logo

Genes within 1Mb (chr1:30666231:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 7.84e-01 0.0242 0.0883 0.259 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0444 0.0707 0.259 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 8.73e-01 -0.00951 0.0593 0.259 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -57354 sc-eQTL 3.61e-02 0.13 0.0617 0.259 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 3.69e-01 0.0439 0.0488 0.259 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0361 0.0737 0.259 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0245 0.0572 0.259 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 8.24e-01 0.0151 0.0678 0.259 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0518 0.0762 0.259 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 2.19e-01 0.0732 0.0594 0.259 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0408 0.053 0.259 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 5.01e-01 0.0396 0.0588 0.259 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 8.71e-01 -0.01 0.0615 0.259 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0549 0.0525 0.259 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0391 0.063 0.259 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 7.50e-02 -0.177 0.0989 0.259 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 3.85e-01 0.0576 0.0662 0.259 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 6.43e-01 0.0271 0.0584 0.259 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 2.48e-01 0.0656 0.0566 0.259 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 8.45e-02 -0.12 0.0694 0.259 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0382 0.0664 0.259 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0336 0.0835 0.259 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0947 0.0912 0.248 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 2.87e-01 -0.115 0.108 0.248 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0218 0.0848 0.248 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00261 0.0606 0.248 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 3.89e-01 0.0846 0.098 0.248 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -743334 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0528 0.0998 0.248 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -839995 sc-eQTL 3.34e-01 0.064 0.066 0.248 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0344 0.0958 0.248 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 9.44e-02 0.116 0.069 0.259 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 1.17e-01 0.135 0.0856 0.259 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0313 0.0551 0.259 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 7.97e-01 -0.013 0.0507 0.259 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -242527 sc-eQTL 1.90e-01 -0.128 0.0971 0.259 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 8.92e-01 -0.00927 0.0684 0.259 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -743334 sc-eQTL 4.79e-01 0.0741 0.105 0.259 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -839995 sc-eQTL 3.25e-01 0.0907 0.092 0.259 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 5.70e-01 0.0458 0.0805 0.259 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 1.47e-01 0.142 0.0979 0.258 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0707 0.0672 0.258 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 3.32e-02 -0.15 0.0699 0.258 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 2.04e-02 0.188 0.0803 0.258 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0249 0.0593 0.258 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 3.56e-01 0.0844 0.0912 0.258 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0612 0.0843 0.258 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 8.09e-01 0.0174 0.0717 0.259 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0607 0.0765 0.259 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 7.30e-01 0.0238 0.0689 0.259 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0154 0.0564 0.259 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0653 0.0753 0.259 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0936 0.0922 0.259 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 8.50e-01 0.0182 0.0963 0.259 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 8.63e-01 -0.02 0.115 0.27 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 2.27e-01 0.141 0.116 0.27 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 2.85e-01 -0.116 0.108 0.27 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -57354 sc-eQTL 5.06e-01 -0.063 0.0945 0.27 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0166 0.066 0.27 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 3.09e-01 -0.114 0.112 0.27 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 4.60e-01 0.0788 0.106 0.27 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 2.55e-01 0.107 0.0939 0.27 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0755 0.108 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0748 0.0903 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 2.39e-01 -0.1 0.085 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -57354 sc-eQTL 3.58e-01 0.0816 0.0886 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 3.95e-01 0.0464 0.0544 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 3.56e-01 0.0933 0.101 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 8.11e-02 -0.133 0.0759 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0685 0.0854 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0888 0.105 0.256 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0312 0.0966 0.256 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 5.00e-01 0.0567 0.084 0.256 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -57354 sc-eQTL 3.78e-01 0.071 0.0803 0.256 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 8.06e-01 0.0176 0.0713 0.256 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0573 0.0952 0.256 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 9.72e-01 0.00286 0.0816 0.256 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 4.88e-01 0.0663 0.0955 0.256 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 6.00e-01 0.0507 0.0967 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0704 0.0834 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 7.58e-01 0.0228 0.0737 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -57354 sc-eQTL 2.23e-01 0.091 0.0745 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 1.03e-01 0.0812 0.0496 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 4.90e-01 0.0608 0.088 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0472 0.0655 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 8.48e-01 0.0156 0.081 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 1.96e-01 -0.133 0.103 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 9.28e-01 0.00771 0.085 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0288 0.0832 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -57354 sc-eQTL 5.81e-01 0.0442 0.0799 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 2.07e-01 0.0684 0.0541 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 5.03e-02 -0.193 0.0978 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 7.42e-01 -0.026 0.079 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 8.57e-01 0.0154 0.0853 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 9.38e-01 0.00808 0.103 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 1.99e-01 0.13 0.101 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0672 0.0993 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 2.38e-01 0.105 0.0883 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 2.92e-01 0.0956 0.0906 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 2.53e-01 0.111 0.0966 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 3.87e-03 0.245 0.0837 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 1.17e-01 -0.124 0.0785 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 2.95e-01 0.0733 0.0698 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0235 0.0559 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 7.17e-01 0.0217 0.0599 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0171 0.0657 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0649 0.0606 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00903 0.0698 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 9.07e-01 0.0118 0.101 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0498 0.0814 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 5.74e-01 0.0405 0.0721 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 7.82e-01 0.0166 0.0598 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 1.77e-01 -0.108 0.0799 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0971 0.0756 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0984 0.0843 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0368 0.101 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 4.49e-03 0.272 0.0946 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0147 0.0803 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 7.01e-01 0.0312 0.0812 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 1.57e-01 0.129 0.0905 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 6.69e-01 0.0406 0.095 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 9.64e-01 0.00421 0.0936 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 2.00e-01 -0.14 0.109 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 1.75e-01 0.113 0.0833 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 7.60e-03 0.215 0.0799 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 9.17e-01 0.00936 0.09 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0117 0.0784 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 2.09e-01 -0.119 0.0942 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00259 0.089 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 1.33e-01 -0.148 0.098 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0239 0.0849 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0793 0.0682 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 2.08e-01 0.0824 0.0653 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 2.53e-01 -0.104 0.0908 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0499 0.0817 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 7.40e-01 0.0296 0.089 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0755 0.109 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 4.68e-01 0.0726 0.0999 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 9.75e-01 0.00292 0.094 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 3.60e-01 0.0901 0.0982 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0014 0.101 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 6.76e-01 0.0381 0.0911 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0237 0.0921 0.264 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0671 0.106 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0963 0.101 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00532 0.104 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 7.98e-01 0.025 0.0975 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0571 0.0917 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 4.36e-01 -0.079 0.101 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 4.45e-01 -0.07 0.0915 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0634 0.107 0.26 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0337 0.0949 0.26 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 9.35e-01 0.00745 0.091 0.26 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 5.13e-01 0.0562 0.0858 0.26 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 8.06e-02 -0.164 0.0937 0.26 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0185 0.0956 0.26 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0103 0.0986 0.26 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 2.98e-01 0.114 0.109 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 1.13e-01 -0.146 0.092 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 5.10e-01 0.0641 0.0971 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 2.31e-01 -0.115 0.0955 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 4.93e-01 0.0638 0.093 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 6.91e-02 -0.175 0.0956 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 1.15e-01 -0.15 0.0943 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 9.99e-01 0.000134 0.104 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00162 0.0766 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 3.27e-02 -0.167 0.0777 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 8.13e-03 0.22 0.0824 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0135 0.0746 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 4.77e-01 0.0747 0.105 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 1.79e-01 0.116 0.0862 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 2.27e-01 -0.137 0.113 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0836 0.101 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0604 0.0989 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 1.04e-01 0.153 0.0938 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 8.89e-02 -0.181 0.106 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 2.63e-01 0.112 0.1 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 1.48e-01 0.141 0.0967 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 5.58e-02 0.195 0.102 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 8.22e-01 -0.018 0.08 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 1.46e-02 -0.21 0.0852 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 2.74e-02 0.209 0.0941 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0527 0.081 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 9.24e-01 0.00967 0.101 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0478 0.0938 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 1.33e-01 0.177 0.117 0.278 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0871 0.137 0.278 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 1.20e-01 -0.184 0.118 0.278 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -57354 sc-eQTL 2.34e-02 0.249 0.108 0.278 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 1.49e-01 0.114 0.0785 0.278 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0841 0.122 0.278 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0703 0.108 0.278 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 9.03e-01 0.0141 0.115 0.278 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 7.17e-01 0.0291 0.0803 0.261 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0772 0.102 0.261 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 9.21e-01 0.00946 0.0951 0.261 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0453 0.0682 0.261 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0109 0.1 0.261 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0656 0.0952 0.261 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 8.73e-02 -0.15 0.0871 0.261 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0753 0.104 0.259 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 2.40e-01 0.118 0.1 0.259 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0594 0.0802 0.259 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 8.67e-01 0.0154 0.092 0.259 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 6.53e-02 -0.183 0.0985 0.259 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0202 0.0937 0.259 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 2.82e-01 0.101 0.0933 0.259 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 1.55e-01 -0.148 0.103 0.256 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 3.34e-01 -0.109 0.112 0.256 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 4.08e-01 0.0801 0.0965 0.256 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0194 0.0678 0.256 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 5.08e-02 0.191 0.0972 0.256 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -743334 sc-eQTL 7.41e-01 0.0288 0.087 0.256 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -839995 sc-eQTL 7.98e-02 -0.149 0.0848 0.256 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0567 0.092 0.256 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 2.27e-01 0.101 0.0833 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 7.75e-01 0.0267 0.0932 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 8.96e-01 0.00824 0.0631 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0398 0.0553 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -242527 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0844 0.104 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 5.00e-01 0.0574 0.0851 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -743334 sc-eQTL 3.64e-01 0.0959 0.105 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -839995 sc-eQTL 2.75e-01 0.102 0.093 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 4.79e-01 0.0617 0.0869 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 2.46e-01 0.101 0.087 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 1.17e-01 0.161 0.103 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0398 0.0745 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0343 0.0573 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -242527 sc-eQTL 1.20e-01 -0.154 0.0984 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 5.02e-01 -0.06 0.0893 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -743334 sc-eQTL 4.66e-01 0.0765 0.105 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -839995 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0391 0.0851 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0562 0.0854 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 3.33e-01 0.123 0.127 0.261 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 3.16e-01 0.11 0.109 0.261 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0261 0.113 0.261 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 4.64e-02 -0.243 0.121 0.261 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 4.11e-01 0.0921 0.112 0.261 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 5.86e-02 -0.213 0.112 0.261 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0344 0.109 0.261 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 7.70e-01 0.0286 0.0976 0.253 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 4.53e-01 0.0788 0.105 0.253 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 1.46e-02 -0.216 0.0877 0.253 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 1.26e-01 0.107 0.0695 0.253 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -242527 sc-eQTL 1.40e-01 -0.141 0.0951 0.253 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 2.75e-01 0.11 0.1 0.253 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -743334 sc-eQTL 1.70e-01 0.137 0.0997 0.253 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -839995 sc-eQTL 2.58e-01 0.107 0.0946 0.253 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 4.85e-02 0.187 0.094 0.253 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 9.86e-01 0.00163 0.0915 0.256 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 8.37e-01 0.0201 0.0976 0.256 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0546 0.0797 0.256 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 5.17e-01 0.047 0.0723 0.256 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -242527 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0579 0.0811 0.256 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 1.70e-01 -0.128 0.0927 0.256 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -743334 sc-eQTL 8.40e-01 0.0179 0.0886 0.256 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -839995 sc-eQTL 5.37e-01 0.0546 0.0885 0.256 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 5.25e-01 0.0584 0.0917 0.256 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0634 0.103 0.257 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0623 0.113 0.257 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0582 0.0935 0.257 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 8.94e-01 0.0117 0.087 0.257 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0308 0.113 0.257 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -743334 sc-eQTL 6.71e-01 0.0449 0.105 0.257 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -839995 sc-eQTL 3.79e-01 0.0722 0.0817 0.257 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 9.37e-01 0.00761 0.0964 0.257 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 2.10e-01 -0.129 0.102 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0761 0.0853 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00739 0.0758 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -57354 sc-eQTL 2.12e-01 0.108 0.0861 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 5.67e-01 0.0311 0.0542 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0364 0.0899 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0345 0.0717 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 6.12e-01 0.0398 0.0782 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 8.81e-01 0.014 0.0939 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 5.45e-01 -0.045 0.0742 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 4.45e-01 0.0537 0.0701 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -57354 sc-eQTL 2.56e-01 0.0768 0.0674 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 4.96e-02 0.0931 0.0472 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00786 0.0869 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0536 0.0614 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 5.14e-01 0.0477 0.0729 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 1.40e-01 0.117 0.079 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 1.96e-01 0.116 0.0896 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 9.79e-01 0.00154 0.0574 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0108 0.0504 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -242527 sc-eQTL 1.94e-01 -0.133 0.102 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 8.70e-01 0.0119 0.0723 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -743334 sc-eQTL 5.32e-01 0.0661 0.106 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -839995 sc-eQTL 4.84e-01 0.0607 0.0866 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 9.04e-01 0.00977 0.0812 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 3.26e-01 0.0854 0.0867 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 6.19e-01 0.0473 0.0951 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 3.18e-02 -0.167 0.0771 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 4.35e-01 0.0487 0.0623 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -242527 sc-eQTL 2.19e-01 -0.112 0.0907 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0579 0.0827 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -743334 sc-eQTL 2.78e-01 0.102 0.0942 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -839995 sc-eQTL 1.30e-01 0.135 0.0891 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 1.59e-01 0.126 0.0893 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -630557 sc-eQTL 2.65e-01 0.11 0.0988 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -630751 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0395 0.0676 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -399760 sc-eQTL 1.49e-02 -0.179 0.0731 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -91543 sc-eQTL 1.87e-02 0.194 0.0818 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -978665 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0659 0.0628 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 sc-eQTL 1.54e-01 0.136 0.0951 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -65462 sc-eQTL 8.77e-01 0.0128 0.0825 0.259 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162512 SDC3 -242527 eQTL 0.0264 -0.0592 0.0266 0.0 0.0 0.255
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -52273 eQTL 4.74e-02 -0.027 0.0136 0.0 0.0 0.255
ENSG00000284543 LINC01226 -840050 eQTL 0.0148 -0.0836 0.0342 0.00119 0.0 0.255

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina