logo

Genes within 1Mb (chr1:30664722:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0349 0.0889 0.226 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 9.31e-01 0.00615 0.0712 0.226 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 6.91e-01 0.0238 0.0597 0.226 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -58863 sc-eQTL 2.25e-02 -0.143 0.0621 0.226 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 5.92e-01 0.0264 0.0492 0.226 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 2.21e-01 0.0908 0.074 0.226 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 8.02e-01 0.0145 0.0577 0.226 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 1.24e-01 0.105 0.0679 0.226 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 7.94e-02 0.136 0.0771 0.226 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 3.72e-01 0.0542 0.0606 0.226 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0307 0.054 0.226 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 8.07e-01 0.0147 0.0599 0.226 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0244 0.0626 0.226 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 4.20e-01 0.0433 0.0535 0.226 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 2.74e-01 0.0702 0.064 0.226 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 3.96e-01 0.0883 0.104 0.226 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 9.19e-02 -0.116 0.0687 0.226 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 6.66e-01 0.0263 0.0609 0.226 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0191 0.0591 0.226 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 6.51e-01 0.0329 0.0728 0.226 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00188 0.0693 0.226 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 4.89e-01 0.0603 0.087 0.226 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 5.27e-01 -0.057 0.0899 0.23 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0532 0.106 0.23 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0798 0.0833 0.23 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 9.59e-02 0.099 0.0592 0.23 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 1.56e-01 -0.137 0.0961 0.23 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -744843 sc-eQTL 3.68e-01 0.0885 0.0981 0.23 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -841504 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0511 0.065 0.23 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 5.11e-01 -0.062 0.0941 0.23 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 4.17e-01 0.0568 0.0699 0.226 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0848 0.0865 0.226 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00434 0.0556 0.226 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0163 0.0511 0.226 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -244036 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0763 0.0982 0.226 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 5.72e-01 -0.039 0.0689 0.226 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -744843 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0197 0.105 0.226 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -841504 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0785 0.0927 0.226 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0199 0.0812 0.226 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 2.02e-01 0.126 0.0985 0.223 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 1.68e-01 -0.0932 0.0674 0.223 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 4.87e-01 0.0494 0.0709 0.223 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00605 0.0817 0.223 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 3.36e-01 0.0575 0.0595 0.223 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0925 0.0916 0.223 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 1.19e-01 0.132 0.0843 0.223 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 8.51e-01 0.0137 0.0724 0.226 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0864 0.0772 0.226 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0331 0.0696 0.226 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 7.08e-02 0.103 0.0566 0.226 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000617 0.0762 0.226 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 4.29e-01 0.0739 0.0933 0.226 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 6.04e-01 0.0505 0.0972 0.226 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 7.19e-01 0.0425 0.118 0.227 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 9.09e-01 0.0137 0.119 0.227 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 9.36e-01 0.00888 0.111 0.227 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -58863 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00513 0.0967 0.227 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 8.62e-01 0.0117 0.0674 0.227 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 8.23e-03 0.301 0.112 0.227 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 5.01e-01 0.0733 0.109 0.227 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 7.70e-01 0.0282 0.0963 0.227 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 8.92e-01 0.0149 0.11 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 7.59e-01 0.0281 0.0914 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 5.15e-01 0.0561 0.0861 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -58863 sc-eQTL 6.22e-01 0.0443 0.0897 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 2.27e-01 0.0665 0.0549 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0117 0.102 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 9.91e-01 0.000859 0.0773 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 7.97e-01 0.0223 0.0865 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0569 0.108 0.226 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 3.23e-02 0.212 0.0985 0.226 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 9.23e-01 0.00839 0.0867 0.226 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -58863 sc-eQTL 1.03e-01 -0.135 0.0824 0.226 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 3.02e-01 0.076 0.0734 0.226 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 3.59e-01 0.0902 0.098 0.226 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00786 0.0842 0.226 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0128 0.0986 0.226 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 2.17e-01 0.119 0.0959 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 8.61e-02 0.142 0.0826 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 3.91e-01 0.0629 0.0732 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -58863 sc-eQTL 2.42e-02 -0.167 0.0735 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 5.36e-01 0.0308 0.0497 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 5.45e-01 0.053 0.0875 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00404 0.0653 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 2.00e-01 0.103 0.0803 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 8.87e-01 0.0148 0.104 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 1.29e-02 -0.212 0.0846 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 8.73e-02 -0.143 0.0834 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -58863 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0583 0.0805 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 3.82e-01 0.0478 0.0547 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 2.43e-02 0.223 0.0984 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 5.89e-01 0.0432 0.0797 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 2.18e-01 0.106 0.0858 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0733 0.102 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 8.71e-02 -0.172 0.1 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 6.97e-02 0.179 0.0982 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0303 0.0882 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0954 0.0902 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 1.72e-01 0.132 0.096 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0678 0.085 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 5.96e-02 0.153 0.0808 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 5.62e-01 0.0419 0.0721 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0442 0.0576 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 2.94e-01 0.0649 0.0616 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 7.59e-01 0.0208 0.0677 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 4.11e-01 0.0515 0.0626 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 2.78e-02 0.158 0.0712 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 2.54e-01 0.116 0.102 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00885 0.0823 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 8.29e-01 0.0158 0.0729 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0659 0.0603 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 6.36e-01 0.0384 0.081 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 8.22e-01 0.0173 0.0767 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0799 0.0853 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 4.16e-01 0.0813 0.0998 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00969 0.0952 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 7.29e-01 0.0275 0.0793 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 3.31e-01 0.0781 0.0801 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 4.61e-02 -0.179 0.089 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0636 0.0938 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0889 0.0923 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 5.39e-01 0.0672 0.109 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0722 0.0837 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0524 0.0813 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 3.91e-01 0.0773 0.09 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 8.52e-01 0.0147 0.0785 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 5.01e-01 0.0637 0.0947 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 9.32e-01 0.00757 0.0891 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 8.55e-01 0.0186 0.101 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 3.23e-02 -0.186 0.0864 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 5.01e-01 0.0474 0.0703 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 4.22e-01 0.0542 0.0673 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 3.20e-01 0.0932 0.0935 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 7.29e-02 0.151 0.0835 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 6.61e-01 0.0402 0.0915 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0507 0.113 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0228 0.104 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0418 0.0975 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0402 0.102 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 1.43e-01 -0.153 0.104 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 7.89e-02 -0.166 0.0937 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0475 0.0954 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 4.16e-01 0.0856 0.105 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 2.49e-01 0.116 0.1 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0498 0.103 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 9.48e-02 0.162 0.0962 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 2.28e-01 -0.11 0.0909 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 8.15e-01 0.0236 0.101 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 7.11e-01 0.0338 0.091 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 2.81e-01 0.117 0.108 0.227 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0102 0.0957 0.227 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00285 0.0918 0.227 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 7.66e-02 0.153 0.0859 0.227 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00469 0.0951 0.227 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0309 0.0964 0.227 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0189 0.0994 0.227 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 5.10e-01 0.0716 0.108 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0129 0.0917 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 2.29e-01 0.116 0.0959 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 2.61e-02 0.21 0.0938 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0387 0.0922 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0218 0.0954 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 1.80e-01 0.126 0.0936 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 8.66e-01 0.0178 0.105 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 9.69e-02 -0.129 0.0772 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 7.11e-01 0.0296 0.0797 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0122 0.085 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 2.74e-01 0.0828 0.0755 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 2.20e-01 -0.131 0.106 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 2.93e-01 0.0924 0.0877 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 2.51e-01 0.124 0.108 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 2.98e-01 0.101 0.0964 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0566 0.0942 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00683 0.0899 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 5.28e-01 0.064 0.101 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 9.52e-01 0.00571 0.0957 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0392 0.0925 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 7.51e-01 0.032 0.101 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0277 0.0788 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0217 0.0852 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00303 0.0938 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0159 0.0799 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 9.03e-01 0.0121 0.0994 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 2.90e-01 0.0978 0.0923 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 6.95e-01 0.0471 0.12 0.219 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 2.57e-01 -0.157 0.138 0.219 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0259 0.121 0.219 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -58863 sc-eQTL 1.81e-01 -0.15 0.112 0.219 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0905 0.0799 0.219 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0193 0.124 0.219 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 2.23e-01 0.134 0.109 0.219 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 5.70e-01 0.0665 0.117 0.219 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0812 0.0802 0.224 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0481 0.102 0.224 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 4.94e-01 0.0652 0.0951 0.224 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0178 0.0683 0.224 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 4.63e-01 0.0736 0.1 0.224 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0761 0.0953 0.224 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0572 0.0877 0.224 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 1.00e+00 4.26e-05 0.102 0.226 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 2.12e-01 0.123 0.0986 0.226 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 6.15e-01 0.0399 0.0792 0.226 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 7.22e-01 0.0323 0.0907 0.226 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0259 0.0979 0.226 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 5.53e-01 0.0548 0.0923 0.226 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 7.07e-01 0.0348 0.0923 0.226 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 8.83e-01 0.0155 0.105 0.232 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0488 0.114 0.232 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0952 0.0978 0.232 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 1.13e-01 0.109 0.0683 0.232 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0897 0.0993 0.232 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -744843 sc-eQTL 3.99e-01 0.0744 0.0881 0.232 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -841504 sc-eQTL 1.66e-01 0.12 0.0863 0.232 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00246 0.0933 0.232 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 2.74e-02 0.183 0.0823 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 9.97e-01 0.000366 0.0929 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 6.19e-01 0.0312 0.0628 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0325 0.0551 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -244036 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0231 0.104 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 9.46e-01 0.00571 0.0849 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -744843 sc-eQTL 9.76e-01 0.00311 0.105 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -841504 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0484 0.0929 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 9.39e-01 0.00666 0.0867 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 5.13e-01 0.0574 0.0876 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0879 0.103 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 6.22e-01 0.0369 0.0748 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 9.70e-01 0.00216 0.0575 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -244036 sc-eQTL 4.32e-01 0.0782 0.0992 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0545 0.0897 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -744843 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00712 0.105 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -841504 sc-eQTL 8.31e-01 0.0183 0.0855 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 9.45e-01 0.00588 0.0858 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0858 0.127 0.236 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0025 0.109 0.236 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 4.80e-01 0.0796 0.112 0.236 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 8.26e-02 0.212 0.121 0.236 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 2.99e-01 -0.116 0.112 0.236 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0172 0.113 0.236 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 8.34e-01 0.023 0.109 0.236 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 9.63e-01 0.00464 0.0998 0.227 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0873 0.107 0.227 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 7.15e-01 0.0332 0.091 0.227 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0235 0.0714 0.227 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -244036 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0898 0.0976 0.227 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 9.36e-02 0.172 0.102 0.227 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -744843 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0613 0.102 0.227 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -841504 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0331 0.0969 0.227 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 5.23e-01 0.062 0.0969 0.227 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 7.99e-02 -0.158 0.0897 0.229 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 2.95e-01 0.101 0.0961 0.229 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00781 0.0787 0.229 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0599 0.0714 0.229 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -244036 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0263 0.0801 0.229 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 1.00e-01 0.151 0.0913 0.229 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -744843 sc-eQTL 9.13e-01 0.00959 0.0875 0.229 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -841504 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0101 0.0874 0.229 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 7.66e-01 -0.027 0.0906 0.229 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 1.21e-01 -0.158 0.101 0.232 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 8.84e-01 0.0164 0.112 0.232 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 7.78e-01 0.0263 0.0929 0.232 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 9.78e-01 0.00237 0.0864 0.232 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 1.78e-01 -0.151 0.111 0.232 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -744843 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0345 0.105 0.232 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -841504 sc-eQTL 1.47e-01 -0.118 0.0808 0.232 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0186 0.0957 0.232 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 9.60e-01 0.00521 0.105 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 2.21e-01 0.107 0.0868 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 7.67e-01 0.0229 0.0772 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -58863 sc-eQTL 1.21e-01 -0.136 0.0875 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 6.83e-02 0.101 0.0549 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 9.94e-01 0.000732 0.0916 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 7.81e-01 0.0203 0.0731 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 8.95e-01 0.0105 0.0797 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 4.97e-01 0.0634 0.0933 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00794 0.0739 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 8.90e-01 0.00968 0.0699 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -58863 sc-eQTL 3.80e-02 -0.139 0.0666 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 5.14e-01 0.031 0.0473 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 1.14e-01 0.137 0.086 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 1.00e+00 -7.2e-06 0.0612 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 2.23e-01 0.0886 0.0724 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 9.97e-02 0.131 0.079 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 7.14e-01 -0.033 0.0901 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 5.61e-01 0.0334 0.0574 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00224 0.0505 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -244036 sc-eQTL 7.20e-01 0.0369 0.103 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0808 0.0722 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -744843 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00515 0.106 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -841504 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0599 0.0868 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 6.79e-01 0.0337 0.0813 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 1.08e-01 -0.141 0.0876 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 4.43e-01 -0.074 0.0963 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0218 0.079 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0364 0.0631 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -244036 sc-eQTL 1.77e-01 -0.125 0.0919 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 6.65e-02 0.153 0.0832 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -744843 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0925 0.0955 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -841504 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0636 0.0907 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0196 0.091 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -632066 sc-eQTL 2.42e-01 0.116 0.099 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0912 0.0675 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -401269 sc-eQTL 6.89e-01 0.0298 0.0743 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0385 0.083 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -980174 sc-eQTL 3.36e-01 0.0608 0.063 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 sc-eQTL 2.79e-01 -0.104 0.0955 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -66971 sc-eQTL 1.52e-01 0.118 0.0823 0.224 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121766 ZCCHC17 -632260 eQTL 1.17e-02 0.0493 0.0195 0.0 0.0 0.239
ENSG00000142910 TINAGL1 -911763 pQTL 0.0445 0.0352 0.0175 0.0 0.0 0.224
ENSG00000162511 LAPTM5 -93052 eQTL 0.00985 -0.0284 0.011 0.0 0.0 0.239
ENSG00000162517 PEF1 -980174 eQTL 0.0256 0.0366 0.0164 0.0 0.0 0.239
ENSG00000168528 SERINC2 -744843 eQTL 0.0206 0.0985 0.0425 0.0 0.0 0.239
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -53782 eQTL 2.02e-04 0.0515 0.0138 0.0 0.0 0.239

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina