logo

Genes within 1Mb (chr1:30669165:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0579 0.117 0.128 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 2.40e-01 -0.11 0.0936 0.128 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 1.92e-01 0.103 0.0785 0.128 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -54420 sc-eQTL 1.27e-01 0.126 0.0824 0.128 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 8.25e-01 0.0144 0.0649 0.128 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 7.24e-01 0.0347 0.0979 0.128 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 1.74e-01 -0.103 0.0757 0.128 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 6.14e-01 0.0454 0.0899 0.128 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 6.30e-01 0.05 0.104 0.128 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 6.40e-01 0.0379 0.0809 0.128 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0958 0.0718 0.128 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0418 0.0798 0.128 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0394 0.0835 0.128 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0864 0.0712 0.128 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0811 0.0854 0.128 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 3.44e-01 -0.129 0.136 0.128 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 3.07e-01 0.0923 0.0902 0.128 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00296 0.0797 0.128 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 2.14e-01 0.0961 0.0771 0.128 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 2.75e-01 -0.104 0.095 0.128 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 6.44e-01 0.0419 0.0906 0.128 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 9.68e-01 0.00457 0.114 0.128 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 9.93e-01 0.00111 0.122 0.122 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 2.81e-02 -0.316 0.143 0.122 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 5.21e-01 0.0726 0.113 0.122 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 8.32e-01 0.0171 0.0808 0.122 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0962 0.131 0.122 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -740400 sc-eQTL 9.75e-01 0.00417 0.133 0.122 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -837061 sc-eQTL 2.73e-01 0.0968 0.088 0.122 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0465 0.128 0.122 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 4.63e-01 0.0685 0.0932 0.128 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 4.82e-02 0.228 0.115 0.128 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 6.79e-01 0.0307 0.0742 0.128 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0464 0.0682 0.128 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -239593 sc-eQTL 1.09e-01 -0.21 0.13 0.128 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 4.37e-01 0.0715 0.0919 0.128 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -740400 sc-eQTL 8.86e-01 0.0202 0.141 0.128 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -837061 sc-eQTL 4.19e-01 0.1 0.124 0.128 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 5.68e-01 0.0619 0.108 0.128 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 7.56e-02 0.229 0.128 0.127 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 2.11e-01 -0.111 0.088 0.127 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 8.90e-01 0.0129 0.0927 0.127 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 6.66e-01 0.0461 0.107 0.127 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0463 0.0778 0.127 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 7.75e-01 0.0344 0.12 0.127 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 2.92e-01 -0.117 0.11 0.127 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0403 0.0954 0.128 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0344 0.102 0.128 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0639 0.0916 0.128 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 2.55e-01 0.0856 0.075 0.128 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 9.26e-01 0.00936 0.1 0.128 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0676 0.123 0.128 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0767 0.128 0.128 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 6.01e-02 0.292 0.154 0.13 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 2.67e-01 0.174 0.157 0.13 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 1.91e-01 -0.191 0.145 0.13 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -54420 sc-eQTL 1.55e-01 -0.181 0.127 0.13 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0428 0.0889 0.13 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0635 0.151 0.13 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 9.92e-01 0.0014 0.144 0.13 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 7.59e-01 0.039 0.127 0.13 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 2.16e-01 -0.18 0.145 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 9.13e-01 0.0132 0.121 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0684 0.114 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -54420 sc-eQTL 2.51e-01 0.136 0.118 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0282 0.0729 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 8.30e-01 0.0291 0.135 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 6.73e-02 -0.187 0.102 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 1.49e-01 -0.165 0.114 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 1.45e-01 -0.205 0.141 0.127 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0108 0.13 0.127 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 1.95e-01 0.147 0.113 0.127 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -54420 sc-eQTL 8.53e-01 0.0201 0.108 0.127 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0632 0.0959 0.127 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0303 0.128 0.127 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 9.64e-01 0.00495 0.11 0.127 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 7.17e-02 0.231 0.128 0.127 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 8.64e-01 0.0224 0.131 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 9.38e-01 0.0088 0.113 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 1.41e-01 0.147 0.0992 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -54420 sc-eQTL 4.46e-01 0.0771 0.101 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 2.86e-01 0.0721 0.0674 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 8.69e-02 0.204 0.118 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0951 0.0886 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0131 0.11 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 3.72e-01 -0.125 0.139 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0986 0.115 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 9.69e-01 0.00445 0.113 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -54420 sc-eQTL 2.84e-01 0.116 0.108 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 8.37e-01 0.0151 0.0736 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0104 0.134 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 8.96e-01 0.0141 0.107 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 3.23e-01 0.114 0.115 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 7.43e-01 0.0446 0.136 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0372 0.133 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 6.61e-02 -0.24 0.13 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 3.86e-01 0.101 0.116 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 8.68e-01 0.0198 0.12 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 7.86e-01 0.0346 0.128 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 8.60e-04 0.371 0.109 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0975 0.108 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00859 0.0959 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 1.46e-01 -0.111 0.0762 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0466 0.082 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 9.04e-01 0.0108 0.09 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 4.69e-02 -0.165 0.0825 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0126 0.0957 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 2.85e-01 0.146 0.136 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 3.87e-01 0.0951 0.11 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 2.42e-01 0.114 0.0969 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0797 0.0805 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 4.27e-01 -0.086 0.108 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 3.02e-01 -0.106 0.102 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 1.83e-01 -0.152 0.114 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 3.71e-01 0.121 0.135 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 4.58e-02 0.256 0.127 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0189 0.107 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0814 0.108 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 9.19e-01 0.0124 0.121 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 4.35e-01 0.099 0.127 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 9.07e-01 0.0146 0.125 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 2.05e-01 -0.186 0.146 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 3.68e-02 0.234 0.111 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 8.42e-02 0.188 0.108 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 8.44e-01 0.0237 0.121 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0081 0.105 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0708 0.127 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 7.23e-01 0.0424 0.119 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 6.91e-01 -0.054 0.136 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 2.53e-01 -0.134 0.117 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 1.08e-01 -0.151 0.0936 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 5.84e-01 0.0495 0.0902 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 2.12e-01 -0.156 0.125 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 4.05e-01 0.0939 0.112 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 3.20e-01 0.122 0.122 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 4.80e-01 -0.106 0.15 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 4.15e-01 0.112 0.137 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 8.42e-01 0.0257 0.129 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 7.28e-01 0.0471 0.135 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 1.48e-01 -0.2 0.137 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 8.97e-01 0.0162 0.125 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 5.03e-01 0.0848 0.126 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 2.85e-01 -0.154 0.144 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0834 0.138 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 3.35e-01 -0.136 0.141 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 2.05e-01 0.168 0.132 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 9.75e-01 0.00385 0.125 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0944 0.138 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 4.38e-01 0.0966 0.124 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 2.30e-01 -0.171 0.142 0.13 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 7.56e-01 0.0392 0.126 0.13 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 5.16e-01 0.0785 0.121 0.13 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 3.40e-01 0.109 0.114 0.13 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0595 0.125 0.13 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00978 0.127 0.13 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0388 0.131 0.13 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 9.84e-01 0.00293 0.147 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0885 0.124 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 2.40e-01 0.153 0.13 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0381 0.128 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 6.64e-01 0.0543 0.125 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 3.16e-02 -0.276 0.128 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0811 0.127 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 7.80e-01 0.0381 0.136 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0681 0.101 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0358 0.103 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 4.08e-01 0.0912 0.11 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0514 0.098 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0518 0.138 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 5.57e-01 0.067 0.114 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 3.17e-01 -0.147 0.146 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0136 0.131 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 3.24e-01 -0.126 0.127 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 6.03e-01 0.0634 0.122 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 4.11e-01 0.113 0.137 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 2.54e-01 0.148 0.129 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 6.80e-01 0.0518 0.125 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 1.27e-02 0.332 0.132 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0927 0.105 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0269 0.113 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 5.54e-01 0.0739 0.125 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0733 0.106 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 4.80e-01 0.0934 0.132 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 3.27e-01 0.121 0.123 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0222 0.151 0.137 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 5.05e-01 -0.117 0.175 0.137 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0156 0.152 0.137 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -54420 sc-eQTL 2.98e-01 0.147 0.141 0.137 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 9.78e-01 0.00278 0.101 0.137 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0273 0.156 0.137 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 3.97e-01 0.117 0.138 0.137 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 7.70e-01 0.0433 0.147 0.137 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00939 0.104 0.13 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 4.23e-01 -0.105 0.131 0.13 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 8.47e-01 0.0237 0.123 0.13 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 8.74e-01 -0.014 0.088 0.13 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0933 0.129 0.13 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0216 0.123 0.13 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 3.69e-01 -0.102 0.113 0.13 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0918 0.139 0.128 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 9.94e-01 0.000935 0.135 0.128 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 9.47e-01 0.00714 0.108 0.128 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0812 0.123 0.128 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 9.16e-02 -0.225 0.133 0.128 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0989 0.126 0.128 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00414 0.126 0.128 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0379 0.137 0.127 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 1.31e-01 -0.224 0.148 0.127 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 4.49e-02 0.255 0.126 0.127 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0642 0.0893 0.127 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0466 0.129 0.127 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -740400 sc-eQTL 2.51e-01 0.132 0.114 0.127 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -837061 sc-eQTL 1.03e-01 -0.183 0.112 0.127 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0709 0.121 0.127 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 1.21e-01 0.175 0.113 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 1.00e-01 0.207 0.126 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 6.81e-01 0.0352 0.0855 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0704 0.0749 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -239593 sc-eQTL 2.46e-01 -0.164 0.141 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 3.29e-01 0.113 0.115 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -740400 sc-eQTL 9.61e-01 0.00704 0.143 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -837061 sc-eQTL 3.66e-01 0.114 0.126 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 6.70e-01 0.0503 0.118 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 5.55e-01 0.07 0.118 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 6.71e-02 0.255 0.139 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 6.37e-01 0.0478 0.101 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0226 0.0777 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -239593 sc-eQTL 3.04e-01 -0.138 0.134 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00252 0.121 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -740400 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00302 0.142 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -837061 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0406 0.115 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0466 0.116 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0206 0.171 0.13 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0103 0.146 0.13 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 2.91e-01 -0.16 0.15 0.13 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 5.18e-01 -0.106 0.164 0.13 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 8.14e-02 0.261 0.149 0.13 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 5.94e-02 -0.284 0.15 0.13 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 2.59e-01 -0.166 0.146 0.13 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 3.36e-02 -0.283 0.132 0.124 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0134 0.144 0.124 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0514 0.122 0.124 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 3.82e-01 0.0837 0.0955 0.124 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -239593 sc-eQTL 3.57e-01 -0.121 0.131 0.124 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 4.24e-01 0.11 0.137 0.124 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -740400 sc-eQTL 3.69e-01 0.123 0.137 0.124 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -837061 sc-eQTL 4.60e-01 0.096 0.13 0.124 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 4.02e-01 0.109 0.13 0.124 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0385 0.122 0.127 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0262 0.13 0.127 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0532 0.106 0.127 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 8.52e-01 0.0181 0.0967 0.127 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -239593 sc-eQTL 2.41e-01 -0.127 0.108 0.127 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 1.54e-01 -0.177 0.124 0.127 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -740400 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0193 0.118 0.127 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -837061 sc-eQTL 2.71e-01 0.13 0.118 0.127 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 1.81e-01 0.164 0.122 0.127 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0087 0.14 0.116 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0681 0.153 0.116 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 9.67e-01 0.00528 0.127 0.116 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 6.11e-01 0.0602 0.118 0.116 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 8.21e-01 0.0349 0.153 0.116 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -740400 sc-eQTL 8.95e-01 -0.019 0.143 0.116 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -837061 sc-eQTL 1.83e-01 0.148 0.111 0.116 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 6.81e-01 0.0538 0.131 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 2.05e-01 -0.174 0.137 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0471 0.114 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 4.38e-01 0.0785 0.101 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -54420 sc-eQTL 6.06e-01 0.0595 0.115 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0244 0.0725 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0828 0.12 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0971 0.0957 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 7.96e-01 0.027 0.105 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0198 0.127 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0937 0.1 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 1.98e-01 0.122 0.0945 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -54420 sc-eQTL 2.52e-01 0.104 0.091 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 1.30e-01 0.0972 0.0639 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 8.92e-02 0.199 0.117 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 3.54e-01 -0.077 0.0828 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 2.66e-01 0.11 0.0983 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 2.92e-01 0.113 0.107 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 2.76e-02 0.266 0.12 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 4.33e-01 0.0607 0.0772 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0497 0.0679 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -239593 sc-eQTL 1.68e-01 -0.191 0.138 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 2.71e-01 0.107 0.0972 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -740400 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0121 0.143 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -837061 sc-eQTL 5.80e-01 0.0648 0.117 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 9.50e-01 0.0069 0.109 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00931 0.116 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0137 0.127 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0967 0.104 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0188 0.0835 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -239593 sc-eQTL 2.07e-01 -0.154 0.122 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0326 0.111 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -740400 sc-eQTL 4.35e-01 0.0988 0.126 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -837061 sc-eQTL 1.61e-01 0.168 0.12 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 6.11e-01 0.0612 0.12 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -627623 sc-eQTL 1.20e-01 0.202 0.13 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -627817 sc-eQTL 2.50e-01 -0.102 0.0888 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -396826 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0186 0.0976 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -88609 sc-eQTL 7.33e-01 0.0373 0.109 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -975731 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0797 0.0827 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 sc-eQTL 3.52e-01 0.117 0.126 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -62528 sc-eQTL 8.54e-01 -0.02 0.109 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -49339 eQTL 1.46e-02 -0.0425 0.0174 0.0 0.0 0.146
ENSG00000284543 LINC01226 -837116 eQTL 4.13e-05 -0.179 0.0435 0.0744 0.0362 0.146

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000284543 LINC01226 -837116 2.76e-07 1.27e-07 5.49e-08 1.82e-07 1.01e-07 9.91e-08 1.6e-07 5.43e-08 1.47e-07 6.08e-08 1.57e-07 1.05e-07 1.53e-07 7.13e-08 6.12e-08 7.5e-08 4.01e-08 1.44e-07 6.07e-08 4.3e-08 1.22e-07 1.26e-07 1.44e-07 2.91e-08 1.55e-07 1.26e-07 1.13e-07 9.74e-08 1.23e-07 1.05e-07 1.02e-07 3.08e-08 3.96e-08 8.72e-08 5.64e-08 3.28e-08 5.37e-08 8.61e-08 6.63e-08 4.19e-08 4.92e-08 1.4e-07 5.2e-08 1.26e-08 3.83e-08 1.87e-08 1.2e-07 1.88e-09 5.02e-08