logo

Genes within 1Mb (chr1:30682898:GC:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0873 0.0975 0.197 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 9.93e-01 0.000652 0.0782 0.197 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0272 0.0656 0.197 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -40687 sc-eQTL 5.25e-02 -0.133 0.0684 0.197 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 4.07e-01 0.0448 0.0539 0.197 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 3.10e-01 0.0829 0.0814 0.197 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 3.07e-01 0.0647 0.0632 0.197 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 7.93e-02 0.131 0.0744 0.197 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 2.09e-01 0.107 0.0847 0.197 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 3.00e-01 0.0689 0.0663 0.197 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0365 0.0591 0.197 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 4.92e-01 0.045 0.0655 0.197 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00699 0.0685 0.197 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 2.04e-01 0.0743 0.0584 0.197 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 5.03e-01 0.0471 0.0701 0.197 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 2.05e-01 0.142 0.112 0.197 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 1.65e-01 -0.103 0.0743 0.197 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 8.77e-01 0.0102 0.0657 0.197 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0503 0.0638 0.197 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 8.73e-01 0.0126 0.0786 0.197 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00984 0.0748 0.197 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 3.94e-01 0.0802 0.0939 0.197 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0711 0.0967 0.203 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0449 0.115 0.203 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0691 0.0897 0.203 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 1.03e-01 0.104 0.0637 0.203 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0928 0.104 0.203 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -726667 sc-eQTL 1.87e-01 0.14 0.105 0.203 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -823328 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0481 0.07 0.203 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0758 0.101 0.203 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 5.50e-01 0.0454 0.0759 0.197 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0744 0.094 0.197 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00129 0.0604 0.197 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00138 0.0555 0.197 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -225860 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0278 0.107 0.197 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0354 0.0748 0.197 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -726667 sc-eQTL 8.10e-01 0.0275 0.114 0.197 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -823328 sc-eQTL 1.59e-01 -0.142 0.1 0.197 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0424 0.0881 0.197 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 2.25e-01 0.129 0.106 0.195 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0808 0.0726 0.195 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 4.23e-01 0.0612 0.0762 0.195 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0226 0.0878 0.195 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 5.32e-01 0.0401 0.0641 0.195 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0268 0.0987 0.195 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 2.38e-01 0.107 0.0909 0.195 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 7.78e-01 0.0224 0.0796 0.197 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0732 0.085 0.197 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0475 0.0765 0.197 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 3.95e-02 0.129 0.0621 0.197 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 8.10e-01 0.0202 0.0837 0.197 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 1.75e-01 0.139 0.102 0.197 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 6.23e-01 0.0527 0.107 0.197 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 8.79e-01 0.0195 0.127 0.199 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 9.78e-01 -0.0036 0.129 0.199 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 9.68e-01 0.00477 0.119 0.199 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -40687 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0205 0.104 0.199 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 3.00e-01 0.0754 0.0726 0.199 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 1.36e-02 0.303 0.122 0.199 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 4.46e-01 0.0895 0.117 0.199 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 7.03e-01 0.0397 0.104 0.199 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 8.68e-01 -0.02 0.12 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 6.29e-01 0.0485 0.1 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 5.31e-01 0.0594 0.0946 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -40687 sc-eQTL 8.27e-01 0.0215 0.0986 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 2.03e-01 0.077 0.0603 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0543 0.112 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 5.95e-01 0.0452 0.0849 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 2.89e-01 0.101 0.0948 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0338 0.119 0.196 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 4.35e-02 0.221 0.109 0.196 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0579 0.0955 0.196 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -40687 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0681 0.0913 0.196 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 4.70e-01 0.0586 0.081 0.196 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 4.92e-01 0.0744 0.108 0.196 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 7.19e-01 0.0334 0.0927 0.196 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0794 0.109 0.196 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 3.44e-01 0.0999 0.105 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 1.68e-01 0.126 0.0908 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 6.93e-01 0.0318 0.0804 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -40687 sc-eQTL 6.58e-02 -0.15 0.081 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 5.19e-01 0.0352 0.0545 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 5.35e-01 0.0597 0.0961 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 4.99e-01 0.0485 0.0716 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 4.06e-02 0.18 0.0876 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 6.47e-01 0.0514 0.112 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 5.87e-03 -0.253 0.0909 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 2.91e-02 -0.197 0.0896 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -40687 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0668 0.0868 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 3.14e-01 0.0595 0.0589 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 4.55e-02 0.214 0.106 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 6.52e-01 0.0388 0.0859 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 5.95e-01 0.0495 0.0928 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0935 0.112 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 2.24e-01 -0.134 0.11 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 3.60e-02 0.226 0.107 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0671 0.0963 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 8.47e-02 -0.17 0.0981 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 1.52e-01 0.151 0.105 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 2.09e-02 -0.214 0.0918 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 9.37e-02 0.149 0.0886 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 5.63e-01 0.0458 0.079 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0428 0.063 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 2.92e-01 0.0712 0.0674 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 5.98e-01 0.0391 0.0741 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 1.72e-01 0.0935 0.0683 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 1.56e-01 0.112 0.0784 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 3.18e-01 0.111 0.111 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 8.78e-01 0.0139 0.09 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 7.35e-01 -0.027 0.0796 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 8.85e-01 -0.00961 0.0661 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 4.61e-01 0.0654 0.0885 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 3.37e-01 0.0805 0.0837 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 5.28e-01 -0.059 0.0933 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 2.91e-01 0.115 0.109 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0441 0.104 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 8.17e-01 0.02 0.0866 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 1.23e-01 0.135 0.0871 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 1.39e-01 -0.145 0.0976 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 2.44e-01 -0.119 0.102 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 1.71e-01 -0.138 0.101 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 9.06e-01 0.0141 0.119 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0557 0.091 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0363 0.0884 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 7.50e-01 0.0312 0.0979 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 8.82e-01 0.0127 0.0853 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 3.97e-01 0.0872 0.103 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0266 0.0968 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 3.72e-01 0.0985 0.11 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 1.12e-01 -0.151 0.0945 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 7.52e-01 0.0242 0.0765 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 5.69e-01 0.0418 0.0732 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 3.32e-01 0.0988 0.102 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 1.46e-01 0.133 0.091 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 7.18e-01 0.036 0.0996 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 7.38e-01 0.0418 0.125 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 7.33e-01 0.0392 0.114 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0619 0.108 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0171 0.113 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 1.04e-01 -0.187 0.114 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 1.33e-01 -0.157 0.104 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0589 0.105 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 7.03e-01 0.0434 0.114 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 6.51e-01 0.0494 0.109 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0529 0.112 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 1.57e-01 0.148 0.104 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 1.38e-01 -0.146 0.0983 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0207 0.109 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 6.21e-01 0.0489 0.0986 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 2.10e-01 0.146 0.116 0.197 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00871 0.103 0.197 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 9.25e-01 0.00934 0.0991 0.197 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 5.35e-02 0.18 0.0926 0.197 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 3.84e-01 0.0895 0.103 0.197 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 8.08e-01 0.0253 0.104 0.197 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0628 0.107 0.197 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 4.95e-01 0.0795 0.116 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0206 0.0985 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 1.80e-01 0.139 0.103 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 2.22e-02 0.232 0.101 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0492 0.0991 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 6.30e-01 0.0495 0.102 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 3.39e-01 0.0966 0.101 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 9.02e-01 0.0138 0.113 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 5.84e-02 -0.157 0.0825 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 6.54e-01 0.0384 0.0854 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0521 0.091 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 8.13e-01 0.0192 0.081 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00108 0.114 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 8.90e-01 0.013 0.0941 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 1.90e-01 0.153 0.116 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 1.25e-01 0.159 0.103 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0682 0.101 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 9.08e-01 0.0112 0.0967 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 7.21e-01 0.0389 0.109 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 9.61e-01 -0.0051 0.103 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 6.51e-01 -0.045 0.0994 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 9.56e-01 0.00605 0.108 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0109 0.0845 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 6.05e-01 0.0473 0.0914 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0325 0.101 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 8.88e-01 0.0121 0.0858 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00855 0.107 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 6.91e-01 0.0394 0.0992 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 8.86e-01 0.0196 0.137 0.185 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 3.76e-01 -0.14 0.158 0.185 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0401 0.138 0.185 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -40687 sc-eQTL 1.34e-01 -0.192 0.127 0.185 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 2.06e-01 -0.116 0.091 0.185 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 7.77e-01 -0.04 0.141 0.185 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 3.15e-01 0.126 0.125 0.185 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 9.17e-01 -0.014 0.133 0.185 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0791 0.0877 0.193 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 8.45e-01 0.0218 0.112 0.193 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 6.23e-01 0.0512 0.104 0.193 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0477 0.0746 0.193 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 8.75e-01 0.0173 0.11 0.193 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0976 0.104 0.193 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 4.99e-01 -0.065 0.0959 0.193 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0158 0.112 0.197 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 4.25e-01 0.0864 0.108 0.197 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 8.30e-01 0.0186 0.0866 0.197 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 3.25e-01 0.0977 0.099 0.197 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 4.79e-01 0.0758 0.107 0.197 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 3.31e-01 0.0982 0.101 0.197 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00118 0.101 0.197 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 5.16e-01 0.0735 0.113 0.205 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0336 0.122 0.205 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 7.39e-02 -0.187 0.104 0.205 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 1.26e-01 0.113 0.0731 0.205 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0672 0.106 0.205 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -726667 sc-eQTL 3.18e-01 0.0943 0.0943 0.205 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -823328 sc-eQTL 3.83e-02 0.192 0.0918 0.205 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 8.01e-01 0.0253 0.1 0.205 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 6.57e-02 0.166 0.0899 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 9.04e-01 0.0121 0.101 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 4.92e-01 0.047 0.0683 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0247 0.06 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -225860 sc-eQTL 8.39e-01 0.0231 0.113 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0416 0.0923 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -726667 sc-eQTL 6.30e-01 0.0552 0.114 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -823328 sc-eQTL 2.27e-01 -0.122 0.101 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00689 0.0944 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 6.46e-01 0.0439 0.0953 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0722 0.113 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00383 0.0814 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 5.87e-01 0.034 0.0625 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -225860 sc-eQTL 2.99e-01 0.112 0.108 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0527 0.0976 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -726667 sc-eQTL 7.44e-01 0.0374 0.114 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -823328 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0356 0.093 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0264 0.0934 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0605 0.136 0.206 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0155 0.117 0.206 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 4.81e-01 0.0852 0.121 0.206 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 9.50e-02 0.219 0.13 0.206 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0864 0.12 0.206 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 5.21e-01 0.0778 0.121 0.206 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 3.61e-01 0.107 0.117 0.206 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 7.61e-01 0.0328 0.108 0.198 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 2.57e-01 -0.131 0.116 0.198 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 6.06e-01 0.0508 0.0983 0.198 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0256 0.0771 0.198 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -225860 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0685 0.106 0.198 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 1.29e-01 0.168 0.11 0.198 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -726667 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0417 0.111 0.198 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -823328 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00334 0.105 0.198 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 7.46e-01 0.034 0.105 0.198 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 1.49e-01 -0.14 0.097 0.199 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 2.45e-01 0.121 0.104 0.199 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 8.19e-01 0.0195 0.085 0.199 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0383 0.0771 0.199 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -225860 sc-eQTL 4.25e-01 -0.069 0.0864 0.199 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 1.87e-02 0.232 0.0978 0.199 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -726667 sc-eQTL 5.65e-01 0.0543 0.0944 0.199 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -823328 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0453 0.0943 0.199 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 4.74e-01 -0.07 0.0977 0.199 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 1.17e-01 -0.174 0.11 0.198 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 8.31e-01 0.0261 0.122 0.198 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 4.83e-01 0.071 0.101 0.198 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 8.17e-01 0.0218 0.094 0.198 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 6.65e-01 -0.053 0.122 0.198 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -726667 sc-eQTL 7.89e-01 0.0305 0.114 0.198 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -823328 sc-eQTL 5.37e-02 -0.17 0.0875 0.198 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0929 0.104 0.198 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 9.32e-01 0.00984 0.116 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 1.91e-01 0.126 0.0961 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0228 0.0855 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -40687 sc-eQTL 2.45e-01 -0.113 0.0972 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 6.81e-02 0.111 0.0608 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0292 0.101 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 3.30e-01 0.079 0.0809 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 5.86e-01 0.0482 0.0883 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 6.18e-01 0.051 0.102 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0313 0.0808 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0706 0.0763 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -40687 sc-eQTL 1.12e-01 -0.117 0.0731 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 5.92e-01 0.0278 0.0518 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 1.96e-01 0.122 0.0942 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 5.41e-01 0.0409 0.0668 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 1.80e-01 0.107 0.0791 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 1.86e-01 0.114 0.086 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0159 0.0978 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 6.20e-01 0.031 0.0624 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 8.67e-01 0.00919 0.0549 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -225860 sc-eQTL 3.85e-01 0.0972 0.112 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0979 0.0784 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -726667 sc-eQTL 6.67e-01 0.0496 0.115 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -823328 sc-eQTL 1.72e-01 -0.129 0.094 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 9.44e-01 0.00622 0.0884 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 1.63e-01 -0.133 0.0946 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0911 0.104 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 8.48e-01 0.0164 0.0852 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0235 0.0682 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -225860 sc-eQTL 2.52e-01 -0.114 0.0992 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 4.38e-02 0.182 0.0896 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -726667 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0625 0.103 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -823328 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0605 0.0979 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0597 0.098 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -613890 sc-eQTL 2.62e-01 0.12 0.107 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -614084 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0753 0.0728 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -383093 sc-eQTL 6.23e-01 0.0393 0.0799 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0494 0.0893 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -961998 sc-eQTL 6.23e-01 0.0334 0.0678 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0345 0.103 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -48795 sc-eQTL 5.24e-01 0.0567 0.0889 0.196 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162511 LAPTM5 -74876 eQTL 0.00454 -0.0323 0.0114 0.0 0.0 0.217
ENSG00000162517 PEF1 -961998 eQTL 0.0196 0.0396 0.0169 0.0 0.0 0.217
ENSG00000168528 SERINC2 -726667 eQTL 0.0142 0.108 0.0439 0.0 0.0 0.217
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 eQTL 1.71e-04 0.0538 0.0143 0.0 0.0 0.217

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -35606 0.000162 9.37e-06 1.56e-06 4.75e-06 4.79e-07 1.52e-05 1.04e-05 8.47e-07 5.1e-06 2.22e-06 8.97e-06 3.28e-06 1.12e-05 2.24e-06 1.35e-06 3.83e-06 2.73e-06 3.53e-06 2.1e-06 1.28e-06 2.93e-06 7.46e-06 6.24e-06 2.78e-06 7.71e-06 1.72e-06 2.53e-06 1.55e-06 1.24e-05 4.39e-06 2.56e-06 3.67e-08 1.25e-06 1.57e-06 3.09e-06 9.6e-07 8.21e-07 4.75e-07 1.06e-06 2.04e-07 2.88e-07 2.15e-05 2.66e-06 9.69e-08 8.03e-07 3.28e-07 1e-06 1.71e-07 3.12e-07