logo

Genes within 1Mb (chr1:30668302:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0388 0.107 0.15 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0508 0.0853 0.15 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 2.31e-01 0.0858 0.0714 0.15 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -55283 sc-eQTL 2.90e-02 0.164 0.0745 0.15 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 5.38e-01 0.0364 0.0589 0.15 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 9.68e-01 0.00356 0.089 0.15 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 4.10e-01 -0.057 0.069 0.15 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 3.66e-01 0.074 0.0817 0.15 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 5.84e-01 0.0514 0.0938 0.15 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 3.33e-01 0.0709 0.0732 0.15 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0447 0.0652 0.15 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0683 0.0722 0.15 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0682 0.0755 0.15 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0323 0.0647 0.15 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0535 0.0774 0.15 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 2.93e-01 -0.13 0.123 0.15 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 1.58e-01 0.116 0.0819 0.15 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 8.47e-01 -0.014 0.0724 0.15 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 7.76e-01 0.02 0.0703 0.15 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0982 0.0864 0.15 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 9.07e-01 0.0096 0.0824 0.15 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0348 0.104 0.15 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 9.60e-01 0.00561 0.112 0.14 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 8.88e-02 -0.226 0.132 0.14 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 5.44e-01 0.0631 0.104 0.14 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00914 0.0743 0.14 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0906 0.12 0.14 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -741263 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00883 0.123 0.14 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -837924 sc-eQTL 3.52e-01 0.0756 0.081 0.14 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 8.89e-01 0.0164 0.118 0.14 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 2.46e-01 0.0987 0.0848 0.15 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 1.67e-02 0.251 0.104 0.15 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 9.78e-01 -0.0019 0.0676 0.15 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0473 0.0621 0.15 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -240456 sc-eQTL 1.98e-01 -0.154 0.119 0.15 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 4.16e-01 0.0683 0.0838 0.15 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -741263 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0137 0.128 0.15 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -837924 sc-eQTL 4.13e-01 0.0925 0.113 0.15 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0263 0.0988 0.15 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 2.45e-01 0.137 0.118 0.148 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0614 0.0806 0.148 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0429 0.0846 0.148 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 9.42e-01 0.00705 0.0974 0.148 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0476 0.071 0.148 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 8.56e-01 0.0199 0.109 0.148 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 1.40e-01 -0.149 0.101 0.148 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0604 0.0865 0.15 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 8.78e-01 0.0142 0.0925 0.15 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 9.41e-01 0.0062 0.0832 0.15 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 6.62e-01 0.0298 0.0682 0.15 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0189 0.0911 0.15 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0946 0.112 0.15 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0162 0.116 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 4.07e-02 0.277 0.134 0.156 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 1.70e-01 0.188 0.136 0.156 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 4.03e-01 -0.106 0.127 0.156 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -55283 sc-eQTL 4.56e-01 -0.083 0.111 0.156 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0187 0.0776 0.156 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 2.72e-01 -0.145 0.132 0.156 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 9.15e-01 0.0134 0.125 0.156 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 5.39e-01 0.0683 0.111 0.156 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 4.47e-01 -0.1 0.132 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 6.92e-01 0.0436 0.11 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 2.01e-01 -0.133 0.103 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -55283 sc-eQTL 2.67e-01 0.12 0.108 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 9.33e-01 0.00561 0.0662 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 5.06e-01 0.0818 0.123 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 4.74e-02 -0.184 0.0921 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0815 0.104 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 1.79e-01 -0.171 0.127 0.149 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000859 0.117 0.149 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 2.51e-01 0.117 0.102 0.149 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -55283 sc-eQTL 6.14e-01 0.0494 0.0977 0.149 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0322 0.0866 0.149 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 3.29e-01 -0.113 0.115 0.149 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 7.20e-01 0.0356 0.0991 0.149 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 1.18e-01 0.181 0.115 0.149 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0585 0.118 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00876 0.102 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 4.08e-01 0.0746 0.0899 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -55283 sc-eQTL 1.97e-01 0.118 0.091 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 2.33e-01 0.0727 0.0608 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 2.17e-01 0.133 0.107 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0464 0.0801 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 7.75e-01 0.0284 0.099 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 6.36e-01 -0.06 0.127 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 9.08e-01 0.0121 0.105 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 4.42e-01 0.0786 0.102 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -55283 sc-eQTL 5.27e-02 0.19 0.0973 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 8.41e-01 0.0134 0.0667 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0149 0.121 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 8.23e-01 0.0218 0.0971 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 2.65e-01 0.117 0.105 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 9.83e-01 -0.0027 0.123 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 6.93e-01 0.0477 0.121 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 1.47e-01 -0.171 0.118 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 8.45e-01 0.0206 0.106 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0196 0.108 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 4.77e-01 0.0822 0.115 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 8.26e-04 0.336 0.099 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 5.95e-01 -0.052 0.0977 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 5.91e-01 0.0466 0.0866 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0496 0.0691 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0569 0.0741 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0175 0.0813 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0732 0.0751 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 8.84e-01 0.0127 0.0865 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 5.15e-01 0.0804 0.123 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 3.40e-01 0.095 0.0993 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 3.52e-01 0.0821 0.0879 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 1.05e-01 -0.118 0.0726 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 2.68e-01 -0.108 0.0977 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0755 0.0926 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 1.50e-01 -0.148 0.103 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 4.52e-01 0.0924 0.123 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 4.66e-02 0.232 0.116 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0344 0.0975 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 1.89e-01 -0.129 0.0982 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 5.72e-01 0.0625 0.11 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 6.56e-01 0.0515 0.115 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 8.11e-01 0.0272 0.114 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 2.06e-01 -0.169 0.133 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 3.64e-02 0.213 0.101 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 4.02e-02 0.203 0.0983 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0681 0.11 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0446 0.0957 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0999 0.115 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 9.50e-01 0.00678 0.109 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0357 0.122 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0401 0.105 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 4.95e-02 -0.166 0.084 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 8.64e-01 -0.014 0.0812 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0998 0.113 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 6.21e-01 0.0502 0.101 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 3.93e-01 0.0944 0.11 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 1.60e-01 -0.19 0.134 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 5.56e-01 0.0729 0.124 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0248 0.116 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00431 0.122 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 3.27e-01 -0.122 0.124 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 7.43e-01 0.037 0.113 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 7.14e-01 0.0419 0.114 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 2.32e-01 -0.154 0.128 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 4.22e-01 -0.099 0.123 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 3.85e-01 -0.11 0.126 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 4.07e-01 0.0984 0.118 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0103 0.112 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0934 0.123 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 2.81e-01 0.12 0.111 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 1.74e-01 -0.175 0.128 0.152 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 4.87e-01 0.0793 0.114 0.152 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 4.35e-01 0.0855 0.109 0.152 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 6.36e-01 0.0489 0.103 0.152 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0749 0.113 0.152 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0332 0.115 0.152 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 5.88e-01 0.0641 0.118 0.152 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 9.99e-01 0.000156 0.132 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0655 0.111 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 1.76e-01 0.158 0.117 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 2.04e-01 -0.147 0.115 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 4.82e-01 0.0789 0.112 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 7.73e-02 -0.205 0.115 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0507 0.114 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0158 0.124 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0293 0.0918 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0868 0.094 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 3.47e-01 0.0946 0.1 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0522 0.0893 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0314 0.126 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 8.26e-01 0.0229 0.104 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 2.75e-01 -0.145 0.132 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 7.49e-01 -0.038 0.118 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0971 0.115 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 8.92e-01 -0.015 0.11 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 4.61e-01 0.0916 0.124 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 2.73e-01 0.128 0.117 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0641 0.113 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 1.66e-02 0.29 0.12 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0307 0.0951 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 2.73e-01 -0.113 0.103 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 8.81e-01 0.017 0.113 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0882 0.0963 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 8.28e-01 0.0261 0.12 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 4.01e-01 0.0937 0.111 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0568 0.135 0.163 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0688 0.156 0.163 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0537 0.136 0.163 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -55283 sc-eQTL 7.10e-02 0.228 0.125 0.163 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 6.62e-01 0.0397 0.0904 0.163 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 3.18e-01 -0.139 0.139 0.163 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 7.94e-01 0.0323 0.124 0.163 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 5.30e-01 0.0829 0.132 0.163 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0376 0.0951 0.152 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 3.75e-01 -0.107 0.121 0.152 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 6.98e-01 0.0438 0.113 0.152 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0279 0.0808 0.152 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0789 0.118 0.152 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 9.46e-01 0.00772 0.113 0.152 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 1.41e-01 -0.153 0.103 0.152 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0931 0.127 0.15 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 9.67e-01 0.00509 0.123 0.15 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 8.78e-01 0.0151 0.0984 0.15 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 1.99e-01 -0.145 0.112 0.15 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 9.65e-02 -0.202 0.121 0.15 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0992 0.115 0.15 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 3.49e-01 0.107 0.114 0.15 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0185 0.127 0.144 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 1.39e-01 -0.203 0.136 0.144 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 4.70e-02 0.233 0.117 0.144 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 3.58e-01 -0.076 0.0824 0.144 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 9.45e-01 0.00826 0.12 0.144 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -741263 sc-eQTL 4.70e-01 0.0766 0.106 0.144 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -837924 sc-eQTL 2.98e-01 -0.108 0.104 0.144 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00258 0.112 0.144 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 6.44e-02 0.189 0.102 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 1.27e-01 0.174 0.114 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 5.92e-01 0.0415 0.0774 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0759 0.0678 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -240456 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0796 0.128 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 1.52e-01 0.15 0.104 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -741263 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0455 0.13 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -837924 sc-eQTL 3.35e-01 0.111 0.114 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00462 0.107 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 4.37e-01 0.0839 0.108 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 2.38e-02 0.287 0.126 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 6.90e-01 0.0368 0.0922 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0131 0.0709 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -240456 sc-eQTL 4.13e-01 -0.1 0.122 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00587 0.111 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -741263 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0209 0.13 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -837924 sc-eQTL 8.02e-01 0.0265 0.105 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0621 0.106 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 9.44e-01 0.0109 0.153 0.155 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 9.74e-01 0.00438 0.132 0.155 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0337 0.136 0.155 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 1.84e-01 -0.196 0.147 0.155 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 2.03e-01 0.172 0.134 0.155 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 2.11e-02 -0.312 0.134 0.155 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0756 0.132 0.155 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 7.12e-02 -0.222 0.122 0.142 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0253 0.132 0.142 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 2.74e-01 -0.123 0.112 0.142 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 4.38e-01 0.0684 0.088 0.142 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -240456 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0975 0.12 0.142 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 7.47e-01 0.041 0.127 0.142 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -741263 sc-eQTL 5.80e-01 0.07 0.126 0.142 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -837924 sc-eQTL 4.70e-01 0.0864 0.12 0.142 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 2.21e-01 0.146 0.119 0.142 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 2.43e-01 -0.131 0.111 0.147 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 9.84e-01 0.00235 0.119 0.147 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0771 0.0972 0.147 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00921 0.0885 0.147 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -240456 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0983 0.0989 0.147 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 1.47e-01 -0.164 0.113 0.147 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -741263 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0538 0.108 0.147 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -837924 sc-eQTL 3.48e-01 0.102 0.108 0.147 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 1.84e-01 0.149 0.112 0.147 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0404 0.13 0.133 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 8.81e-01 0.0214 0.143 0.133 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 9.84e-01 0.00237 0.118 0.133 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 7.22e-01 0.0392 0.11 0.133 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 4.42e-01 -0.11 0.142 0.133 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -741263 sc-eQTL 9.62e-01 0.00637 0.133 0.133 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -837924 sc-eQTL 2.87e-01 0.11 0.103 0.133 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 4.60e-01 0.0901 0.122 0.133 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 2.73e-01 -0.137 0.125 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0117 0.104 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 7.17e-01 0.0334 0.0921 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -55283 sc-eQTL 4.16e-01 0.0855 0.105 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00221 0.066 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0884 0.109 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0646 0.0872 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 7.31e-01 0.0328 0.0951 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0467 0.115 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0467 0.0905 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 1.41e-01 0.126 0.0853 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -55283 sc-eQTL 7.74e-02 0.145 0.0819 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 1.11e-01 0.0924 0.0577 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 2.04e-01 0.135 0.106 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0472 0.075 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 9.80e-02 0.147 0.0886 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 7.98e-02 0.171 0.0968 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 1.18e-02 0.276 0.109 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 5.01e-01 0.0475 0.0704 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0264 0.0619 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -240456 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0949 0.126 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 2.42e-01 0.104 0.0886 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -741263 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0502 0.13 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -837924 sc-eQTL 5.09e-01 0.0704 0.106 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0626 0.0997 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 5.25e-01 -0.068 0.107 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 8.43e-01 0.0232 0.117 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 1.60e-01 -0.135 0.0954 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0303 0.0767 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -240456 sc-eQTL 2.59e-01 -0.126 0.112 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0359 0.102 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -741263 sc-eQTL 6.23e-01 0.0572 0.116 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -837924 sc-eQTL 1.82e-01 0.147 0.11 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 4.95e-01 0.0753 0.11 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -628486 sc-eQTL 3.41e-01 0.113 0.119 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -628680 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0545 0.0811 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -397689 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0871 0.0888 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -89472 sc-eQTL 9.47e-01 0.00666 0.0994 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -976594 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0873 0.0753 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 sc-eQTL 4.48e-01 0.0871 0.115 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -63391 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0715 0.0989 0.149 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -50202 eQTL 9.84e-03 -0.0433 0.0167 0.0 0.0 0.157
ENSG00000284543 LINC01226 -837979 eQTL 4.11e-05 -0.173 0.0419 0.0847 0.041 0.157

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000284543 LINC01226 -837979 3.07e-07 1.59e-07 7.6e-08 2.43e-07 9.82e-08 8.85e-08 2.74e-07 5.48e-08 1.54e-07 8.53e-08 1.62e-07 1.23e-07 2.29e-07 8.54e-08 6.27e-08 9.01e-08 4.12e-08 1.72e-07 9.69e-08 5.33e-08 1.22e-07 1.47e-07 1.75e-07 3.49e-08 2.86e-07 1.22e-07 1.29e-07 1.1e-07 1.36e-07 1.06e-07 1.07e-07 3.59e-08 3.73e-08 9.3e-08 1.33e-07 3.18e-08 3.91e-08 8.51e-08 6.58e-08 4.55e-08 5.36e-08 1.55e-07 3.35e-08 2.06e-08 3.3e-08 9.44e-09 8.93e-08 3.2e-09 4.83e-08