logo

Genes within 1Mb (chr1:30646703:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 4.02e-02 0.211 0.102 0.179 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0294 0.0825 0.179 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0577 0.0691 0.179 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -76882 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0611 0.0727 0.179 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0422 0.0569 0.179 B L1
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 6.81e-01 0.0354 0.086 0.179 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 6.29e-01 0.0324 0.0668 0.179 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0319 0.0791 0.179 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 1.95e-01 -0.117 0.0901 0.179 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0778 0.0705 0.179 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 3.23e-01 0.0621 0.0628 0.179 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 6.27e-01 0.0339 0.0697 0.179 CD4T L1
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 7.59e-01 0.0224 0.0729 0.179 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 8.98e-02 0.106 0.0619 0.179 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0529 0.0746 0.179 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 8.06e-01 0.0295 0.12 0.179 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 9.84e-01 0.00165 0.0798 0.179 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 4.23e-01 0.0563 0.0702 0.179 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00112 0.0683 0.179 CD8T L1
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 2.61e-01 0.0945 0.0838 0.179 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 2.08e-01 0.101 0.0797 0.179 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 8.42e-01 -0.02 0.101 0.179 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0346 0.105 0.187 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0222 0.124 0.187 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0337 0.0971 0.187 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 9.19e-01 0.00702 0.0694 0.187 DC L1
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 7.65e-01 0.0336 0.112 0.187 DC L1
ENSG00000168528 SERINC2 -762862 sc-eQTL 5.92e-01 0.0613 0.114 0.187 DC L1
ENSG00000284543 LINC01226 -859523 sc-eQTL 8.87e-01 0.0108 0.0758 0.187 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 9.99e-02 0.18 0.109 0.187 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 9.09e-02 -0.139 0.0818 0.179 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0565 0.102 0.179 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 4.00e-02 0.134 0.0648 0.179 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 7.26e-01 0.0211 0.0602 0.179 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -262055 sc-eQTL 8.66e-01 0.0195 0.116 0.179 Mono L1
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 5.20e-02 0.157 0.0805 0.179 Mono L1
ENSG00000168528 SERINC2 -762862 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0149 0.124 0.179 Mono L1
ENSG00000284543 LINC01226 -859523 sc-eQTL 7.08e-01 -0.041 0.109 0.179 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 1.99e-01 -0.123 0.0953 0.179 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00994 0.114 0.18 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00115 0.078 0.18 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 7.17e-01 0.0297 0.0818 0.18 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 4.33e-01 -0.074 0.0941 0.18 NK L1
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 1.59e-01 0.0968 0.0684 0.18 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0411 0.106 0.18 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 9.72e-01 0.00345 0.0977 0.18 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 8.47e-01 0.0166 0.0859 0.179 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 2.66e-01 0.102 0.0915 0.179 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0805 0.0823 0.179 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 4.90e-01 0.0467 0.0676 0.179 Other_T L1
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 7.70e-01 0.0264 0.0903 0.179 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 5.12e-01 0.0728 0.111 0.179 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 4.36e-02 -0.232 0.114 0.179 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 7.20e-01 0.0491 0.137 0.181 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 7.08e-01 0.0517 0.138 0.181 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0261 0.128 0.181 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -76882 sc-eQTL 2.27e-01 0.135 0.112 0.181 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0128 0.0781 0.181 B_Activated L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 3.17e-01 0.133 0.133 0.181 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0276 0.126 0.181 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0923 0.111 0.181 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 5.75e-01 0.0711 0.127 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0459 0.106 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 4.21e-01 0.0803 0.0995 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -76882 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00715 0.104 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0577 0.0636 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 2.94e-01 0.124 0.118 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 1.54e-01 0.127 0.0889 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 5.86e-01 0.0544 0.0999 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 1.39e-01 0.182 0.123 0.181 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 5.49e-02 -0.217 0.112 0.181 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 9.44e-01 0.00697 0.0987 0.181 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -76882 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0569 0.0944 0.181 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 8.44e-01 0.0165 0.0837 0.181 B_Memory L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 1.35e-01 0.167 0.111 0.181 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 5.83e-02 -0.181 0.095 0.181 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 2.47e-01 -0.13 0.112 0.181 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 2.67e-01 0.127 0.114 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 9.03e-01 -0.012 0.0987 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0976 0.0868 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -76882 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0657 0.0882 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 9.47e-02 -0.0984 0.0586 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0944 0.104 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 1.11e-01 0.123 0.077 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 6.28e-01 0.0464 0.0957 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 4.31e-01 0.0957 0.121 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 6.36e-01 0.0475 0.1 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0746 0.0979 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -76882 sc-eQTL 9.81e-01 0.00228 0.0941 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 5.70e-03 -0.175 0.0628 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0911 0.116 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 1.47e-01 0.135 0.0926 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0515 0.1 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 9.16e-01 0.0128 0.12 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0958 0.118 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 6.68e-01 0.0499 0.116 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 5.34e-01 0.0645 0.103 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 7.05e-01 0.0402 0.106 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 2.01e-01 -0.145 0.113 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 9.36e-01 -0.008 0.1 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0511 0.0947 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0687 0.0839 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 1.50e-01 0.0966 0.0668 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 4.30e-01 0.0568 0.0718 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0508 0.0788 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 1.34e-01 0.109 0.0726 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 2.15e-01 -0.104 0.0835 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 1.17e-02 -0.296 0.116 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 8.40e-01 0.0193 0.0952 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0433 0.0842 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 4.81e-01 0.0493 0.0698 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 3.36e-01 0.0901 0.0935 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 6.35e-02 0.164 0.088 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 3.04e-01 0.102 0.0985 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 7.49e-01 0.0382 0.119 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 2.10e-01 -0.143 0.113 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 1.78e-01 0.127 0.0943 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 6.20e-01 0.0475 0.0958 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 1.99e-01 0.138 0.107 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0983 0.112 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 8.69e-01 0.0183 0.11 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0555 0.129 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 9.87e-01 0.0016 0.0987 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 4.47e-01 0.073 0.0957 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 6.58e-01 -0.047 0.106 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 2.84e-01 0.0989 0.0922 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 1.85e-01 0.148 0.111 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 7.56e-01 0.0327 0.105 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 2.61e-01 0.135 0.12 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 5.96e-01 0.0549 0.103 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 1.59e-01 0.117 0.0829 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0234 0.0798 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0267 0.111 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 4.83e-01 0.0698 0.0995 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0934 0.108 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0738 0.135 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 6.23e-01 0.0609 0.124 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 8.26e-01 0.0256 0.116 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 9.12e-01 0.0135 0.122 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 6.13e-01 0.063 0.124 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0204 0.113 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 7.52e-01 0.0361 0.114 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0147 0.122 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 6.38e-01 -0.055 0.117 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 9.09e-01 0.0137 0.119 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 1.50e-01 -0.161 0.112 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 5.43e-01 0.0643 0.105 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 2.00e-01 -0.149 0.116 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 6.55e-01 0.0472 0.105 0.178 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0875 0.126 0.182 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 9.50e-01 0.00701 0.112 0.182 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 9.17e-01 0.0111 0.107 0.182 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0383 0.101 0.182 MAIT L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 2.25e-01 0.135 0.111 0.182 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 6.39e-01 0.0527 0.112 0.182 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 2.93e-01 -0.122 0.116 0.182 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0944 0.127 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 5.00e-01 0.0723 0.107 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 2.46e-01 -0.13 0.112 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 7.73e-01 0.0321 0.111 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0372 0.108 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 7.65e-02 -0.197 0.111 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 6.50e-01 0.0499 0.11 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 9.54e-01 0.00691 0.12 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0755 0.0889 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 2.70e-01 0.101 0.0911 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 1.84e-01 -0.129 0.097 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00757 0.0867 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 8.62e-01 0.0213 0.122 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 8.61e-01 0.0177 0.101 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0542 0.128 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0552 0.114 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 3.65e-01 -0.101 0.111 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0202 0.106 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 1.14e-01 0.189 0.119 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0315 0.113 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0355 0.109 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 8.56e-01 0.0213 0.117 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 6.96e-01 0.0358 0.0914 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 2.19e-01 0.121 0.0985 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 2.39e-01 -0.128 0.108 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 7.29e-02 0.166 0.092 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0419 0.115 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0644 0.107 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 9.10e-01 0.0172 0.152 0.178 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0839 0.176 0.178 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 1.22e-02 0.38 0.149 0.178 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -76882 sc-eQTL 7.94e-01 0.0373 0.143 0.178 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 3.97e-01 0.0865 0.102 0.178 PB L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 2.32e-01 0.188 0.156 0.178 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 1.66e-01 0.193 0.139 0.178 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 2.92e-01 -0.157 0.148 0.178 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 1.73e-01 0.126 0.0922 0.18 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 6.44e-01 0.0543 0.118 0.18 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 3.48e-01 -0.103 0.109 0.18 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 1.48e-01 0.114 0.0783 0.18 Pro_T L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0216 0.115 0.18 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 7.84e-01 0.0302 0.11 0.18 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000926 0.101 0.18 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 3.34e-01 0.118 0.121 0.179 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 2.52e-01 -0.135 0.117 0.179 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0491 0.0941 0.179 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0719 0.108 0.179 Treg L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 8.65e-02 0.199 0.116 0.179 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 6.64e-01 0.0478 0.11 0.179 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 3.62e-01 0.1 0.11 0.179 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 2.65e-01 0.135 0.121 0.19 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 1.22e-01 0.202 0.13 0.19 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0391 0.112 0.19 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0191 0.0788 0.19 cDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 7.30e-01 0.0395 0.114 0.19 cDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -762862 sc-eQTL 2.55e-01 0.115 0.101 0.19 cDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -859523 sc-eQTL 3.53e-01 0.0925 0.0992 0.19 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 6.59e-02 0.196 0.106 0.19 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 2.50e-01 -0.114 0.0987 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0813 0.11 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 1.81e-01 0.0999 0.0745 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 7.26e-01 -0.023 0.0656 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -262055 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0294 0.124 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 1.40e-01 0.149 0.1 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000168528 SERINC2 -762862 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0149 0.125 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000284543 LINC01226 -859523 sc-eQTL 1.27e-01 -0.168 0.11 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 5.32e-02 -0.199 0.102 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 8.02e-02 -0.182 0.103 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00735 0.123 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 4.45e-01 0.0678 0.0887 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 3.22e-01 0.0676 0.0681 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -262055 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0398 0.118 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 2.08e-01 0.134 0.106 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000168528 SERINC2 -762862 sc-eQTL 9.28e-01 0.0114 0.125 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000284543 LINC01226 -859523 sc-eQTL 8.03e-01 0.0253 0.101 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 9.98e-01 0.000234 0.102 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 6.40e-01 0.0778 0.166 0.185 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 5.68e-01 0.0815 0.142 0.185 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 6.06e-01 -0.076 0.147 0.185 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0462 0.16 0.185 gdT L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0237 0.146 0.185 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 3.04e-01 0.152 0.147 0.185 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 3.45e-01 -0.135 0.142 0.185 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 4.59e-01 0.0851 0.115 0.18 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 6.97e-01 0.0481 0.123 0.18 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 3.80e-01 0.092 0.105 0.18 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0521 0.0821 0.18 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -262055 sc-eQTL 6.39e-01 0.0528 0.112 0.18 intMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0559 0.118 0.18 intMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -762862 sc-eQTL 8.95e-01 0.0156 0.118 0.18 intMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -859523 sc-eQTL 2.65e-01 -0.124 0.111 0.18 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 6.72e-03 -0.3 0.11 0.18 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 1.99e-01 0.138 0.107 0.183 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0907 0.114 0.183 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 2.80e-01 0.101 0.0934 0.183 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 7.13e-01 0.0314 0.085 0.183 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -262055 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0381 0.0953 0.183 ncMono L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 8.91e-01 -0.015 0.109 0.183 ncMono L2
ENSG00000168528 SERINC2 -762862 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00192 0.104 0.183 ncMono L2
ENSG00000284543 LINC01226 -859523 sc-eQTL 5.04e-02 0.203 0.103 0.183 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0713 0.108 0.183 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0552 0.121 0.189 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0488 0.132 0.189 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 6.58e-01 0.0488 0.11 0.189 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0196 0.102 0.189 pDC L2
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 1.16e-01 0.208 0.131 0.189 pDC L2
ENSG00000168528 SERINC2 -762862 sc-eQTL 9.24e-02 -0.208 0.123 0.189 pDC L2
ENSG00000284543 LINC01226 -859523 sc-eQTL 1.55e-01 -0.136 0.0956 0.189 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0547 0.113 0.189 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 1.02e-01 0.197 0.12 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0526 0.1 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 9.16e-01 0.00941 0.0888 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -76882 sc-eQTL 7.40e-01 0.0337 0.101 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0483 0.0636 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 5.80e-02 0.199 0.105 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00234 0.0842 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0406 0.0917 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 2.56e-01 0.126 0.111 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 7.60e-01 0.0269 0.0878 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 1.45e-01 -0.121 0.0827 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -76882 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0554 0.0799 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 5.11e-02 -0.11 0.0558 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 1.70e-01 -0.141 0.102 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 1.16e-01 0.114 0.0723 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 7.28e-01 0.0301 0.0864 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 1.49e-02 -0.228 0.0927 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0956 0.106 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 2.37e-01 0.0803 0.0677 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 8.18e-01 0.0138 0.0597 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -262055 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0334 0.122 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 9.15e-02 0.144 0.0851 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -762862 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0242 0.125 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -859523 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0845 0.103 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 2.13e-01 -0.12 0.0959 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 9.86e-02 0.169 0.102 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0391 0.112 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 5.40e-02 0.176 0.091 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0303 0.0734 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -262055 sc-eQTL 5.24e-01 0.0684 0.107 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0221 0.0974 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000168528 SERINC2 -762862 sc-eQTL 7.43e-01 0.0365 0.111 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000284543 LINC01226 -859523 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00657 0.106 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 5.55e-02 -0.202 0.105 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -650085 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00844 0.115 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -650279 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0092 0.0782 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -419288 sc-eQTL 3.95e-01 0.0729 0.0856 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -111071 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0818 0.0956 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162517 PEF1 -998193 sc-eQTL 1.54e-01 0.104 0.0724 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -71801 sc-eQTL 8.28e-01 -0.024 0.11 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -84990 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0462 0.0953 0.179 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000284543 \N -859578 2.74e-07 1.3e-07 5.14e-08 1.86e-07 9.79e-08 9.9e-08 1.53e-07 5.48e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.54e-07 9.19e-08 1.47e-07 6.76e-08 5.91e-08 7.36e-08 4.09e-08 1.33e-07 5.75e-08 4.31e-08 1.21e-07 1.24e-07 1.44e-07 3.03e-08 1.46e-07 1.21e-07 1.07e-07 9.74e-08 1.16e-07 1.07e-07 9.7e-08 3.1e-08 3.66e-08 8e-08 6.67e-08 3.53e-08 4.99e-08 8.71e-08 6.37e-08 3.76e-08 4.69e-08 1.36e-07 5.2e-08 1.45e-08 4.25e-08 1.86e-08 1.21e-07 1.88e-09 5.02e-08