logo

Genes within 1Mb (chr1:30649756:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 1.95e-01 -0.206 0.159 0.06 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 8.71e-01 0.0209 0.128 0.06 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 5.57e-01 0.0631 0.107 0.06 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -73829 sc-eQTL 9.34e-02 0.189 0.112 0.06 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 3.92e-01 0.0756 0.0881 0.06 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 7.25e-01 0.0469 0.133 0.06 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 8.01e-01 -0.026 0.103 0.06 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 3.74e-01 0.109 0.122 0.06 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 8.25e-01 0.0305 0.138 0.06 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 2.67e-01 0.119 0.107 0.06 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 5.23e-01 0.0612 0.0956 0.06 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 9.37e-03 -0.274 0.104 0.06 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0502 0.111 0.06 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00664 0.0949 0.06 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 8.90e-01 0.0157 0.114 0.06 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 2.23e-01 -0.219 0.179 0.06 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 4.63e-01 0.088 0.12 0.06 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 9.12e-01 0.0117 0.105 0.06 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 7.65e-03 -0.271 0.101 0.06 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 2.64e-01 -0.141 0.126 0.06 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0886 0.12 0.06 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0583 0.151 0.06 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 8.86e-01 0.0231 0.162 0.059 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 5.20e-01 0.123 0.191 0.059 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 7.58e-01 0.0462 0.15 0.059 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 8.43e-02 -0.184 0.106 0.059 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 3.00e-01 -0.18 0.173 0.059 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -759809 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0981 0.176 0.059 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -856470 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0599 0.117 0.059 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 7.05e-01 0.0642 0.169 0.059 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 5.91e-01 0.0662 0.123 0.06 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 9.04e-02 0.258 0.152 0.06 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0485 0.0978 0.06 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0615 0.0899 0.06 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -259002 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0866 0.173 0.06 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 1.77e-01 0.163 0.121 0.06 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -759809 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0115 0.186 0.06 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -856470 sc-eQTL 1.62e-01 0.228 0.163 0.06 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 4.47e-01 -0.109 0.143 0.06 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 8.64e-01 0.0295 0.172 0.06 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 7.39e-01 0.0393 0.118 0.06 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 8.21e-01 -0.028 0.124 0.06 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 2.97e-01 -0.148 0.142 0.06 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0707 0.104 0.06 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 8.83e-01 0.0235 0.16 0.06 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 1.81e-02 -0.347 0.146 0.06 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 3.47e-01 -0.12 0.127 0.06 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0112 0.137 0.06 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 6.20e-01 0.0609 0.123 0.06 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 9.81e-02 -0.166 0.1 0.06 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0641 0.134 0.06 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 3.82e-01 -0.144 0.165 0.06 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 5.57e-01 0.101 0.172 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 9.61e-02 0.324 0.194 0.064 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 1.93e-01 0.256 0.196 0.064 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000504 0.183 0.064 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -73829 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0113 0.16 0.064 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 7.88e-01 0.03 0.112 0.064 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 9.38e-02 -0.318 0.188 0.064 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0388 0.18 0.064 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0274 0.159 0.064 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 4.96e-01 -0.13 0.191 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 8.23e-02 0.276 0.158 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0939 0.15 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -73829 sc-eQTL 1.91e-01 0.204 0.155 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 8.57e-01 0.0173 0.0958 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 6.92e-03 0.477 0.175 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 3.11e-01 -0.136 0.134 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 5.72e-01 0.085 0.15 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 2.95e-01 -0.192 0.183 0.06 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 2.73e-01 0.185 0.169 0.06 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 3.73e-01 0.131 0.147 0.06 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -73829 sc-eQTL 1.48e-01 0.204 0.14 0.06 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0852 0.125 0.06 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 2.31e-01 -0.199 0.166 0.06 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 3.42e-01 0.136 0.143 0.06 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 3.85e-01 -0.145 0.167 0.06 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 1.69e-02 -0.41 0.17 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 2.25e-01 -0.18 0.148 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0995 0.131 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -73829 sc-eQTL 4.45e-01 0.102 0.133 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 1.58e-01 0.126 0.0886 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 7.55e-01 0.049 0.157 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0966 0.117 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 2.48e-01 0.167 0.144 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 8.15e-01 0.0424 0.181 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0394 0.15 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 3.81e-01 0.128 0.146 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -73829 sc-eQTL 1.26e-01 0.215 0.14 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 9.29e-01 0.00854 0.0955 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0765 0.174 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0422 0.139 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 8.60e-01 0.0266 0.15 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 1.95e-01 -0.23 0.177 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 5.87e-02 0.329 0.173 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 4.76e-01 0.122 0.171 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 4.38e-01 -0.118 0.152 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 9.42e-01 0.0114 0.156 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 4.93e-01 0.114 0.167 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 1.03e-01 0.24 0.146 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 7.53e-01 0.0451 0.143 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 5.80e-01 0.0705 0.127 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 5.83e-01 0.0558 0.101 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 1.67e-02 -0.259 0.107 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 9.20e-01 0.012 0.119 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0419 0.11 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0335 0.127 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 9.79e-01 0.00478 0.179 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 7.66e-01 0.043 0.144 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 7.22e-01 0.0455 0.128 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 3.63e-03 -0.306 0.104 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0925 0.142 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 9.28e-01 0.0121 0.135 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 3.94e-01 -0.128 0.15 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 8.99e-01 0.0226 0.178 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 2.02e-02 0.392 0.167 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0923 0.141 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 2.51e-02 -0.319 0.141 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 5.57e-01 0.094 0.16 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0505 0.167 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00841 0.165 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 4.86e-01 -0.134 0.192 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 4.79e-01 0.104 0.147 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 2.09e-01 0.18 0.143 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 1.00e-01 -0.26 0.157 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 8.62e-01 0.0241 0.138 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 1.45e-01 -0.242 0.166 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0506 0.157 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 3.43e-01 -0.168 0.176 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 2.11e-01 0.191 0.152 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 1.17e-01 -0.192 0.122 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 3.41e-02 -0.248 0.116 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 3.03e-01 -0.168 0.163 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0378 0.147 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 3.39e-01 0.153 0.159 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 1.64e-01 -0.271 0.194 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0103 0.179 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0251 0.168 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 1.11e-01 -0.28 0.175 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 3.38e-01 -0.172 0.179 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 2.81e-01 0.176 0.162 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 3.07e-01 -0.168 0.164 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 6.94e-02 -0.331 0.181 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 2.90e-01 -0.186 0.175 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 9.72e-01 0.00636 0.179 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 6.66e-01 0.0728 0.168 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 4.79e-01 -0.112 0.158 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 5.54e-01 -0.103 0.175 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 5.36e-01 0.098 0.158 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 5.25e-01 -0.119 0.186 0.061 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 5.34e-01 -0.103 0.165 0.061 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 3.91e-01 0.136 0.158 0.061 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 1.15e-01 -0.235 0.148 0.061 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0898 0.164 0.061 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0336 0.166 0.061 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 7.56e-01 0.0531 0.171 0.061 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0871 0.19 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0615 0.16 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 2.73e-01 0.185 0.168 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 2.83e-01 -0.178 0.166 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 2.06e-01 0.204 0.161 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 5.29e-01 0.105 0.167 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 3.37e-01 -0.158 0.164 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 8.77e-01 0.0281 0.182 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0251 0.135 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0361 0.138 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0722 0.147 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0998 0.131 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 5.95e-01 0.0981 0.184 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 6.04e-01 -0.079 0.152 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 3.72e-01 -0.175 0.195 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 8.69e-01 0.0288 0.175 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 2.00e-01 0.218 0.17 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0525 0.162 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 4.33e-01 0.143 0.183 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0528 0.173 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 2.42e-02 -0.375 0.165 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 7.75e-01 0.0504 0.176 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 4.58e-01 0.102 0.137 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 1.04e-01 -0.242 0.148 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 9.23e-01 0.0158 0.164 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 6.79e-02 -0.254 0.138 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 3.50e-01 -0.162 0.173 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 1.59e-01 -0.227 0.161 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 4.47e-01 -0.161 0.211 0.059 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0784 0.245 0.059 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0846 0.213 0.059 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -73829 sc-eQTL 1.87e-01 0.262 0.197 0.059 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 1.43e-01 0.208 0.141 0.059 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 6.74e-02 -0.398 0.216 0.059 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 3.36e-01 -0.187 0.194 0.059 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 2.04e-01 0.263 0.206 0.059 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 4.12e-01 -0.115 0.139 0.061 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 4.98e-01 -0.12 0.177 0.061 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0463 0.165 0.061 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 9.31e-01 0.0103 0.119 0.061 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0455 0.174 0.061 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 2.86e-01 -0.177 0.165 0.061 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 3.88e-01 -0.132 0.152 0.061 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 2.49e-01 -0.216 0.187 0.06 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0757 0.181 0.06 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00323 0.145 0.06 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 1.98e-01 -0.213 0.165 0.06 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 4.44e-01 -0.137 0.179 0.06 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0715 0.169 0.06 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 1.35e-01 0.252 0.168 0.06 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 8.17e-01 0.0432 0.186 0.059 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 5.36e-01 -0.125 0.201 0.059 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 7.15e-01 0.0633 0.173 0.059 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 8.43e-02 -0.209 0.12 0.059 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00417 0.176 0.059 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -759809 sc-eQTL 6.66e-01 0.0672 0.156 0.059 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -856470 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0442 0.153 0.059 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 9.18e-01 -0.017 0.165 0.059 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0242 0.15 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 3.81e-01 0.147 0.167 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00877 0.113 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 2.83e-01 -0.107 0.0991 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -259002 sc-eQTL 6.12e-01 -0.095 0.187 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 8.10e-02 0.266 0.152 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -759809 sc-eQTL 5.85e-01 -0.104 0.189 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -856470 sc-eQTL 6.86e-02 0.304 0.166 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0164 0.156 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 4.43e-01 0.122 0.159 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 2.25e-02 0.426 0.185 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 2.70e-01 0.15 0.135 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 8.21e-01 0.0236 0.104 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -259002 sc-eQTL 3.53e-01 -0.167 0.18 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 3.76e-01 0.144 0.162 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -759809 sc-eQTL 8.87e-01 0.0271 0.191 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -856470 sc-eQTL 8.64e-02 0.265 0.154 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0464 0.156 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 8.08e-01 -0.054 0.221 0.061 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 2.60e-01 0.214 0.189 0.061 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 6.01e-01 0.103 0.196 0.061 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 2.07e-02 -0.489 0.209 0.061 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 9.43e-01 0.014 0.195 0.061 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 1.89e-01 -0.257 0.195 0.061 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 4.75e-01 0.136 0.19 0.061 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0168 0.178 0.056 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 3.35e-01 -0.185 0.191 0.056 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 9.18e-02 -0.274 0.161 0.056 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 1.00e+00 5.46e-05 0.128 0.056 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -259002 sc-eQTL 4.45e-01 -0.133 0.174 0.056 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 3.56e-01 -0.17 0.183 0.056 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -759809 sc-eQTL 9.00e-01 0.023 0.183 0.056 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -856470 sc-eQTL 2.63e-01 0.194 0.173 0.056 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 6.52e-01 0.0783 0.173 0.056 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 7.59e-02 -0.282 0.158 0.061 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 4.46e-01 -0.13 0.17 0.061 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0927 0.139 0.061 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 3.26e-02 -0.268 0.125 0.061 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -259002 sc-eQTL 7.55e-01 0.0442 0.141 0.061 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0863 0.162 0.061 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -759809 sc-eQTL 3.26e-01 -0.152 0.154 0.061 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -856470 sc-eQTL 6.13e-01 -0.078 0.154 0.061 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 7.44e-01 0.0524 0.16 0.061 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 3.51e-01 -0.188 0.201 0.054 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 1.33e-01 0.332 0.219 0.054 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 6.42e-01 0.0852 0.183 0.054 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0732 0.17 0.054 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 4.68e-02 -0.438 0.218 0.054 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -759809 sc-eQTL 1.57e-01 0.292 0.205 0.054 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -856470 sc-eQTL 9.75e-01 0.0051 0.16 0.054 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 6.13e-01 0.0955 0.189 0.054 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 3.29e-01 -0.178 0.182 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 5.81e-02 0.287 0.151 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 6.09e-01 0.0688 0.134 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -73829 sc-eQTL 7.57e-02 0.272 0.152 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0307 0.0963 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 5.22e-01 0.102 0.159 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 9.69e-01 0.00492 0.127 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 9.60e-01 0.00702 0.139 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 5.57e-02 -0.317 0.165 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 1.78e-01 -0.177 0.131 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000167 0.124 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -73829 sc-eQTL 3.90e-01 0.103 0.119 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 2.01e-01 0.108 0.0839 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 5.39e-01 0.0945 0.154 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 3.48e-01 -0.102 0.108 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 8.05e-02 0.225 0.128 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 4.39e-01 0.11 0.141 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 5.33e-02 0.309 0.159 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 7.99e-01 0.0261 0.102 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00096 0.0899 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -259002 sc-eQTL 6.01e-01 -0.096 0.183 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 4.56e-02 0.257 0.128 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -759809 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0642 0.189 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -856470 sc-eQTL 1.21e-01 0.239 0.154 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 4.76e-01 -0.103 0.145 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 4.46e-01 -0.118 0.154 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 4.07e-01 -0.14 0.168 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 2.21e-01 -0.169 0.138 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 1.87e-01 -0.146 0.11 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -259002 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00248 0.162 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 4.41e-01 -0.113 0.147 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -759809 sc-eQTL 9.25e-01 0.0157 0.168 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -856470 sc-eQTL 2.88e-01 0.169 0.159 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 8.80e-01 0.0241 0.159 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -647032 sc-eQTL 9.28e-01 0.0156 0.173 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -647226 sc-eQTL 6.67e-01 0.0509 0.118 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -416235 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0726 0.129 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -108018 sc-eQTL 3.64e-01 -0.131 0.144 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -995140 sc-eQTL 1.25e-01 -0.168 0.109 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -68748 sc-eQTL 8.38e-01 0.0341 0.167 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -81937 sc-eQTL 2.78e-02 -0.315 0.142 0.06 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000284543 LINC01226 -856525 eQTL 0.0386 -0.129 0.0624 0.0 0.0 0.0623

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina