128 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -822647 sc-eQTL 4.19e-01 0.1 0.124 0.128 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 5.68e-01 0.0619 0.108 0.128 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 7.56e-02 0.229 0.128 0.127 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 2.11e-01 -0.111 0.088 0.127 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 8.90e-01 0.0129 0.0927 0.127 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 6.66e-01 0.0461 0.107 0.127 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0463 0.0778 0.127 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 7.75e-01 0.0344 0.12 0.127 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 2.92e-01 -0.117 0.11 0.127 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0403 0.0954 0.128 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0344 0.102 0.128 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0639 0.0916 0.128 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 2.55e-01 0.0856 0.075 0.128 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 9.26e-01 0.00936 0.1 0.128 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0676 0.123 0.128 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0767 0.128 0.128 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 6.01e-02 0.292 0.154 0.13 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 2.67e-01 0.174 0.157 0.13 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 1.91e-01 -0.191 0.145 0.13 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -40006 sc-eQTL 1.55e-01 -0.181 0.127 0.13 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0428 0.0889 0.13 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0635 0.151 0.13 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 9.92e-01 0.0014 0.144 0.13 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 7.59e-01 0.039 0.127 0.13 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 2.16e-01 -0.18 0.145 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 9.13e-01 0.0132 0.121 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0684 0.114 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -40006 sc-eQTL 2.51e-01 0.136 0.118 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0282 0.0729 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 8.30e-01 0.0291 0.135 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 6.73e-02 -0.187 0.102 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 1.49e-01 -0.165 0.114 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 1.45e-01 -0.205 0.141 0.127 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0108 0.13 0.127 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 1.95e-01 0.147 0.113 0.127 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -40006 sc-eQTL 8.53e-01 0.0201 0.108 0.127 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0632 0.0959 0.127 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0303 0.128 0.127 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 9.64e-01 0.00495 0.11 0.127 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 7.17e-02 0.231 0.128 0.127 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 8.64e-01 0.0224 0.131 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 9.38e-01 0.0088 0.113 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 1.41e-01 0.147 0.0992 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -40006 sc-eQTL 4.46e-01 0.0771 0.101 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 2.86e-01 0.0721 0.0674 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 8.69e-02 0.204 0.118 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0951 0.0886 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0131 0.11 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 3.72e-01 -0.125 0.139 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0986 0.115 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 9.69e-01 0.00445 0.113 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -40006 sc-eQTL 2.84e-01 0.116 0.108 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 8.37e-01 0.0151 0.0736 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0104 0.134 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 8.96e-01 0.0141 0.107 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 3.23e-01 0.114 0.115 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 7.43e-01 0.0446 0.136 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0372 0.133 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 6.61e-02 -0.24 0.13 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 3.86e-01 0.101 0.116 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 8.68e-01 0.0198 0.12 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 7.86e-01 0.0346 0.128 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 8.60e-04 0.371 0.109 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0975 0.108 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00859 0.0959 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 1.46e-01 -0.111 0.0762 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0466 0.082 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 9.04e-01 0.0108 0.09 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 4.69e-02 -0.165 0.0825 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0126 0.0957 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 2.85e-01 0.146 0.136 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 3.87e-01 0.0951 0.11 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 2.42e-01 0.114 0.0969 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0797 0.0805 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 4.27e-01 -0.086 0.108 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 3.02e-01 -0.106 0.102 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 1.83e-01 -0.152 0.114 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 3.71e-01 0.121 0.135 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 4.58e-02 0.256 0.127 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0189 0.107 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0814 0.108 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 9.19e-01 0.0124 0.121 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 4.35e-01 0.099 0.127 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 9.07e-01 0.0146 0.125 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 2.05e-01 -0.186 0.146 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 3.68e-02 0.234 0.111 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 8.42e-02 0.188 0.108 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 8.44e-01 0.0237 0.121 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0081 0.105 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0708 0.127 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 7.23e-01 0.0424 0.119 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 6.91e-01 -0.054 0.136 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 2.53e-01 -0.134 0.117 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 1.08e-01 -0.151 0.0936 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 5.84e-01 0.0495 0.0902 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 2.12e-01 -0.156 0.125 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 4.05e-01 0.0939 0.112 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 3.20e-01 0.122 0.122 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 4.80e-01 -0.106 0.15 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 4.15e-01 0.112 0.137 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 8.42e-01 0.0257 0.129 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 7.28e-01 0.0471 0.135 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 1.48e-01 -0.2 0.137 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 8.97e-01 0.0162 0.125 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 5.03e-01 0.0848 0.126 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 2.85e-01 -0.154 0.144 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0834 0.138 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 3.35e-01 -0.136 0.141 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 2.05e-01 0.168 0.132 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 9.75e-01 0.00385 0.125 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0944 0.138 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 4.38e-01 0.0966 0.124 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 2.30e-01 -0.171 0.142 0.13 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 7.56e-01 0.0392 0.126 0.13 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 5.16e-01 0.0785 0.121 0.13 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 3.40e-01 0.109 0.114 0.13 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0595 0.125 0.13 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00978 0.127 0.13 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0388 0.131 0.13 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 9.84e-01 0.00293 0.147 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0885 0.124 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 2.40e-01 0.153 0.13 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0381 0.128 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 6.64e-01 0.0543 0.125 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 3.16e-02 -0.276 0.128 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0811 0.127 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 7.80e-01 0.0381 0.136 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0681 0.101 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0358 0.103 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 4.08e-01 0.0912 0.11 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0514 0.098 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0518 0.138 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 5.57e-01 0.067 0.114 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 3.17e-01 -0.147 0.146 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0136 0.131 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 3.24e-01 -0.126 0.127 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 6.03e-01 0.0634 0.122 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 4.11e-01 0.113 0.137 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 2.54e-01 0.148 0.129 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 6.80e-01 0.0518 0.125 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 1.27e-02 0.332 0.132 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0927 0.105 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0269 0.113 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 5.54e-01 0.0739 0.125 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0733 0.106 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 4.80e-01 0.0934 0.132 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 3.27e-01 0.121 0.123 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0222 0.151 0.137 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 5.05e-01 -0.117 0.175 0.137 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0156 0.152 0.137 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -40006 sc-eQTL 2.98e-01 0.147 0.141 0.137 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 9.78e-01 0.00278 0.101 0.137 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0273 0.156 0.137 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 3.97e-01 0.117 0.138 0.137 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 7.70e-01 0.0433 0.147 0.137 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00939 0.104 0.13 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 4.23e-01 -0.105 0.131 0.13 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 8.47e-01 0.0237 0.123 0.13 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 8.74e-01 -0.014 0.088 0.13 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0933 0.129 0.13 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0216 0.123 0.13 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 3.69e-01 -0.102 0.113 0.13 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0918 0.139 0.128 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 9.94e-01 0.000935 0.135 0.128 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 9.47e-01 0.00714 0.108 0.128 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0812 0.123 0.128 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 9.16e-02 -0.225 0.133 0.128 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0989 0.126 0.128 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00414 0.126 0.128 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0379 0.137 0.127 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 1.31e-01 -0.224 0.148 0.127 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 4.49e-02 0.255 0.126 0.127 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0642 0.0893 0.127 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0466 0.129 0.127 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -725986 sc-eQTL 2.51e-01 0.132 0.114 0.127 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -822647 sc-eQTL 1.03e-01 -0.183 0.112 0.127 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0709 0.121 0.127 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 1.21e-01 0.175 0.113 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 1.00e-01 0.207 0.126 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 6.81e-01 0.0352 0.0855 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0704 0.0749 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -225179 sc-eQTL 2.46e-01 -0.164 0.141 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 3.29e-01 0.113 0.115 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -725986 sc-eQTL 9.61e-01 0.00704 0.143 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -822647 sc-eQTL 3.66e-01 0.114 0.126 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 6.70e-01 0.0503 0.118 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 5.55e-01 0.07 0.118 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 6.71e-02 0.255 0.139 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 6.37e-01 0.0478 0.101 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0226 0.0777 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -225179 sc-eQTL 3.04e-01 -0.138 0.134 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00252 0.121 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -725986 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00302 0.142 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -822647 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0406 0.115 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0466 0.116 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0206 0.171 0.13 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0103 0.146 0.13 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 2.91e-01 -0.16 0.15 0.13 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 5.18e-01 -0.106 0.164 0.13 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 8.14e-02 0.261 0.149 0.13 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 5.94e-02 -0.284 0.15 0.13 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 2.59e-01 -0.166 0.146 0.13 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 3.36e-02 -0.283 0.132 0.124 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0134 0.144 0.124 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0514 0.122 0.124 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 3.82e-01 0.0837 0.0955 0.124 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -225179 sc-eQTL 3.57e-01 -0.121 0.131 0.124 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 4.24e-01 0.11 0.137 0.124 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -725986 sc-eQTL 3.69e-01 0.123 0.137 0.124 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -822647 sc-eQTL 4.60e-01 0.096 0.13 0.124 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 4.02e-01 0.109 0.13 0.124 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0385 0.122 0.127 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0262 0.13 0.127 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0532 0.106 0.127 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 8.52e-01 0.0181 0.0967 0.127 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -225179 sc-eQTL 2.41e-01 -0.127 0.108 0.127 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 1.54e-01 -0.177 0.124 0.127 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -725986 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0193 0.118 0.127 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -822647 sc-eQTL 2.71e-01 0.13 0.118 0.127 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 1.81e-01 0.164 0.122 0.127 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0087 0.14 0.116 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0681 0.153 0.116 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 9.67e-01 0.00528 0.127 0.116 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 6.11e-01 0.0602 0.118 0.116 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 8.21e-01 0.0349 0.153 0.116 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -725986 sc-eQTL 8.95e-01 -0.019 0.143 0.116 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -822647 sc-eQTL 1.83e-01 0.148 0.111 0.116 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 6.81e-01 0.0538 0.131 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 2.05e-01 -0.174 0.137 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0471 0.114 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 4.38e-01 0.0785 0.101 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -40006 sc-eQTL 6.06e-01 0.0595 0.115 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0244 0.0725 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0828 0.12 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0971 0.0957 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 7.96e-01 0.027 0.105 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0198 0.127 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0937 0.1 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 1.98e-01 0.122 0.0945 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -40006 sc-eQTL 2.52e-01 0.104 0.091 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 1.30e-01 0.0972 0.0639 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 8.92e-02 0.199 0.117 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 3.54e-01 -0.077 0.0828 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 2.66e-01 0.11 0.0983 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 2.92e-01 0.113 0.107 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 2.76e-02 0.266 0.12 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 4.33e-01 0.0607 0.0772 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0497 0.0679 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -225179 sc-eQTL 1.68e-01 -0.191 0.138 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 2.71e-01 0.107 0.0972 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -725986 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0121 0.143 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -822647 sc-eQTL 5.80e-01 0.0648 0.117 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 9.50e-01 0.0069 0.109 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00931 0.116 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0137 0.127 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0967 0.104 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0188 0.0835 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -225179 sc-eQTL 2.07e-01 -0.154 0.122 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0326 0.111 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -725986 sc-eQTL 4.35e-01 0.0988 0.126 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -822647 sc-eQTL 1.61e-01 0.168 0.12 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 6.11e-01 0.0612 0.12 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -613209 sc-eQTL 1.20e-01 0.202 0.13 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -613403 sc-eQTL 2.50e-01 -0.102 0.0888 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -382412 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0186 0.0976 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -74195 sc-eQTL 7.33e-01 0.0373 0.109 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -961317 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0797 0.0827 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 sc-eQTL 3.52e-01 0.117 0.126 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -48114 sc-eQTL 8.54e-01 -0.02 0.109 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -34925 eQTL 1.16e-02 -0.0438 0.0173 0.0 0.0 0.147
ENSG00000284543 LINC01226 -822702 eQTL 9.56e-05 -0.17 0.0434 0.0341 0.0164 0.147

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000284543 LINC01226 -822702 2.69e-07 1.16e-07 3.56e-08 1.79e-07 9.65e-08 9.87e-08 1.38e-07 5.35e-08 1.41e-07 4.38e-08 1.6e-07 7.88e-08 1.26e-07 6.21e-08 5.55e-08 7.26e-08 4.94e-08 1.1e-07 5.21e-08 4.03e-08 1.04e-07 1.27e-07 1.26e-07 4.26e-08 1.31e-07 1.15e-07 1.11e-07 8.7e-08 9.88e-08 1.12e-07 9.58e-08 3.8e-08 2.91e-08 8.68e-08 8.93e-08 3.87e-08 5.01e-08 9.62e-08 6.56e-08 3.55e-08 4.57e-08 1.31e-07 3.19e-08 2.33e-08 7.91e-08 1.68e-08 1.24e-07 4.04e-09 4.85e-08