logo

Genes within 1Mb (chr1:30653789:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 4.22e-01 0.0991 0.123 0.109 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0187 0.0988 0.109 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 1.07e-01 -0.133 0.0824 0.109 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -69796 sc-eQTL 6.88e-01 0.035 0.0871 0.109 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 5.88e-01 0.037 0.0682 0.109 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0752 0.103 0.109 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 7.22e-01 0.0285 0.0799 0.109 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0697 0.0945 0.109 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 1.17e-01 -0.166 0.106 0.109 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 5.39e-01 0.051 0.083 0.109 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0219 0.0739 0.109 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 4.40e-02 0.164 0.0812 0.109 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 4.27e-01 0.0681 0.0856 0.109 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 3.76e-01 -0.065 0.0732 0.109 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00717 0.0878 0.109 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 1.99e-01 -0.177 0.137 0.109 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0342 0.0918 0.109 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 3.91e-01 0.0694 0.0807 0.109 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 2.00e-01 0.101 0.0782 0.109 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 2.64e-01 -0.108 0.0964 0.109 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0852 0.0919 0.109 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 8.56e-01 -0.021 0.116 0.109 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 1.45e-01 -0.18 0.123 0.108 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 6.66e-01 0.0632 0.146 0.108 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 3.09e-01 -0.117 0.114 0.108 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 9.38e-01 0.00634 0.082 0.108 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 4.53e-02 0.265 0.132 0.108 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -755776 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0858 0.135 0.108 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -852437 sc-eQTL 7.79e-01 0.0252 0.0895 0.108 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0829 0.129 0.108 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 3.20e-01 0.0948 0.0952 0.109 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0611 0.118 0.109 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0566 0.0757 0.109 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 6.18e-01 0.0348 0.0697 0.109 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -254969 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0481 0.134 0.109 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 2.72e-01 -0.103 0.0937 0.109 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -755776 sc-eQTL 2.75e-01 0.157 0.143 0.109 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -852437 sc-eQTL 6.65e-01 0.0549 0.127 0.109 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 2.80e-01 0.119 0.11 0.109 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 5.17e-01 0.0865 0.133 0.109 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0514 0.0913 0.109 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 2.06e-02 -0.221 0.0946 0.109 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 2.09e-03 0.336 0.108 0.109 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 8.50e-01 0.0152 0.0805 0.109 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 2.95e-01 0.13 0.124 0.109 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 4.95e-01 0.0782 0.114 0.109 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 2.58e-01 0.112 0.0985 0.109 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 2.05e-01 -0.134 0.105 0.109 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 6.96e-01 0.0371 0.0949 0.109 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 3.82e-01 -0.068 0.0777 0.109 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0995 0.104 0.109 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0548 0.127 0.109 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 6.75e-01 0.0556 0.133 0.109 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 8.78e-03 -0.409 0.154 0.115 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 9.53e-01 0.0094 0.159 0.115 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0723 0.148 0.115 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -69796 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00581 0.129 0.115 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00588 0.09 0.115 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0179 0.153 0.115 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 3.76e-01 0.129 0.145 0.115 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 4.01e-01 0.108 0.128 0.115 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0146 0.149 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 1.12e-01 -0.197 0.123 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0201 0.117 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -69796 sc-eQTL 9.93e-01 0.00113 0.122 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 2.83e-01 0.0804 0.0747 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 6.06e-01 0.0717 0.139 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0166 0.105 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0253 0.118 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 7.22e-01 0.0514 0.144 0.108 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0579 0.133 0.108 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0429 0.116 0.108 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -69796 sc-eQTL 5.21e-01 0.0712 0.111 0.108 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 4.48e-01 0.0746 0.0981 0.108 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 7.80e-01 0.0366 0.131 0.108 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0403 0.112 0.108 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 4.16e-01 -0.107 0.131 0.108 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 1.99e-01 0.171 0.133 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 2.86e-01 -0.123 0.115 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0518 0.102 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -69796 sc-eQTL 8.22e-01 0.0232 0.103 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 3.70e-01 0.0618 0.0688 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0535 0.121 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0307 0.0905 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0065 0.112 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 2.15e-01 -0.175 0.141 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000615 0.116 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 1.83e-01 -0.152 0.113 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -69796 sc-eQTL 1.63e-01 -0.153 0.109 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 1.33e-01 0.111 0.0739 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 1.08e-02 -0.342 0.133 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0757 0.108 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 3.20e-01 -0.116 0.117 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 8.94e-01 0.0188 0.141 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 1.91e-01 0.182 0.138 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 4.60e-01 0.101 0.136 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 1.63e-01 0.169 0.121 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 9.77e-02 0.206 0.124 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 4.55e-01 0.0995 0.133 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 9.01e-01 0.0147 0.117 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 1.11e-01 -0.176 0.11 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 3.90e-01 0.0842 0.0978 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 8.26e-01 0.0173 0.0782 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 1.69e-01 0.115 0.0835 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0112 0.0919 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0337 0.0851 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0339 0.0977 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0802 0.139 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 5.40e-02 -0.216 0.111 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0276 0.0995 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 2.63e-02 0.183 0.0816 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0678 0.111 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0884 0.105 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 9.86e-01 0.00206 0.117 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 1.83e-01 -0.182 0.136 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 1.08e-01 0.209 0.13 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 8.84e-01 0.0158 0.109 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 4.66e-02 0.218 0.109 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 1.99e-01 0.158 0.123 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 9.35e-01 0.0104 0.129 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0261 0.127 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0499 0.149 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0549 0.114 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 1.81e-01 0.148 0.111 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 4.04e-01 0.103 0.123 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 7.51e-01 0.034 0.107 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0968 0.129 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0133 0.122 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 7.63e-02 -0.244 0.137 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 9.72e-01 0.00417 0.119 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 5.59e-01 0.0559 0.0955 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 5.01e-02 0.179 0.0908 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0765 0.127 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 1.58e-01 -0.161 0.114 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0621 0.124 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 5.39e-01 0.0935 0.152 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 7.27e-01 0.0486 0.139 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 7.78e-01 0.037 0.131 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 1.88e-01 0.18 0.136 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 2.79e-01 0.152 0.14 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 8.31e-01 0.027 0.127 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 4.40e-01 -0.099 0.128 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 6.33e-01 0.0691 0.145 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 6.92e-01 -0.055 0.139 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 3.65e-01 0.129 0.142 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0777 0.133 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0938 0.125 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0295 0.138 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 2.31e-02 -0.283 0.124 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 4.54e-01 0.111 0.149 0.108 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 1.94e-01 -0.171 0.131 0.108 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0997 0.126 0.108 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 7.19e-01 0.043 0.119 0.108 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 9.71e-02 -0.217 0.13 0.108 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 9.48e-01 0.00869 0.133 0.108 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 4.41e-01 -0.105 0.137 0.108 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 1.53e-01 0.214 0.15 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 1.33e-01 -0.191 0.126 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0844 0.133 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0263 0.132 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 8.89e-01 0.0179 0.128 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0637 0.132 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 9.70e-02 -0.216 0.129 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 8.84e-01 0.0208 0.142 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 7.38e-01 0.0351 0.105 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 6.22e-02 -0.2 0.107 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 1.11e-02 0.289 0.113 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 6.76e-01 0.0427 0.102 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 2.08e-01 0.181 0.143 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 1.12e-01 0.188 0.118 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0542 0.15 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0974 0.134 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 8.84e-01 0.0191 0.131 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 2.06e-02 0.288 0.123 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 1.84e-03 -0.434 0.137 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 8.13e-01 0.0315 0.133 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 1.01e-02 0.328 0.126 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0178 0.138 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 9.51e-01 0.00666 0.107 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 4.23e-02 -0.235 0.115 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 5.09e-03 0.355 0.125 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 8.74e-01 0.0173 0.109 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0158 0.135 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 1.02e-01 -0.205 0.125 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 9.92e-03 0.41 0.156 0.115 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 7.32e-01 -0.064 0.187 0.115 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 9.96e-02 -0.266 0.16 0.115 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -69796 sc-eQTL 3.59e-01 0.139 0.151 0.115 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 1.49e-01 0.156 0.107 0.115 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 8.02e-01 0.0418 0.166 0.115 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 2.31e-01 -0.177 0.147 0.115 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 5.60e-01 -0.092 0.157 0.115 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 3.45e-01 0.103 0.109 0.109 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00159 0.138 0.109 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 7.57e-01 -0.04 0.129 0.109 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0468 0.0925 0.109 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 5.40e-01 0.0834 0.136 0.109 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 3.12e-01 -0.131 0.129 0.109 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0748 0.119 0.109 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0253 0.143 0.109 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 1.15e-01 0.218 0.138 0.109 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 2.33e-01 -0.132 0.11 0.109 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 9.30e-02 0.213 0.126 0.109 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0916 0.137 0.109 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 4.99e-01 0.0874 0.129 0.109 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 6.68e-01 0.0553 0.129 0.109 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 7.48e-02 -0.253 0.141 0.112 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 7.35e-01 0.0522 0.154 0.112 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 2.76e-01 -0.144 0.132 0.112 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 5.21e-01 0.0596 0.0926 0.112 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 9.26e-03 0.346 0.132 0.112 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -755776 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0427 0.119 0.112 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -852437 sc-eQTL 2.22e-01 -0.143 0.116 0.112 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 4.14e-01 -0.103 0.126 0.112 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0468 0.115 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 1.87e-01 -0.17 0.128 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0368 0.0872 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 7.94e-01 0.02 0.0765 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -254969 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0605 0.144 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0799 0.118 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -755776 sc-eQTL 9.80e-02 0.241 0.145 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -852437 sc-eQTL 6.72e-01 0.0547 0.129 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 3.04e-01 0.124 0.12 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 4.60e-01 0.0901 0.122 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 7.23e-01 -0.051 0.144 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 2.32e-01 -0.124 0.104 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 5.32e-01 -0.05 0.0799 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -254969 sc-eQTL 2.15e-01 -0.171 0.138 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 3.81e-01 -0.109 0.124 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -755776 sc-eQTL 2.30e-01 0.175 0.146 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -852437 sc-eQTL 3.56e-01 -0.11 0.119 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0304 0.119 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 1.97e-01 0.233 0.179 0.106 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 1.66e-01 0.214 0.154 0.106 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00583 0.16 0.106 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 2.11e-01 -0.217 0.173 0.106 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0526 0.159 0.106 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 9.81e-01 0.00382 0.16 0.106 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 8.20e-01 0.0354 0.155 0.106 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 1.74e-02 0.317 0.132 0.111 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 2.15e-01 0.179 0.144 0.111 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 3.10e-02 -0.263 0.121 0.111 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 2.09e-01 0.121 0.0957 0.111 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -254969 sc-eQTL 2.51e-01 -0.151 0.131 0.111 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 2.51e-01 0.159 0.138 0.111 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -755776 sc-eQTL 2.00e-01 0.176 0.137 0.111 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -852437 sc-eQTL 4.43e-01 0.1 0.13 0.111 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 1.70e-01 0.179 0.13 0.111 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 1.86e-01 0.164 0.124 0.109 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 7.97e-01 0.034 0.132 0.109 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00549 0.108 0.109 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 3.20e-01 0.0976 0.0979 0.109 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -254969 sc-eQTL 8.94e-01 0.0146 0.11 0.109 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 8.00e-01 -0.032 0.126 0.109 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -755776 sc-eQTL 4.09e-01 0.0992 0.12 0.109 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -852437 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0246 0.12 0.109 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 5.41e-01 -0.076 0.124 0.109 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0657 0.135 0.124 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 3.79e-01 -0.13 0.148 0.124 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 4.03e-01 -0.103 0.123 0.124 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0222 0.114 0.124 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 6.60e-01 0.0652 0.148 0.124 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -755776 sc-eQTL 6.11e-01 0.0704 0.138 0.124 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -852437 sc-eQTL 9.60e-01 0.00543 0.108 0.124 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0841 0.126 0.124 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0681 0.141 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 2.73e-01 -0.129 0.117 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0567 0.104 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -69796 sc-eQTL 4.26e-01 0.0945 0.119 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 4.09e-01 0.0616 0.0745 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 7.22e-01 0.0441 0.124 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 8.60e-01 0.0174 0.0987 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 7.57e-01 0.0333 0.108 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 5.03e-01 0.0873 0.13 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0263 0.103 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0594 0.0972 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -69796 sc-eQTL 6.70e-01 -0.04 0.0937 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 3.65e-01 0.0598 0.0658 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 1.16e-01 -0.189 0.12 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0421 0.0852 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0982 0.101 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 9.45e-01 0.00765 0.11 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 3.03e-01 -0.128 0.124 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0571 0.0792 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 8.55e-01 0.0127 0.0697 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -254969 sc-eQTL 3.43e-01 -0.135 0.142 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 2.76e-01 -0.109 0.0997 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -755776 sc-eQTL 1.94e-01 0.19 0.146 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -852437 sc-eQTL 8.22e-01 0.0269 0.12 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 3.83e-01 0.098 0.112 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 3.98e-02 0.243 0.118 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 6.46e-01 0.0597 0.13 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 1.73e-01 -0.145 0.106 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 1.32e-01 0.128 0.0847 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -254969 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0528 0.124 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0637 0.113 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -755776 sc-eQTL 3.50e-01 0.12 0.129 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -852437 sc-eQTL 5.59e-01 0.0716 0.122 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 2.44e-01 0.143 0.122 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -642999 sc-eQTL 6.65e-01 0.0581 0.134 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -643193 sc-eQTL 9.74e-01 -0.003 0.0915 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -412202 sc-eQTL 2.95e-02 -0.217 0.0991 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -103985 sc-eQTL 1.83e-03 0.345 0.109 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -991107 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00952 0.0851 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -64715 sc-eQTL 2.86e-01 0.138 0.129 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -77904 sc-eQTL 3.06e-01 0.114 0.111 0.11 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162512 \N -254969 4.53e-06 2.63e-06 7.32e-07 2.02e-06 4.79e-07 1.74e-06 2.08e-06 4.32e-07 1.98e-06 1.27e-06 2e-06 1.43e-06 3.39e-06 1.43e-06 1.36e-06 1.7e-06 1.02e-06 2.68e-06 1.36e-06 1.15e-06 1.92e-06 3.2e-06 3.01e-06 1.66e-06 3.3e-06 1.02e-06 1.33e-06 1.63e-06 3.19e-06 3.32e-06 1.82e-06 6.26e-07 7.75e-07 1.22e-06 1.02e-06 7.09e-07 9.63e-07 4.36e-07 1.18e-06 2.05e-07 2.14e-07 3e-06 1.79e-06 1.35e-07 6.1e-07 9.16e-07 7.75e-07 3.03e-07 3.41e-07